Atamparib (RBN-2397)

别名: RBN2397; RBN 2397; Atamparib; RBN-2397 4-[[(2S)-1-[3-Oxo-3-[4-[5-(三氟甲基)嘧啶-2-基]哌嗪-1-基]丙氧基]丙-2-基]氨基]-5-(三氟甲基)-1H-哒嗪-6-酮
目录号: V38922 纯度: ≥98%
Atamparib (RBN-2397; RBN2397) 是一种一流的、有效的、口服生物活性的 NAD+ 竞争性 PARP7 抑制剂 (IC50<3 nM),具有抗肿瘤和免疫调节作用。
Atamparib (RBN-2397) CAS号: 2381037-82-5
产品类别: PARP
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述
阿坦帕尼(RBN-2397;RBN2397)是一种首创的强效口服生物活性PARP7 NAD+竞争性抑制剂(IC50<3 nM),具有抗肿瘤和免疫调节作用。它对多种物种均有效。RBN-2397通过特异性结合PARP7来恢复I型干扰素信号通路。RBN-2397有望用于治疗已进展或转移的实体瘤。
阿坦帕尼(RBN-2397)是一种首创的强效口服生物活性PARP7 NAD+竞争性抑制剂。其分子式为C20H23F6N7O3,分子量为523.44。该化合物对PARP7的IC50小于3 nM,Kd小于1 nM。阿坦帕尼可通过抑制肿瘤细胞中的PARP7直接抑制细胞增殖并恢复I型干扰素信号通路,从而刺激先天性或适应性抗肿瘤免疫反应。它对多种物种均有效,目前正在研究其治疗晚期或转移性实体瘤的疗效。
生物活性&实验参考方法

