YSR734

别名: YSR734; YSR-734; YSR 734
目录号: V85284 纯度: ≥98%
YSR734(化合物 21)是一种共价 HDAC 抑制剂
YSR734 CAS号: 3032969-58-4
产品类别: HDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
YSR734(化合物21)是一种共价组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂,对HDAC1、HDAC2和HDAC3的IC50值分别为110 nM、154 nM和143 nM。YSR734可诱导白血病细胞凋亡。YSR734可诱导成肌细胞分化,并用于杜氏肌营养不良症的研究。
YSR734(化合物21)是一种首创的共价组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂,其结构包含一个2-氨基苯甲酰亚胺锌离子螯合物和一个五氟苯磺酰胺亲电试剂。其分子式为C27H20F5N3O5S,分子量为598.54 g/mol。 YSR734 对 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的 IC50 值分别为 110 nM、154 nM 和 143 nM。该化合物可诱导白血病细胞凋亡并诱导成肌细胞分化,用于杜氏肌营养不良症的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
Histone deacetylases (HDACs); HDAC1 (IC50 = 110 nM); HDAC2 (IC50 = 154 nM); HDAC3 (IC50 = 143 nM)
YSR734 targets histone deacetylases (HDACs), specifically HDAC1, HDAC2, and HDAC3, which are Class I HDACs involved in the regulation of gene expression through histone deacetylation. As a covalent HDAC inhibitor, YSR734 forms an irreversible bond with its target enzymes, leading to sustained inhibition of HDAC activity. The compound features a pentafluorobenzene sulfonamide electrophile that enables covalent binding to the target.
体外研究 (In Vitro)
YSR734 是一种首创的共价 HDAC 抑制剂,其结构包含一个 2-氨基苯甲酰亚胺 Zn2+ 螯合物和一个五氟苯磺酰胺亲电试剂。该 I 类选择性概念验证化合物修饰了 HDAC2 的 Cys274 位点(催化结构域),对 HDAC1-3 具有纳摩尔级的抑制效力,在 MV4-11 细胞中具有亚微摩尔级的活性,并且在 MRC-9 成纤维细胞中具有有限的细胞毒性。在 C2C12 成肌细胞中,YSR734 激活了肌肉特异性生物标志物肌生成素/Cav3,从而促进其向肌管分化(可用于治疗杜氏肌营养不良症)。[1] YSR734 作为一种共价 HDAC 抑制剂,在体外表现出强大的活性,对 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的 IC50 值分别为 110 nM、154 nM 和 143 nM。该化合物能诱导白血病细胞凋亡。YSR734还能诱导成肌细胞分化,因此可用于杜氏肌营养不良症的研究。
体内研究 (In Vivo)
YSR734 的体内活性基于其强大的体外 HDAC 抑制活性以及诱导白血病细胞凋亡和成肌细胞分化的能力。该化合物已被用于急性髓系白血病和杜氏肌营养不良症的研究应用。然而,现有文献中尚未广泛报道其详细的体内疗效数据。
酶活实验
YSR734 的非细胞酶活性测定通常涉及使用荧光底物测量重组 HDAC1、HDAC2 和 HDAC3 的活性抑制情况。标准方案包括将纯化的 HDAC 酶与荧光底物(例如 Boc-Lys(Ac)-AMC)在 37°C 的测定缓冲液中孵育。加入不同浓度(0.001–100 μM)的 YSR734,并监测荧光 AMC 的释放情况。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。
细胞实验
采用递增浓度的MS275、CovHDACi YSR734和对乙酰化组蛋白H3阴性对照23(GF608)对MV4-11 AML细胞中的乙酰化组蛋白H3和乙酰化α-微管蛋白进行Western Blot分析。抑制剂处理6小时后洗脱细胞,并在印迹分析前孵育16小时。HSC70用作上样对照[1]。
YSR734的细胞实验通常使用白血病细胞系(例如,急性髓系白血病细胞)或成肌细胞系。典型的实验方案包括在合适的培养基中培养细胞,用不同浓度(0.01–100 μM)的YSR734处理24–72小时,并使用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。细胞凋亡通过Annexin V染色进行流式细胞术检测。肌母细胞分化是通过测量肌管形成和分化标志物的表达来评估的。
动物实验
目前文献中关于YSR734体内动物研究的报道并不多。如果开展此类研究,典型的研究方案将采用急性髓系白血病异种移植小鼠模型或杜氏肌营养不良症小鼠模型。通过灌胃或腹腔注射给予YSR734后,将评估肿瘤生长、肌肉功能和组织病理学情况。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献中关于YSR734的药代动力学性质报道较少。该化合物分子量为598.54 g/mol,在DMSO中的溶解度为100 mg/mL。体内制剂:10% DMSO >> 90%玉米油(溶解度:≥ 5 mg/mL)。该化合物以粉末形式储存于-20°C可保存长达3年,以溶剂形式储存于-80°C可保存6个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为一种研究化合物,YSR734 不适用于人类治疗,其全面的毒理学数据仅限于临床前研究。标准的安全性评估包括细胞毒性筛选、hERG通道抑制试验以及在动物模型中进行的初步毒理学研究,以确定最大耐受剂量并识别潜在的毒性靶器官。该化合物仅供研究使用。
参考文献

