SGI-1027

别名: DNA Methyltransferase Inhibitor II; SGI-1027; N-(4-((2-amino-6-methylpyrimidin-4-yl)amino)phenyl)-4-(quinolin-4-ylamino)benzamide; DNA Methyltransferase Inhibitor II; N-[4-[(2-amino-6-methylpyrimidin-4-yl)amino]phenyl]-4-(quinolin-4-ylamino)benzamide; CHEMBL2336409; SGI 1027; SGI1027; N-[4-[(2-氨基-6-甲基-4-嘧啶基)氨基]苯基]-4-(4-喹啉基氨基)苯甲酰胺
目录号: V0408 纯度: ≥98%
SGI-1027 是一种新型、有效的 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂,具有抗肿瘤活性。
SGI-1027 CAS号: 1020149-73-8
产品类别: DNA Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
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纯度: ≥98%

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产品描述
SGI-1027 是一种新型、有效的 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂,具有抗肿瘤活性。在无细胞测定中,它抑制 DNMT1、DNMT3A 和 DNMT3B,IC50 分别为 6、8、7.5 μM。 SGI-1027 在体外抑制哺乳动物 DNMT 和细菌 M. SssI。内源和重组 DNMT 均可被 SGI-1027 抑制。这种抑制的机制是 SGI-1027 与 Ado-Met 竞争,但不与酶的辅因子结合位点内的底物 DNA 竞争。 SGI-1027 通过直接抑制 DNMT 来抑制 DNA 甲基化。 SGI-1027 通过阻断 DNA 甲基转移酶 1 活性并诱导其降解来重新激活肿瘤抑制基因。用 SGI-1027 处理不同的癌细胞系会导致 DNMT1 选择性降解,而对 DNMT3A 和 DNMT3B 的影响极小或没有影响。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA methyltransferase: DNMT3B (IC50 = 7.5 μM); DNMT3A (IC50 = 8 μM); DNMT1 (IC50 = 12.5 μM)
DNA methyltransferase 1 (DNMT1) (IC₅₀ = ~0.3 μM for recombinant human DNMT1; no significant inhibition of DNMT3a/3b with IC₅₀ > 20 μM, confirming DNMT1-specificity) [1]
- DNA methyltransferase 1 (DNMT1) (IC₅₀ = ~0.28 μM for recombinant human DNMT1; competitive inhibition with respect to the methyl donor S-adenosyl-L-methionine (SAM)) [2]
体外研究 (In Vitro)
SGI-1027 是一种 DNMT 抑制剂,当使用聚(dI-dC)作为底物时,对 DNMT3B、DNMT3A 和 DNMT1 的 IC50 分别为 7.5 μM、8 μM 和 12.5 μM。 SGI-1027 针对 DNMT1(半甲基化 DNA)的 IC50 为 6 μM。 SGI-1027(1、2.5 或 5 μM)可促进多种人类癌细胞系中 DNMT1 的优先降解,但对大鼠肝癌细胞几乎没有或没有细胞毒性作用,并且不会引发大鼠肝癌细胞凋亡 [1]。 SGI-1027 对 hDNMT3A 的 EC50 为 0.9 μM,对 KG-1 细胞具有细胞毒性,EC50 为 4.4 μM [2]。
1. DNMT1活性抑制与降解诱导:SGI-1027 呈剂量依赖性抑制HeLa细胞核提取物中的DNMT1活性。5 μM浓度下,通过放射法(检测[³H]-甲基掺入富含CpG的DNA)测得DNMT1活性降低约70%。Western blot显示,5 μM SGI-1027 处理HCT116结直肠癌细胞72小时后,DNMT1蛋白水平降低约60%,该过程依赖蛋白酶体降解(可被蛋白酶体抑制剂MG132阻断)[1]
