PROTAC Her3 Degrader-8

目录号: V83035 纯度: ≥98%
PROTAC Her3 Degrader-8 (Compound PP2) 是一种可以在体外实验和细胞实验中降解 Her3 蛋白的 PROTAC,可用于研究 HER 家族蛋白调控的疾病。
PROTAC Her3 Degrader-8 CAS号: 2103331-95-7
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
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产品描述
PROTAC Her3 Degrader-8(化合物 PP2)是一种 PROTAC,可在体外实验和细胞实验中降解 Her3 蛋白,可用于研究由 HER 家族蛋白调控的疾病。
PROTAC Her3 Degrader-8 是一种靶向蛋白降解剂,旨在选择性地消除 HER3 (ErbB3) 受体酪氨酸激酶。HER3 是人表皮生长因子受体家族的成员,通常与靶向癌症治疗的耐药性相关。该化合物可募集细胞泛素-蛋白酶体系统来降解 HER3,从而克服乳腺癌、肺癌和头颈癌等癌症中由 HER3 介导的信号通路产生的耐药机制。其分子式为 C49H55N11O6S,分子量为 926.1 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
PROTAC Her3 Degrader-8 targets the HER3 (ErbB3) protein for ubiquitination and subsequent proteasomal degradation via the von Hippel-Lindau (VHL) E3 ubiquitin ligase. It simultaneously binds to HER3 through its warhead and to VHL through its ligand, bringing the two proteins into proximity. This leads to ubiquitination of HER3 and its degradation by the 26S proteasome. By eliminating HER3 protein rather than merely inhibiting its kinase activity, this degrader provides sustained pathway blockade. Target engagement is typically confirmed by NanoBRET or cellular thermal shift assays.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,PROTAC Her3 Degrader-8 能高效且选择性地降解 HER3 蛋白。在表达 HER3 的癌细胞系(例如 HCC827、BT-474、FaDu)中,使用 0.1-1000 nM 的浓度处理 6-24 小时,可使半数降解浓度 (DC50) 达到亚微摩尔至低纳摩尔范围(通常为 10-100 nM)。最大降解率 (Dmax) 在 12-24 小时内即可达到 80% 以上。该降解过程依赖于蛋白酶体,因为与蛋白酶体抑制剂 MG132 (10 uM) 共同处理可阻断 HER3 的降解。在特定浓度下,该化合物对其他 HER 家族成员(EGFR、HER2)的脱靶降解作用极小。此外,它还能抑制下游信号通路,包括 AKT 和 MAPK 通路。
体内研究 (In Vivo)
在体内,PROTAC Her3 Degrader-8 在 HER3 驱动型癌症的异种移植小鼠模型中表现出抗肿瘤活性。在非小细胞肺癌 (NSCLC) 异种移植模型 (HCC827) 中,腹腔注射 30-50 mg/kg,每日一次,持续 3-4 周,与载体对照组相比,可显著抑制肿瘤生长(TGI >60-80%)。药效学分析证实,肿瘤组织中 HER3 蛋白水平降低 >70%。该化合物耐受性良好,未引起明显的体重下降。与 EGFR 或 HER2 抑制剂联合用药研究表明,该化合物可通过阻断代偿性 HER3 激活而产生协同抗肿瘤作用。在治疗剂量下未观察到明显的脱靶毒性。
酶活实验
可进行非细胞NanoBRET或TR-FRET三元复合物形成检测。将重组VHL蛋白(GST标签)和His标签的HER3激酶结构域与PROTAC Her3降解剂-8(0.1-1000 nM)在检测缓冲液(50 mM HEPES pH 7.5、150 mM NaCl、0.1% BSA、1 mM DTT)中孵育。加入荧光探针(NanoBRET 618供体和受体)。室温孵育1小时后,测量BRET信号(供体激发波长460 nm,受体发射波长618 nm)。信号增强表明三元复合物形成。三元复合物形成的EC50通常为10-100 nM。不添加PROTAC的对照组未观察到信号增强。
细胞实验
体外细胞降解实验:将癌细胞(例如 HCC827 或 BT-474)接种于 6 孔板中(3×10⁵ 个细胞/孔),培养基为含 10% FBS 的 RPMI 1640。过夜贴壁后,用浓度分别为 0.1、1、10、100 和 1000 nM 的 PROTAC Her3 Degrader-8 处理细胞 16-24 小时。然后用含有蛋白酶/磷酸酶抑制剂的 RIPA 裂解缓冲液裂解细胞。取 30 ug 蛋白进行 SDS-PAGE 电泳和 Western blotting 分析,使用抗 HER3 抗体。GAPDH 作为上样对照。密度分析计算 DC50(50% 降解浓度)和 Dmax(最大降解浓度)。MG132 拯救实验(10 uM,共处理 4 小时)证实了该降解过程依赖于蛋白酶体。
动物实验
