Super-TDU

别名: Super-TDU;SuperTDU;Super TDU
目录号: V3198 纯度: ≥98%
Super-TDU 是一种合理设计的基于肽的抑制剂,通过模仿具有抗癌活性的 VGLL 来靶向 YAP-TEADs 相互作用。
Super-TDU CAS号: 1599441-71-0
产品类别: YAP
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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纯度: ≥98%

产品描述
Super-TDU 是一种基于肽的合理设计的抑制剂,它通过模拟具有抗癌活性的 VGLL 来靶向 YAP-TEADs 相互作用。VGLL4 是一种先前已知的 YAP 拮抗剂,同时也是 Wnt/β-catenin 信号通路的调节因子。Super-TDU 显示出治疗 YAP 激活型人类癌症的潜力。共免疫沉淀 (coIP) 实验表明,Super-TDU 可降低 YAP 与 TEADs 之间的内源性相互作用。Super-TDU 抑制了胃癌细胞系 MGC-803、BGC-823 和 HGC27 的细胞活力和克隆形成能力,但正如预期的那样,它对 MKN-45 细胞没有影响。此外,Super-TDU 还下调了 YAP-TEADs 靶基因 CTGF、CYR61 和 CDX2 的表达。进一步的染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验也表明,Super-TDU 呈剂量依赖性地降低了 YAP 抗体 ChIP 的 CTGF 和 CDX2 启动子 cDNA 的量。为了验证Super-TDU的特异性,我们构建了两个Super-TDU突变体,这两个突变体携带的突变会破坏TEADs的结合。正如预期的那样,突变型Super-TDU无法与TEADs相互作用并抑制细胞增殖。因此,Super-TDU似乎对YAP驱动的人类癌症具有广谱但特异性的抗肿瘤活性,其中YAP/VGLL4比值应被视为个体化治疗的重要预后标志物。
Super-TDU(CAS号:1599441-71-0)是一种基于肽的合理设计的抑制剂,它通过模拟VGLL(Vestigial-like family member 4)的抗癌活性来靶向YAP-TEADs相互作用。VGLL4是一种先前已知的YAP拮抗剂,同时也是Wnt/β-catenin信号通路的调节因子。Super-TDU展现出治疗YAP激活的人类癌症的治疗潜力。
生物活性&实验参考方法
靶点
Super-TDU targets the YAP-TEADs protein-protein interaction, which is critical for the transcriptional activity of the Hippo signaling pathway. By mimicking VGLL4, Super-TDU competitively binds to TEADs, thereby inhibiting YAP-mediated transcription of target genes. The YAP/VGLL4 ratio is considered an important prognostic marker for personalized treatment.
体外研究 (In Vitro)
Super-TDU抑制YAP-TEADs靶基因CTGF、CYR61和CDX2的表达。胃癌细胞系MGC-803、BGC-823和HGC27在暴露于Super-TDU后,其克隆形成能力和细胞存活率均降低[1]。体外实验表明,Super-TDU抑制胃癌细胞系MGC-803、BGC-823和HGC27的细胞活力和克隆形成能力,但与预期相反,它对MKN-45细胞没有影响。Super-TDU下调YAP-TEADs靶基因CTGF、CYR61和CDX2的表达。ChIP实验表明,Super-TDU呈剂量依赖性地降低YAP抗体ChIP结合的CTGF和CDX2启动子cDNA的量。
体内研究 (In Vivo)
Super-TDU 以 50 μg/kg 或 500 μg/kg 的剂量每日一次静脉注射,可显著降低小鼠肿瘤的大小、重量以及 YAP 靶基因的表达[1]。Super-TDU(静脉注射;250 μg/kg 和 500 μg/kg)小鼠的清除率 (CL) 分别为 7.41 mL/min/kg 和 7.72 mL/min/kg;最大血药浓度 (Cmax) 分别为 6.12 ng/mL 和 13.3 ng/mL。小鼠的半衰期 (t1/2α) 分别为 0.78 小时和 0.82 小时[1]。体内实验表明,Super-TDU 以 50 μg/kg 或 500 μg/kg 的剂量每日一次静脉注射,可显著降低小鼠肿瘤的大小、重量以及 YAP 靶基因的表达。共免疫沉淀实验表明,Super-TDU 可降低 YAP 与 TEAD 之间的内源性相互作用。该化合物对YAP驱动的人类癌症表现出特异性抗肿瘤活性。
酶活实验
可使用无细胞检测方法(例如 ELISA 或 AlphaScreen,使用重组 TEADs 蛋白和标记的 YAP 衍生肽)来评估 YAP-TEADs 结合抑制情况。或者,也可使用染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测来评估化合物在体外对 YAP 与靶基因启动子结合的影响。
细胞实验
基于细胞的检测采用胃癌细胞系MGC-803、BGC-823和HGC27。细胞经Super-TDU处理后,评估细胞活力和克隆形成能力。采用qPCR检测YAP-TEADs靶基因CTGF、CYR61和CDX2的表达。ChIP实验证实YAP与靶启动子的结合减少。
动物实验
动物/疾病模型: BALB/cA nu/nu(裸鼠)[1]
剂量: 50 μg/kg 或 500 μg/kg
给药途径: 静脉注射;每日
实验结果: 以剂量依赖的方式减小肿瘤的大小、重量和 YAP 靶基因。

