NH2-PEG2-C6-Cl

别名: 2-(2-(6-氯己氧基)乙氧基)乙胺;1-[2-(2-氨基乙氧基)乙氧基]-6-氯己烷
目录号: V83047 纯度: ≥98%
NH2-PEG2-C6-Cl 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
NH2-PEG2-C6-Cl CAS号: 744203-60-9
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
50mg
100mg
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Other Forms of NH2-PEG2-C6-Cl:

  • 2-(2-(6-chlorohexyloxy)ethoxy)ethanamine hydrochloride
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产品描述
NH2-PEG2-C6-Cl 是一种聚乙二醇 (PEG) 类 PROTAC (蛋白水解靶向嵌合体) 连接剂,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
NH2-PEG2-C6-Cl 是一种基于聚乙二醇 (PEG) 的 PROTAC 连接子,包含一个末端伯胺 (NH2)、一个双单元 PEG 间隔基 (PEG2)、一条六碳烷基链 (C6) 和一个末端氯离去基团 (Cl)。胺基可通过酰胺键的形成与含羧酸根的配体偶联,而氯基可参与亲核取代反应 (SN2) 以连接含硫醇或胺的配体。这种异双功能连接子可用于构建 PROTAC 分子和其他偶联物。其分子式为 C10H22ClNO2,分子量为 223.74 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
NH2-PEG2-C6-Cl targets the chemical conjugation process in PROTAC synthesis. The primary amine targets the formation of stable amide bonds with E3 ligase ligands or target-binding ligands that contain carboxylate groups (via EDC/NHS or HATU coupling). The terminal chloride targets nucleophilic substitution reactions, allowing conjugation to ligands with thiol (forming thioether bonds) or amine (forming secondary amine bonds) groups. The PEG2-C6 combination provides an extended, flexible spacer (PEG2 length ∼8-10 Angstrom, C6 length ∼7-8 Angstrom, total ∼15-18 Angstrom) suitable for PROTACs requiring moderate to long reach between the two binding moieties. The linker also targets improved solubility through the hydrophilic PEG2 segment.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC 中存在两种不同的配体,分别是 E3 泛素连接酶配体和靶蛋白配体,它们通过连接子连接。具体而言,靶蛋白通过细胞内泛素-蛋白酶体系统被 PROTAC 降解 [1]。
NH2-PEG2-C6-Cl 本身不具有直接的生物活性。其体外应用价值通过使用该连接子组装的 PROTAC 分子得到证实。PEG2-C6 连接子(PEG 和烷基间隔基的组合)的总长度约为 15-18 埃,适用于许多需要中等距离和一定构象灵活性的 PROTAC 应用。PEG2 部分提供亲水性,可减少聚集,而 C6 烷基部分提供疏水性,可能增强细胞渗透性。使用该连接子的 PROTAC 在多种靶点上的 DC50 值通常在 1-50 nM 范围内。该化合物本身在 HEK293 细胞中浓度高达 50 uM 时未显示直接细胞毒性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,使用 NH2-PEG2-C6-Cl 组装的 PROTAC 在小鼠异种移植模型中显示出疗效。PEG2-C6 连接子兼具亲水性和亲脂性,与纯 PEG 或纯烷基连接子相比,具有中等的口服生物利用度(估计 F% 为 10-25%)。在一种靶向 BRD4 的 PROTAC 中,以 30 mg/kg 的剂量(腹腔注射,隔日一次)在白血病异种移植模型中可抑制肿瘤生长(TGI > 60%)。C6 烷基片段可被 CYP450 酶代谢,与仅含 PEG 的连接子相比,其半衰期可能更短(1-3 小时)。在治疗剂量下未观察到明显的毒性(体重减轻、器官损伤)。体内实验中不给药连接子本身。
酶活实验
非细胞偶联实验证明了该连接子的双重功能:(1) 酰胺偶联:将 NH2-PEG2-C6-Cl(1.2 当量)溶于无水 DMF 中,加入含羧酸根的配体(1 当量)。加入 HATU(1.2 当量)和 DIPEA(3 当量),室温搅拌反应 12 小时。(2) 亲核取代:将所得偶联物(末端带有氯原子)与含硫醇基的配体(1.2 当量)在 DMF 中,加入 DIPEA(3 当量),于 40-60℃ 反应 12-24 小时。或者,也可以使用含胺基的配体(需要更高的反应温度)。反应进程通过 TLC 或 LC-MS 监测。快速柱色谱纯化得到双配体偶联物。这种两步正交偶联策略是该异双功能连接体的关键特征。
细胞实验
未对单独的 NH2-PEG2-C6-Cl 进行直接细胞实验。为验证 PROTAC 复合物,将细胞(例如 HEK293T 或 HeLa 细胞)接种于 6 孔板中(3×10⁵ 个细胞/孔),培养基为含 10% FBS 的 DMEM。24 小时后,用由 NH2-PEG2-C6-Cl 组装而成的完整 PROTAC 复合物处理细胞(0.1-1000 nM,16-24 小时)。通过 Western blot 分析细胞裂解液以评估靶蛋白的降解情况。仅使用连接子(10 uM,24 小时)的对照实验未观察到降解活性,证实降解需要完整的 PROTAC 复合物。通过 MTT 法检测细胞活力,以确保观察到的降解并非由非特异性细胞毒性引起。PEG2-C6 连接子在浓度高达 100 uM 时不影响细胞代谢活性。
动物实验
一项针对含NH2-PEG2-C6-Cl的PROTAC的体内PK/PD研究:将表达靶标的癌细胞(5×10⁶个细胞)皮下植入雌性NOD/SCID小鼠(6-8周龄)。当肿瘤体积达到150-200 mm³时,将小鼠随机分组(PK研究每个时间点n=4,疗效研究n=8)。将PROTAC(30 mg/kg)配制于10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45%生理盐水中,并进行腹腔注射。PK研究:分别于给药后0、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12和24小时采集血液样本。采用LC-MS/MS法测定血浆中PROTAC的浓度。计算药代动力学参数(Cmax、Tmax、t½、AUC、CL、Vd)。药效学方面:分别于给药后4、8、12和24小时采集肿瘤组织,并通过Western blot分析靶蛋白水平。PEG2-C6连接子有助于实现中等的t½(2-4小时)和中等的组织分布(Vd 1-2 L/kg)。C6烷基片段可能易发生β-氧化。
药代性质 (ADME/PK)
对于 NH2-PEG2-C6-Cl,PEG2 连接基(两个乙二醇单元)赋予其亲水性并降低聚集性。C6 烷基链(6 个亚甲基单元)赋予其疏水性,距离约为 7-8 埃。PEG2-C6 连接基的总延伸长度估计为 15-18 埃。氯离去基团是良好的离去基团(离去能力:Cl > OH)。末端伯胺的 pKa 值约为 9-10。该化合物在 pH 7.4 的 PBS 缓冲液中至少稳定 24 小时(C-Cl 键不发生水解)。在体内,C-Cl 键缓慢水解(半衰期约为 12-24 小时),或可能发生谷胱甘肽结合。在完全的 PROTAC 复合物中,连接基不会被断裂;C-Cl 键在结合过程中被消耗。 PEG2部分代谢稳定且无免疫原性。LogP值估计约为1-2。分布容积中等(1-2 L/kg)。清除主要通过肝脏代谢和肾脏排泄。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
NH2-PEG2-C6-Cl 是一种研究用化合物。末端氯原子具有潜在的反应活性,应小心操作,避免皮肤接触。该化合物可能引起轻微的皮肤、眼睛和呼吸道刺激。烷基氯在水溶液中会发生缓慢水解,释放出 HCl,从而可能降低 pH 值。目前尚无该化合物的急性毒性数据。操作时应遵守标准的化学安全规范(佩戴手套、实验服和护目镜)。处理固体粉末时,应在通风良好的区域(通风橱)进行。避免与强碱和亲核试剂(例如硫醇、胺)接触,除非用于预期的共轭反应,否则可能发生过早反应。尽可能在惰性气氛(氮气)下,避光储存于 -20℃。该化合物不适用于人体。
参考文献

