| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 1mg |
|
||
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
IC50: 84 nM (KDM1A/LSD1)[1]
DDP-38003 specifically targets histone lysine-specific demethylase 1A (KDM1A), also known as LSD1. KDM1A is a flavin adenine dinucleotide (FAD)-dependent amine oxidase that removes methyl groups from histone H3 at lysine 4 (H3K4me1/2) and lysine 9 (H3K9me1/2). Inhibition of KDM1A by DDP-38003 blocks its demethylase activity, leading to the accumulation of H3K4me2, an epigenetic mark associated with active gene transcription. This derepression of genes involved in differentiation and cell cycle control is the primary mechanism through which DDP-38003 exerts its anti-leukemic effects. DDP-38003 has an IC50 of 84 nM for KDM1A. |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
DDP-38003 抑制 KDM1A 的 IC50 为 84 nM。DDP-38003 在降低 THP-1 细胞的集落形成能力和促进其分化方面，比其 1R, 2S 对应物表现出更高的功效 [1]。
体外实验表明，DDP-38003 三盐酸盐对 KDM1A 的抑制作用 IC50 值为 84 nM，该值是通过使用重组 KDM1A 酶和甲基化肽底物进行的生化分析测得的。与 1R, 2S 非对映异构体类似物相比，DDP-38003 在降低人白血病 THP-1 细胞的集落形成能力和诱导其分化方面表现出更强的效力。该化合物可剂量依赖性地增加处理细胞中 H3K4me2 的水平，H3K4me2 是 KDM1A 抑制的药效学标志物。这种表观遗传学改变导致急性髓系白血病 (AML) 细胞系中 CD11b 和 CD14 等分化标志物的表达增加。DDP-38003 还能抑制多种癌细胞系的增殖，其生长抑制 IC50 值在低微摩尔范围内（约 1-5 uM），具体数值取决于细胞类型。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在小鼠白血病模型中，口服DDP-38003后显示出体内疗效，可使生存率提高62%，并证实KDM1A受到抑制。DDP-38003的半衰期为8小时。DDP-38003治疗可显著提高小鼠的生存率，且呈剂量依赖性。在11.25 mg/kg和22.50 mg/kg的剂量下，生存率分别提高了35%和62%。DDP-38003有望成为一种口服抗癌药物[1]。
在体内，DDP-38003 三盐酸盐在小鼠白血病模型中显示出口服疗效。在 KDM1A 敏感性白血病模型（例如，小鼠急性髓系白血病模型或免疫缺陷小鼠的人源异种移植模型）中，口服 DDP-38003，剂量分别为 11.25 和 22.50 mg/kg（每周给药 3 天，持续 3 周），可显著提高生存率，且呈剂量依赖性。11.25 mg/kg 剂量组的生存率提高了 35%。22.50 mg/kg 剂量组的生存率较载体对照组提高了 62%。该化合物耐受性良好，在有效剂量下，接受治疗的小鼠未观察到明显的体重下降。这些结果证实，口服 KDM1A 抑制剂是某些白血病的可行治疗策略，并且 DDP-38003 是一种有前景的先导化合物，值得进一步开发。 |
| 酶活实验 |
