SU-5607 (IC-261)

别名: ic261; 186611-52-9; IC 261; 3-[(2,4,6-TRIMETHOXY-PHENYL)-METHYLENE]-INDOLIN-2-ONE; SU-5607; (3E)-3-[(2,4,6-trimethoxyphenyl)methylidene]-1H-indol-2-one; 3-[(2,4,6-Trimethoxyphenyl)methylidenyl]-indolin-2-one; MFCD00118156; 1,3-二氢-3-[(2,4,6-三甲氧基苯基)亚甲基]-2H-吲哚-2-酮;SU-5607 ;3-(2,4,6-三甲氧基苯亚甲基)吲哚啉-2-酮
目录号: V12863 纯度: ≥98%
IC261 是一种选择性 ATP 竞争性 CK1 抑制剂(拮抗剂),对 Ckiδ、Ckiε 和 Ckiα1 的 IC50 值分别为 1 μM、1 μM 和 16 μM。
SU-5607 (IC-261) CAS号: 186611-52-9
产品类别: Casein Kinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
IC261 是一种选择性 ATP 竞争性 CK1 抑制剂(拮抗剂),对 Ckiδ、Ckiε 和 Ckiα1 的 IC50 值分别为 1 μM、1 μM 和 16 μM。
SU-5607(IC-261,CAS# 186611-52-9)是一种选择性 ATP 竞争性酪蛋白激酶 1 (CK1) 抑制剂。它对 CK1δ 和 CK1ε 的抑制 IC50 值为 1 μM,对 CK1α1 的抑制 IC50 值为 16 μM。在高浓度下(IC50 为 11-21 μM),它也能抑制 CK1α1。SU-5607 不抑制 α、β 和 γ 亚型的活性。它对 Cdk5 的亲和力要低得多,IC50 值为 4.5 mM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ckiδ(IC50 = 1 μM); Ckiε(IC50 = 1 μM); Ckiα1 (IC50 = 16 μM)
SU-5607 targets casein kinase 1 (CK1) isoforms, including CK1δ, CK1ε, and CK1α1. It is a selective, ATP-competitive CK1 inhibitor. SU-5607 triggers mitotic checkpoint control. The compound's inhibition of CK1 disrupts various cellular processes, including cell cycle progression, DNA repair, and Wnt signaling. SU-5607 does not block the activity of α, β, and γ isoforms.
体外研究 (In Vitro)
IC261 对 Ckiδ、Ckiε 和 Ckiα1 的 IC50 值分别为 1 μM、1 μM 和 16 μM。它是一种选择性 ATP 竞争性 CK1 抑制剂。IC261 对 PKA、p34cdc2 和 p55fyn 的 IC50 > 100 μM,因此其作用极小 [1]。在 AC1-M88 细胞中,IC261 可导致中心体扩增、纺锤体异常和有丝分裂阻滞。12 小时后,IC261 (1 μM) 可增加 G2/M 期细胞比例;24 小时后,IC261 可促进 AC1-M88 细胞死亡。绒毛外滋养层杂交细胞在 IC261 (1 μM) 的作用下也会发生凋亡 [2]。多种胰腺肿瘤细胞系,例如 ASPC-1、BxPc3、Capan-1、Colo357、MiaPaCa-2、Panc1、Panc89、PancTu-1 和 PancTu-2 细胞,其增殖能力均受到 IC261 (1.25 μM) 的抑制。IC261 (1.25 μM) 可特异性增强胰腺肿瘤细胞的 CD95 介导的细胞凋亡 [3]。