阿坦帕尼已在临床前模型中显示出体内活性。作为一种口服活性化合物,它便于在动物研究中给药。阿坦帕尼可抑制肿瘤生长并恢复肿瘤细胞中的I型干扰素信号传导。该化合物在不同物种中的活性支持其在实体瘤治疗领域的开发。目前,该化合物正在进行针对晚期或转移性实体瘤的临床试验。
靶点
PARP-7 ( IC50 = 3 nM ); PARP-7 ( Kd = 1 nM )
Atamparib targets PARP7 (poly(ADP-ribose) polymerase 7), a nuclear enzyme involved in the regulation of cellular nucleic acid sensing and interferon signaling. As a NAD+ competitive inhibitor, Atamparib binds to the NAD+ binding site of PARP7, blocking its enzymatic activity. This inhibition restores cytosolic nucleic acid sensing and blocks cell proliferation. The compound also restores type I interferon signaling, stimulating innate and adaptive antitumor immune responses. Its mechanism makes it a promising immunomodulatory and antineoplastic agent.
体外研究 (In Vitro)
RBN-2397(0.0001-100 μM;24 小时)在 NCI-H1373 肺癌细胞中抑制细胞增殖,IC50 值为 20 nM[2]。
RBN-2397(0.4 nM-1 μM;24 小时)通过剂量依赖性地增加 STAT1 磷酸化,恢复 NCI-H1373 人肺癌细胞中的 I 型干扰素反应[2]。
RBN-2397(0.0001-1 μM;24 小时)在细胞生化分析中抑制细胞 MARylation,EC50 值为 1 nM[2]。
RBN-2397 抑制 PARP7 活性,降低 α-微管蛋白 MARylation,从而稳定 α-微管蛋白,并减少癌细胞的增殖和迁移。紫杉醇的加入进一步增强了这些效应,凸显了两种药物之间的协同作用。在紫杉醇存在的情况下,PARP7介导的α-微管蛋白MARylation位点的突变同样导致微管稳定和细胞迁移减少。结论:本研究表明,使用RBN-2397靶向PARP7,特别是与紫杉醇联合使用,为抑制侵袭性卵巢癌细胞表型提供了一种有效策略。我们的研究结果强调了将PARP7抑制剂与现有化疗药物联合使用以提高卵巢癌治疗效果的潜力。[3]
聚腺苷二磷酸核糖聚合酶7 (PARP7) 通过抑制TANK结合蛋白1 (TBK1)来抑制I型干扰素 (IFN) 信号通路。研究表明,抑制PARP7可能调节肿瘤免疫。然而,PARP7抑制对巨噬细胞固有抗病毒免疫的影响及其潜在机制尚未得到充分阐明。本文报道,PARP7抑制剂候选药物RBN-2397可通过激活视黄酸诱导基因I(RIG-I)和干扰素基因刺激因子(STING)信号通路,增强巨噬细胞中I型干扰素(IFN-I)的产生。RBN-2397处理可增加原代骨髓来源巨噬细胞(BMDM)和RAW264.7细胞中模式识别配体诱导的干扰素-β的产生。此外,RBN-2397可抑制水疱性口炎病毒(VSV)感染的巨噬细胞中的病毒复制效率,并增强干扰素刺激趋化因子基因(ISG)的表达。从机制上讲,RBN-2397促进TBK1磷酸化,进而增强RIG-I和STING信号通路的激活。此外,RBN-2397增强IFN-α/β诱导的信号转导和转录激活因子1 (STAT1) 和STAT2的磷酸化,以及巨噬细胞在IFN刺激下趋化因子基因的表达。体内实验表明,RBN-2397增强了感染VSV的小鼠的先天性抗病毒免疫力,导致血清IFN-β水平升高、病毒载量降低,并减轻了VSV感染小鼠的肺部炎症反应。总之,我们的研究结果强调了RBN-2397作为一种有前景的抗病毒治疗药物,能够增强宿主体内IFN相关的抗病毒免疫防御能力。[4]
阿坦帕尼作为PARP7抑制剂,在体外表现出强大的活性。该化合物对PARP7的IC50小于3 nM,Kd小于1 nM。在细胞实验中,Atamparib(0.0001-100 μM;24小时)可抑制NCI-H1373肺癌细胞的增殖,IC50值为20 nM。该化合物可恢复胞质核酸识别并阻断细胞增殖。这些体外活性证实了其作为抗癌药物的潜力。
体内研究 (In Vivo)
RBN-2397(口服;3-100 mg/kg;每日一次;持续24-32天)可在携带CT26肿瘤的BALB/c小鼠的CT26同源模型中诱导肿瘤特异性适应性免疫记忆,并产生持久的完全缓解[2]。
RBN-2397(口服;3-100 mg/kg;每日一次;持续32天)以剂量依赖的方式抑制肿瘤生长,并在剂量≥30 mg/kg时,以100 mg/kg的剂量实现肿瘤完全消退[2]。
RBN-2397在体内的半衰期(t1/2)为325分钟[2]。
酶活实验
阿坦帕尼的体外酶活性测定包括测量其对PARP7活性的抑制作用。这些测定通常使用重组PARP7和NAD+底物。将酶与底物和不同浓度的阿坦帕尼一起孵育。测定NAD+掺入聚(ADP-核糖)聚合物的量。确定IC50(<3 nM)和Kd(<1 nM)。这些测定证实了该化合物作为NAD+竞争性PARP7抑制剂的作用机制。
细胞实验
细胞增殖实验[2]
细胞系:NCI-H1373肺癌细胞
浓度:0.0001 μM;0.001 μM;0.001 μM;0.1 μM;1 μM;10 μM;100 μM
孵育时间:24小时
结果:细胞增殖受阻。
蛋白质印迹分析[2]
细胞系:NCI-H1373肺癌细胞
浓度:0.4 nM-1 μM
孵育时间:24小时
结果:p-STAT1蛋白表达增加。
卵巢癌细胞系(OVCAR4、OVCAR3)分别用RBN-2397和紫杉醇单独及联合处理。 Western blotting 和免疫沉淀实验证实了 RBN-2397 对 α-微管蛋白 MARylation 和稳定性的影响。研究人员评估了细胞增殖和迁移情况,并使用免疫荧光成像定量分析了 α-微管蛋白的稳定性。此外,还进行了 RNA 测序以评估其对基因表达变化的影响。[3]
在 NCI-H1373 肺癌细胞等癌细胞系中进行了 Atamparib 的体外细胞实验。将细胞用不同浓度的化合物处理,并使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法检测细胞增殖。通过检测干扰素刺激基因的表达来评估 I 型干扰素信号通路。这些实验表征了该化合物的抗增殖和免疫调节活性。
动物实验
CB17 SCID 小鼠(NCI-H1373 异种移植瘤)
3 mg/kg、10 mg/kg、30 mg/kg、100 mg/kg
口服给药;每日一次;24-32 天
在小鼠实体瘤异种移植模型中进行了 Atamparib 的体内动物实验。将癌细胞移植到免疫缺陷小鼠体内,并以不同剂量口服 Atamparib。测量肿瘤生长情况,并收集肿瘤组织用于分析 PARP7 抑制和干扰素信号通路。这些研究评估了该化合物在体内的疗效和作用机制。
药代性质 (ADME/PK)
阿坦帕尼是一种口服有效的化合物,具有良好的药代动力学特性。它具有良好的口服生物利用度,适合每日一次给药。临床前研究已对该化合物的半衰期和组织分布进行了表征。其药代动力学特征支持其在临床试验中的应用。该化合物在肝脏代谢,并通过胆汁和肾脏途径排泄。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
阿坦帕尼已在临床前和临床研究中进行了安全性评估。该化合物在治疗剂量下通常耐受性良好。常见不良反应可能包括疲劳、胃肠道不适和血液学改变。目前正在进行的临床试验中正在对该化合物的安全性进行表征。与其他PARP抑制剂一样,长期安全性监测至关重要。
参考文献

[1]. RBN-2397-Inhibiting PARP7, a Key monoPARP Cancer Dependency.

[2]. RBN-2397: A First-in-Class PARP7 Inhibitor Targeting a Newly Discovered Cancer Vulnerability in Stress-Signaling Pathways.