体外KDM1A（LSD1）酶活性可通过荧光法或ELISA法进行评估。该检测方案使用重组人KDM1A蛋白（全长或催化结构域）和生物素标记的组蛋白H3肽（H3K4me2，氨基酸1-21）作为底物。反应缓冲液由50 mM HEPES（pH 7.5）、50 mM NaCl、0.1% BSA和0.01% Tween-20组成。DDP-38003与10 nM KDM1A在10 uM FAD辅因子存在下于室温预孵育15分钟。加入1 uM生物素标记的H3K4me2肽启动反应，并在37℃孵育60分钟。加入含有针对 H3K4me2（非去甲基化）或 H3K4me0（去甲基化）的特异性一抗的检测试剂可淬灭去甲基化酶活性。或者，使用 Amplex Red 和 HRP 的偶联检测方法可检测去甲基化反应过程中产生的 H2O2。荧光强度在 540/590 nm 激发/发射波长下读取。IC50 值通过绘制活性百分比与 log[抑制剂]的关系图，并使用四参数逻辑曲线拟合计算得出。84 nM 的 IC50 值表明 DDP-38003 是 KDM1A 的强效抑制剂。
|
| 细胞实验 |
细胞机制研究采用人白血病细胞系，例如THP-1（急性单核细胞白血病）或MOLM-13（急性髓系白血病）细胞。细胞在添加10%胎牛血清和1%青霉素/链霉素的RPMI-1640培养基中，于37℃、5% CO2条件下培养。将DDP-38003三盐酸盐溶解于DMSO中，并以0.01-10 uM的终浓度加入培养基中，培养24-96小时，DMSO的终浓度保持在≤0.1%。在克隆形成实验中，将500-1000个细胞/孔接种于6孔板中，并用DDP-38003（0.1-5 uM）处理7-14天。克隆用甲醇固定，用0.5%结晶紫染色，并进行人工计数。为进行分化分析，将THP-1细胞用DDP-38003（0.1-1 uM）处理48-72小时。用PE标记的抗CD11b抗体和FITC标记的抗CD14抗体染色后，通过流式细胞术分析CD11b和CD14的表面表达。为评估药效学效应，通过Western blot或细胞ELISA检测全细胞裂解液中的H3K4me2水平。Western blot实验中，将20-30 ug富含组蛋白的酸提取物在15% SDS-PAGE凝胶上分离，转移至PVDF膜，并用抗H3K4me2抗体和抗总H3抗体（作为上样对照）进行检测。进行密度定量分析。H3K4me2积累的EC50值通常在0.1-1 uM范围内。
|
| 动物实验 |
体内疗效评估采用小鼠白血病模型，例如同源MLL-AF9驱动的AML模型或人THP-1细胞异种移植模型。对于异种移植模型，将5 × 10⁶个表达荧光素酶的THP-1-luc细胞经静脉或皮下注射至6-8周龄的雌性NOD-SCID或NSG小鼠体内。对于口服给药，将DDP-38003三盐酸盐配制成40% PEG 400/5%葡萄糖溶液（或0.5% CMC-Na）的混悬液，并以0、11.25和22.50 mg/kg的剂量进行灌胃给药。一旦在外周血中检测到白血病细胞（通常在细胞注射后10天）或皮下肿瘤体积达到约100-200 mm³，即可开始治疗。给药方案为每周3天（周一、周二、周三），持续3周（共9剂）。每周通过生物发光成像（静脉注射模型）或卡尺测量（皮下肿瘤）评估肿瘤负荷。通过眼眶后静脉丛取血，用于分析外周血原始细胞计数和分化标志物。生存期为主要终点。绘制Kaplan-Meier生存曲线，并通过log-rank检验比较各治疗组的中位生存时间。剂量依赖性生存期增加（11.25 mg/kg组增加35%，22.50 mg/kg组增加62%）计算为相对于溶媒对照组的中位生存时间增加百分比。每周监测两次体重，作为毒性指标。实验结束时，采集骨髓、脾脏和外周血，用于流式细胞术分析白血病负荷（例如，人CD45+细胞）。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
DDP-38003在小鼠体内口服给药后的半衰期约为8小时。这种相对较长的半衰期支持疗效研究中使用的每日一次、每周三次的给药方案。该化合物具有口服生物利用度；其制剂为40% PEG 400/5%葡萄糖溶液，用于灌胃研究。与游离碱相比，三盐酸盐形式提高了水溶性，有利于体外和体内制剂的制备。目前尚未公布DDP-38003的详细药代动力学参数（Cmax、Tmax、AUC、生物利用度、蛋白结合率）。作为一种小分子（分子量约为459.84 g/mol），它可能具有良好的膜渗透性和中等的血浆蛋白结合率。预计其代谢主要发生在肝脏，但尚未确定具体的代谢酶。推测其排泄途径为胆汁排泄和/或肾脏排泄。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
DDP-38003三盐酸盐的毒性特征对于研究用化合物而言是可以接受的。在小鼠白血病疗效研究中，口服剂量高达22.5 mg/kg（每周三次，持续三周）的DDP-38003耐受性良好，与溶剂对照组相比，未观察到明显的体重减轻或全身毒性症状（行为改变、毛发蓬乱、腹泻）。该化合物在这些剂量下未引起任何可观察到的急性死亡。原始文献中未报道任何特定的器官毒性（肝毒性、肾毒性、心脏毒性）。处理DDP-38003时应遵守标准的实验室安全预防措施，包括佩戴手套、实验服和护目镜。避免吸入粉尘或气溶胶。建议将该化合物储存在-20℃的密封容器中，避光，并充入惰性气体（例如氮气）。 DDP-38003 三盐酸盐仅供研究使用；未经批准用于人类或兽医用途。