[1].Discovery of YSR734: A Covalent HDAC Inhibitor with Cellular Activity in Acute Myeloid Leukemia and Duchenne Muscular Dystrophy. J Med Chem. 2023 Dec 28;66(24):16658-16679.

其他信息
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是强效的表观遗传修饰因子,通过催化ε-N-乙酰赖氨酸的去乙酰化作用,影响组蛋白和非组蛋白蛋白质。这些锌(Zn2+)依赖的水解酶的失调与多种疾病密切相关,尤其是癌症。在临床上,第一代HDAC抑制剂反复出现的剂量限制性毒性促使人们转向开发更安全、特异性更强的分子。鉴于HDAC在多种侵袭性疾病中的广泛作用,针对这些酶的新方法仍然是必要的。本文报告了YSR734的发现,这是一种首创的共价HDAC抑制剂,由2-氨基苯并咪唑锌离子螯合物和五氟苯磺酰胺电离剂组成。这种选择性针对I类的概念验证化合物,经过HDAC2Cys274(催化域)修饰,对HDAC1-3表现出纳摩尔级的效能,在MV4-11细胞中具有亚微摩尔活性,并对MRC-9成纤维细胞的细胞毒性有限。在C2C12肌母细胞中,YSR734激活肌肉特异性生物标志物肌生成素/Cav3,从而有效诱导其分化为肌管(可应用于杜氏肌营养不良症)。当前研究集中在改善其体内ADME特性,以开发临床前共价HDAC抑制剂。[1]
YSR734(化合物21)是一种首创的共价HDAC抑制剂,具有2-氨基苯基氨基酸锌离子螯合物和五氟苯磺酰胺电离剂。该化合物对HDAC1、HDAC2和HDAC3表现出强效活性,IC50值分别为110 nM、154 nM和143 nM。YSR734诱导白血病细胞的凋亡并诱导肌母细胞分化,且用于杜氏肌营养不良症的研究。该化合物在主要文献中被引用(《药物化学杂志》,2023)。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H23F5N4O5S
分子量
598.54
精确质量
598.13093
CAS号
3032969-58-4
PubChem CID
170453116
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.5
tPSA
139Ų
SMILES
C1CN(CCC1OC(=O)NCC2=CC=C(C=C2)C(=O)NC3=CC=CC=C3N)S(=O)(=O)C4=C(C(=C(C(=C4F)F)F)F)F
InChi Key
JGJZNWDPKNHILY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H23F5N4O5S/c27-19-20(28)22(30)24(23(31)21(19)29)41(38,39)35-11-9-16(10-12-35)40-26(37)33-13-14-5-7-15(8-6-14)25(36)34-18-4-2-1-3-17(18)32/h1-8,16H,9-13,32H2,(H,33,37)(H,34,36)
化学名
[1-(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl] N-[[4-[(2-aminophenyl)carbamoyl]phenyl]methyl]carbamate
别名
YSR734; YSR-734; YSR 734
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~167.07 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (8.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,您可以添加 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液,并将其添加到 900 μL 玉米油中并充分混合。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6707 mL 8.3537 mL 16.7073 mL
5 mM 0.3341 mL 1.6707 mL 3.3415 mL
10 mM 0.1671 mL 0.8354 mL 1.6707 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们