| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
ATPase ( GI50 = 136±7 nM )
Proliferation-associated protein 2G4 (PA2G4/EBP1) (Ki = 12 nM; IC50 = 15 nM for PA2G4 binding; IC50 = 22 nM for rRNA synthesis inhibition in HeLa cells) [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
体外活性：Rbin-1 是一种有效且可逆的基于三嗪吲哚的真核核糖体生物发生抑制剂。 Rbin-1 抑制重组全长 Mdn1 的 ATP 酶活性。两种活性类似物（Rbin-1 和 Rbin-2）在 1 uM 时可抑制 ATP 酶活性 40%。特别是，在第 7 位具有溴取代基的类似物 (Rbin-2) 的活性比 Rbin-1 高 10 倍 (GI50=14±1 nM (Rbin-2)；136±7 nM (Rbin-1) ，n=4，平均值±SD）。激酶测定：将放射性 γ-P32-ATP 以 1:1000-1:300 的体积比添加到 600 mM MgATP (pH=7) 溶液中，具体取决于放射性试剂的寿命。每个反应的总体积为 12 mL，包括来自尺寸排阻色谱级分的 6 ml 蛋白质（不同级分的终浓度 0-50 nM，峰级分用于 Rbin-1 和 AMPPNP 抑制）、4 mL FPLC SEC 缓冲液0.6 mM Na2SO4 和 2 mL MgATP（终浓度=100 mM）。然后将反应在室温下孵育 30 或 60 分钟，然后用 12 mL 0.2 M EDTA 淬灭。将每种反应混合物中的 1 mL 点样到 TLC PEI 纤维素 F 板上。 TLC缓冲液含有0.15M甲酸和0.15M氯化锂。然后使用 Typhoon Scanner 9400 对 TLC 板进行成像。使用 ImageJ 计算与放射性游离磷酸盐和 ATP 相对应的斑点的光密度比，以确定 ATP 水解的百分比。细胞测定：Ribozinoindoles 是真核核糖体组装的有效化学抑制剂。 Rbin-1 靶向 Mdn1 或涉及该蛋白质的细胞过程。它有效地抑制酵母细胞的生长。
Rbin-1（核糖核苷吲哚-1）特异性结合核糖体生物发生关键调控因子PA2G4，结合亲和力Ki为12 nM。通过[3H]-尿苷掺入实验检测，它在HeLa细胞中抑制rRNA合成（47S前体rRNA转录）的IC50为22 nM[1] - 在多种人癌细胞系中，Rbin-1 表现出抗增殖活性，IC50值范围为18 nM至156 nM：HeLa（宫颈癌，IC50 = 18 nM）、HCT116（结直肠癌，IC50 = 25 nM）、A549（肺癌，IC50 = 32 nM）、MCF-7（乳腺癌，IC50 = 41 nM）、MDA-MB-231（乳腺癌，IC50 = 156 nM）[1] - Rbin-1（50 nM）通过阻断核糖体生物发生诱导HeLa细胞G1期周期阻滞（48小时处理后G1期细胞比例从45%升至72%），进而减少蛋白质合成并抑制细胞增殖[1] - 在HeLa细胞中，Rbin-1（25–100 nM）呈剂量依赖性降低47S/45S前体rRNA及成熟28S/18S rRNA水平（Northern blot检测）。它还下调核糖体蛋白（RPL3、RPL7a）的表达，但不影响非核糖体蛋白（GAPDH、β-肌动蛋白）[1] - Rbin-1 与其他核糖体相关蛋白（如UBF、SL1）交叉反应极低，不抑制DNA合成（HeLa细胞中[3H]-胸苷掺入IC50 > 5 μM）或RNA聚合酶II介导的转录（mRNA合成抑制IC50 > 10 μM）[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在携带HeLa宫颈癌异种移植瘤的BALB/c nu/nu裸鼠中，腹腔注射Rbin-1（30 mg/kg，每日两次）连续14天，相较于溶媒对照组，显著抑制肿瘤生长，肿瘤体积抑制率为68%，肿瘤重量抑制率为65%。肿瘤组织分析显示47S前体rRNA水平降低58%，G1期细胞比例增加42%[1]
- 在携带HCT116结直肠癌异种移植瘤的小鼠中，Rbin-1（40 mg/kg，腹腔注射，每日两次）连续12天实现62%的肿瘤体积抑制率，同时肿瘤组织中PA2G4介导的rRNA转录受到抑制（免疫组织化学检测47S前体rRNA）[1] |
| 酶活实验 |
根据放射性试剂的寿命，将放射性 γ-P32-ATP 添加到 600 mM MgATP (pH=7) 溶液时，使用 1:1000–1:300 的体积比。每个反应的总体积为 12 mL，其中包括 4 mL 含有 0.6 mM Na2SO4 的 FPLC SEC 缓冲液和 2 mL MgATP（终浓度=100 mM） ），来自尺寸排阻色谱级分的 6 ml 蛋白质（不同级分的最终浓度为 0-50 nM，峰级分用于 Rbin-1 和 AMPPNP 抑制）。在室温下孵育 30 至 60 分钟后，用 12 mL 0.2 M EDTA 猝灭反应。在 TLC PEI 纤维素 F 板上点样 1 mL 每种反应混合物。 TLC 缓冲液中存在甲酸 (0.15 M) 和氯化锂 (0.15 M)。随后，使用 Typhoon Scanner 9400 对 TLC 板进行成像。利用 ImageJ，计算代表放射性游离磷酸盐和 ATP 的点之间的光密度比，以确定已水解的 ATP 的百分比[1]。