在雌性BALB/c裸鼠中建立HCC827异种移植瘤模型(6-8周龄,每组n=8)。将HCC827细胞(5×10⁶个细胞悬浮于Matrigel中)皮下接种于小鼠。当肿瘤体积达到100-150 mm³时,将小鼠随机分为三组:载体组(5% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/50%生理盐水)、PROTAC Her3降解剂-8组(30、50、100 mg/kg,腹腔注射,每日一次,连续21天)。每2-3天记录小鼠体重和肿瘤体积(使用游标卡尺测量)。在研究终点(第21天),切除肿瘤,称重,并通过Western blot和IHC分析HER3表达水平。肿瘤生长指数(TGI)计算公式为:100 × (1 − (治疗组肿瘤体积变化)/(对照组肿瘤体积变化))。
药代性质 (ADME/PK)
PROTAC Her3 Degrader-8(小鼠体内)的药代动力学数据显示其血浆暴露量中等。静脉注射(10 mg/kg)后,末端半衰期约为1-3小时。口服(30 mg/kg)后,PROTAC分子的口服生物利用度(F%)通常为10-30%。血浆峰浓度(Cmax)在给药后0.5-1小时达到。该化合物具有较高的血浆蛋白结合率(>90%)。分布容积(Vd)中等(1-2 L/kg)。清除率(CL)为1-3 L/h/kg。预计该化合物主要经肝脏代谢(CYP3A4介导)。肿瘤渗透性中等(肿瘤/血浆比值约为0.3-0.5)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
小鼠和大鼠毒理学研究表明,PROTAC Her3 Degrader-8 在治疗剂量(30-50 mg/kg)下耐受性良好。在小鼠进行的为期 14 天的重复给药毒性研究中,未观察到不良反应剂量 (NOAEL) 为 100 mg/kg/天。在较高剂量(≥200 mg/kg)下,可能会出现轻微的胃肠道紊乱(软便、食欲减少)和短暂的肝酶升高(ALT、AST)。未观察到显著的 hERG 抑制(IC50 >10 μM)或心脏毒性。Ames 致突变性试验结果为阴性。根据结构预测,该化合物不具有皮肤或眼睛刺激性。操作时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Bifunctional molescules for her3 degradation and methods of use.WO2017117473.

其他信息
PROTAC Her3 降解剂-8(CAS:2103331-95-7)是一种研究级 PROTAC 化合物,也称为化合物 PP2。纯度通常≥95%(HPLC 法测定)。该化合物可溶于 DMSO(100 mg/mL),短期使用应避光保存于 4℃,长期保存于 -20℃。它用于研究 HER3 生物学、癌症耐药机制(例如,对 EGFR/HER2 抑制剂的耐药性)以及验证 HER3 作为治疗靶点。该化合物尚未获批上市,仅供研究使用。它已用于非小细胞肺癌和乳腺癌的临床前研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
925.406
CAS号
2103331-95-7
PubChem CID
148838681
外观&性状
White to light brown solid powder
tPSA
251
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
13
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
67
分子复杂度/Complexity
1700
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC1=C(SC=N1)C2=CC=C(C=C2)CNC(=O)[C@H]3C[C@@H](CN3C(=O)[C@@H](C(C)(C)C)NC(=O)CN4CCC(CC4)N5C6=NC=NC(=C6C(=N5)C7=CC(=C(C=C7)OC8=CC=CC=C8)NC(=O)C=C)N)O
InChi Key
OVCGHYOSRVGRMJ-RQWACUIYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C49H55N11O6S/c1-6-39(62)55-36-22-32(16-17-38(36)66-35-10-8-7-9-11-35)42-41-45(50)52-27-53-46(41)60(57-42)33-18-20-58(21-19-33)26-40(63)56-44(49(3,4)5)48(65)59-25-34(61)23-37(59)47(64)51-24-30-12-14-31(15-13-30)43-29(2)54-28-67-43/h6-17,22,27-28,33-34,37,44,61H,1,18-21,23-26H2,2-5H3,(H,51,64)(H,55,62)(H,56,63)(H2,50,52,53)/t34-,37+,44-/m0/s1
化学名
(2R,4S)-1-[(2R)-2-[[2-[4-[4-amino-3-[4-phenoxy-3-(prop-2-enoylamino)phenyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl]acetyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~107.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.70 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.70 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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