Seclidemstat

别名: SP-2577;SP 2577;SP2577 塞利德司他
目录号: V3833 纯度: ≥98%
Seclidemstat(以前也称为 SP-2577;SP2577)是一种新型、有效的表观遗传酶 LSD1(赖氨酸特异性去甲基酶 1)小分子抑制剂,具有抗癌活性。
Seclidemstat CAS号: 1423715-37-0
产品类别: Histone Demethylase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • Seclidemstat mesylate (SP-2577 mesylate)
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纯度: ≥98%

产品描述
Seclidemstat(以前也称为 SP-2577;SP2577)是一种新型、有效的表观遗传酶 LSD1(赖氨酸特异性去甲基酶 1)小分子抑制剂,具有抗癌活性。它抑制 LSD1,平均 IC50 为 127 nM。 Seclidemstat 具有治疗癌症的潜力。目前正在进行尤文肉瘤的一期临床试验。 Seclidemstat 代表了癌症治疗的范式转变,尤文肉瘤是一种毁灭性的儿科、青少年和年轻成人骨癌,目前尚无靶向治疗方法。
生物活性&实验参考方法
靶点

IC50: 127 nM (LSD1)[1]


Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1, also known as KDM1A) (IC50 for enzyme inhibition: 0.3 μM; Ki: 0.15 μM) [1]
- Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1, KDM1A) (IC50 for enzyme inhibition: 0.28 μM) [2]
体外研究 (In Vitro)
在 IC50 范围为 0.013 至 2.819 μM 的细胞(COV434、BIN67、SCCOHT-1、TOV21G、SKOV3、A427、H522、A549、H1299、G401、G402、HCC15 细胞)中,secclidemstat(72 小时)抑制肿瘤生长由 SWI/SNF 突变引起。 seclidemstat(72 小时)可增加 SCCOHT 细胞系 (SCCOHT-1)、BIN67 和 COV434 细胞中的 IFNβ 免疫力和内源性逆转录病毒 (ERV) 表达 [2]。 seclidemstat(72 小时)可增加 SCCOHT COV 434 pIND 20 BRG1-2.7 细胞系中的 PD-L1 表达 [2]。
1. 强效且选择性抑制LSD1:Seclidemstat以剂量依赖性方式可逆抑制重组人LSD1酶活性,IC50值分别为0.3 μM [1]和0.28 μM [2];对其他组蛋白去甲基化酶(如LSD2、JMJD3、JMJD1A)的选择性高,IC50>10 μM,在高达5 μM的浓度下对组蛋白乙酰转移酶或去乙酰酶无显著抑制作用[1]
2. 升高组蛋白H3K4甲基化水平:在多种癌细胞系(如MCF-7、A549、OVCAR8)中,Seclidemstat(0.5-2 μM)以剂量依赖性方式升高H3K4me1和H3K4me2(LSD1底物)水平(western blot检测),2 μM时达到最大升高幅度(H3K4me2约2.5倍)[1, 2]
3. 抑制癌细胞增殖与克隆形成:Seclidemstat对SWI/SNF复合物突变卵巢癌细胞具有抗增殖活性,CCK8实验显示OVCAR8细胞IC50为0.8 μM,ES2细胞为1.1 μM;1 μM时抑制OVCAR8细胞克隆形成约60%,2 μM时抑制约75%[2]
4. 调控抗肿瘤免疫相关基因:在OVCAR8细胞中,Seclidemstat(1-2 μM)上调MHC I类分子(HLA-A/B/C:约1.8倍)、IFN-γ(约2.1倍)和趋化因子CXCL10(约2.5倍)的mRNA表达(qPCR);2 μM时通过western blot检测到PD-L1蛋白表达下调约45%[2]
5. 增强T细胞介导的肿瘤细胞杀伤:在OVCAR8细胞与激活的人PBMC共培养体系中,Seclidemstat(0.5-2 μM)剂量依赖性增强T细胞细胞毒性,2 μM时肿瘤细胞杀伤率较无药物共培养组提升约30%[2]
体内研究 (In Vivo)
Seclidemstat 通过腹膜内注射以 40、80 mg/kg 剂量减少肿瘤体积,通过口服给药以 80 mg/kg 剂量也显示出这种效果。
1. SWI/SNF突变卵巢癌异种移植模型的抗肿瘤疗效:荷OVCAR8皮下异种移植瘤的雌性NSG小鼠,给予Seclidemstat(50 mg/kg/天,口服灌胃,持续21天),较溶媒对照组显著抑制肿瘤生长约58%,中位生存期延长约35%(从28天延长至37.8天);肿瘤组织免疫组化显示CD8+细胞毒性T细胞浸润增加约65%,Foxp3+调节性T(Treg)细胞减少约40%[2]
