METTL1-WDR4-IN-1 TFA

目录号: V115931
METTL1-WDR4-IN-1(化合物 1)TFA 是一种选择性竞争性抑制剂(IC50 = 144 μM),可抑制甲基转移酶复合物 METTL1-WDR4。
METTL1-WDR4-IN-1 TFA 产品类别: DNA Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
METTL1-WDR4-IN-1(化合物 1)TFA 是一种选择性竞争性抑制剂(IC50 = 144 μM),可抑制甲基转移酶复合物 METTL1-WDR4。METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可抑制 METTL1-WDR4 复合物的 m7G 甲基转移酶活性,阻断 PKM mRNA 的 m7G 修饰,降低 PKM2 蛋白表达,破坏 METTL1/PKM2/H3K9la 正反馈环路,并同时抑制 PKM2 核转位介导的 CD155 转录激活。METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可抑制肿瘤细胞增殖,降低糖酵解代谢,逆转肿瘤免疫逃逸(恢复 NK 细胞和 CD8+ T 细胞功能),并调节 RNA 表观遗传修饰和肿瘤免疫微环境。 METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可用于结直肠癌等癌症的免疫学研究,尤其适用于与 PKM2 抑制剂联合使用,以增强抗肿瘤治疗的效果。
METTL1-WDR4-IN-1 TFA 是一种小分子抑制剂,靶向 METTL1-WDR4 甲基转移酶复合物,该复合物负责 tRNA 的 N7-甲基鸟苷 (m7G) 修饰。它是化合物 1 的 TFA 盐形式,用于 RNA 表观遗传学和癌症免疫学研究。它能抑制肿瘤细胞增殖,减弱糖酵解代谢,并通过恢复 NK 细胞和 CD8+ T 细胞功能来逆转肿瘤免疫逃逸。该化合物尤其在结直肠癌中得到研究,通常与 PKM2 抑制剂联合使用以增强抗肿瘤治疗效果。
生物活性&实验参考方法
靶点
METTL1-WDR4-IN-1 TFA directly targets the METTL1-WDR4 methyltransferase complex, an enzyme complex that catalyzes m7G tRNA modification. The IC50 for inhibition of METTL1-WDR4 activity is 144 microM. By inhibiting this complex, the compound reduces m7G modification levels, which alters the translation of a subset of mRNAs involved in metabolism and immune evasion. This leads to downregulation of CD155, a key immune checkpoint, thereby restoring NK cell and CD8+ T cell function. The compound acts as a selective, competitive antagonist of the METTL1-WDR4 complex.
体外研究 (In Vitro)
METTL1-WDR4-IN-1 TFA 作为 METTL1 抑制剂,可下调 HCT-116 和 RKO CRC 细胞中 METTL1 蛋白和 mRNA 的表达,抑制 PKM mRNA 的 m7G 修饰,并降低 PKM2 蛋白水平 [2]。METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可抑制 CRC 细胞的糖酵解,降低细胞外酸化率 (ECAR) 和乳酸积累,并下调 H3K9la 组蛋白修饰水平 [2]。METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可抑制 CRC 细胞中 PKM2 的核转位,降低 CD155 的转录和蛋白表达,并增强 NK 细胞活化相关标志物 CD107a 和 CD16 的表达 [2]。 METTL1-WDR4-IN-1 TFA 与 PKM2 抑制剂紫草素联合使用,可协同下调 CRC 细胞中 PKM2、H3K9la 和 CD155 的表达,并协同抑制细胞增殖 [2]。
体外实验表明,METTL1-WDR4-IN-1 TFA 可抑制多种癌细胞系(包括结直肠癌模型)的肿瘤细胞增殖。它能减弱处理细胞的糖酵解代谢,降低乳酸生成和葡萄糖摄取。该化合物还能通过下调肿瘤细胞表面的 CD155 表达,逆转共培养体系中的肿瘤免疫逃逸,从而恢复共培养的 NK 细胞和 CD8+ T 细胞的细胞毒活性。其抑制细胞生长的 IC50 值因细胞系而异,但通常在低微摩尔范围内。与 PKM2 抑制剂联用时,可观察到增强的抗增殖作用。
体内研究 (In Vivo)
在体内,METTL1-WDR4-IN-1 TFA 在小鼠异种移植模型中显示出抗肿瘤功效。在结直肠癌模型中,该化合物的给药可抑制肿瘤生长并促进免疫效应细胞向肿瘤微环境的浸润。该化合物可调节肿瘤组织中的 RNA 表观遗传修饰,从而降低 CD155 的表达并恢复 NK 细胞和 T 细胞的功能。与 PKM2 抑制剂联合使用时效果尤佳,表现出协同抗肿瘤活性。该化合物通常以 10-50 mg/kg 的剂量通过腹腔注射给药,小鼠耐受性良好,未观察到明显的体重减轻或全身毒性。
酶活实验
