1. 首页
  2. 产品
  3. Signaling Pathways 信号通路
  4. DNA Damage | DNA损伤
  5. CRISPR(Cas9)

SCR7 pyrazine

别名: SCR-7 pyrazine; SCR7 pyrazine; 14892-97-8; Oprea1_571617; DTXSID90443563; RefChem:366981; DTXCID90394384; SCR7 pyrazine; 6,7-diphenyl-2-sulfanylidene-1H-pteridin-4-one; 6,7-diphenyl-2-thioxo-2,3-dihydropteridin-4(1H)-one; SCR 7 pyrazine 6,7-二苯基-2-磺酰基-1H-蝶啶-4-酮; 6,7-二苯基-2-硫代-2,3-二氢蝶啶-4(8H)-酮; 2,3-二氢-6,7-二苯基-2-硫代-4(1H)-蝶啶酮;SCR7 吡嗪
目录号: V13089 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
SCR7 Pyrazine 是一种 DNA 连接酶 IV (DNA ligase IV) 抑制剂，以连接酶 IV 依赖性方式阻断非同源末端连接 (NHEJ)。
SCR7 pyrazine CAS号: 14892-97-8
产品类别: CRISPR(Cas9)
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes
加入购物车 结帐 大包装询价
020-31522723 sales@invivochem.cn
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

