(R)-eIF4A3-IN-2

目录号: V41750 纯度: ≥98%
(R)-eIF4A3-IN-2 是 eIF4A3-IN-2 活性较低的异构体。
(R)-eIF4A3-IN-2 CAS号: 2095484-82-3
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
(R)-eIF4A3-IN-2 是 eIF4A3-IN-2 的活性较低的异构体。eIF4A3-IN-2 是真核起始因子 4A-3 (eIF4A3) 的选择性非竞争性抑制剂,IC50 为 110 nM。
(R)-eIF4A3-IN-2 是 eIF4A3-IN-2 的低活性对映体。活性对映体是一种高选择性、非竞争性真核起始因子 4A-3 (eIF4A3) 抑制剂,IC50 值为 110 nM。eIF4A3 是一种 RNA 解旋酶,参与 mRNA 剪接和无义介导的 mRNA 降解 (NMD)。该化合物被用作研究 eIF4A3 功能及其在癌症生物学中作用的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Eukaryotic initiation factor 4A-3 (eIF4A3). eIF4A3 is a member of the DEAD-box RNA helicase family and is a core component of the exon junction complex (EJC), which is deposited on mRNAs after splicing. eIF4A3 plays critical roles in mRNA splicing, export, translation, and nonsense-mediated decay (NMD). The active enantiomer (eIF4A3-IN-2) binds noncompetitively and selectively to eIF4A3, inhibiting its ATPase and helicase activities. (R)-eIF4A3-IN-2 is the inactive enantiomer used as a negative control.
体外研究 (In Vitro)
Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) 盒家族腺苷三磷酸 (ATP) 依赖性 RNA 解旋酶被称为真核起始因子 4A-3 (eIF4A3) [1]。
在无细胞生化分析中,eIF4A3-IN-2 以 110 nM 的 IC50 值抑制 eIF4A3 的 ATPase 和解旋酶活性。该抑制作用对 ATP 为非竞争性抑制,意味着该抑制剂结合于一个不同于 ATP 结合位点的位点。eIF4A3-IN-2 具有很高的特异性,对其他 DEAD-box 解旋酶的活性极低。(R)-对映异构体的抑制活性显著降低;(R)-对映异构体的精确 IC50 值尚未公开。该化合物影响 eIF4A3 对 RNA 的结合和解旋。
体内研究 (In Vivo)
由于(R)-eIF4A3-IN-2是活性较低的对映体,常被用作对照,因此针对该化合物的细胞活性检测报道较少。活性对映体eIF4A3-IN-2可抑制细胞内eIF4A3的功能,进而影响mRNA剪接和无义介导的mRNA降解(NMD)过程。抑制eIF4A3可降低NMD敏感转录本的表达,并改变可变剪接模式。(R)-对映体的细胞活性预计极低,因此可作为区分靶点特异性结合和脱靶效应的合适阴性对照。在活性对映体所用的浓度(例如0.1-10 uM)下,(R)-对映体未显示出显著作用。
酶活实验
eIF4A3 的 ATPase 活性采用偶联发光法在无细胞体系中进行测定。将重组 eIF4A3 蛋白(通常为 10-100 nM)与不同浓度的 (R)-eIF4A3-IN-2 或活性对映体(0.001-100 uM)在含有 ATP(0.1-1 mM)、RNA(poly(U) 或其他 RNA 底物)、Mg2+ 和 KCl 的测定缓冲液中孵育。使用 Kinase-Glo® 或 ATPase-Glo™ 试剂定量 ATP 水解,该试剂可测量剩余的 ATP 或 ADP 生成量。在酶标仪上测量发光值,并根据剂量反应曲线计算 IC50 值。或者,也可以使用孔雀绿法测定释放的磷酸盐。对于解旋酶活性,使用基于 FRET 或凝胶的解旋测定法,并结合荧光标记的双链 RNA 进行测定。
细胞实验
对于用作对照的(R)-对映体,基于细胞的eIF4A3抑制检测并非标准方法。对于活性对映体,将细胞(例如HeLa、HEK293)用eIF4A3-IN-2(0.1-10 uM)处理24-72小时。通过检测mRNA和蛋白质水平,利用报告基因构建体(例如含有提前终止密码子的β-珠蛋白或TCR-β报告基因)评估NMD效率。通过RT-PCR分析eIF4A3靶基因的可变剪接。添加(R)-对映体的浓度与对照相同,并记录任何轻微影响,以解释脱靶或非特异性活性。除非长期NMD抑制破坏细胞稳态,否则eIF4A3抑制剂通常不会影响细胞活力。
动物实验
由于(R)-eIF4A3-IN-2是活性较低的对照化合物,因此尚未有关于其体内动物研究的报道。活性对映体eIF4A3-IN-2已用于癌症研究。在eIF4A3依赖性癌症(例如某些白血病、胶质瘤或实体瘤)的小鼠异种移植模型中,使用活性对映体(例如,腹腔注射或口服10-50 mg/kg)治疗可抑制肿瘤生长并改变NMD依赖性基因表达。(R)-对映体可用作阴性对照,以确认体内效应是由特异性eIF4A3抑制而非非靶向活性引起的。典型的研究设计包括每日给药2-4周、测量肿瘤体积以及对NMD敏感转录本进行终点分析。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未发表针对 (R)-eIF4A3-IN-2 的专门药代动力学研究。作为活性较低的对映异构体,其理化性质(分子量 602.71,C25H19Br2ClN4O2)预计与活性对映异构体相似。需要对消旋体或单个对映异构体进行标准药代动力学参数(例如半衰期、口服生物利用度和组织分布)的评估。对于使用活性对映异构体的体内研究,典型的制剂采用以 PEG300 或生理盐水稀释的 DMSO 基载体。由于结构相似,(R)-对映异构体预计具有相似的吸收、分布、代谢和排泄 (ADME) 特性,但不能排除对映选择性代谢的可能性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
(R)-eIF4A3-IN-2 的临床前毒理学数据尚不可用。作为活性较低的对映体,它并非药物研发的重点,仅用作研究对照工具。活性对映体 eIF4A3-IN-2 在治疗剂量下,预计在动物模型中具有良好的耐受性。RNA 解旋酶抑制剂常见的毒性问题可能包括对细胞 RNA 代谢和剪接的影响,但这些通常与急性毒性无关。应遵循标准的实验室安全预防措施。目前尚无人体临床数据。
参考文献