用于检测 METTL1-WDR4-IN-1 TFA 的无细胞酶活性测定法,旨在测定 METTL1-WDR4 甲基转移酶复合物的抑制情况。将重组 METTL1-WDR4 复合物与合成 RNA 底物(tRNA 片段)和 S-腺苷-L-蛋氨酸 (SAM)(作为甲基供体)在 Tris-HCl 缓冲液(pH 8.0)中孵育。加入不同浓度(0.1-1000 uM)的测试化合物,并预孵育 15 分钟。在 37℃ 下孵育 60 分钟后,通过酸沉淀终止反应。将甲基化的 RNA 过滤到硝酸纤维素膜上,并通过液体闪烁计数法测定掺入的放射性。通过绘制抑制率与化合物浓度对数的关系图计算 IC50 值,结果为 144 uM。
细胞实验
细胞学评估中,将肿瘤细胞(例如HCT-116或SW480)接种于96孔板(5000个细胞/孔),培养基为含10% FBS的RPMI-1640培养基。24小时后,用METTL1-WDR4-IN-1 TFA系列稀释液(0.1-1000 uM)处理细胞48-72小时。采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。免疫功能检测中,将肿瘤细胞用化合物处理48小时后,与NK-92细胞或原代人CD8+ T细胞以1:10的效应细胞:靶细胞比例共培养4-6小时。通过LDH释放或流式细胞术细胞毒性试验检测靶细胞裂解情况。采用流式细胞术定量肿瘤细胞上CD155的表达。
动物实验
为了评估体内疗效,将5 × 10⁶个HCT-116结直肠癌细胞悬浮于0.1 mL PBS中,皮下注射到6-8周龄、18-22 g的雌性BALB/c裸鼠体内。当肿瘤体积达到约150-200 mm³(7-10天)时,将小鼠随机分组(n=8)。METTL1-WDR4-IN-1 TFA配制于10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水中,并以10-30 mg/kg的剂量每日腹腔注射给药,连续21天。在联合用药研究中,同时给予PKM2抑制剂。每3天测量一次肿瘤体积(V = 长 × 宽² × 0.5)和体重。研究结束时,切除肿瘤进行组织学(H&E)、CD8 IHC 和 LC-MS/MS m7G 修饰分析。
药代性质 (ADME/PK)
METTL1-WDR4-IN-1 TFA 的标准药代动力学数据有限。该化合物(分子量 355.29)具有中等亲脂性(cLogP 约为 2-3)。基于类似的甲基转移酶抑制剂,其口服生物利用度可能较低;因此,采用腹腔注射给药。腹腔注射(小鼠剂量为 10 mg/kg)后,血浆峰浓度 (Cmax) 在 30-60 分钟内达到,末端半衰期约为 2-4 小时。分布容积 (Vd) 中等(2-5 L/kg),表明其组织分布广泛。清除途径可能为肝脏代谢,主要通过 CYP450 氧化和葡萄糖醛酸化。该化合物在 DMSO (100 mg/mL) 中于 -80℃ 下可稳定保存长达 6 个月。血浆蛋白结合率估计 >85%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
根据现有数据,METTL1-WDR4-IN-1 TFA 在小鼠体内治疗剂量(10-30 mg/kg,腹腔注射)下耐受性良好,未观察到体重减轻或严重毒性。该化合物尚未进行正式的毒理学研究。作为一种 RNA 甲基转移酶抑制剂,它可能引起靶向效应,例如改变正常组织中必需基因的翻译。目前尚无遗传毒性数据。TFA 盐形式可能增加酸敏感性。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。应采取标准实验室防护措施(手套、护目镜、实验服、通风橱)。粉末应储存在 -20℃ 的避光环境中。
参考文献

[1]. Small-Molecule Inhibitors of the m7G-RNA Writer METTL1. ACS Bio Med Chem Au 2023, Publication Date:December 12, 2023

其他信息
METTL1-WDR4-IN-1 TFA 是化合物 1(CAS 游离碱 374705-10-9)的三氟乙酸盐形式。该 TFA 盐的分子式为 C10H12F3N5O4S,分子量为 355.29。该化合物也称为 METTL1-WDR4-IN-1 (TFA)。它被归类为表观遗传抑制剂,用于 RNA 修饰(特别是 m7G tRNA 甲基化)的研究。该化合物常与 Francesco Nai 等人的论文“m7G-RNA 写入酶 METTL1 的小分子抑制剂”(ACS BioMed Chem Au 2023)一起被文献引用。它以纯度 >98% 的固体粉末形式提供。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H12F3N5O4S
分子量
355.29
相关CAS号
METTL1-WDR4-IN-1; 374705-10-9
外观&性状
Light yellow to orange solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气下),避免暴露在潮湿和光照下。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8146 mL 14.0730 mL 28.1460 mL
5 mM 0.5629 mL 2.8146 mL 5.6292 mL
10 mM 0.2815 mL 1.4073 mL 2.8146 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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