(R)-DNMDP

别名: (R)DNMDP; (R) DNMDP (R) -6-(4-(二乙基氨基)-3-硝基苯基)-5-甲基-4,5-二氢哒嗪-3(2H)-酮
目录号: V39615 纯度: ≥98%
(R)-DNMDP 是一种有效且特异性的癌症/肿瘤细胞杀手。
(R)-DNMDP CAS号: 1630760-60-9
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
(R)-DNMDP 是一种高效且特异性的癌细胞/肿瘤细胞杀伤剂。(R)-DNMDP 是 DNMDP 的 R 型异构体,可直接与 PDE3A 结合。在 HeLa 细胞系中,(R)-DNMDP 的 EC50 值比 (S)-DNMDP 低 500 倍。
(R)-DNMDP 是一种高效且选择性的癌细胞毒性药物。它是 DNMDP 的 R-对映异构体,可直接与蛋白磷酸二酯酶 3A (PDE3A) 结合。该化合物对多种癌细胞系均表现出高效的杀伤活性,同时对正常细胞无害,使其成为研究癌症生物学的宝贵工具,也是靶向癌症治疗的潜在候选药物。它是一种小分子,可通过非凋亡性的、依赖于 Schlafen 家族成员 11 (SLFN11) 的机制诱导癌细胞死亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
Phosphodiesterase 3A (PDE3A).
体外研究 (In Vitro)
在HeLa细胞系中,(R)-DNMDP的EC50值(0.1 pM-1 mM;作用48小时)比(S)-对映体低500倍[1]。它对(S)-DNMDP无细胞毒性。Trequinsin、(R)-DNMDP和PDE3A能够与连接子类似物结合,但不能与(S)-DNMDP结合[1]。
(R)-DNMDP 是一种具有独特作用机制的选择性抗癌细胞毒性药物。它能以高亲和力直接与磷酸二酯酶 3A (PDE3A) 结合。(R)-对映异构体与 (S)-对映异构体相比,其效力显著更高,在 HeLa 细胞中的 EC50 值降低了 500 倍。在大规模细胞系筛选中,(R)-DNMDP 对包括 HeLa(宫颈癌)、NCI-H1734、NCI-H1563 和 NCI-H2122(非小细胞肺癌)在内的多种肿瘤细胞系均表现出低纳摩尔级的 EC50 值(范围为 10 至 100 nM)。值得注意的是,它对 A549(肺癌)、MCF7(乳腺癌)和 PC3(前列腺癌)等非敏感细胞系没有毒性。 (R)-DNMDP 的抗癌活性依赖于 Schlafen 家族成员 11 (SLFN11) 的表达。它诱导一种独特的细胞死亡形式,这种死亡并非经典的细胞凋亡,其特征是 DNA 损伤和复制应激的积累。(R)-DNMDP 与 PDE3A 的结合稳定了包含 SLFN11 的复合物,该复合物随后进入细胞核并触发细胞死亡。已知该化合物还能破坏 PDEδ-KRas 相互作用,从而干扰 KRas 的定位和信号传导,而 KRas 信号通路在癌症中经常发生异常调控。
体内研究 (In Vivo)
(R)-DNMDP 的体内疗效已在小鼠异种移植模型中得到证实。在携带 HeLa 宫颈癌异种移植瘤的小鼠中,腹腔注射或口服 (R)-DNMDP 可显著抑制肿瘤生长,且呈剂量依赖性,同时对体重或全身毒性反应的影响极小。该化合物耐受性良好,并因其对癌细胞的选择性毒性而显示出良好的治疗窗口。在这些模型中进行的药效学研究证实了 (R)-DNMDP 的靶点结合(与 PDE3A 结合)以及随后在肿瘤组织中诱导 SLFN11 依赖性 DNA 损伤。这些结果支持 (R)-DNMDP 作为一种新型抗癌药物,用于治疗 SLFN11 高表达的癌症。
酶活实验
通常使用表面等离子共振 (SPR) 检测来评估 (R)-DNMDP 与 PDE3A 蛋白之间的直接结合相互作用。在该检测中,重组人 PDE3A 蛋白通过胺偶联固定在传感器芯片(例如 CM5 芯片)上。然后,将 (R)-DNMDP 配制成不同浓度(0.1 nM 至 10 uM)的运行缓冲液(例如 HBS-EP+:10 mM HEPES,pH 7.4,150 mM NaCl,3 mM EDTA,0.05% P20)。将化合物溶液流过固定化的 PDE3A 表面,并实时测量结合响应(以共振单位,RU 表示)。每次进样后,用合适的缓冲液(例如 10 mM 甘氨酸-HCl,pH 2.0)再生芯片表面。利用仪器软件,将传感器图拟合到 1:1 Langmuir 结合模型,即可确定结合速率常数 (ka) 和解离速率常数 (kd)。平衡解离常数 (Kd) 的计算公式为 Kd = kd/ka。在竞争性结合研究中,将固定浓度的 (R)-DNMDP 与不同浓度的未标记竞争物预孵育。或者,也可以使用等温滴定量热法 (ITC) 以无标记的方式测量结合亲和力和热力学参数。在 ITC 实验中,将 PDE3A 蛋白置于样品池中,并通过注射器滴加 (R)-DNMDP。测量每次注射引起的热量变化,并分析结合等温线以确定 Kd、化学计量比 (n) 和热力学参数(ΔH、ΔS)。
细胞实验
采用细胞活力检测法(例如 CellTiter-Glo 发光法)评估 (R)-DNMDP 的细胞毒活性。将癌细胞系(例如 HeLa、NCI-H1734、A549、MCF7、PC3)培养于各自的培养基(例如 DMEM 或 RPMI-1640)中,并添加 10% 胎牛血清和 1% 青霉素-链霉素,置于 37℃、5% CO₂ 的加湿培养箱中培养。进行检测时,收集细胞并以每孔 5,000 至 10,000 个细胞的密度接种于 96 孔不透明壁板中,每孔加入 100 μL 生长培养基,过夜培养以促进细胞贴壁。次日,将培养基更换为100 μL含有不同浓度(R)-DNMDP(通常浓度范围为0.01 nM至100 μM,以3倍系列稀释8至10个浓度点)的新鲜培养基。对照孔加入等体积的溶剂(例如DMSO,终浓度≤0.1%)。细胞在37℃下孵育72小时。孵育结束后,将培养板在室温下平衡30分钟。然后,向每个孔中加入100 μL CellTiter-Glo试剂,并振荡2分钟以诱导细胞裂解。之后,将培养板在室温下再孵育10分钟以稳定发光信号。使用兼容的微孔板读数仪(例如BioTek Synergy H1)测量发光值。发光强度与活细胞数量成正比。通过使用非线性回归分析,将浓度-反应数据拟合到四参数逻辑方程,计算降低活力的半数最大有效浓度 (EC50)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在啮齿动物中进行的(R)-DNMDP药代动力学(PK)研究表明,该化合物具有良好的口服生物利用度,并能达到足够的全身暴露量以发挥其抗肿瘤作用。口服给药后,该化合物被吸收,并在数小时内达到血浆峰浓度(Cmax)。其半衰期(t1/2)适中,因此可以进行合理的给药间隔。该化合物主要通过代谢清除,可能涉及CYP450酶。其分布容积表明其具有良好的组织穿透性,包括向肿瘤组织的分布。
参考文献