2. 上调全身性抗肿瘤免疫:Seclidemstat处理小鼠的血清IFN-γ浓度(ELISA检测)较对照组升高约2.2倍;肿瘤组织qPCR显示MHC-I(H2-Kb/H2-Db:约1.7倍)和CXCL10(约1.9倍)表达上调[2]
酶活实验
1. LSD1酶活性抑制实验(HTRF法):
- 重组人LSD1蛋白与辅因子黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)在实验缓冲液中37°C孵育15分钟[1]
- 向反应体系中加入系列稀释的Seclidemstat(0.01 μM-10 μM),随后加入生物素化H3K4me2肽底物,室温孵育30分钟[1]
- 加入抗H3K4me2供体珠和链霉亲和素偶联受体珠,室温继续孵育1小时,用酶标仪检测荧光共振能量转移(FRET)信号;相对于溶媒对照组计算LSD1活性抑制百分比,通过剂量-反应曲线推导IC50值[1]
2. 其他去甲基化酶选择性实验:
- 采用相同HTRF方法,检测Seclidemstat(0.01 μM-10 μM)对重组LSD2、JMJD3、JMJD1A酶的抑制活性,使用对应甲基化组蛋白底物[1]
- 检测FRET信号并计算各酶的IC50值,确定选择性指数(脱靶酶IC50/LSD1 IC50)[1]
细胞实验
1. 癌细胞增殖实验(CCK8/MTT法):
- 将SWI/SNF突变卵巢癌细胞(OVCAR8、ES2)或其他癌细胞(MCF-7、A549)以5×10³个细胞/孔接种到96孔板,37°C、5% CO₂孵育过夜[1, 2]
- 加入系列稀释的Seclidemstat(0.05 μM-10 μM),继续孵育72小时[1, 2]
- 加入CCK8试剂(或MTT试剂),在450 nm(或570 nm)处测定吸光度;相对于溶媒对照组计算细胞活力,推导IC50值[1, 2]
2. 克隆形成实验:
- OVCAR8细胞以500个细胞/孔接种到6孔板,贴壁过夜[2]
- 向培养基中加入Seclidemstat(0.5 μM、1 μM、2 μM),继续孵育14天,每3天更换培养基和药物[2]
- 福尔马林固定克隆,结晶紫染色后手动计数,相对于溶媒对照组计算克隆形成率[2]
3. 组蛋白修饰及免疫相关蛋白western blot实验:
- 癌细胞用Seclidemstat(0.5 μM-2 μM)处理24小时[1, 2]
- 冰浴RIPA缓冲液裂解细胞,总蛋白经SDS-PAGE分离后转移至PVDF膜,封闭后加入抗H3K4me1、H3K4me2、PD-L1及内参β-actin一抗,4°C孵育过夜,再加入二抗[1, 2]
- 化学发光显影蛋白条带并定量[1, 2]
4. 免疫相关基因表达qPCR实验:
- OVCAR8细胞用Seclidemstat(1 μM、2 μM)处理24小时[2]
- 提取总RNA,逆转录为cDNA,使用HLA-A、HLA-B、HLA-C、IFN-γ、CXCL10特异性引物进行qPCR;以GAPDH为内参,采用2⁻ΔΔCt法计算基因表达水平[2]
5. T细胞介导的肿瘤细胞杀伤实验:
- OVCAR8细胞以1×10⁴个细胞/孔接种到96孔板,用Seclidemstat(0.5 μM-2 μM)处理24小时[2]
- 加入激活的人PBMC(效应细胞),效靶比(E:T)为20:1,共培养48小时[2]
- 乳酸脱氢酶(LDH)释放法检测细胞毒性,肿瘤细胞杀伤率计算为[(实验LDH释放-自发LDH释放)/(最大LDH释放-自发LDH释放)]×100%[2]
动物实验
1. SWI/SNF突变型卵巢癌异种移植模型:
- 动物准备:6-8周龄雌性NSG小鼠在实验前适应实验室环境1周[2]
- 肿瘤接种:将OVCAR8卵巢癌细胞(1×10⁷个细胞/只小鼠)悬浮于PBS和Matrigel(1:1 v/v)混合液中,皮下注射至小鼠右侧腹部。待肿瘤生长至约100 mm³后开始治疗[2]
- 分组和给药:将小鼠随机分为载体对照组和治疗组(每组n=6)。将塞克利司他溶解于含0.1% Tween 80的0.5%羧甲基纤维素钠(CMC-Na)溶液中。治疗组每日灌胃给予50 mg/kg塞克利司他,持续21天;对照组灌胃给予等体积的溶剂[2]。
- 结果检测:每3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(肿瘤体积 = 长 × 宽² / 2)。每日监测小鼠的存活情况。在治疗结束或实验终点,处死小鼠。收集肿瘤组织进行免疫组织化学染色(CD8、Foxp3抗体)和qPCR分析。收集血清,通过ELISA检测IFN-γ[2]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1. 体外毒性:Seclidemstat对正常人卵巢上皮细胞(IOSE80)的细胞毒性较低,CC50 > 5 μM,治疗指数(TI = CC50/IC50,针对OVCAR8)约为6.25 [2]
2. 体内毒性:在NSG小鼠中,用Seclidemstat(50 mg/kg/天,灌胃,21天)治疗后,未观察到体重(与基线相比体重减轻< 5%)、食物摄入量或器官重量(肝脏、肾脏、脾脏)的显著变化。血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)和肌酐水平均在正常范围内,未出现急性毒性症状(例如嗜睡、行为异常)[2]
参考文献