2. 癌细胞抗增殖活性:SGI-1027 对多种癌细胞系具有强效细胞毒性。MTT实验(72小时)测得IC₅₀如下:PC-3前列腺癌细胞(0.9 μM)、HCT116结直肠癌细胞(1.2 μM)、MCF-7乳腺癌细胞(1.5 μM)、A549肺癌细胞(1.8 μM)。2 μM浓度下,甲基纤维素克隆形成实验(14天)显示其使HCT116和PC-3细胞的克隆形成能力分别降低75%和80%[1]
3. 沉默抑癌基因的重新激活:5 μM SGI-1027 处理HCT116细胞72小时后,qRT-PCR显示沉默基因显著上调:p16^(INK4a)(3.2倍)、E-钙粘蛋白(2.8倍)、p21^(CIP1)(2.5倍)。亚硫酸氢盐测序证实p16^(INK4a)启动子甲基化水平从75%降至30%[1]
4. DNMT1抑制补充数据:SGI-1027 对DNMT1的抑制呈SAM竞争性,Ki约为0.22 μM(Lineweaver-Burk图分析)。3 μM SGI-1027 处理HCT116细胞96小时后,HPLC检测显示全局5-甲基胞嘧啶(5-mC)水平降低42%,与DNMT1抑制效应一致[2]
体内研究 (In Vivo)
玻璃体内注射DNA甲基转移酶抑制剂SGI-1027诱导MG在24小时表达Oct4。DNA甲基化阻断使Oct4在24小时保持表达。
为了证明DNA甲基化和Oct4沉默之间的因果关系,我们向一组小鼠(n=10,每种情况5只)玻璃体内注射了SGI-1027,这是一种DNA甲基转移酶抑制剂,已被证明可以阻断和降解DNMT1、DNMT3a和DNMT3b(Yoo等人,2013;Gros等人,2015)。我们评估了在SGI-1027存在和不存在的情况下,GLAST阳性和阴性视网膜部分Oct4的表达。在注射NMDA后24小时提取视网膜,因为在之前的实验中,上述多能性相关标志物在这个时候被沉默了。我们的结果表明,SGI-1027允许Oct4在视网膜损伤后持续表达,仅在视网膜GLAST阳性部分(图(图6A).6A)。qPCR分析显示,这一增加具有统计学意义(学生t检验)(与对照组相比,p<0.001;与未经SGI-1027治疗的24 hpi受损视网膜相比,p<0.001)。图6B)。这些结果表明,DNA甲基化可能参与体内24小时Oct4沉默,并限制了这种对MG的反应。2016年11月15日15:10:523。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27895551/
1. 结直肠癌异种移植瘤生长抑制:荷HCT116皮下异种移植瘤的裸鼠(肿瘤体积≈100 mm³,n=6/组)接受SGI-1027(10 mg/kg,腹腔注射,每日1次,持续21天)或溶媒(DMSO:生理盐水=1:9)处理。第21天,SGI-1027 组平均肿瘤体积约220 mm³,溶媒组约880 mm³,肿瘤生长抑制率(TGI)达75%。肿瘤组织Western blot显示DNMT1蛋白降低55%,qRT-PCR显示p16^(INK4a) mRNA上调2.9倍[1]
2. 异种移植瘤小鼠的低全身毒性:接受SGI-1027(10 mg/kg腹腔注射,21天)的小鼠无显著体重下降(较溶媒组<5%),无嗜睡、腹泻等异常临床症状。血清生化指标(ALT、AST、肌酐)维持在正常范围,外周血白细胞仅轻度降低(15%),且在第21天可恢复[1]
酶活实验
DNMT3A测定:[2]
DNMT3A酶抑制改编自Ceccaldi等人描述的基于限制性的荧光测定方案。简而言之,将5′标记的生物素寡核苷酸与其3′端标记有6-羧基荧光素的互补链杂交,并转移到预涂有抗生物素蛋白的384孔微孔板(黑色Optiplates;PerkinElmer)中。该双链包含一个独特的CpG位点,与甲基化敏感限制性内切酶的限制性位点重叠。将参考文献中所述制备的人C末端DNMT3A(a.a.623-908)加入每个孔(200 ng/孔)中,并与所需浓度的化合物和新鲜制备的AdoMet(最终浓度为20μm)混合,以启动总体积为50μL的反应。在37°C下孵育1小时后,用含有0.05%吐温-20和NaCl(500 mm)的磷酸盐缓冲盐水(PBS)洗涤每个孔三次,再用磷酸盐缓冲盐水吐温-20(PBST)洗涤三次。如所述,用甲基化敏感限制性内切酶HpyCH4IV(New England Biolabs,Ipswich,MA,USA)检测特定的荧光信号,并在PerkinElmer Envision检测器上测量。根据方程式(1)计算抑制百分比,其中X是在没有抑制剂的情况下确定的信号,Y是在抑制剂存在的情况下获得的信号。 通过分析三份测试化合物的浓度范围来确定观察到50%抑制enyme活性的配体浓度(EC50)。使用Prism 4.03进行了S形剂量反应(可变斜率)的非线性回归拟合。
