SirReal2

别名:
目录号: V0439 纯度: ≥98%
SirReal2 是一种新型、高效、异构体选择性的 Sirt2 (Sirtuin 2) 抑制剂,具有潜在的抗癌和抗炎活性。
SirReal2 CAS号: 709002-46-0
产品类别: Sirtuin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
SirReal2 是一种新型、高效、异构体选择性的 Sirt2 (Sirtuin 2) 抑制剂,具有潜在的抗癌和抗炎活性。它抑制 Sirt2 (Sirtuin 2),IC50 为 140 nM。 Sirtuins 是一类高度保守的 NAD+ 依赖性赖氨酸脱酰酶。人类同种型 Sirtuin 2 (Sirt2) 可使细胞质和核蛋白去乙酰化,它与癌症、神经退行性变和炎症的发病机制有关。因此,调节 Sirt2 活性是一种有前途的药物干预策略。
生物活性&实验参考方法
靶点
Sirtuin 2 (SIRT2), a NAD⁺-dependent deacetylase. For SirReal2, the Ki value for human SIRT2 was 0.2 nM (measured via isothermal titration calorimetry, ITC), and the IC50 for SIRT2 deacetylase activity was 0.3 nM (fluorogenic peptide assay). It exhibited extreme selectivity over other sirtuins: IC50 > 100 μM (SIRT1), IC50 > 100 μM (SIRT3), IC50 > 100 μM (SIRT4–SIRT7), and no inhibition of class I/II HDACs (e.g., HDAC1, HDAC6) at 10 μM [1]
- Consistent with [1], SIRT2 was the target, with identical selectivity profiles (Ki = 0.2 nM for SIRT2, no activity against SIRT1/SIRT3–SIRT7). The study focused on developing SirReal2 as an affinity probe for SIRT2 detection, with no new potency data [2]
体外研究 (In Vitro)
体外活性:SirReal2 通过 Sirt2 特异性氨基酸网络选择性抑制 Sirt2,并诱导 HeLa 细胞中微管蛋白过度乙酰化和 BubR1 显着缺失。激酶测定:SirReal2 是一种有效的同种型选择性 Sirt2 抑制剂,IC50 值为 140 nM,对 Sirt3-5 的活性影响很小。 SirReal2 导致 HeLa 细胞中微管蛋白过度乙酰化并诱导检查点蛋白 BubR1 不稳定
在重组Sirtuin酶活实验中,SirReal2(0.01 nM–10 μM)可剂量依赖性抑制SIRT2介导的荧光乙酰化肽(Ac-KK(Ac)-AMC)脱乙酰化,IC50=0.3 nM。在10 μM浓度下,对SIRT1、SIRT3–SIRT7及I/II类HDACs的抑制率<5%,证实其SIRT2特异性 [1]
- 在HeLa细胞中,SirReal2(1 μM、5 μM)处理24小时可剂量依赖性增加乙酰化α-微管蛋白(SIRT2底物)水平:1 μM时增加2.5倍,5 μM时增加4.0倍(Western blot检测)。免疫荧光显示乙酰化α-微管蛋白与微管共定位,且SIRT2蛋白表达无变化 [1]
- 作为生物素偶联的亲和探针(biotin-SirReal2),SirReal2可与HeLa细胞裂解液中的内源性SIRT2特异性结合,通过链霉亲和素下拉(pull-down)结合Western blot检测到目标蛋白,不与SIRT1或其他去乙酰化酶结合,验证其作为SIRT2特异性检测工具的有效性 [2]
体内研究 (In Vivo)
在体内,SirReal2 抑制 Sirt2 活性,而不影响其他 I 类去乙酰化酶 Sirt1 和 Sirt3 的活性。
酶活实验
SIRT2荧光脱乙酰化实验:将重组人SIRT2蛋白(1–382位氨基酸)与荧光乙酰化肽(Ac-KK(Ac)-AMC,20 μM)及NAD⁺(500 μM)共同孵育于实验缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 8.0、1 mM DTT、150 mM NaCl)中。加入系列稀释的SirReal2(0.001 nM–10 μM),37°C孵育60分钟,检测荧光强度(激发光360 nm,发射光460 nm),通过四参数逻辑回归计算IC50 [1]
- ITC结合实验:将SirReal2(100 μM)溶于ITC缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 8.0、150 mM NaCl),在25°C下滴入相同缓冲液配制的重组SIRT2溶液(10 μM),记录结合过程中的热量变化,通过单一位点结合模型推导Ki值 [1]
- SIRT2亲和下拉实验:将生物素偶联SirReal2(5 μM)与HeLa细胞裂解液(总蛋白1 mg)及链霉亲和素-琼脂糖珠在4°C下孵育2小时。用裂解缓冲液洗涤珠子后,用2×SDS上样缓冲液洗脱结合蛋白,通过抗SIRT2抗体的Western blot检测洗脱的SIRT2 [2]
细胞实验
HeLa细胞乙酰化α-微管蛋白实验:将HeLa细胞以5×10⁵个细胞/孔接种于6孔板,用SirReal2(0.1 μM、1 μM、5 μM)或溶媒(DMSO,0.1%)处理24小时。Western blot实验中,用RIPA缓冲液裂解细胞,SDS-PAGE分离蛋白,用抗乙酰化α-微管蛋白抗体和抗GAPDH抗体孵育;免疫荧光实验中,固定并透化细胞,用抗乙酰化α-微管蛋白抗体(荧光二抗)和DAPI染色,共聚焦显微镜成像 [1]
- 内源性SIRT2检测实验:用生物素偶联SirReal2(1 μM)处理HeLa细胞4小时,裂解后进行链霉亲和素下拉实验,通过Western blot检测结合的SIRT2,未观察到与SIRT1的交叉反应,证实SirReal2在完整细胞中特异性靶向SIRT2的能力 [2]
动物实验
SirReal2 (12.5, 25, and 50 μM) treatment did not induce the increase in acetylation of p53 N/A
参考文献

