Gln-AMS TFA

目录号: V76976 纯度: ≥98%
Gln-AMS (TFA) 是一种 Ia 型氨酰基-tRNA 合成酶 (AARS) 抑制剂。
Gln-AMS TFA 产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Gln-AMS (TFA) 是一种 Ia 型氨酰-tRNA 合成酶 (AARS) 抑制剂。Gln-AMS 对谷氨酰-tRNA 合成酶的抑制常数 Ki 为 1.32 µM。
Gln-AMS TFA 是一种小分子 Ia 型氨酰-tRNA 合成酶 (AARS) 抑制剂,特异性靶向谷氨酰-tRNA 合成酶 (GlnRS)。该化合物由一个腺苷部分通过磺酰胺键与一个谷氨酰胺残基连接而成。Gln-AMS TFA 作为谷氨酰胺的竞争性抑制剂,与 GlnRS 的活性位点结合,从而阻止 tRNAGln 的氨酰化。由于氨酰-tRNA 合成酶是新兴的抗生素研发靶点,因此该化合物是研究谷氨酰-tRNA 合成酶在蛋白质合成、细胞代谢和细菌致病机制中作用的重要生化工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ki: 1.32 µM (GlnRS)[1]
Glutaminyl-tRNA synthetase (GlnRS). Gln-AMS is a type Ia aminoacyl-tRNA synthetase (AARS) inhibitor that specifically targets glutaminyl-tRNA synthetase (GlnRS). GlnRS catalyzes the ATP-dependent ligation of glutamine to its cognate tRNA, a critical step in protein biosynthesis. By binding to the active site, Gln-AMS competes with the natural substrate glutamine, thereby preventing the formation of glutaminyl-tRNA and halting protein synthesis. This inhibition is reversible and competitive with respect to glutamine. The TFA salt form is used to enhance compound stability and solubility for research applications.
体外研究 (In Vitro)
Gln-AMS(TFA) 是 Ia 型氨酰-tRNA 合成酶 (AARS) 的抑制剂[2]。
体外实验表明,Gln-AMS (TFA) 能以 1.32 uM 的 Ki 值抑制谷氨酰-tRNA 合成酶 (GlnRS)。该 Ki 值反映了抑制剂与酶的结合亲和力,并体现了其作为竞争性抑制剂的效力。根据其结构和抑制特性,该化合物被归类为 Ia 型氨酰-tRNA 合成酶 (AARS) 抑制剂。在细菌和真核生物的无细胞翻译系统中,Gln-AMS 以浓度依赖的方式抑制蛋白质合成。然而,由于化合物的渗透性和外排机制,达到细胞活性所需的有效细胞内浓度可能更高。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无Gln-AMS TFA的具体体内数据。作为一种氨酰tRNA合成酶(AARS)抑制剂,这类化合物通常用于无细胞体系中的机制研究或探索潜在的抗菌应用,因为AARS抑制剂已被证实是新型抗生素(例如莫匹罗星)的靶点。Gln-AMS TFA是研究谷氨酰tRNA合成酶生物学和评估GlnRS抑制在不同细胞环境中的功能后果的标准工具化合物。它不适用于体内治疗。
酶活实验
典型的非细胞酶抑制实验中,重组谷氨酰-tRNA合成酶(GlnRS)配制于测定缓冲液(50 mM HEPES pH 7.5、150 mM KCl、10 mM MgCl2、1 mM DTT)中。反应混合物包含0.1-10 uM Gln-AMS TFA、1-500 uM L-谷氨酰胺、1-100 uM ATP和0.1-10 uM tRNAGln。加入GlnRS(0.1-1 nM)启动反应,并在37℃下孵育10-30分钟。取少量反应液,用三氯乙酸终止反应,并通过P32-ATP掺入或焦磷酸盐比色法检测来测定产物生成量。通过测量不同底物和抑制剂浓度下的初始反应速率,并拟合竞争性抑制模型,确定Ki值。
细胞实验
典型的 Gln-AMS TFA 细胞活性测定可使用大肠杆菌或哺乳动物细胞系进行。将细胞培养至对数生长期中期,然后用不同浓度的 Gln-AMS TFA(0.1-100 uM)孵育 2-24 小时。对于蛋白质合成抑制研究,将细胞在 37℃ 下用 35S-甲硫氨酸脉冲标记 30 分钟,然后裂解细胞,并通过液体闪烁计数法定量三氯乙酸沉淀的放射性。或者,在化合物暴露 24-48 小时后,使用 MTT 或刃天青还原法评估细胞活力。细胞生长抑制的 IC50 值可从剂量反应曲线中得出。Gln-AMS TFA 也可用于研究 GlnRS 依赖的细胞反应以及 GlnRS 抑制的代谢后果。
动物实验
对于该特定化合物,目前尚无标准的体内研究方案。对于通用的Ia型氨酰tRNA合成酶(AARS)抑制剂,可向实验动物(例如小鼠)静脉注射(5-20 mg/kg)或腹腔注射给药。在不同时间点(给药后0.5、1、2、4、8、12和24小时)采集血液和组织样本。将组织(肝脏、肾脏、脾脏)匀浆,并通过液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)定量分析化合物浓度。疗效研究可能涉及感染模型(例如细菌性腹膜炎)以评估抗菌活性,但Gln-AMS TFA通常不用于此类模型。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种小分子抑制剂,Gln-AMS TFA 的药代动力学性质尚未得到充分表征。基于其化学结构(包含腺苷部分和肽样连接),该化合物预计具有极性特征,水溶性高但膜渗透性低(LogP 值为负)。它可能主要经肾脏排泄,并可能发生水解或代谢裂解。TFA 反离子以化学计量比(与活性分子比例为 1:1 或 2:1)存在,对药代动力学无显著影响。目前尚未报道该化合物的详细药代动力学参数(半衰期、清除率、分布容积)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
氨酰tRNA合成酶(AARS)抑制剂,例如Gln-AMS,通常被认为具有较低的固有毒性,因为它们对细菌AARS的选择性高于哺乳动物酶。然而,Gln-AMS TFA对哺乳动物GlnRS的抑制Ki值为1.32 μM,表明其在高浓度下可能对真核细胞具有细胞毒性。体外细胞毒性试验可能显示,浓度高于50-100 μM时细胞活力降低。目前尚无具体的遗传毒性、器官毒性或致癌性数据。用于研究时,应采取标准防护措施(戴手套、穿实验服)。Gln-AMS TFA不适用于人体。
参考文献

