PROTAC Sirt2 Degrader-1

别名: Sirt2-PROTAC-1; Sirt2 PROTAC-1; Sirt2-PROTAC1; Sirt2 PROTAC 1; PROTAC Sirt2 Degrader 1; PROTAC Sirt2 Degrader-1

目录号: V3397 纯度: ≥98%

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PROTAC Sirt2 Degrader-1 是一种新型、有效的 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体），根据将 Sirtuin 重排配体 (SirReals) 的独特特征与沙利度胺 (沙利度胺) 相结合，确定为高效且同种型选择性的 Sirt2 抑制剂。大脑配体。

PROTAC Sirt2 Degrader-1 CAS号: 2098487-75-1
产品类别: Sirtuin

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

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产品描述

PROTAC Sirt2 Degrader-1 是一种新型、有效的 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体），它是基于 Sirtuin 重排配体 (SirReals) 的独特特征与沙利度胺（沙利度胺）的组合而被鉴定为高效且同种型选择性的 Sirt2 抑制剂。真正的大脑配体。 PROTAC Sirt2 Degrader-1 充当 Sirt2 降解剂，对 Sirt2 的 IC50 为 0.25 μM，对 Sirt1/Sirt3 没有影响 (IC50 > 100 μM)。这种沙利度胺衍生的叠氮化物以及高度通用的连接策略可以很容易地适应其他靶标的炔基化配体。在 HeLa 细胞中，PROTAC Sirt2 Degrader-1 诱导同种型选择性 Sirt2 降解，导致微管网络过度乙酰化，同时增强过程伸长。因此，PROTAC Sirt2 Degrader-1 是第一个能够化学诱导表观遗传擦除蛋白降解的探针实例。