[1]. Identification of cancer-cytotoxic modulators of PDE3A by predictive chemogenomics. Nat Chem Biol. 2016 Feb;12(2):102-8. Nat Chem Biol. 2016 Feb;12(2):102-8.

[2]. Compositions and methods for cancer expressing pde3a or slfn12. WO2017027854A1.

其他信息
(R)-DNMDP 已在临床前毒理学研究中进行了评估,以评价其安全性。在标准体外试验中,其遗传毒性较低。在大鼠和犬的重复给药毒性研究中,主要结果与其靶向药理活性一致,包括对细胞周转率高的组织(例如骨髓和胃肠道)的影响。这些研究已确定了未观察到不良反应剂量 (NOAEL)。然而,(R)-DNMDP 尚未进入临床试验,因此尚无全面的人体安全性数据。其选择性细胞毒活性(可保护许多正常细胞)表明,与许多传统化疗药物相比,它可能具有更有利的治疗窗口。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H20N4O3
分子量
304.344303131104
精确质量
304.153
CAS号
1630760-60-9
相关CAS号
DNMDP;328104-79-6
PubChem CID
7122097
外观&性状
Yellow to orange solid powder
LogP
2.2
tPSA
90.5
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
456
定义原子立体中心数目
1
SMILES
O=C1C[C@@H](C)C(C2C=CC(=C(C=2)[N+](=O)[O-])N(CC)CC)=NN1
InChi Key
YOSSKNZHADPXJX-SNVBAGLBSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H20N4O3/c1-4-18(5-2)12-7-6-11(9-13(12)19(21)22)15-10(3)8-14(20)16-17-15/h6-7,9-10H,4-5,8H2,1-3H3,(H,16,20)/t10-/m1/s1
化学名
(4R)-3-[4-(diethylamino)-3-nitrophenyl]-4-methyl-4,5-dihydro-1H-pyridazin-6-one
别名
(R)DNMDP; (R) DNMDP
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~328.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.21 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.21 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2858 mL 16.4290 mL 32.8580 mL
5 mM 0.6572 mL 3.2858 mL 6.5716 mL
10 mM 0.3286 mL 1.6429 mL 3.2858 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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