[3]. RBN-2397, a PARP7 Inhibitor, Synergizes with Paclitaxel to Inhibit Proliferation and Migration of Ovarian Cancer Cells. bioRxiv. 2024 Sep 5:2024.08.20.608802.

[4]. PARP7i Clinical Candidate RBN-2397 Exerts Antiviral Activity by Modulating Interferon-β Associated Innate Immune Response in Macrophages. Drug Dev Res. 2024 Nov;85(7):e70013.

其他信息
阿坦帕尼是一种口服的小分子核糖体聚合酶(ADP-核糖)7抑制剂,具有潜在的免疫调节和抗肿瘤活性。口服后,阿坦帕尼选择性地与PARP7结合,恢复I型干扰素信号通路。这可能导致先天性和适应性免疫反应的诱导,并抑制肿瘤的生长和增殖。PARP催化核蛋白的翻译后ADP-核糖基化,这些核蛋白具有信号转导功能,并能募集其他蛋白质修复受损的DNA。单ADP-核糖基化是一种蛋白质的翻译后修饰,在癌细胞生物学中正日益成为重要的调控因子。PARP7(TiPARP)是一种单ADP-核糖转移酶(MART),在卵巢癌细胞中对其底物α-微管蛋白进行MARylation修饰,从而促进微管不稳定、细胞生长和迁移。近年来,一种选择性作用于PARP7的强效抑制剂RBN-2397的开发,为探索PARP7催化活性在生物过程中的作用提供了一种新的工具。本研究通过α-微管蛋白的马里化作用,探讨了PARP7催化活性在卵巢癌细胞生物学调控中的作用。[3]
阿坦帕尼(RBN-2397)是一种首创的强效口服活性PARP7 NAD+竞争性抑制剂。其IC50小于3 nM,Kd小于1 nM。该化合物可抑制细胞增殖并恢复I型干扰素信号传导,从而刺激抗肿瘤免疫反应。阿坦帕尼目前正在研究用于治疗晚期或转移性实体瘤。它也被称为RBN-2397。其作为PARP7抑制剂的独特机制使其成为一种有前景的免疫调节剂和抗肿瘤药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₂₀H₂₃F₆N₇O₃
分子量
523.43
精确质量
523.18
元素分析
C, 45.89; H, 4.43; F, 21.78; N, 18.73; O, 9.17
CAS号
2381037-82-5
PubChem CID
146047148
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.53±0.1 g/cm3(Predicted)
LogP
1.2
tPSA
112
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
848
定义原子立体中心数目
1
SMILES
FC(C1C([H])=NC(=NC=1[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C(C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])[C@]([H])(C([H])([H])[H])N([H])C2C([H])=NN([H])C(C=2C(F)(F)F)=O)=O)C([H])([H])C1([H])[H])(F)F
InChi Key
UQZCQKXJAXKZQH-LBPRGKRZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H23F6N7O3/c1-12(30-14-10-29-31-17(35)16(14)20(24,25)26)11-36-7-2-15(34)32-3-5-33(6-4-32)18-27-8-13(9-28-18)19(21,22)23/h8-10,12H,2-7,11H2,1H3,(H2,30,31,35)/t12-/m0/s1
化学名
4-[[(2S)-1-[3-oxo-3-[4-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]piperazin-1-yl]propoxy]propan-2-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)-1H-pyridazin-6-one
别名
RBN2397; RBN 2397; Atamparib; RBN-2397
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100~200 mg/mL (191.0~382.1 mM)
Ethanol: ~13 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.78 mM) (饱和度未知) in 5% DMSO + 95% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。


配方 4 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,您可以将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

配方 5 中的溶解度: ≥ 0.5 mg/mL (0.96 mM) (饱和度未知) in 1% DMSO 99% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 6 中的溶解度: 5%DMSO+ 40%PEG300+ 5%Tween 80+ 50%ddH2O: 5.0mg/ml (9.55mM)

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9105 mL 9.5524 mL 19.1048 mL
5 mM 0.3821 mL 1.9105 mL 3.8210 mL
10 mM 0.1910 mL 0.9552 mL 1.9105 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
RBN-2397 in Combination With Pembrolizumab in Patients With SCCL
CTID: NCT05127590
Phase: Phase 1/Phase 2
Status: Unknown status
Date: 2023-07-03
Conditions: Advanced Squamous Non-Small Cell Lung Carcinoma
Interventions: RBN-2397
Linked Compound CID: 146047148
Phase 1 Study of RBN-2397, an Oral PARP7 Inhibitor, in Patients With Solid Tumors
CTID: NCT04053673
Phase: Phase 1
Status: Unknown status
Date: 2023-03-28
Conditions: Solid Tumor, Adult
Interventions: RBN-2397
Linked Compound CID: 146047148
A Phase 1b/2, multicenter, single arm study of RBN-2397 in combination with pembrolizumab in patients with Squamous Cell Carcinoma of the Lung (SCCL)
EudraCT: 2021-003829-30
Phase: Phase 1, Phase 2
Status: Prematurely Ended
Date: 2022-02-03
Linked Compound CID: 146047148
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