PT2399

别名: PT2399 PT-2399 PT 2399 PT2399 | HIF/HIF Prolyl-Hydroxylase
目录号: V13346 纯度: ≥98%
PT2399 是一种新型、有效、口服生物可利用的 HIF-2 小分子抑制剂,它与 HIF-2α PAS B 结构域结合,IC50 为 6 nM,在体内表现出有效的抗肿瘤活性。
PT2399 CAS号: 1672662-14-4
产品类别: HIF
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • Rac-PT2399
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
PT2399 是一种新型、高效且口服生物利用度高的 HIF-2 小分子抑制剂,它能与 HIF-2α PAS B 结构域结合,IC50 值为 6 nM,并在体内表现出强大的抗肿瘤活性。它能选择性地破坏 HIF-2α 与 HIF-1β 的异二聚化。临床前和临床数据表明,PT2399 能有效抑制透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 的癌细胞生长、增殖和肿瘤血管生成。
PT2399(CAS 编号:1672662-14-4)是一种高效且口服生物利用度高的缺氧诱导因子 2α (HIF-2α) 拮抗剂。其分子式为 C18H12F3NO5S,分子量为 411.35 g/mol。 PT2399 选择性地破坏 HIF-2α 与 HIF-1β (ARNT) 的异二聚化,IC50 为 6 nM。该化合物直接与 HIF-2α 的 PAS-B 结构域结合。它在体内显示出强大的抗肿瘤活性。PT2399 可抑制 786-O VHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 细胞中多种 HIF 靶基因的表达,但不抑制 HIF-1α 特异性靶基因,例如 BNIP3。在 pVHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌的临床前小鼠模型中,PT2399 可导致肿瘤消退。
生物活性&实验参考方法
靶点
PT2399's primary target is hypoxia-inducible factor 2α (HIF-2α), a transcription factor that plays a key role in cellular responses to hypoxia. It binds directly to the HIF-2α PAS-B domain with an IC50 of 6 nM. By binding to this domain, it selectively disrupts the heterodimerization of HIF-2α with HIF-1β (ARNT). This prevents the formation of the active HIF-2 transcriptional complex, thereby reducing the expression of HIF-2 target genes such as VEGF, SERPINE1, IGFBP3, CCND1, TGFA, and SLC2A1. PT2399 does not suppress HIF-1α-specific targets such as CA9, PGK1, and LDHA, demonstrating its selectivity for HIF-2α over HIF-1α.
体外研究 (In Vitro)
PT2399(化合物 10f)抑制 HIF-2α 的 IC50 为 6 nM [3]。由于 PT2399 可抑制 HIF 转位 -2α-/- 786-O 细胞和其他经测试的 HIF-2α 细胞系,因此 PT2399 (20 μM) 可能诱导脱靶损伤。它直接与 HIF-2α 的 PAS B 结构域结合,其结合能力优于 HIF-2α 与芳烃受体核转运蛋白 (ARNT) 的结合能力 [2]。在软琼脂中,PT2399 (0.2-2 μM) 可抑制 786-O VHL/(0-21 天) 细胞的增殖,并阻止 786-O 细胞的发育 [2]。在透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 细胞中,包括 BNIP3 在内的许多 HIF 靶基因并不抑制 HIF-1α 的潜在靶基因 [2]。体外实验表明,PT2399 是一种强效的 HIF-2α 拮抗剂,IC50 值为 6 nM。它能选择性地破坏 HIF-2α 与 HIF-1β 的异二聚化。PT2399 可抑制 786-O VHL 缺陷型 ccRCC 细胞中多种 HIF 靶基因的表达,但并不抑制 HIF-1α 特异性靶基因,例如 BNIP3。它能降低 HIF-2 靶基因(VEGF、SERPINE1、IGFBP3、CCND1、TGFA 和 SLC2A1)的表达,但对 HIF-1 靶基因(CA9、PGK1 和 LDHA)的表达没有影响。该化合物特异性地解离 HIF-2 复合物,但对 HIF-1 复合物没有影响。浓度为 20 µM 时,PT2399 可引起脱靶损伤。