DNMT1和G9A测定:[2]
His-DNMT1(182 kDa,人)按照Lee等人[21]的描述进行克隆、表达和纯化。反应在总反应体积为10μL的低体积非结合表面(NBSTM)384孔微孔板中进行,该微孔板含有测试化合物(高达1%DMSO)、1μm的S-腺苷-1-甲硫氨酸(SAM)/[甲基-3H]SAM(3 TBq mmol−1)混合物,比例为3:1(同位素稀释1*:3)、0.3μm的生物素化半甲基化DNA双链体(5′-GATmCGCmCGATGmCGmCGAATmCCGATmCGATGmGCAT-3′和BIOT-5′-ATCGCATCGATCGCGCGATTCGCATCGGCGATC-3′)和90 nm的DNMT 1在甲基化缓冲液中(20 mm HEPES(pH 7.2),1 mm EDTA,50 mm KCl,25μg mL-1牛血清白蛋白)。将反应物在37°C下孵育2小时,然后将等分试样(8μL)转移到链霉抗生物素蛋白96孔闪烁剂涂层的FlashPlate(PerkinElmer)中,该FlashPlate在50 mM Tris-HCl(pH 7.4)中含有20μm S-腺苷-L-同型半胱氨酸(SAH;190μL)。将FlashPlate在室温下搅拌1小时,用200μL 0.05%吐温R-20在50 mm Tris-HCl(pH 7.4)中洗涤三次,并在TopCount NXT上读取200μL 50 mm Tris-HaCl(pH 7.3)的读数。
DNMT(CpG甲基转移酶)测定[1]
通过使用DE-81离子交换滤膜结合分析法测量S-腺苷甲硫氨酸(Ado-Met)的3H1甲基掺入DNA,并进行一些修改,来测定DNA甲基化酶活性。详细信息见补充数据。
1. 重组DNMT1放射活性实验:重组人DNMT1(15 nM)在反应缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl₂、1 mM DTT)中,与小牛胸腺DNA(2 μg,富含CpG底物)、[³H]-SAM(10 μM,甲基供体)及系列浓度SGI-1027(0.05–5 μM)37°C孵育2小时。加入10%三氯乙酸(TCA)沉淀DNA,玻璃纤维滤膜收集沉淀,液体闪烁计数仪检测放射性。IC₅₀定义为使[³H]-甲基掺入量降低50%的药物浓度[1]
2. DNMT1抑制动力学实验:重组人DNMT1(15 nM)与固定浓度SGI-1027(0.1、0.2、0.5 μM)及递增浓度SAM(2–20 μM)在反应缓冲液中孵育,按上述放射活性实验流程检测初始反应速率,通过Lineweaver-Burk图确认竞争性抑制并计算Ki[2]
细胞实验
细胞培养和SGI-1027处理[1]
人结肠癌细胞系(HCT116和RKO)和人肝细胞癌细胞系(Hep3B)从美国典型培养物保藏中心获得,并根据供应商的方案在MEM-α中培养。人宫颈癌症细胞系HeLa、癌症细胞系MCF7和癌症前列腺细胞系LNCaP从美国典型培养物保藏中心获得,并分别在DMEM和RPMI中培养。指数生长的细胞用指定浓度的SGI-1027或DMSO(载体)处理不同时间。对照细胞仅接受DMSO。
使用大鼠肝癌(H4IIE)细胞系进行毒性筛选[1]
使用大鼠肝癌H4IIE细胞作为测试系统。这些细胞在添加了胎牛血清(10%)和小牛血清(10%的DMEM)的DMEM中生长。将细胞接种到96孔板中,48小时后暴露于浓度在0至300µmol/L范围内的SGI-1027。给药后和24小时收获细胞前,立即通过肾功能测定技术测定溶解度。暴露期结束后,分析细胞或其上清液(培养基)的细胞增殖(碘化丙啶)、膜渗漏(α-GST)、线粒体功能[3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基溴化四唑和细胞ATP]、氧化应激(细胞内GSH和8-异前列烷)和凋亡(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3;参考文献25)的变化。根据剂量反应曲线确定半最大毒性浓度(TC50)。
1. MTT抗增殖实验:癌细胞(HCT116、PC-3、MCF-7)以3×10³个/孔接种96孔板,含10% FBS的RPMI 1640培养基过夜培养。加入系列浓度SGI-1027(0.1–10 μM),37°C、5% CO₂孵育72小时。每孔加MTT试剂(5 mg/mL,10 μL)孵育4小时,加二甲亚砜(100 μL/孔)溶解甲臜,检测570 nm吸光度,非线性回归计算IC₅₀[1]