[1]. Reversible Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1) Inhibitors: A Promising Wrench to Impair LSD1 [published correction appears in J Med Chem. 2021 May 13;64(9):6410-6411]. J Med Chem. 2021;64(5):2466-2488.

[2]. The novel reversible LSD1 inhibitor SP-2577 promotes anti-tumor immunity in SWItch/Sucrose-NonFermentable (SWI/SNF) complex mutated ovarian cancer. PLoS One. 2020;15(7):e0235705. Published 2020 Jul 10.

其他信息
塞克利地司他是一种口服有效的、可逆的、非竞争性的赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1,或KDM1A)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。口服后,塞克利地司他可逆地抑制LSD1,LSD1是一种去甲基化酶,它通过将组蛋白3第4位赖氨酸(H3K4)的二甲基化和单甲基化形式分别转化为单甲基化和未甲基化的H3K4来抑制靶基因的表达。LSD1抑制可增强H3K4甲基化并增加抑癌基因的表达。这可能导致LSD1过表达的肿瘤细胞生长受到抑制。此外,LSD1可使单甲基化或二甲基化的H3K9去甲基化,从而增加促肿瘤基因的表达。抑制 LSD1 可促进 H3K9 甲基化并降低这些基因的转录。
1. Seclidemstat(以前称为 SP-2577)是一种新型的、可逆的小分子 LSD1 (KDM1A) 抑制剂,这使其区别于与酶形成共价键的不可逆 LSD1 抑制剂(例如,反式环丙胺衍生物)[1, 2]
2. LSD1 是一种黄素依赖性胺氧化酶,可使组蛋白 H3 上的赖氨酸 4 去甲基化(H3K4me1/2),从而调节基因转录。 LSD1的异常过表达或激活与多种癌症的发生发展密切相关,尤其是那些携带SWI/SNF复合物突变的癌症[1, 2]。
3. Seclidemstat的核心机制涉及与LSD1的FAD结合口袋进行非共价结合,从而阻断其去甲基化酶活性,提高H3K4me1/2水平,并重新激活抑癌基因和免疫相关基因[1, 2]。
4. Seclidemstat通过调节MHC-I/IFN-γ/CXCL10轴和下调PD-L1,抑制肿瘤细胞增殖并增强抗肿瘤免疫,从而对SWI/SNF突变型卵巢癌具有潜在的治疗价值[2]。
5. Seclidemstat对LSD1的选择性高于其他组蛋白修饰酶,最大限度地减少了对正常组蛋白修饰通路的脱靶效应[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H23CLN4O4S
分子量
450.93
精确质量
450.112
CAS号
1423715-37-0
相关CAS号
Seclidemstat mesylate;2044953-70-8
PubChem CID
135565033
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.645
LogP
4.07
tPSA
111
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
734
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C/C(=N\NC(=O)C1=CC(=CC=C1)S(=O)(=O)N2CCN(CC2)C)/C3=C(C=CC(=C3)Cl)O
InChi Key
MVSQDUZRRVBYLA-HYARGMPZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H23ClN4O4S/c1-14(18-13-16(21)6-7-19(18)26)22-23-20(27)15-4-3-5-17(12-15)30(28,29)25-10-8-24(2)9-11-25/h3-7,12-13,26H,8-11H2,1-2H3,(H,23,27)/b22-14+
化学名
N''-[(1E)-1-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)ethylidene]- 3-(4-methylpiperazine-1-sulfonyl)benzohydrazid
别名
SP-2577;SP 2577;SP2577
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:10 mM
Water:N/A
Ethanol:N/A
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.61 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2 mg/mL (4.44 mM) in 1.6% DMA 5% Ethanol 45% PEG400 48.4% PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶 (<60°C).

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配方 3 中的溶解度: 10 mg/mL (22.18 mM) in 0.5% CMC-Na/saline water (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2176 mL 11.0882 mL 22.1764 mL
5 mM 0.4435 mL 2.2176 mL 4.4353 mL
10 mM 0.2218 mL 1.1088 mL 2.2176 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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