RI-1

别名: RAD51 inhibitor 1; RI-1; RI1; RI 1 3-氯-1-(3,4-二氯苯基)-4-(4-吗啉基)-1H-吡咯-2,5-二酮
目录号: V1951 纯度: ≥98%
RI-1(也称为 RAD51 抑制剂 1)是 RAD51 的不可逆小分子抑制剂,IC50 范围为 5 至 30 μM。
RI-1 CAS号: 415713-60-9
产品类别: RAD51
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
RI-1(也称为 RAD51 抑制剂 1)是一种不可逆的 RAD51 小分子抑制剂,IC50 范围为 5 至 30 μM。 RI-1 通过直接、特异性破坏 HsRAD51 并抑制 RAD51 在 ssDNA 上形成细丝的能力,使细胞对 DNA 损伤敏感。此外,RI-1 单独对所有三种癌细胞系(HeLa、MCF-7 和 U2OS)产生单药毒性,LD50 值在 20–40 µM 范围内。 RI-1 减少 G2 期细胞中 γ-H2AX 病灶的重新连接,并导致照射后 6 小时内未修复的 DSB 水平更高。
生物活性&实验参考方法
靶点
RAD51 ( IC50 = 5-30 μM )
体外研究 (In Vitro)
体外活性:RI-1 通过直接、特异性破坏 HsRAD51 并抑制 RAD51 在 ssDNA 上形成细丝的能力,使细胞对 DNA 损伤敏感。此外,RI-1 单独对所有三种癌细胞系(HeLa、MCF-7 和 U2OS)产生单药毒性,LD50 值在 20–40 µM 范围内。 RI-1 减少 G2 期细胞中 γ-H2AX 病灶的重新连接,并导致照射后 6 小时内未修复的 DSB 水平更高。激酶测定:所有反应均在黑色非结合聚苯乙烯 384 孔板中进行,反应体积为 30–100 μL。纯化的DNA链交换蛋白和化合物在室温下预孵育5分钟;然后将它们与 100 nM ssDNA 底物在 37°C 下进一步孵育 30 分钟,该底物由 5' 末端带有 Alexa 488 标记的 45 聚体聚 dT(由 Integrated DNA Technologies 合成和纯化)组成。反应在 20 mM HEPES pH 7.5、10 mM MgCl2、0.25 μM BSA、2% 甘油、30 mM NaCl、4% DMSO 和 2 mM ATP 中进行。一些条件包括所示的 DTT 或 TCEP(三(2-羧乙基)膦)。使用 Safire2 酶标仪测量 DNA 结合作为荧光偏振 (FP) 的函数,使用以下设置:激发 470±5nm,发射 530±5nm,10 个读数/孔,从对照孔自动校准 Z 高度和 G 因子。显示的误差线代表标准偏差。对于涉及蛋白质浓度滴定的实验,数据适合一个方程,该方程解释了重组酶蛋白结合 DNA 的合作性质。对于涉及 RI-1 滴定的实验,选择蛋白质浓度以在不存在 RI-1 的情况下提供约 80% 的 FP 信号饱和度。细胞测定:细胞毒性是通过集落形成能力的丧失来确定的。实验一式三份进行。使用 CCD 相机对结晶紫染色的菌落进行成像,并使用 NIH Image 软件进行计数。误差线表示标准误差。
体内研究 (In Vivo)
由于 RI-1 在组织培养基和水性缓冲液中的半衰期较短,因此其在临床前体内模型中的开发受到限制。 RI-2 是 RI-1 的同系物,它的诞生可以减轻这些影响 (119)。 RI-2 显示可结合 Rad51 并抑制 Rad51 在 DNA 损伤位点的核灶。 RI-2 目前是进一步体外和体内研究的主题,并被用于鉴定抑制 Rad51 功能的第三代类似物。
酶活实验
反应体积范围为 30 至 100 μL,所有反应均在 384 孔黑色非结合聚苯乙烯板中进行。纯化的化合物和 DNA 链交换蛋白首先在室温下孵育五分钟。然后将它们在 37°C 下与 100 nM ssDNA 底物一起孵育 30 分钟,该底物是在 5' 末端标有 Alexa 488 的 45 聚体聚 dT(由 Integrated DNA Technologies 纯化和合成)。反应使用 20 mM HEPES pH 7.5、10 mM MgCl2、0.25 μM BSA、2% 甘油、30 mM NaCl、4% DMSO 和 2 mM ATP。 DTT 或 TCEP(三(2-羧乙基)膦)属于所提及的条件。 Safire2 酶标仪用于测量 DNA 结合作为荧光偏振 (FP) 的函数。使用以下设置:激发 470±5 nm、发射 530±5 nm、10 个读数/孔、Z 高度和从对照孔自动校准的 G 因子。显示的误差线代表标准偏差。将数据拟合到一个方程中,该方程考虑了在涉及蛋白质浓度滴定的实验中重组酶蛋白 DNA 结合的协同性质。选择用于 RI-1 滴定实验的蛋白质浓度,以便当 RI-1 不存在时 FP 信号达到约 80% 饱和度。
细胞实验
形成集落的能力是细胞毒性的关键指标。每个实验进行三份重复。 NIH Image 软件用于对用结晶紫染色并使用 CCD 相机成像的菌落进行计数。正常误差由误差线指示。
动物实验
Female BALB/c nude mice (6 weeks) bearing TNBC tumor
50 mg/kg
I.p. every 3 days for 30 days
参考文献

[1]. RI-1: a chemical inhibitor of RAD51 that disrupts homologous recombination in human cells. Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(15):7347-57.

[2]. DAXX, as a Tumor Suppressor, Impacts DNA Damage Repair and Sensitizes BRCA-Proficient TNBC Cells to PARP Inhibitors. Neoplasia. 2019 Jun;21(6):533-544.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H11CL3N2O3
分子量
361.61
精确质量
359.983
元素分析
C, 46.50; H, 3.07; Cl, 29.41; N, 7.75; O, 13.27
CAS号
415713-60-9
相关CAS号
415713-60-9
PubChem CID
1074953
外观&性状
Yellow to orange solid powder
密度
1.6±0.1 g/cm3
沸点
483.0±45.0 °C at 760 mmHg
闪点
245.9±28.7 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.669
LogP
3.04
tPSA
49.85
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
520
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C(N(C2C([H])=C([H])C(=C(C=2[H])Cl)Cl)C(C=1N1C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C1([H])[H])=O)=O
InChi Key
MWSUIZKGNWELRF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H11Cl3N2O3/c15-9-2-1-8(7-10(9)16)19-13(20)11(17)12(14(19)21)18-3-5-22-6-4-18/h1-2,7H,3-6H2
化学名
3-chloro-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-morpholin-4-ylpyrrole-2,5-dione
别名
RAD51 inhibitor 1; RI-1; RI1; RI 1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 33.3~50 mg/mL (92.2~138.3 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7654 mL 13.8271 mL 27.6541 mL
5 mM 0.5531 mL 2.7654 mL 5.5308 mL
10 mM 0.2765 mL 1.3827 mL 2.7654 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • RI-1

    RI-1 inhibits human RAD51 in biochemical assays. Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(15):7347-57.
  • RI-1

    The cysteine binding target of RI-1 is highly conserved among eukaryotic RAD51 proteins and is located in an interface used for protein–protein interactions. Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(15):7347-57.
  • RI-1

    RI-1 disrupts the formation of RAD51 foci after DNA damage. Nucleic Acids Res. 2012 Aug;40(15):7347-57.
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