体内研究 (In Vivo)
PT2399 可降低肾细胞癌 (RCC) 小鼠的肿瘤细胞密度并增加纤维化 [1]。PT2399(100 mg/kg;侧壁灌胃;每 12 小时一次)的活性高于 SU 11248,并能抑制 RCC 荷瘤细胞中的多种相互作用。PT2399 可直接抑制原发性和转移性 pVHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 中的 HIF-2α,并在临床前模型中导致肿瘤消退 [2]。SU 11248 则可促进肿瘤生长 [1]。
在体内,PT2399 可直接抑制 HIF-2α,并在原发性和转移性 pVHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌的临床前小鼠模型中引起肿瘤消退。在荷瘤小鼠中,PT2399 可抑制肿瘤细胞增殖 3.5 倍。PT2399 在体内显示出强大的抗肿瘤活性。其口服给药特性使其适用于临床治疗。人们研究了该化合物在治疗透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 方面的潜力,该癌的特征是 VHL 丢失和 HIF-2α 激活。
酶活实验
PT2399 的体外活性可通过多种生化和细胞实验进行评估。结合实验中,可采用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 测定 PT2399 与 HIF-2α PAS-B 结构域的结合亲和力。功能实验中,将 786-O VHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 细胞用不同浓度的 PT2399(通常为 0.1-100 µM)处理 24-72 小时。采用 qPCR 或蛋白质印迹法分析 HIF 靶基因(例如 VEGF、SERPINE1、CCND1)的表达。HIF-2α/ARNT 异二聚体的破坏情况可通过共免疫沉淀或邻位连接分析进行评估。
细胞实验
细胞活力检测[1]
细胞类型: 786-O 细胞
测试浓度: 0 μM、0.2 μM、2 μM
孵育时间: 0-21 天
实验结果: 0.2-2 μM 浓度可抑制 786-O 细胞在软琼脂中的生长。
细胞实验采用 786-O VHL 缺陷型透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 细胞和其他癌细胞系。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的 PT2399(通常为 0.1-100 µM)处理特定时间(24-72 小时)。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 检测评估细胞活力。通过检测 caspase-3/7 活性或使用 Annexin V/PI 染色进行流式细胞术分析来评估细胞凋亡。采用qPCR分析HIF靶基因的表达。采用碘化丙啶染色流式细胞术分析细胞周期进程。比较对HIF-2α和HIF-1α活性的影响以验证其选择性。
动物实验
动物/疾病模型:小鼠肾细胞癌肿瘤移植模型[1]
剂量:100 mg/kg
给药途径:口服(po);每12小时一次
实验结果:活性高于SU 11248,并能抑制多种SU 11248耐药肿瘤的生长。
在体内,PT2399通常以口服方式给药于肾细胞癌小鼠模型。该化合物配制于合适的载体中(例如,0.5%甲基纤维素或PEG400和水的混合物),并以不同剂量(通常为10-100 mg/kg)每日一次或两次给药。通过测量肿瘤体积来监测肿瘤生长。研究结束时,切除肿瘤组织,并通过qPCR分析HIF靶基因的表达,并通过TUNEL或免疫组化分析细胞凋亡情况。可在给药后不同时间点采集血液和肿瘤组织进行药效学研究。
药代性质 (ADME/PK)
PT2399 可口服。其分子量为 411.35 g/mol,分子式为 C18H12F3NO5S。该化合物可溶于 DMSO。为保持其稳定性,应在 -20°C 的适宜条件下储存。所提供的检索结果中未包含具体的药代动力学数据(吸收、分布、代谢、排泄)。其半衰期和生物利用度需要进一步研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
所提供的搜索结果中没有关于PT2399的具体毒性数据。体外研究表明,20 µM的PT2399可诱导脱靶损伤,提示高浓度可能产生非特异性效应。由于该化合物对HIF-2α具有选择性,预计其在治疗剂量下具有良好的耐受性。然而,长期抑制HIF-2α可能会影响依赖于HIF-2信号通路的正常生理过程,包括红细胞生成和血管功能。需要进行全面的毒理学研究以确定其完整的安全性。
参考文献

[1]. Targeting renal cell carcinoma with a HIF-2 antagonist. Nature. 2016 Nov 3;539(7627):112-117.