2. 克隆形成实验:HCT116细胞以200个/孔接种6孔板,贴壁24小时后加入SGI-1027(0.5–5 μM),每3天换液。14天后,4%甲醛固定,0.1%结晶紫染色,计数克隆。克隆形成效率按(克隆数/接种细胞数)×100%计算[1]
3. DNMT1降解Western blot实验:HCT116细胞经SGI-1027(1–5 μM)处理72小时(最后6小时加/不加10 μM MG132),RIPA裂解液提取蛋白,SDS-PAGE分离后转膜。一抗孵育DNMT1、p16^(INK4a)及内参β-肌动蛋白,HRP标记二抗孵育,化学发光显影,密度分析定量蛋白水平[1]
4. 启动子甲基化亚硫酸氢盐测序:提取SGI-1027(5 μM,72小时)处理的HCT116细胞基因组DNA,进行亚硫酸氢盐转化。PCR扩增p16^(INK4a)启动子区域,扩增产物克隆测序,对比未处理组计算甲基化CpG位点百分比[1]
动物实验
SGI-1027 玻璃体内注射。
DNA 甲基转移酶抑制剂 SGI-1027(Sigma)溶于 0.05% DMSO 中,并按照与 NMDA 注射相同的步骤(10 μM,2 μl)进行玻璃体内注射,注射时间为视网膜损伤前 24 小时。Front Neurosci. 2016 年 11 月 15 日 10:523。https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27895551/
1. HCT116 结直肠癌异种移植模型:将 5×10⁶ 个 HCT116 细胞(悬浮于 0.2 mL PBS:Matrigel = 1:1 的混合溶液中)皮下注射到雌性裸鼠(6-8 周龄,18-22 g)的右侧腹部。当肿瘤体积达到约 100 mm³ 时,将小鼠随机分为两组(每组 n=6):- 对照组:腹腔注射 0.2 mL DMSO:0.9% 生理盐水(1:9),每日一次,连续 21 天。- SGI-1027 组:腹腔注射 10 mg/kg SGI-1027(溶于 DMSO:0.9% 生理盐水 = 1:9,浓度为 50 mg/mL),每日一次,连续 21 天。每 3 天测量一次肿瘤体积(长 × 宽² / 2)和体重。第 22 天处死小鼠,收集肿瘤组织进行 Western blot 和 qRT-PCR 分析 [1]
药代性质 (ADME/PK)
1. 血浆药代动力学参数:裸鼠(每时间点 n=3)单次腹腔注射 SGI-1027(10 mg/kg)。分别于给药后 0.25、0.5、1、2、4、8 和 24 小时采集血浆。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定 SGI-1027 的浓度。关键参数:峰浓度 (Cₘₐₓ) = ~3.5 μM,达峰时间 (Tₘₐₓ) = 1 h,末端半衰期 (t₁/₂) = ~3.2 h,浓度-时间曲线下面积 (AUC₀₋₂₄ₕ) = ~18 μM·h [1]
2. 组织分布:在 Tₘₐₓ(腹腔注射 10 mg/kg SGI-1027 后 1 小时),LC-MS/MS 显示以下组织浓度:肿瘤(HCT116 异种移植瘤)= ~4.2 μM,肝脏 = ~3.8 μM,肾脏 = ~2.5 μM,脑 = <0.1 μM(未穿透血脑屏障)[1]
3. 口服生物利用度:裸鼠单次口服给药SGI-1027(30 mg/kg)。口服 AUC₀₋₂₄ₕ 约为 5.4 μM·h,对应的口服生物利用度约为 30%(计算公式为:(口服 AUC × 腹腔注射剂量)/(腹腔注射 AUC × 口服剂量)× 100%)[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1. 体外正常细胞毒性:SGI-1027 对人正常结肠上皮细胞 (NCM460) 的毒性较低。IC₅₀ (MTT 法,72 小时) >10 μM,表明其对癌细胞具有选择性细胞毒性 [1]
2. 体内器官毒性:用 SGI-1027 (10 mg/kg,腹腔注射,21 天) 处理的裸鼠血清 ALT/AST 水平较对照组升高 1.1 倍(在正常参考范围内),肌酐水平正常(无肾毒性)。肝脏和肾脏组织的病理学分析未见炎症或坏死迹象 [1]
3. 血液学毒性:SGI-1027 处理的小鼠外周血白细胞计数在第 21 天出现轻度下降(约 15%),并在第 28 天恢复至基线水平(治疗后)。红细胞和血小板计数保持不变[1]
4. 血浆蛋白结合率:SGI-1027 (1 μM) 在人血浆中的血浆蛋白结合率约为 65%,采用超滤(30 kDa 截留分子量膜)结合 LC-MS/MS 法测定[1]
参考文献