体外实验表明,SU-5607 是一种选择性的 ATP 竞争性 CK1 抑制剂,对 CK1δ 和 CK1ε 的 IC50 为 1 μM,对 CK1α1 的 IC50 为 16 μM。它对 Cdk5 的亲和力要低得多,IC50 为 4.5 mM。该化合物可触发有丝分裂检查点调控。 SU-5607 对细胞周期进程和细胞凋亡的影响已在多种癌细胞系中进行了研究。
体内研究 (In Vivo)
在SCID小鼠中,IC261(20.5 mg/kg)抑制PancTu-2细胞肿瘤的形成,下调多种抗凋亡蛋白,包括CK1δ/ε、KRAS和IL6,并增加p21、ATM、CHEK1和STAT1的表达[3]。IC261在异种移植模型中抑制肿瘤生长[3]。以上结果强烈提示,小分子抑制剂对CK1的抑制作用会影响胰腺肿瘤细胞系的生长。为了比较IC261与吉西他滨(一种常用的胰腺肿瘤治疗药物)在体内对胰腺肿瘤细胞生长的影响,我们将PancTu-1细胞固定在基质胶中,并皮下注射到6周龄SCID小鼠的后侧腹部,以获得异种移植瘤。肿瘤植入17天后,将小鼠随机分为四组(n=5):对照组(MOCK处理组)、IC261组、吉西他滨组和IC261/吉西他滨联合治疗组。小鼠每日接受治疗,持续8天。在治疗期间对小鼠进行临床观察,并在研究结束时对所有重要器官进行病理学检查,结果显示小鼠的体重和临床病理特征均未受到显著影响。此外,这些体内实验结果表明,IC261 和吉西他滨均能显著抑制肿瘤生长。联合治疗并未进一步抑制肿瘤生长(图 5)。肿瘤细胞增殖减少与肿瘤细胞数量减少相一致,这通过 Ki-67 免疫组化染色得以证实。与对照组(21.0%)相比,各治疗组的 Ki-67 阳性染色率均有所降低(IC261 组:11.3%;吉西他滨组:14.7%;IC261/吉西他滨组:10.5%)(图 5B)。此外,与未治疗的对照组相比,IC261 治疗组和其他治疗组的细胞凋亡率均有所增加。图 5C 显示了一个代表性示例。
SU-5607 已在动物癌症模型中进行了体内评估。临床前研究已证实该化合物能够抑制CK1并诱导癌细胞凋亡。SU-5607对肿瘤生长和存活的影响已在异种移植模型中得到评估。还需要进一步研究以确定其药代动力学和药效学特征。
酶活实验
磷酸转移酶活性测定[1]
酪蛋白激酶活性测定在37 °C下进行,方法如前所述。标准反应体系(40 μl)包含25 mM 2-(N-吗啉代)乙磺酸(pH 6.5)、50 mM NaCl、15 mM MgCl2、2 mg/ml酪蛋白、2 mM EGTA和100 μM [γ-32P]ATP(100–400 cpm/pmol)。初始反应速率测定重复两次,以ATP为底物。动力学常数及其标准误差的计算方法见参考文献26。抑制剂效力(IC50)测定中,[γ-32P]ATP浓度保持恒定(10 μM),而IC261浓度则有所变化(0.1、0.3、1、3和10 μM)。为了评估动力学机制,抑制剂浓度保持不变(IC261,20 μM;IC3608,100 μM),而[γ-32P]ATP的浓度则如上所述进行变化。对于小分子库的筛选,CK1亚型(Ckiα1、δ和ε)的测定方法与上述相同,只是酪蛋白的浓度为10 mg/ml,[γ-32P]ATP的浓度保持在2 μM或1 mM。
SU-5607的体外酶活性测定包括测量其对酪蛋白激酶1 (CK1) 活性的抑制作用。该测定通常包括将纯化的CK1酶与不同浓度的SU-5607在ATP和肽底物存在下孵育。使用闪烁计数或荧光法测量底物的磷酸化水平。计算IC50值。使用激酶谱评估该化合物对不同 CK1 同工酶和其他激酶的选择性。
细胞实验
绒毛外滋养层杂交细胞[2]
人类绒毛外滋养层细胞一旦脱离其天然细胞外基质,便会不可逆地退出细胞周期并死亡。因此,我们采用了永生化侵袭性绒毛外滋养层细胞系AC1-M88进行体外实验。该细胞系是通过将绒毛外滋养层细胞与绒毛膜癌细胞系Jeg-3的突变体AC1-1融合而构建的(Funayama等,1997;Frank等,2000)。细胞在添加10%胎牛血清(FCS;Biochrom)的DMEM(CV-1)或DMEM/F-12(AC1-M88)培养基(均为Gibco公司产品)中,于37℃、5% CO₂的湿润环境中培养。在指定时间点,细胞经5 Gy γ射线照射后收集,用于Western blot分析;或用1 μM IC261或0.4 μM诺考达唑处理12小时后固定,用于免疫荧光分析;或用1 μM IC261处理后固定,用于流式细胞术分析;或在指定时间点裂解细胞,用于Western blot分析。IC261的合成方法参照Mashhoon等人(2000)所述。IC261和诺考达唑分别以25 mM和10 mM的浓度溶于DMSO配制成储备液,对照组细胞用0.004% DMSO处理。对于免疫细胞化学,将细胞培养在盖玻片上,用甲醇(-20°C)处理5分钟,再用丙酮(-20°C)处理20-30秒,然后按照上述方法进行免疫细胞化学检测。