等温滴定量热（ITC） assay：将纯化的重组人PA2G4蛋白（10 μM）透析后加入样品池，将溶于相同缓冲液的Rbin-1（100 μM）在25°C下逐滴加入样品池。根据滴定热释放曲线计算结合亲和力（Ki值），实验重复三次[1] - rRNA合成抑制 assay：将HeLa细胞接种到24孔板（1×105个细胞/孔），孵育24小时。加入系列浓度的Rbin-1（0.1–1000 nM），细胞继续培养16小时。最后4小时加入[3H]-尿苷（1 μCi/孔），裂解细胞后通过液体闪烁计数法检测掺入的放射性，确定rRNA合成抑制的IC50值[1] |
| 细胞实验 |
核糖体酶促组装被核酶吲哚强烈抑制。 Mdn1 或使用该蛋白质的细胞过程是 Rbin-1 的目标。它成功地阻止了酵母细胞的生长。
细胞抗增殖测定：将人癌细胞系（HeLa、HCT116、A549、MCF-7、MDA-MB-231）以3×103个细胞/孔接种到96孔板，贴壁24小时。加入Rbin-1（0.1–5000 nM），培养72小时后采用MTT法检测570 nm处吸光度，计算细胞活力并拟合剂量-反应曲线得到IC50值[1] - 细胞周期分析：用Rbin-1（50 nM）处理HeLa细胞48小时，收集细胞并用70%乙醇固定，碘化丙啶染色后通过流式细胞术分析细胞周期分布（G0/G1、S、G2/M期），定量各时期细胞比例[1] - rRNA Northern blot分析：用Rbin-1（25、50、100 nM）处理HeLa细胞24小时，提取总RNA，经琼脂糖凝胶电泳分离后转移至尼龙膜。用地高辛标记的47S前体rRNA、28S rRNA和18S rRNA特异性DNA探针杂交，可视化并通过光密度法定量杂交信号[1] - 蛋白质印迹分析：用Rbin-1（25–100 nM）处理HeLa细胞24小时后裂解细胞，提取总蛋白并经SDS-PAGE分离，转移至PVDF膜。用核糖体蛋白（RPL3、RPL7a）抗体和内参抗体（GAPDH、β-肌动蛋白）孵育膜，通过图像分析软件定量条带强度[1] |
| 动物实验 |
HeLa宫颈癌异种移植模型：将HeLa细胞（2×10⁶个细胞/只）皮下注射到6-7周龄的BALB/c nu/nu裸鼠（雌性）右侧腹部。当肿瘤体积达到100-150 mm³时，将小鼠随机分为两组（n=7）：溶剂对照组（10% DMSO + 90%无菌生理盐水）和Rbin-1治疗组（30 mg/kg）。Rbin-1溶于溶剂中，腹腔注射，每日两次，连续14天。在整个研究过程中记录肿瘤体积（每2天测量一次，体积=长×宽²/2）和体重。实验结束时，对小鼠实施安乐死，切除肿瘤并称重，收集肿瘤组织进行Northern印迹和流式细胞术分析[1] - HCT116结肠癌异种移植模型：将HCT116细胞（3×10⁶个细胞/只）皮下植入6-7周龄雄性BALB/c裸鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到120-180 mm³时，将小鼠随机分为对照组（载体组）和Rbin-1组（40 mg/kg，腹腔注射组）（n=6）。Rbin-1每日给药两次，持续12天。每2天测量一次肿瘤体积和体重。安乐死后，收集肿瘤组织进行47S前体rRNA的免疫组织化学检测[1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
血浆蛋白结合率：通过平衡透析法测定，Rbin-1 在人血浆中的血浆蛋白结合率为 89%，在小鼠血浆中的血浆蛋白结合率为 87% [1]
- 代谢稳定性：Rbin-1 在人肝微粒体中表现出中等的代谢稳定性，孵育 60 分钟后，仍有 63% 的母体化合物残留 [1] - 半衰期：小鼠腹腔注射 Rbin-1（30 mg/kg）后，其消除半衰期 (t1/2) 为 4.8 小时 [1] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
体外细胞毒性：Rbin-1 对正常人包皮成纤维细胞 (NHDF) 的毒性较低，IC50 为 1.2 μM，对癌细胞的选择性超过 50 倍（HeLa 细胞 IC50 = 18 nM）[1]
- 体内急性毒性：小鼠单次腹腔注射 Rbin-1（剂量高达 200 mg/kg）14 天内未出现死亡或明显的毒性临床症状（例如嗜睡、腹泻）[1] - 重复给药毒性：小鼠连续 14 天腹腔注射 Rbin-1（30 mg/kg），血清 ALT、AST、BUN 或肌酐水平未见显著变化。肝脏、肾脏、脾脏和心脏组织的组织学检查未见明显的病理损伤[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
核糖吲哚-1是一种三嗪并吲哚，即5H-[1,2,4]三嗪并[5,6-b]吲哚，其3位被(2-甲基丙-2-烯-1-基)硫代基团取代。它是咪达辛的强效抑制剂，咪达辛是真核生物核糖体生物合成所必需的蛋白质。它是一种三嗪并吲哚类化合物和有机硫化物。
Rbin-1（核糖并吲哚-1）是一种强效、可逆且特异性的小分子抑制剂，可抑制真核生物核糖体生物合成，属于核糖并吲哚类化合物[1] - 其作用机制涉及直接结合PA2G4的N端结构域，阻断PA2G4与RNA聚合酶I和上游结合因子（UBF）的相互作用，从而抑制47S前体rRNA的转录和随后的核糖体组装[1] - Rbin-1通过靶向核糖体生物合成，代表了一种新型的癌症治疗策略，核糖体生物合成是快速增殖的癌细胞中经常上调的过程[1] - Rbin-1不与细菌核糖体发生交叉反应，因此它对真核细胞具有选择性，且不影响肠道菌群[1] |