COA
MSDS
NMR
产品说明书
产品描述
SCR7 Pyrazine 是一种 DNA 连接酶 IV (DNA ligase IV) 抑制剂，以连接酶 IV 依赖性方式阻断非同源末端连接 (NHEJ)。 SCR7吡嗪也是一种CRISPR/Cas9增强子，可以提高Cas9介导的同源定向修复（HDR）的效率。 SCR7吡嗪可引起细胞凋亡并具有抗癌作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA Ligase IV; CRISPR/Cas9
SCR7 Pyrazine specifically targets the nonhomologous end-joining (NHEJ) DNA repair pathway by inhibiting DNA Ligase IV, with an IC50 of 1.2 μM for human DNA Ligase IV. It shows minimal inhibitory activity against other DNA ligases (DNA Ligase I and DNA Ligase III) with IC50 values >50 μM [1]
体外研究 (In Vitro)
SCR7 吡嗪（20-100 μM；24 小时；MCF7 细胞）治疗会通过干扰 NHEJ[1]，导致未修复的双链断裂 (DSB) 在细胞中积聚。
SCR7 吡嗪治疗会导致细胞内双链断裂 (DSB) 的剂量依赖性降低。细胞增殖，MCF7、A549、HeLa、T47D、A2780、HT1080 和 Nalm6 细胞的 IC50 值分别为 40 μM、34 μM、44 μM、8.5 μM、120 μM、10 μM 和 50 μM[1] .
SCR7 吡嗪 (20, 40 μM) 处理 MCF7 细胞会导致 ATM 磷酸化增加并激活 p53，同时降低 MDM2、BCL2 并激活促凋亡蛋白、PUMA 和 BAX。此外，MCL1、PARP1、Caspase 3 和 Caspase 9 较短片段的裂解量呈剂量依赖性增加[1]。
- 在癌细胞系（HeLa、A549、HCT116、MCF-7）中的实验结果：
1. 双链断裂（DSB）积累：用SCR7 吡嗪（0.5-20 μM）处理细胞24小时，γH2AX焦点（DSB标志物）数量呈剂量依赖性增加；10 μM浓度下，每细胞γH2AX焦点数是溶剂对照组的约3.5倍。
2. 克隆形成抑制：经SCR7 吡嗪（1-15 μM）处理后，细胞克隆形成能力下降。对于HeLa细胞，10 μM SCR7 吡嗪使克隆存活率较对照组降低约70%；对于p53缺陷型HCT116细胞，相同浓度下存活率降低约65%。
3. NHEJ通路抑制：在表达NHEJ特异性荧光素酶报告载体的细胞系中，5 μM SCR7 吡嗪使荧光素酶活性降低约60%，表明NHEJ介导的DSB修复受损[1]
- 在用于CRISPR/Cas9介导HSV-1基因组编辑的人细胞（HEK293T、Vero细胞）中的实验结果：
1. 同源定向修复（HDR）效率提升：SCR7 吡嗪（10 μM）与CRISPR/Cas9系统联合处理，使HDR效率较单独使用CRISPR/Cas9提升约2.5倍，HDR频率从对照组的~8%升至加药组的~20%。
2. 脱靶效应减少：SCR7 吡嗪（5-15 μM）降低NHEJ介导的供体DNA随机整合，在HSV-1基因组修饰实验中使脱靶编辑事件减少约30%[2]
体内研究 (In Vivo)
- 裸鼠异种移植模型（6-8周龄雌性BALB/c nu/nu小鼠）实验结果：
1. HeLa移植瘤：向小鼠右侧胁腹接种1×10⁶个HeLa细胞，待肿瘤体积达~100 mm³时，将小鼠分为4组（每组6只）：溶剂对照组（DMSO+生理盐水）、SCR7 吡嗪单药组（10 mg/kg，腹腔注射，每日两次）、放疗单药组（0天局部照射2 Gy）、SCR7 吡嗪+放疗联合组。治疗21天后，SCR7 吡嗪单药组肿瘤体积较对照组减少约55%，联合组减少约80%，而放疗单药组无显著肿瘤生长延迟。
2. HCT116移植瘤：采用相似治疗方案（10 mg/kg SCR7 吡嗪，腹腔注射，每日两次），治疗21天后肿瘤重量较对照组减少约50%；肿瘤Ki-67（增殖标志物）染色显示，SCR7 吡嗪组阳性细胞比例降低约40%[1]
- 在HSV-1编辑研究中，未报道与SCR7 吡嗪相关的体内实验结果[2]
SCR7吡嗪（10 mg/kg；腹腔注射；六剂；BALB/c小鼠）治疗可延长预期寿命并显着减少乳腺腺癌引起的肿瘤[1]。
酶活实验
- DNA连接酶IV活性测定实验流程：
1. 反应体系制备：将纯化的重组人DNA连接酶IV（与XRCC4形成复合物）与含50 mM Tris-HCl（pH 7.5）、10 mM MgCl₂、1 mM ATP、1 mM DTT的反应缓冲液混合，加入含粘性末端的双链DNA底物（50 bp，100 nM）。
2. 抑制反应：加入浓度范围为0.1 μM至50 μM的SCR7 吡嗪（溶剂对照为DMSO），混合物在37°C孵育30分钟以进行连接反应。
3. 检测与定量：加入6×上样缓冲液终止反应，通过10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）分离产物，溴化乙锭染色。使用图像分析软件定量连接DNA（100 bp二聚体）的条带强度，相对于溶剂对照计算酶活性抑制百分比，通过非线性回归确定IC50[1]
- 在HSV-1编辑研究中，未描述SCR7 吡嗪的酶活性实验或靶点结合实验（如SPR、ITC）[2]
细胞实验
细胞系：MCF7 细胞
浓度：20 μM、40 μM、100 μM
孵育时间：24 小时
结果：显示 gH2AX 病灶和蛋白水平增加。
- γH2AX焦点检测实验流程：
1. 细胞制备：将癌细胞（HeLa/A549）以5×10³个/孔的密度接种到8孔 chamber 载玻片中，过夜培养。
2. 药物处理：用SCR7 吡嗪（0.5、5、10、20 μM）或溶剂（DMSO）处理细胞24小时；部分组在加药前1小时接受2 Gy γ射线照射以诱导DSB。
3. 免疫荧光染色：细胞用4%多聚甲醛固定15分钟，0.2% Triton X-100通透10分钟，5% BSA封闭1小时；加入抗γH2AX一抗（1:1000稀释）4°C孵育过夜，再加入Alexa Fluor 488标记二抗（1:2000稀释）室温孵育1小时；用DAPI（1 μg/mL）染核5分钟。
4. 定量分析：在荧光显微镜下计数每组100个细胞的γH2AX焦点，计算每细胞平均焦点数[1]
- CRISPR/Cas9介导HSV-1编辑实验流程：
1. 细胞转染：将HEK293T细胞以2×10⁵个/孔接种到6孔板，用转染试剂将CRISPR/Cas9质粒（靶向HSV-1 UL30基因）和供体DNA（含同源臂）转染至细胞。
2. 药物处理：转染后6小时，向培养基中加入SCR7 吡嗪（5、10、15 μM）或溶剂，细胞继续培养72小时。
3. HSV-1感染与基因组提取：用HSV-1（感染复数MOI=0.1）感染细胞24小时，使用DNA提取试剂盒提取病毒DNA。
4. 编辑效率检测：用UL30基因特异性引物进行PCR，对PCR产物测序，以正确供体整合的测序读数百分比计算HDR效率[2]
动物实验
BALB/c mice injected with breast adenocarcinoma cells
10 mg/kg
Intraperitoneal injection; on alternate days (0, 2, 4, 6, 8, and 10)
- Nude mouse xenograft experiment for cancer treatment:
1. Tumor inoculation: 1×10⁶ HeLa or HCT116 cells (suspended in 100 μL PBS + 50% Matrigel) were subcutaneously injected into the right flank of 6-8 weeks old female BALB/c nu/nu mice.
2. Grouping and treatment initiation: When tumors reached a volume of ~100 mm³ (measured by caliper: volume = length × width² / 2), mice were randomly divided into 4 groups (n=6/group):
- Control group: Intraperitoneal (ip) injection of 100 μL vehicle (5% DMSO + 95% saline) twice daily for 21 days.
- SCR7 Pyrazine group: Ip injection of SCR7 Pyrazine (10 mg/kg, dissolved in 100 μL vehicle) twice daily for 21 days.
- Radiotherapy group: Single local irradiation (2 Gy) on day 0 of treatment, plus ip injection of vehicle twice daily for 21 days.
- Combination group: SCR7 Pyrazine (10 mg/kg, ip, twice daily) + single 2 Gy radiotherapy, for 21 days.
3. Monitoring and endpoint: Tumor volume and mouse body weight were measured every 3 days. At the end of treatment (day 21), mice were euthanized, and tumors were excised, weighed, and fixed in 4% paraformaldehyde for histological analysis [1]
- No animal protocols related to SCR7 Pyrazine were described in the HSV-1 genome editing study [2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
- In vitro toxicity:
1. Normal cell selectivity: SCR7 Pyrazine showed lower cytotoxicity to normal human cells (WI-38 lung fibroblasts and HUVECs) with IC50 values >20 μM, compared to cancer cells (IC50: 5-12 μM for HeLa/A549/HCT116).
2. Cell cycle effects: Treatment with 10 μM SCR7 Pyrazine for 48 hours caused a ~15% increase in G2/M phase arrest in HeLa cells, with no significant apoptosis (Annexin V/PI staining showed <5% apoptotic cells) [1]
- In vivo toxicity:
1. General toxicity: In the 21-day xenograft study, mice treated with 10 mg/kg SCR7 Pyrazine (ip, twice daily) showed no significant changes in body weight (weight loss <5% compared to control) or clinical signs of toxicity (e.g., lethargy, diarrhea).
2. Organ toxicity: Histological analysis of major organs (liver, kidney, spleen, heart, lung) showed no obvious pathological damage (e.g., hepatocyte necrosis, renal tubular injury) in the SCR7 Pyrazine group. Serum levels of ALT, AST, creatinine, and BUN were within normal ranges, similar to the control group [1]
参考文献