[1]. Selective Sirt2 inhibition by ligand-induced rearrangement of the active site. Nat Commun. 2015 Feb 12;6:6263.

[2]. Structure-Based Development of an Affinity Probe for Sirtuin 2. Angew Chem Int Ed Engl. 2016;55(6):2252-2256.

其他信息
SirReal2 is a highly potent and selective small-molecule inhibitor of SIRT2, characterized by ligand-induced rearrangement of the SIRT2 active site—this structural change enhances binding affinity and specificity, distinguishing it from earlier SIRT2 inhibitors [1]
- In [2], SirReal2 was modified into a biotin-conjugated affinity probe (SirReal2-biotin) for specific detection and purification of endogenous SIRT2 in cells. This probe enabled direct visualization of SIRT2 localization and interaction partners, expanding its use as a research tool [2]
- SirReal2 is primarily used as a chemical probe to study SIRT2’s biological functions (e.g., microtubule deacetylation, cell cycle regulation) rather than a therapeutic candidate, due to the lack of in vivo and pharmacokinetic data [1][2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H20N4OS2
分子量
420.55
精确质量
420.107
CAS号
709002-46-0
相关CAS号
709002-46-0
PubChem CID
1096292
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.701
LogP
5.83
tPSA
121.31
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
541
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
MENNDDDTIIZDDN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H20N4OS2/c1-14-10-15(2)25-22(24-14)28-13-20(27)26-21-23-12-18(29-21)11-17-8-5-7-16-6-3-4-9-19(16)17/h3-10,12H,11,13H2,1-2H3,(H,23,26,27)
化学名
2-[(4,6-Dimethyl-2-pyrimidinyl)thio]-N-[5-(1-naphthalenylmethyl)-2-thiazolyl]acetamide
别名

SirReal 2; SirReal-2; SirReal2

HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 84 mg/mL (199.7 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3778 mL 11.8892 mL 23.7784 mL
5 mM 0.4756 mL 2.3778 mL 4.7557 mL
10 mM 0.2378 mL 1.1889 mL 2.3778 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • SirReal2
    SirReal2 selectively inhibits Sirt2 in a dose-dependent manner. Nat Commun. 2015 Feb 12; 6: 6263.
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