体外细胞实验评估SU-5607对细胞周期进程、细胞凋亡和信号通路的影响。将细胞培养在合适的培养基中,并用SU-5607的系列稀释液处理。使用碘化丙啶染色和流式细胞术评估细胞周期分布。通过测量caspase活性或Annexin V染色评估细胞凋亡。使用报告基因检测或Western blot评估该化合物对Wnt信号通路和其他通路的影响。
动物实验
将500万个PancTu-1细胞重悬于100 µl含有50% Matrigel和50% DMEM/RPMI-1640 (1:1)的溶液中,注射到6周龄CB-17/IcrHsd-scid-bg小鼠的背外侧。17天后,将小鼠随机分为对照组(n = 5)、IC261治疗组(n = 5)、吉西他滨组(n = 5)和IC261/吉西他滨联合治疗组(n = 5)。每日注射二甲基亚砜(DMSO;对照组)、IC261(20.5 mg/kg)、吉西他滨(0.6 mg/kg)或二者联合(20.5 mg/kg IC261/0.6 mg/kg 吉西他滨)(治疗组),连续8天。末次给药后次日,用二氧化碳窒息法处死小鼠。在治疗前后测量肿瘤大小。最后,切除肿瘤,测量其大小和重量,并用福尔马林固定或速冻。肿瘤体积根据旋转椭球体公式(长×高×宽×0.5236)计算。[3]
在体内,SU-5607在癌症动物模型(例如异种移植小鼠模型)中进行评估。免疫缺陷小鼠皮下移植肿瘤后,通过多种给药途径接受SU-5607治疗。每周使用游标卡尺测量两次肿瘤体积,并计算相对于载体对照组的肿瘤生长抑制率(TGI)。进行药代动力学研究以确定化合物的半衰期、清除率和组织分布。
药代性质 (ADME/PK)
SU-5607 (IC-261) 是一种选择性 ATP 竞争性 CK1 抑制剂。其分子式为 C₁₈H₁₇NO₄,分子量为 311.33 g/mol。SU-5607 对 CK1δ 和 CK1ε 的抑制 IC50 值为 1 μM,对 CK1α1 的抑制 IC50 值为 16 μM。其熔点为 214°C,在 DMSO 中的溶解度为 18 mg/mL。该化合物应储存于 -20°C。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SU-5607的毒性已在临床前研究中得到评估。该化合物在治疗剂量下显示出良好的安全性。在动物研究中,SU-5607耐受性良好,在具有抗肿瘤活性的剂量下未报告明显的不良反应。该化合物在人体中的安全性尚未得到广泛研究,需要进一步的临床试验来确定其安全性和有效性。
参考文献

[1]. Crystal structure of a conformation-selective casein kinase-1 inhibitor. J Biol Chem. 2000 Jun 30;275(26):20052-60.

[2]. Inhibition of casein kinase I delta alters mitotic spindle formation and induces apoptosis in trophoblast cells. Oncogene. 2005 Dec 1;24(54):7964-75.

[3]. Anti-apoptotic and growth-stimulatory functions of CK1 delta and epsilon in ductal adenocarcinoma of the pancreas are inhibited by IC261 in vitro and in vivo. Gut. 2008 Jun;57(6):799-806.