[2]. On-Target Efficacy of a HIF2α Antagonist in Preclinical Kidney Cancer Models. Nature. Nature. 2016 Nov 3;539(7627):107-111.

[3]. Design and Activity of Specific Hypoxia-Inducible Factor-2α (HIF-2α) Inhibitors for the Treatment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Discovery of Clinical Candidate (S)-3-((2,2-Difluoro-1-hydroxy-7-(methylsulfonyl)-2,3-dihydro-1 H-inden-4-yl)oxy)-5-fluorobenzonitrile (PT2385). J Med Chem. 2018 Nov 8;61(21):9691-9721.

其他信息
PT2399 是一种研究化合物,已被开发为一种强效且选择性的 HIF-2α 拮抗剂,用于治疗透明细胞肾细胞癌 (ccRCC)。ccRCC 的特征是 VHL 缺失,这会导致 HIF-2α 的组成型激活,使其成为关键的致癌驱动因子。PT2399 直接与 HIF-2α 的 PAS-B 结构域结合,并破坏其与 ARNT 的异二聚化,从而抑制 HIF-2 靶基因的表达。该化合物在临床前模型中显示出强大的抗肿瘤活性,可导致肿瘤消退。PT2399 尚未获准用于临床,仅供研究用途。可从化学品供应商处获得,用于研究应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H10F5NO4S
分子量
419.322620868683
精确质量
419.03
元素分析
C, 48.69; H, 2.40; F, 22.65; N, 3.34; O, 15.26; S, 7.65
CAS号
1672662-14-4
相关CAS号
(Rac)-PT2399;1672662-07-5
PubChem CID
91663289
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.3
tPSA
95.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
734
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1C2=C(C=CC(=C2[C@@H](C1(F)F)O)S(=O)(=O)C(F)F)OC3=CC(=CC(=C3)C#N)F
InChi Key
MXUSGDMIHGLCNC-HNNXBMFYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H10F5NO4S/c18-9-3-8(7-23)4-10(5-9)27-12-1-2-13(28(25,26)16(19)20)14-11(12)6-17(21,22)15(14)24/h1-5,15-16,24H,6H2/t15-/m0/s1
化学名
3-[(1S)-7-(Difluoromethylsulfonyl)-2,2-difluoro-1-hydroxy-indan-4-yl]oxy-5-fluoro-benzonitrile
别名
PT2399 PT-2399 PT 2399
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 200 mg/mL (~476.96 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3848 mL 11.9241 mL 23.8481 mL
5 mM 0.4770 mL 2.3848 mL 4.7696 mL
10 mM 0.2385 mL 1.1924 mL 2.3848 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • a, Mean change in mouse body weights after treatment with vehicle (veh; n = 89), PT2399 (100 mg/kg) by oral gavage every 12 hours (PT; n = 96), or sunitinib (10 mg/kg) by oral gavage every 12 hours (Sun; n = 82). b, Hemoglobin levels, reticulocyte counts, and erythropoietin (EPO) levels in mice treated as indicated. (Hemoglobin and reticulocytes vehicle n = 52, PT2399 n = 58, sunitinib n = 53; EPO vehicle n = 63, PT2399 n = 74, sunitinib n = 61). c, Mean percent change in tumor volume in mice treated with vehicle (n = 89), PT2399 (n = 96), or sunitinib (n = 82). d, Growth curves of each tumorgraft line grouped according to PT2399 responsiveness into sensitive (GI [growth inhibition] at end of trial >80%), intermediate (GI=40%-80%), or resistant (GI<40%). Treatment starts on day 0 and values represent mean tumor volume +/− s.e.m. To minimize bias (despite overestimation) volumes calculated as length×width×height. Each XP had n ~ 3–5 tumors per treatment group (vehicle n = 89, PT2399 n = 96, sunitinib n = 82). a–c, Tests completed using a mixed model with compound symmetrical covariance structure for mice in the same tumourgraft line using vehicle as the reference group. **, p < 0.01; ***, p < 0.001; and ****, p < 0.0001.[1]. Targeting renal cell carcinoma with a HIF-2 antagonist. Nature. 2016 Nov 3;539(7627):112-117.