[1]. Discovery and Characterization of a Eukaryotic Initiation Factor 4A-3-Selective Inhibitor That Suppresses Nonsense-Mediated mRNA Decay. ACS Chem Biol. 2017;12(7):1760-1768.

其他信息
(R)-eIF4A3-IN-2 是一种研究级化合物,用作 eIF4A3-IN-2 的阴性对照。活性对映体(非 (R)-型)是 eIF4A3 的一种高选择性非竞争性抑制剂。eIF4A3 是一种 RNA 解旋酶,参与 mRNA 剪接和无义介导的 mRNA 降解 (NMD)。该化合物可用于研究癌症生物学、新型治疗途径以及基因表达调控。eIF4A3 在多种癌症中过表达,抑制 eIF4A3 是一种潜在的治疗策略。该化合物的分子式为 C25H19Br2ClN4O2,分子量为 602.71。(R)-eIF4A3-IN-2 尚未获准用于临床。活性对映体的选择性源于其与 eIF4A3 特有的非竞争性结合位点结合,从而最大限度地减少了对其他解旋酶的脱靶效应。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H19BR2CLN4O2
分子量
602.7050
精确质量
601.954
CAS号
2095484-82-3
相关CAS号
eIF4A3-IN-2;2095677-20-4
PubChem CID
131953886
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
5
tPSA
57.9
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
744
定义原子立体中心数目
1
SMILES
BrC1C([H])=C([H])C2=C(C([H])=NN2C=1[H])C(N1C([H])([H])C([H])([H])N(C(C2C([H])=C([H])C(=C([H])C=2[H])Br)=O)[C@]([H])(C2C([H])=C([H])C(=C([H])C=2[H])Cl)C1([H])[H])=O
InChi Key
WKKAVTNXNVPCCN-QHCPKHFHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H19Br2ClN4O2/c26-18-5-1-17(2-6-18)24(33)31-12-11-30(15-23(31)16-3-8-20(28)9-4-16)25(34)21-13-29-32-14-19(27)7-10-22(21)32/h1-10,13-14,23H,11-12,15H2/t23-/m0/s1
化学名
(4-bromophenyl)-[(2R)-4-(6-bromopyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carbonyl)-2-(4-chlorophenyl)piperazin-1-yl]methanone
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~82.96 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.15 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.15 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6592 mL 8.2959 mL 16.5917 mL
5 mM 0.3318 mL 1.6592 mL 3.3183 mL
10 mM 0.1659 mL 0.8296 mL 1.6592 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们