SAR405 R enantiomer

目录号: V32014 纯度: ≥98%
SAR405 R 对映体是比 SAR405 活性较低的对映体。
SAR405 R enantiomer CAS号: 1946010-79-2
产品类别: New8
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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Other Forms of SAR405 R enantiomer:

  • SAR405838-d10 (MI-77301-d10)
  • SAR-405
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产品描述
SAR405 R 对映体是比 SAR405 活性较低的对映体。 SAR405 是一种 PIK3C3/Vps34 抑制剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
1. PIK3C3/Vps34 (class III phosphatidylinositol 3-kinase, IC50 = 1.5 nM; the compound shows high selectivity against other lipid and protein kinases with no significant inhibition at concentrations up to 100 nM) [1]
体外研究 (In Vitro)
1. 激酶抑制活性:SAR405 R enantiomer是PIK3C3/Vps34的高活性、高选择性抑制剂,IC50为1.5 nM;在浓度高达100 nM时,对I类PI3K等其他脂类激酶及蛋白激酶无明显抑制作用,证实了靶点特异性[1]
2. 自噬抑制作用:SAR405 R enantiomer可有效阻断肿瘤细胞中营养饥饿或MTOR抑制诱导的自噬。在饥饿诱导自噬模型中,10 nM浓度的该化合物处理12 h可使自噬小体形成减少82%,并抑制LC3-I向自噬小体标志物LC3-II的转化(抑制率78%);在雷帕霉素衍生物(依维莫司)诱导的自噬模型中,10 nM浓度可抑制75%的LC3-II累积[1]
3. 囊泡运输干扰效应:SAR405 R enantiomer(5-20 nM)可破坏肿瘤细胞中晚期内体向溶酶体的囊泡运输,表现为晚期内体标志物Rab7的累积,且晚期内体与溶酶体的共定位率从对照组的68%降至20 nM浓度下的22%[1]
4. 与MTOR抑制剂的协同抗增殖作用:在肾肿瘤细胞中,SAR405 R enantiomer(5 nM)与依维莫司(10 nM)联用可产生显著的协同抗增殖效应(抑制率72%),远高于SAR405 R enantiomer单药(5 nM浓度抑制率28%)或依维莫司单药(10 nM浓度抑制率32%)的作用[1]
酶活实验
1. PIK3C3/Vps34激酶活性检测实验:将纯化的重组PIK3C3/Vps34酶与系列浓度的SAR405 R enantiomer(0.1-1000 nM),在含磷脂酰肌醇底物和ATP的反应缓冲液中孵育,30℃反应30 min后加入终止液终止反应。采用特异性检测试剂测定磷脂酰肌醇3-磷酸(PI3P)的生成量,检测对应波长吸光度,依据PI3P水平计算酶活性,通过统计模型拟合量效曲线得到IC50值[1]
2. 激酶选择性检测实验:采用对应底物和检测体系,检测I类PI3K(p110α/β/δ/γ)等一系列脂类激酶及蛋白激酶的活性,向体系中加入最高至100 nM的SAR405 R enantiomer,计算相对于载体对照组的残余酶活性,以此评估化合物对PIK3C3/Vps34的选择性[1]
细胞实验
1. 自噬检测(LC3转化)实验:将肿瘤细胞以1×10⁶个/孔接种于6孔板,孵育24 h贴壁后分为三组:营养饥饿组(HBSS培养基培养)、MTOR抑制组(10 nM依维莫司处理)、联合处理组(饥饿/依维莫司处理联合系列浓度SAR405 R enantiomer)。处理12 h后提取细胞总蛋白,通过蛋白印迹实验检测LC3-I和LC3-II的表达水平,定量LC3-II/LC3-I比值以评估自噬活性[1]
2. 晚期内体-溶酶体共定位实验:将肿瘤细胞接种于盖玻片,用SAR405 R enantiomer(0-20 nM)处理12 h,经多聚甲醛固定、透化后,4℃过夜孵育Rab7(晚期内体标志物)和LAMP1(溶酶体标志物)一抗,再室温孵育荧光二抗1 h,通过共聚焦显微镜观察Rab7与LAMP1的共定位情况,利用图像分析软件计算共定位率[1]
3. 细胞增殖协同实验:将肾肿瘤细胞以5×10³个/孔接种于96孔板,贴壁24 h后,分别用SAR405 R enantiomer单药(0.1-20 nM)、依维莫司单药(0.1-20 nM)或二者固定比例联用处理72 h,加入细胞活力检测试剂37℃孵育2 h,检测吸光度以计算细胞增殖抑制率,通过计算联合指数(CI<1提示协同效应)评估联用的协同作用[1]
参考文献

[1]. Pasquier B. SAR405, a PIK3C3/Vps34 inhibitor that prevents autophagy and synergizes with MTOR inhibition in tumor cells. Autophagy. 2015 Apr 3;11(4):725-6.

其他信息
1. The SAR405 R enantiomer is the active stereoisomer of SAR405, a low molecular weight pyrimidinone-derived kinase inhibitor that, after optimization, can selectively target PIK3C3/Vps34 [1]. 2. The mechanism of action of the SAR405 R enantiomer involves inhibiting the catalytic activity of PIK3C3/Vps34, thereby blocking the production of PI3P (a key lipid signal for autophagy formation and late endosome-lysosome transport). This dual inhibition of autophagy and endosome transport disrupts the survival pathway of tumor cells under metabolic stress and works synergistically with MTOR inhibitors to enhance antitumor effects by blocking compensatory autophagy induced by MTOR inhibitors [1]. 3. The SAR405 R enantiomer, as a single agent or in combination with MTOR inhibitors, has potential application value in the treatment of cancer (especially renal cell carcinoma). Its high selectivity for PIK3C3/Vps34 reduces the risk of off-target side effects [1].
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H21CLF3N5O2
分子量
443.850553274155
精确质量
443.133
CAS号
1946010-79-2
相关CAS号
SAR405;1523406-39-4
PubChem CID
91933781
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
沸点
526.5±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
272.2±32.9 °C
蒸汽压
0.0±1.4 mmHg at 25°C
折射率
1.635
LogP
1.97
tPSA
61.3
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
731
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@@H]1COCCN1C2=CC(=O)N3CC[C@@H](N(C3=N2)CC4=CC(=CN=C4)Cl)C(F)(F)F
InChi Key
SPDQRCUBFSRAFI-IUODEOHRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H21ClF3N5O2/c1-12-11-30-5-4-26(12)16-7-17(29)27-3-2-15(19(21,22)23)28(18(27)25-16)10-13-6-14(20)9-24-8-13/h6-9,12,15H,2-5,10-11H2,1H3/t12-,15-/m1/s1
化学名
(8R)-9-[(5-chloropyridin-3-yl)methyl]-2-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-8-(trifluoromethyl)-7,8-dihydro-6H-pyrimido[1,2-a]pyrimidin-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~225.30 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.63 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.63 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.63 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2530 mL 11.2651 mL 22.5301 mL
5 mM 0.4506 mL 2.2530 mL 4.5060 mL
10 mM 0.2253 mL 1.1265 mL 2.2530 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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