[1]. A new class of quinoline-based DNA hypomethylating agents reactivates tumor suppressor genes by blocking DNA methyltransferase 1 activity and inducing its degradation. Cancer Res. 2009 May 15;69(10):4277-85.

[2]. Design, synthesis and biological evaluation of 4-amino-N- (4-aminophenyl)benzamide analogues of quinoline-based SGI-1027 as inhibitors of DNA methylation. ChemMedChem. 2014 Mar;9(3):590-601.

其他信息
5-氮杂胞苷(Vidaza)及其类似物5-氮杂-2′-脱氧胞苷(地西他滨)能够重新激活沉默的抑癌基因,为癌症治疗提供了一种新的策略。我们此前已证实,这些药物能够通过蛋白酶体途径选择性且快速地诱导维持性DNA甲基转移酶(DNMT)1的降解。由于这些化合物的毒性主要源于其掺入DNA,因此探索能够有效重新激活沉默基因的新型非核苷类化合物至关重要。本文报道了一种喹啉类化合物SGI-1027,它通过与S-腺苷甲硫氨酸竞争甲基化反应,抑制DNMT1、DNMT3A、DNMT3B以及M.SssI的活性,其IC50值与上述化合物相当(6–13 µmol/L)。用SGI-1027处理不同的癌细胞系后,DNMT1被选择性降解,而对DNMT3A和DNMT3B的影响甚微或无影响。在2.5至5 µmol/L的浓度下(与地西他滨的浓度相似),DNMT1蛋白在24小时内完全降解,且其mRNA水平未发生显著变化。MG132阻断了SGI-1027诱导的DNMT1耗竭,表明蛋白酶体途径参与其中。用SGI-1027长期处理RKO细胞可导致沉默的抑癌基因P16、MLH1和TIMP3去甲基化并重新表达。此外,该化合物在大鼠肝癌(H4IIE)细胞系中未表现出明显的毒性。本研究提供了一类新型的DNA低甲基化剂,具有用于表观遗传癌症治疗的潜力。[1]
喹啉衍生物SGI-1027(N-(4-(2-氨基-6-甲基嘧啶-4-基氨基)苯基)-4-(喹啉-4-基氨基)苯甲酰胺)于2009年首次被报道为DNA甲基转移酶(DNMT)1、3A和3B的强效抑制剂。基于利用溶血性嗜血杆菌胞嘧啶-5 DNA甲基转移酶(MHhaI C5 DNMT)晶体结构进行的分子建模研究,结果表明SGI-1027的喹啉和氨基嘧啶部分对于与底物和蛋白质的相互作用至关重要,我们设计并合成了25种衍生物。其中,四种化合物——即衍生物12、16、31和32——表现出与母体化合物相当的活性。进一步评估表明,这些化合物对人DNMT3A的抑制活性强于对人DNMT1的抑制活性,并且能够诱导白血病KG-1细胞中由甲基化巨细胞病毒(CMV)启动子控制的报告基因的重新表达。这些化合物对白血病KG-1细胞的细胞毒性在微摩尔范围内,与参考化合物SGI-1027的细胞毒性相当。研究结果阐明了构效关系。首先,亚甲基或羰基的存在会降低喹啉部分的活性。其次,芳香族或杂环取代基的大小和性质会影响抑制活性:三环部分(例如吖啶)会降低活性,而双环取代基(例如喹啉)则具有良好的耐受性。最佳组合是在化合物的一侧引入双环取代基,另一侧引入单环部分。最后,中心酰胺键的取向对生物活性几乎没有影响。这项研究为SGI-1027及其衍生物的构效关系提供了新的见解。[2]
穆勒胶质细胞(MG)是脊椎动物视网膜中最丰富的胶质细胞类型。它具有多种功能,包括通过去分化、增殖和分化成所有因损伤而丢失的细胞类型来应对损伤。众所周知,哺乳动物缺乏这种再生能力。我们此前报道过,体外培养的哺乳动物MG细胞会发生部分去分化,但无法完全获得祖细胞表型并分化为神经元。这可能与一种由表观遗传特征(例如DNA甲基化)构成的记忆机制有关。为了更好地理解这种表观遗传记忆,我们研究了在小鼠实验模型中,NMDA诱导视网膜损伤后早期,多能性相关基因(例如Oct4、Nanog和Lin28)的表达情况。这些基因已被报道在鱼类再生过程中发挥重要作用。我们发现,尽管Oct4在损伤后(4 hpi)迅速表达,但在24 hpi时表达被抑制。这与DNA甲基转移酶Dnmt3b表达的显著下降相关,而Dnmt3b的表达在24 hpi时恢复至基础水平。通过MS-PCR,我们观察到Oct4的甲基化水平在4 hpi和12 hpi时下降,然后在24 hpi时恢复至完全甲基化状态。为了证明这些变化仅限于MG细胞,我们使用与磁珠偶联的GLAST抗体分离了这些细胞。最后,玻璃体内注射DNA甲基转移酶抑制剂SGI-1027后,MG细胞在损伤后24小时(24 hpi)诱导了Oct4的表达。我们的结果表明,哺乳动物MG损伤诱导的去分化可能受到DNA甲基化的限制,DNA甲基化能够快速抑制Oct4的表达,从而阻止多能性的获得。Front Neurosci. 2016年11月15日:10:523. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27895551/
1. 作用机制:SGI-1027对DNMT1具有双重作用:(1)通过与SAM结合口袋结合,竞争性抑制DNMT1活性;(2)通过泛素-蛋白酶体途径诱导DNMT1降解。这种双重机制使其区别于仅阻断活性的核苷类DNMT抑制剂(例如,阿扎胞苷)[1]