[1]. How glutaminyl-tRNA synthetase selects glutamine. Structure. 1998 Apr 15;6(4):439-49.

[2]. Structural basis for full-spectrum inhibition of translational functions on a tRNA synthetase. Nat Commun. 2015 Mar 31;6:6402.

其他信息
Gln-AMS(谷氨酰腺苷单磷酰胺磺酰胺)是一种双底物类似物抑制剂,可模拟谷氨酰tRNA合成酶(GlnRS)催化的氨酰化反应的反应中间体。该化合物含有不可水解的磺酰胺键,因此具有稳定的抑制作用。它已被广泛用作氨酰tRNA合成酶功能的机制探针。与其它盐形式(例如盐酸盐)相比,制备三氟乙酸盐(TFA盐)形式可提高其固态稳定性和水溶性。Gln-AMS是酶学和化学生物学中一种成熟的工具化合物,但并非获批药物。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H23F3N8O10S
分子量
588.47
相关CAS号
Gln-AMS;209543-57-7
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~130 mg/mL (~220.91 mM)
DMSO :~50 mg/mL (~84.97 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4.25 mg/mL (7.22 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 42.5mg/mL澄清DMSO储备液加入900μL玉米油中,混合均匀。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6993 mL 8.4966 mL 16.9932 mL
5 mM 0.3399 mL 1.6993 mL 3.3986 mL
10 mM 0.1699 mL 0.8497 mL 1.6993 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们