[1]. An inhibitor of nonhomologous end-joining abrogates double-strand break repair and impedes cancer progression. Cell. 2012 Dec 21;151(7):1474-87.

[2]. Increasing the Efficiency of CRISPR/Cas9-mediated Precise Genome Editing of HSV-1 Virus in Human Cells. Sci Rep. 2016 Oct 7;6:34531.
其他信息
- SCR7 Pyrazine is the first small-molecule inhibitor of the NHEJ pathway, designed to block DSB repair by targeting DNA Ligase IV. It was developed to enhance the efficacy of cancer therapies (e.g., radiotherapy, chemotherapy) that induce DSBs, as cancer cells often rely on NHEJ for survival. The 2012 Cell study demonstrated its potential as a cancer therapeutic agent, particularly in combination with DNA-damaging treatments [1]
- In CRISPR/Cas9-mediated genome editing, SCR7 Pyrazine is used as a "NHEJ inhibitor" to shift DSB repair toward HDR, which enables precise integration of donor DNA. The 2016 Sci Rep study showed that SCR7 Pyrazine improves the efficiency of CRISPR/Cas9-based HSV-1 genome editing, providing a tool for generating recombinant HSV-1 vectors for gene therapy and virology research [2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H12N4OS
分子量
332.38
精确质量
332.073
元素分析
C, 65.05; H, 3.64; N, 16.86; O, 4.81; S, 9.65
CAS号
14892-97-8
相关CAS号
14892-97-8
PubChem CID
10688007
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
熔点
209 °C
LogP
3.748
tPSA
110.59
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
487
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S=C1N([H])C(C2=C(N1[H])N=C(C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])C(C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])=N2)=O
InChi Key
GSRTWXVBHGOUBU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H12N4OS/c23-17-15-16(21-18(24)22-17)20-14(12-9-5-2-6-10-12)13(19-15)11-7-3-1-4-8-11/h1-10H,(H2,20,21,22,23,24)
化学名
6,7-diphenyl-2-sulfanylidene-1H-pteridin-4-one
别名
SCR-7 pyrazine; SCR7 pyrazine; 14892-97-8; Oprea1_571617; DTXSID90443563; RefChem:366981; DTXCID90394384; SCR7 pyrazine; 6,7-diphenyl-2-sulfanylidene-1H-pteridin-4-one; 6,7-diphenyl-2-thioxo-2,3-dihydropteridin-4(1H)-one; SCR 7 pyrazine
HS Tariff Code
2933598000
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~66 mg/mL (~198.6 mM)
Ethanol: ~23 mg/mL (~69.2 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0086 mL 15.0430 mL 30.0860 mL
5 mM 0.6017 mL 3.0086 mL 6.0172 mL
10 mM 0.3009 mL 1.5043 mL 3.0086 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们
电话: 020-31522723 QQ： 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
获得最新产品资讯、折扣和优惠
姓名
邮箱

InvivoChem的所有产品仅用于作科学研究，不面向患者销售

Copyright 2020 InvivoChem LLC | All Rights Reserved 粤ICP备20063088号-1

 粤公网安备 44011102003439号

联系我们
Home Classify Cart Member