RR6

别名: (2R)-2-羟基-3-(羟甲基)-3-甲基-N-(3-氧代-4-苯基丁基)丁酰胺;(2R)-2-hydroxy-3-(hydroxymethyl)-3-methyl-N-(3-oxo-4-phenylbutyl)butanamide
目录号: V33141 纯度: ≥98%
RR6 (RR-6; RR 6) 是一种新型口服生物活性选择性 Vanin 抑制剂。
RR6 CAS号: 1351758-37-6
产品类别: New8
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
RR6 (RR-6; RR 6) 是一种新型口服生物活性选择性 Vanin 抑制剂。大鼠口服 RR6 完全抑制血浆 Vanin 活性,并引起禁食后血浆脂质浓度的变化,从而说明其在化学生物学研究中的潜在用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
Vanin-1 (VNN1) / Pantetheinase (IC₅₀: 0.54 µM for recombinant human vanin-1; 0.040 µM for human serum pantetheinase; 0.041 µM for fetal bovine serum pantetheinase; 0.087 µM for rat serum pantetheinase).
No significant inhibition of human serum biotinidase (IC₅₀ > 200 µM).
No inhibition of human cathepsins B, L, or papain at up to 200 µM. [1]
体外研究 (In Vitro)
RR6 是哺乳动物vanin(泛酰巯基乙胺酶)的选择性、可逆、竞争性抑制剂。
它抑制重组人vanin-1的IC₅₀为0.54 µM(95%置信区间0.43–0.68 µM)。
在血清中抑制效力更高:对人血清的IC₅₀为40 nM,对胎牛血清为41 nM,对大鼠血清为87 nM。
Lineweaver-Burk分析证实其对底物AMC-Pan是竞争性抑制。
RR6预孵育的牛血清进行凝胶渗透色谱分析后,vanin活性完全恢复,表明结合是可逆的。
RR6 在高达200 µM浓度下,对生物素酶(IC₅₀ > 200 µM)或对组织蛋白酶B、组织蛋白酶L和木瓜蛋白酶无抑制活性。 [1]
体内研究 (In Vivo)
禁食后,lumen RR6 完全抑制静脉支架活性并增加 Wistar 活塞中的静脉支架浓度(150-200 g)。在活塞中部,将 RR6 调整为 3 mg/mL 几乎完全抑制静脉支架 [1]。
口服 RR6 可剂量依赖性地抑制大鼠血浆vanin活性。
单次口服50 mg/kg剂量可导致血浆vanin活性完全抑制,持续长达8小时。
通过饮用水给药(3 mg/mL)4天后,RR6 几乎完全抑制血浆vanin活性。
在饮用含RR6(3 mg/mL)的水4天后禁食24小时的大鼠中,与对照组相比,血浆游离脂肪酸水平显著升高,血浆胆固醇水平显著降低。血浆葡萄糖水平未改变。 [1]
酶活实验
使用荧光底物泛酸-7-氨基-4-甲基香豆素(AMC-Pan)测量泛酰巯基乙胺酶活性。
对于抑制实验,将样品(重组人vanin-1或稀释血清)与抑制剂预孵育10分钟,然后在PBS pH 7.4中加入AMC-Pan(终浓度10 µM)。
反应10分钟后终止,稀释,并测量荧光(激发360 nm,发射450 nm)。
使用浓度范围为10⁻¹⁰至10⁻³ M的抑制剂稀释液,根据剂量反应曲线确定IC₅₀值。
为了确定抑制类型,在存在或不存在RR6的情况下,使用不同底物浓度(1–300 µM)进行反应,并使用Lineweaver-Burk图分析数据。
为了测量来自处理动物的未稀释大鼠血浆中的活性,将缓冲的AMC-Pan溶液在孔中干燥,加入血浆,并按上述方法测量水解。 [1]
动物实验
在药效学研究中,雌性Wistar大鼠(200–250 g)单次口服溶于10% DMSO PBS溶液中的RR6,剂量分别为2、10或50 mg/kg。
或者,将RR6以0.3、1或3 mg/mL的浓度通过饮用水给药。
在不同时间点采集血样,并通过离心制备血浆,用于泛酰巯基乙胺酶活性测定。
在代谢研究中,雄性Wistar大鼠(150–200 g)连续4天饮用含RR6(3 mg/mL)的饮用水,随后禁食24小时。
禁食后采集血液,制备血浆,并使用商业试剂盒分析代谢物(游离脂肪酸、葡萄糖、胆固醇)。[1]
药代性质 (ADME/PK)
在大鼠体内口服RR6后,血浆香草醛活性呈剂量依赖性抑制,表明存在全身暴露和生物利用度。
单次口服50 mg/kg剂量可使血浆香草醛活性完全抑制长达8小时。
饮用水给药(3 mg/mL)几乎完全抑制了血浆香草醛活性,表明存在持续暴露。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
研究中,所有剂量(单次口服剂量最高达 50 mg/kg 或以 3 mg/mL 的浓度溶于饮用水中,连续给药 4 天)均未观察到对动物的不良反应。[1]
参考文献

[1]. Discovery of small molecule vanin inhibitors: new tools to study metabolism and disease. ACS Chem Biol. 2013 Mar 15;8(3):530-4.

其他信息
RR6是一种泛酰巯基乙胺类似物,旨在作为可逆的竞争性泛酰巯基乙胺抑制剂。
它代表了一种新型的化学生物学工具,可用于研究泛酰巯基乙胺在健康和疾病中的功能,尤其是在脂质代谢和PPAR-α信号通路方面。
研究表明,作为PPAR-α靶点的泛酰巯基乙胺-1可能在禁食期间的营养/脂质代谢中发挥作用,这可以从RR6处理后血浆游离脂肪酸和胆固醇的变化中看出。
该化合物对泛酰巯基乙胺具有很高的选择性,而对生物素酶和常见半胱氨酸蛋白酶等相关酶则无明显选择性。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H23NO4
分子量
293.35812497139
精确质量
293.162
CAS号
1351758-37-6
PubChem CID
54754611
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
559.5±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
292.2±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.542
LogP
0.71
tPSA
86.6
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
348
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC(C)(CO)[C@H](C(=O)NCCC(=O)CC1=CC=CC=C1)O
InChi Key
PTVUGLNOPRZQEY-AWEZNQCLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H23NO4/c1-16(2,11-18)14(20)15(21)17-9-8-13(19)10-12-6-4-3-5-7-12/h3-7,14,18,20H,8-11H2,1-2H3,(H,17,21)/t14-/m0/s1
化学名
(2R)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethyl-N-(3-oxo-4-phenylbutyl)butanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~340.88 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 3.25 mg/mL (11.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 32.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 3.25 mg/mL (11.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 32.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 3.25 mg/mL (11.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 32.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.4088 mL 17.0439 mL 34.0878 mL
5 mM 0.6818 mL 3.4088 mL 6.8176 mL
10 mM 0.3409 mL 1.7044 mL 3.4088 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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