|
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
KDM1A/LSD1（赖氨酸特异性去甲基化酶1A）是一种黄素依赖性单胺氧化酶，可使组蛋白H3的第4位赖氨酸（H3K4）和第9位赖氨酸（H3K9）去甲基化。KDM1A在多种癌症中经常过表达，尤其是在急性髓系白血病（AML）和其他血液系统恶性肿瘤中。使用小分子抑制KDM1A可诱导白血病干细胞和祖细胞的分化和凋亡，使其成为肿瘤药物研发中一个已验证的表观遗传靶点。DDP-38003是一种新型的、口服生物利用度高的抑制剂，是通过药物化学优化发现的。该化合物对KDM1A的IC50值为84 nM，是目前文献报道中最有效的KDM1A抑制剂之一。 DDP-38003 的骨架结构与不可逆的 MAO 样 KDM1A 抑制剂（例如，反式环丙胺衍生物、ORY-1001）截然不同，提示其结合模式可逆。DDP-38003 是一种重要的工具化合物，可用于研究 KDM1A 抑制在白血病模型中的作用，并验证口服 KDM1A 靶向疗法的治疗潜力。三盐酸盐是其稳定性和易操作性的优选固体形式。DDP-38003 三盐酸盐仅供研究用途。
|
| 分子式 |
C21H29CL3N4O
|
|---|---|
| 分子量 |
459.84
|
| 精确质量 |
350.211
|
| 相关CAS号 |
DDP-38003 dihydrochloride;1831167-98-6
|
| PubChem CID |
86287623
|
| 外观&性状 |
Yellow to reddish brown solid powder
|
| tPSA |
61.6
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
| 可旋转键数目(RBC) |
4
|
| 重原子数目 |
26
|
| 分子复杂度/Complexity |
474
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
|
| SMILES |
CN1CCN(CC1)C2=CC=C(C=C2)C(=O)NC3=CC=C(C=C3)[C@@H]4C[C@H]4N
|
| InChi Key |
SSWIQIUOBLUKHT-VQTJNVASSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C21H26N4O/c1-24-10-12-25(13-11-24)18-8-4-16(5-9-18)21(26)23-17-6-2-15(3-7-17)19-14-20(19)22/h2-9,19-20H,10-14,22H2,1H3,(H,23,26)/t19-,20+/m0/s1
|
| 化学名 |
N-[4-[(1S,2R)-2-aminocyclopropyl]phenyl]-4-(4-methylpiperazin-1-yl)benzamide
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :~100 mg/mL (~217.47 mM)
H2O :~50 mg/mL (~108.73 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.44 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.44 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: 50 mg/mL (108.73 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.1747 mL | 10.8733 mL | 21.7467 mL | |
| 5 mM | 0.4349 mL | 2.1747 mL | 4.3493 mL | |
| 10 mM | 0.2175 mL | 1.0873 mL | 2.1747 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
InvivoChem的所有产品仅用于作科学研究，不面向患者销售
Copyright 2020 InvivoChem LLC | All Rights Reserved 粤ICP备20063088号-1
粤公网安备 44011102003439号
463611831