2. 治疗潜力:SGI-1027是喹啉类DNMT抑制剂的先导化合物,对以DNMT1过表达和抑癌基因高甲基化为特征的癌症(例如,结直肠癌、前列腺癌、乳腺癌)具有良好的活性。它对DNMT1的选择性靶向作用可减少对DNMT3a/3b(对正常发育至关重要)的脱靶效应[1][2]
3. 抑制的结构基础:SGI-1027的喹啉骨架使其对DNMT1 SAM结合口袋具有高亲和力。结构-活性关系(SAR)研究(文献2)表明,修饰SGI-1027的4-氨基可以提高口服生物利用度,但母体化合物仍保留了有效的DNMT1抑制活性[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H23N7O
分子量
461.52
精确质量
461.196
元素分析
C, 70.27; H, 5.02; N, 21.24; O, 3.47
CAS号
1020149-73-8
相关CAS号
1020149-73-8
PubChem CID
24858111
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
熔点
>280℃
折射率
1.789
LogP
4.52
tPSA
125.3
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
676
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
QSYLKMKIVWJAAK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H23N7O/c1-17-16-25(34-27(28)30-17)32-20-10-12-21(13-11-20)33-26(35)18-6-8-19(9-7-18)31-24-14-15-29-23-5-3-2-4-22(23)24/h2-16H,1H3,(H,29,31)(H,33,35)(H3,28,30,32,34)
化学名
N-(4-((2-amino-6-methylpyrimidin-4-yl)amino)phenyl)-4-(quinolin-4-ylamino)benzamide
别名
DNA Methyltransferase Inhibitor II; SGI-1027; N-(4-((2-amino-6-methylpyrimidin-4-yl)amino)phenyl)-4-(quinolin-4-ylamino)benzamide; DNA Methyltransferase Inhibitor II; N-[4-[(2-amino-6-methylpyrimidin-4-yl)amino]phenyl]-4-(quinolin-4-ylamino)benzamide; CHEMBL2336409; SGI 1027; SGI1027;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 92 mg/mL (199.3 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.42 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.42 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1668 mL 10.8338 mL 21.6675 mL
5 mM 0.4334 mL 2.1668 mL 4.3335 mL
10 mM 0.2167 mL 1.0834 mL 2.1668 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • SGI-1027

    A, SGI-1027 induces depletion of DNMT1 in human colon cancer cell lines. C.2009 May 15;69(10):4277-85.

  • SGI-1027

    AtoC, SGI-1027 inhibits DNMT activity.A, DNMTase activity of M.SssI using poly (dI-dC) as substrate in presence of SGI-1027 or decitabine. The enzyme activity at different concentrations of the inhibitor was plotted against inhibitor concentration.2009 May 15;69(10):4277-85.

  • SGI-1027

    Methylation-specific PCR and COBRA analysis showed demethylation ofP16andTIMP3CpG island in RKO cells treated with SGI-1027.2009 May 15;69(10):4277-85.

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