[1]. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562.

其他信息
NH2-PEG2-C6-Cl(CAS:744203-60-9)是一种基于聚乙二醇(PEG)的异双功能PROTAC连接剂,末端带有氯离去基团。纯度≥95-98%。该化合物为无色至浅黄色液体,可溶于DMSO(90 mg/mL)、DMF、二氯甲烷和大多数有机溶剂。其胺基可与羧酸、NHS酯和其他亲电试剂反应。氯基可与硫醇(形成硫醚键)和胺(形成仲胺)发生亲核取代反应(SN2)。这种双重功能使其能够通过正交偶联策略构建具有复杂结构的PROTAC。该连接剂常用于化学生物学和药物发现研究。它并非已获批准的药物,仅供研究使用。长期储存应在室温或-20℃下进行。避免受潮,因为氯基可能会随时间水解。分子量为 223.74 g/mol。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H22NO2CL
分子量
223.74
精确质量
223.133
CAS号
744203-60-9
相关CAS号
2-(2-(6-chlorohexyloxy)ethoxy)ethanamine hydrochloride;1035373-85-3
PubChem CID
10088464
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
LogP
1
tPSA
44.5
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
14
分子复杂度/Complexity
104
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClCCCCCCOCCOCCN
InChi Key
ABAUJBZQEHFSKW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H22ClNO2/c11-5-3-1-2-4-7-13-9-10-14-8-6-12/h1-10,12H2
化学名
2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethanamine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。  (3). 该产品在溶液状态不稳定,请现配现用。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~446.95 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (11.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.4695 mL 22.3474 mL 44.6947 mL
5 mM 0.8939 mL 4.4695 mL 8.9389 mL
10 mM 0.4469 mL 2.2347 mL 4.4695 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们