其他信息
酪蛋白激酶-1 (CK-1) 家族蛋白激酶在细胞调控和疾病发病机制中发挥着至关重要的作用。与大多数蛋白激酶不同,它们似乎以组成型活性酶的形式发挥作用。因此,选择性药理抑制剂对于阐明 CK-1 依赖性过程至关重要。为了满足这一需求,我们基于体外筛选,分离出具有 ATP 竞争性和非 ATP 竞争性作用机制的新型小分子 CK-1 抑制剂。本文报道了 3-[(2,4,6-三甲氧基苯基)亚甲基]-吲哚啉-2-酮 (IC261) 的晶体结构。IC261 是一种 ATP 竞争性抑制剂,对 CK-1 的不同亚型具有不同的活性。该化合物与裂殖酵母 CK-1 催化结构域形成的复合物的晶体结构经精修,在 2.8 Å 分辨率下,晶体学 R 因子为 22.4%。结构分析表明,IC261 可将 CK-1 稳定在核苷酸底物-配体结合和非配体结合构象之间的中间状态。我们推测,酪蛋白激酶-1 家族成员的这种构象可稳定侧链相互作用的离域网络,从而降低抑制剂的解离速率。[1]
丝氨酸/苏氨酸特异性酪蛋白激酶 I δ (CKIδ) 在所有组织中普遍表达,在应激条件下受 p53 依赖性诱导,并在多种细胞过程中发挥重要作用。人胎盘的免疫组织化学分析显示,CKIδ 在滋养层外细胞和绒毛膜癌中表达最强。对滋养层外杂交细胞系中 CKIδ 功能作用的研究表明,CKIδ 组成性定位于中心体和有丝分裂纺锤体。使用CKI特异性抑制剂IC261抑制CKIδ会导致中心体结构改变、多极纺锤体形成、有丝分裂抑制,并且与其他细胞系不同,还能诱导细胞凋亡。我们的结果表明,CKIδ在滋养层细胞的有丝分裂过程和存活中发挥重要作用。因此,IC261可能为绒毛膜癌的治疗提供一种新的工具。[2]
背景:胰腺导管腺癌(PDAC)由于多种信号通路的改变而表现出高度耐药性。CK1亚型在这些通路中发挥着重要的调控作用。目的:我们分析了胰腺肿瘤细胞中CK1δ和ε(CK1δ/in)的表达水平,以验证CK1抑制剂3-[2,4,6-(三甲氧基苯基)亚甲基]-吲哚啉-2-酮(IC261)对胰腺肿瘤细胞增殖及其对CD95抗体和吉西他滨敏感性的影响。方法:采用Western blotting和免疫组化法检测CK1δ/in的表达水平。采用流式细胞术分析细胞死亡情况。采用实时定量PCR和Western blotting检测基因表达。在胰腺癌皮下小鼠异种移植模型中,我们测试了IC261的潜在抗肿瘤作用。结果:我们发现CK1δ/in在胰腺肿瘤细胞系和高级别胰腺导管腺癌(PDAC)中高表达。 IC261通过抑制CK1δ/in,在体外和体内均能降低胰腺肿瘤细胞的生长。此外,IC261还能降低多种抗凋亡蛋白的表达水平,并增强细胞对CD95介导的凋亡的敏感性。然而,IC261在体外或体内均未增强吉西他滨介导的细胞死亡。结论:靶向CK1亚型的IC261可以影响体外胰腺肿瘤细胞的生长和凋亡敏感性,并在体内诱导肿瘤生长,从而为胰腺肿瘤的治疗提供了一种有前景的新策略。[3] SU-5607 (IC-261) 是一种选择性的ATP竞争性CK1抑制剂,可触发有丝分裂检查点控制。它对CK1δ和CK1ε的IC50值为1 μM,对CK1α1的IC50值为16 μM。 SU-5607 不抑制 α、β 和 γ 亚型的活性。它对 Cdk5 的亲和力要低得多,IC50 值为 4.5 mM。SU-5607 是研究 CK1 在各种细胞过程和疾病中作用的宝贵工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H17NO4
分子量
311.3319
精确质量
311.115
元素分析
C, 69.44; H, 5.50; N, 4.50; O, 20.56
CAS号
186611-52-9
PubChem CID
5288600
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
555.2±50.0 °C at 760 mmHg
熔点
214 °C
闪点
289.6±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.619
LogP
2.8
tPSA
56.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
450
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C([H])([H])[H])C1C([H])=C(C([H])=C(C=1/C(/[H])=C1/C(N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C/12)=O)OC([H])([H])[H])OC([H])([H])[H]
InChi Key
JBJYTZXCZDNOJW-JLHYYAGUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H17NO4/c1-21-11-8-16(22-2)14(17(9-11)23-3)10-13-12-6-4-5-7-15(12)19-18(13)20/h4-10H,1-3H3,(H,19,20)/b13-10+
化学名
(3E)-3-[(2,4,6-trimethoxyphenyl)methylidene]-1H-indol-2-one
别名
ic261; 186611-52-9; IC 261; 3-[(2,4,6-TRIMETHOXY-PHENYL)-METHYLENE]-INDOLIN-2-ONE; SU-5607; (3E)-3-[(2,4,6-trimethoxyphenyl)methylidene]-1H-indol-2-one; 3-[(2,4,6-Trimethoxyphenyl)methylidenyl]-indolin-2-one; MFCD00118156;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 33 mg/mL (~106.00 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2120 mL 16.0601 mL 32.1203 mL
5 mM 0.6424 mL 3.2120 mL 6.4241 mL
10 mM 0.3212 mL 1.6060 mL 3.2120 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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