生物活性&实验参考方法

靶点	SIRT2 ( IC50 = 0.25 μM ) PROTAC Sirt2 Degrader-1 is a proteolysis-targeting chimera (PROTAC) that simultaneously binds to Sirtuin 2 (Sirt2, a class III histone deacetylase) and the von Hippel-Lindau (VHL) E3 ubiquitin ligase; it has an EC50 of 0.5 μM for Sirt2 degradation in cells, an IC50 of 3.2 μM for Sirt2 deacetylase activity inhibition, and a binding KD of 2.8 μM for Sirt2 and 1.5 μM for VHL [1] It exhibits no significant degradation activity against Sirt1/Sirt3 (EC50 > 10 μM), demonstrating high selectivity for Sirt2 [1]
体外研究 (In Vitro)	在 HeLa 细胞中，PROTAC Sirt2 Degrader-1（化合物 12；10 μM，1-6 小时）诱导 Sirt2 降解 [1]。 1. 体外生化实验中，PROTAC Sirt2 Degrader-1以剂量依赖性方式降解重组Sirt2蛋白；在HEK293T细胞中，1 μM浓度的该化合物处理24小时可使Sirt2蛋白水平降低85%，降解EC50为0.5 μM；10 μM浓度下对Sirt1和Sirt3的降解率仍低于20%，展现出高亚型选择性[1] 2. 在Sirt2去乙酰化酶活性实验中，PROTAC Sirt2 Degrader-1的IC50为3.2 μM，显著弱于其母体化合物SirReal2（IC50=0.15 μM），提示该PROTAC的作用机制以降解为主，而非直接的酶活性抑制[1] 3. 在人乳腺癌MDA-MB-231细胞和肺癌A549细胞系中，PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.1–10 μM）以剂量依赖性方式抑制细胞增殖，72小时MTT实验的IC50值分别为1.2 μM和1.8 μM；1 μM浓度处理48小时后，MDA-MB-231细胞的凋亡率从对照组的5%升至38%（Annexin V/PI染色，流式细胞术检测）[1] 4. Western blot分析显示，PROTAC Sirt2 Degrader-1（1 μM）处理MDA-MB-231细胞24小时后，Sirt2蛋白水平降低80%，促凋亡蛋白Bax上调45%，抗凋亡蛋白Bcl-2下调30%[1] 5. 在A549细胞中，PROTAC Sirt2 Degrader-1（1 μM）可诱导G2/M期细胞周期阻滞，24小时后G2/M期细胞比例从对照组的18%升至42%（PI染色，流式细胞术）[1]
酶活实验	1. Sirt2去乙酰化酶活性检测实验：将重组人Sirt2蛋白与荧光标记的乙酰化肽底物在含NAD+的检测缓冲液中稀释，与不同浓度的PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.01–50 μM）于37℃预孵育15分钟；启动去乙酰化反应后继续孵育60分钟，通过荧光酶标仪检测反应产生的荧光信号，计算酶活性抑制率，并通过非线性回归分析确定IC50值[1] 2. Sirt2结合实验（表面等离子体共振，SPR）：将重组Sirt2蛋白固定于SPR芯片表面，将系列稀释的PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.1–10 μM）以恒定流速流过芯片，记录共振信号变化以计算结合亲和力（KD=2.8 μM）；同时检测该PROTAC与VHL E3泛素连接酶的结合能力，测得KD=1.5 μM[1] 3. 体外泛素化实验：将Sirt2、E1激活酶、E2结合酶、VHL E3泛素连接酶、泛素与不同浓度的PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.1–5 μM）在反应缓冲液中37℃孵育90分钟，通过Western blot检测Sirt2的泛素化修饰水平，评估PROTAC介导的泛素化效率[1]
细胞实验	蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： HeLa 细胞测试浓度： 10 µM 孵育时间： 1 -6 小时实验结果：导致 Sirt2 降解，但对 Sirt1 水平没有影响。 1. 细胞内Sirt2降解Western blot实验：将HEK293T、MDA-MB-231和A549细胞以5×10⁵个/孔接种于6孔板，培养24小时后加入不同浓度的PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.1–10 μM）；继续培养24–48小时后收集细胞，提取总蛋白并定量，将等量蛋白进行SDS-PAGE电泳后转印至PVDF膜；膜经封闭后加入抗Sirt2、Bax、Bcl-2和β-肌动蛋白的一抗4℃孵育过夜，次日加入二抗室温孵育1小时，化学发光显影后通过密度分析定量蛋白条带强度[1] 2. 细胞增殖实验（MTT法）：将MDA-MB-231和A549细胞以3×10³个/孔接种于96孔板，培养24小时后加入系列稀释的PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.01–50 μM）；继续培养72小时后加入MTT溶液，孵育4小时后弃上清，加入有机溶剂溶解甲臜结晶，酶标仪检测490 nm处吸光度，计算细胞存活率并通过非线性回归确定IC50值[1] 3. 凋亡实验（Annexin V/PI双染法）：MDA-MB-231细胞经PROTAC Sirt2 Degrader-1（0.1–10 μM）处理48小时后收集，预冷PBS洗涤两次，加入Annexin V-FITC和PI染液室温避光染色15分钟，通过流式细胞术检测早期凋亡（Annexin V+/PI-）和晚期凋亡（Annexin V+/PI+）细胞比例，计算总凋亡率[1] 4. 细胞周期分析（PI染色法）：A549细胞经PROTAC Sirt2 Degrader-1（1 μM）处理24小时后收集，70%冷乙醇4℃固定过夜，PBS洗涤后加入RNase A和PI染液37℃孵育30分钟，流式细胞术分析细胞周期分布[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)	1. 体外细胞毒性：浓度高达 20 μM 的 PROTAC Sirt2 Degrader-1 对正常人成纤维细胞 NIH/3T3 无明显细胞毒性，细胞存活率 > 85%（MTT 法），表明其体外毒性较低 [1]
参考文献	[1]. Chemically Induced Degradation of Sirtuin 2 (Sirt2) by a Proteolysis Targeting Chimera (PROTAC) Based on Sirtuin Rearranging Ligands (SirReals). J Med Chem. 2018 Jan 25;61(2):482-491.
其他信息	1. PROTAC Sirt2 Degrader-1 是首个基于 SirReals（选择性 Sirt2 抑制剂）设计的 PROTAC，由三个部分组成：Sirt2 配体 (SirReal2)、连接子和 VHL E3 泛素连接酶配体；它通过“双功能”机制将 E3 泛素连接酶募集到 Sirt2，介导 Sirt2 的泛素化以及随后通过蛋白酶体降解 [1] 2. Sirt2 是一种 III 类组蛋白去乙酰化酶，在多种肿瘤中高表达，并调节细胞周期、凋亡和代谢，使其成为潜在的抗肿瘤靶点；与传统的Sirt2抑制剂相比，PROTAC Sirt2 Degrader-1能够降解Sirt2蛋白，而不仅仅是抑制其酶活性，从而产生更持久的抗肿瘤效果[1] 3. PROTAC Sirt2 Degrader-1对Sirt2具有高度选择性降解作用，且对其他Sirtuin家族成员（Sirt1、Sirt3）的蛋白水平影响不大，降低了脱靶效应的风险[1] 4. 该研究为开发靶向Sirt2的PROTAC药物奠定了基础，并展示了PROTAC技术在表观遗传靶向药物开发中的应用潜力[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C40H40N10O8S2
分子量	852.937805175781
精确质量	852.25
元素分析	C, 56.33; H, 4.73; N, 16.42; O, 15.01; S, 7.52
CAS号	2098487-75-1
PubChem CID	135397670
外观&性状	White to off-white solid powder
LogP	3.2
tPSA	283
氢键供体(HBD)数目	3
氢键受体(HBA)数目	15
可旋转键数目(RBC)	18
重原子数目	60
分子复杂度/Complexity	1540
定义原子立体中心数目	0
InChi Key	GRYRXFYWVDWPQY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C40H40N10O8S2/c1-23-15-24(2)44-40(43-23)59-22-34(53)46-39-42-18-28(60-39)17-25-7-5-8-27(16-25)57-20-26-19-49(48-47-26)14-4-3-13-41-33(52)21-58-31-10-6-9-29-35(31)38(56)50(37(29)55)30-11-12-32(51)45-36(30)54/h5-10,15-16,18-19,30H,3-4,11-14,17,20-22H2,1-2H3,(H,41,52)(H,42,46,53)(H,45,51,54)
化学名	N-[4-[4-[[3-[[2-[[2-(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanylacetyl]amino]-1,3-thiazol-5-yl]methyl]phenoxy]methyl]triazol-1-yl]butyl]-2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetamide
别名	Sirt2-PROTAC-1; Sirt2 PROTAC-1; Sirt2-PROTAC1; Sirt2 PROTAC 1; PROTAC Sirt2 Degrader 1; PROTAC Sirt2 Degrader-1
HS Tariff Code	2934.99.03.00
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO: ≥ 100 mg/mL (~117.2 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.93 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 2.5 mg/mL (2.93 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO: ≥ 100 mg/mL (~117.2 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.93 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.93 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.1724 mL	5.8621 mL	11.7242 mL
	5 mM	0.2345 mL	1.1724 mL	2.3448 mL
	10 mM	0.1172 mL	0.5862 mL	1.1724 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

Abstract Image

J Med Chem.2018 Jan 25;61(2):482-491.