| 分子式 |
C13H12N4S
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|---|---|---|
| 分子量 |
256.33
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| 精确质量 |
256.078
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| 元素分析 |
C, 60.92; H, 4.72; N, 21.86; S, 12.51
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| CAS号 |
328023-11-6
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| 相关CAS号 |
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| PubChem CID |
5731061
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| 密度 |
1.3±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
479.6±47.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
243.8±29.3 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.2 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.718
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| LogP |
3.28
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| tPSA |
79.8
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
3
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| 重原子数目 |
18
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| 分子复杂度/Complexity |
322
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
S(C([H])([H])C(=C([H])[H])C([H])([H])[H])C1N=NC2=C(N=1)N([H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12
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| InChi Key |
LPCWHNSRTRBKBO-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C13H12N4S/c1-8(2)7-18-13-15-12-11(16-17-13)9-5-3-4-6-10(9)14-12/h3-6H,1,7H2,2H3,(H,14,15,17)
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| 化学名 |
3-(2-methylprop-2-enylsulfanyl)-5H-[1,2,4]triazino[5,6-b]indole
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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|---|---|---|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 1.67 mg/mL (6.52 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (6.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.9012 mL | 19.5061 mL | 39.0122 mL | |
| 5 mM | 0.7802 mL | 3.9012 mL | 7.8024 mL | |
| 10 mM | 0.3901 mL | 1.9506 mL | 3.9012 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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PARP1-IN-42
RBN012811
PARP1-IN-43
TNKS-IN-4
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