  • a, Immunoprecipitation of HIF-1β from tumor lysates of sensitive (XP373), intermediate (XP391), and resistant (XP506 and XP169) tumors from mice treated with either vehicle (Veh) or PT2399. (Samples are labeled with “V” for vehicle-treated or “P” for PT2399-treated followed by the mouse identifier.) b, Proximity ligation assay detecting either HIF-2α + HIF-1β or HIF-1α + HIF-1β heterodimers from vehicle- or PT2399-treated sensitive (XP374) or resistant (XP296) tumors and summary of results across responsive and resistant tumorgrafts. (Images representative of quantitative data shown in graph.) Summary includes analyses from 11 vehicle-treated tumors and 11 PT2399-treated tumors (3 fields were analyzed for each sample) in 5 sensitive, 3 intermediate, and 3 resistant tumorgraft trials. Scale bars = 20 µM. c, qRT-PCR for the indicated HIF-2 target genes in PT2399 sensitive, intermediate, and resistant tumors treated with vehicle (blue), PT2399 (red), or sunitinib (green). HIF-1 target genes CA9, PGK1, and LDHA included as negative controls. Excepting PGK1 and LDHA, samples were available for n = 58 vehicle-treated tumors (Sensitive: n = 11; Intermediate: n = 21; Resistant: n = 26), n = 62 PT2399-treated tumors (Sensitive: n = 15; Intermediate: n = 21; Resistant: n = 26), and n = 52 sunitinib-treated tumors (Sensitive: n = 10; Intermediate: n = 23; Resistant: n = 19). PGK1 and LDHA were available for 24 tumors for each treatment group (Sensitive: n = 6; Intermediate: n = 8; Resistant: n = 10).[1]. Targeting renal cell carcinoma with a HIF-2 antagonist. Nature. 2016 Nov 3;539(7627):112-117.
  • a, Tumor volumes from a cohort of mice of the XP164 tumorgraft line treated with vehicle (blue lines, n=2; V3286 and V3299); sunitinib until the development of resistance (green lines, n = 2; S3295 and S3296; compare to Fig. 1d); or PT2399 (red lines, n = 2; P3283 and P3288). b, Circulating human VEGF levels in mice treated for the indicated number of days (d) showing increased tumor-produced VEGF with development of resistance (all bars, n = 2). c, Bidirectional chromatograms from tumorgrafts developing resistance compared to controls: P3283 (c.968G>A in EPAS1 [HIF2A] leading to a G323E) and P5123 (derived from P3288; c.1338C>A in ARNT [HIF1B] leading to a F446L). d, Crystal structure of PAS-B domains from HIF-2α bound to HIF-1β (PDB entry 4ZP428) highlighting side chains of G323 (lining opening of PT2399 binding pocket in HIF-2α) and F446 (in HIF-1β at the interface with HIF-2α). In another structure (PDB entry 4GHI18) quaternary arrangement between HIF-2α and HIF-1β PAS-B domains differs, but F446 remains at the interface.[1]. Targeting renal cell carcinoma with a HIF-2 antagonist. Nature. 2016 Nov 3;539(7627):112-117.
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