动物/疾病模型: BALB/cA nu/nu(裸鼠)[1]
剂量: 250 μg/kg 或 500 μg/kg(药代动力学/PK 研究)
给药途径: 静脉注射 (iv)
实验结果: t1/2α 分别为 0.78 小时和 0.82 小时;Cmax 分别为 6.12 ng/mL 和 13.3 ng/mL;在小鼠体内,250 μg/kg 和 500 μg/kg 剂量下的清除率 (CL) 分别为 7.41 ml/min/kg 和 7.72 ml/min/kg。
在携带胃癌异种移植瘤的 BALB/cA nu/nu(裸鼠)中进行体内研究。Super-TDU 每日一次静脉注射,剂量分别为 50 μg/kg 或 500 μg/kg。测量肿瘤大小、重量和 YAP 靶基因表达。药代动力学研究剂量分别为 250 μg/kg 和 500 μg/kg。
药代性质 (ADME/PK)
Super-TDU的分子式为C₂₃₇H₃₆₉N₆₅O₇₀S,分子量为5280.92。在小鼠中,静脉注射250 μg/kg和500 μg/kg后,Cmax值分别为6.12 ng/mL和13.3 ng/mL,t₁/₂α分别为0.78小时和0.82小时。CL值分别为7.41 mL/min/kg和7.72 mL/min/kg。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有参考文献中未提供具体的毒性数据。然而,该化合物对YAP驱动型癌症的特异性及其肽类结构表明其具有靶向作用机制,且毒性可能可控。无法与TEAD结合的突变型Super-TDUs不抑制细胞增殖,证实了其靶向特异性。
参考文献

[1]. A peptide mimicking VGLL4 function acts as a YAP antagonist therapy against gastric cancer. Cancer Cell. 2014 Feb 10;25(2):166-80.

其他信息
Super-TDU是一种尚未获准用于临床的研究性化合物。它是一种特异性YAP拮抗剂,靶向YAP-TEADs相互作用。该药物已显示出治疗胃癌和其他YAP激活肿瘤的潜力。与传统药物不同,其抗肿瘤活性倾向于针对YAP/VGLL4比值升高的肿瘤。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C237H370N66O69S
分子量
5279.9396
精确质量
5278.726
CAS号
1599441-71-0
相关CAS号
Super-TDU TFA
PubChem CID
155886330
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-25.5
tPSA
2170
氢键供体(HBD)数目
71
氢键受体(HBA)数目
81
可旋转键数目(RBC)
173
重原子数目
373
分子复杂度/Complexity
13400
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C)CCC(C(NC(C(NC(C(NC(CCCNC(=N)N)C(NC(CCCCN)C(NC(CC(C)C)C(N1CCCC1C(NC(CC(=O)O)C(NC(CO)C(NC(CC1C=CC=CC=1)C(NC(CC1C=CC=CC=1)C(NC(CCCCN)C(N1CCCC1C(N1CCCC1C(NC(C(N)=O)CCC(=O)O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)CC(C)C)=O)CCCNC(=N)N)=O)NC(C1CCCN1C(C(C(C)C)NC(C(C(C)O)NNC(CCC(N)=O)C(C(C1CCCN1C(C(C(C)C)NC(C(CC(N)=O)NC(C(C)NC(C(C(C)O)NC(C(CCCCN)NC(C1CCCN1C(C(CC(N)=O)NC(CNC(C(CO)NC(CNC(CNC(C(C(C)CC)NC(C(CCC(N)=O)NC(C(CC(C)C)NC(C(CC1=CNC2=CC=CC=C12)NC(C(C(C)O)NC(C(CC(=O)O)NC(CNC(C(CC(C)C)NC(C(CO)NC(C(CCCCN)NC(C(C)NC(C(CC1C=CC=CC=1)NC(C(CC1=CN=CN1)NC(C(CC(=O)O)NC(C(CC(=O)O)NC(C(C(C)C)NNC(C=O)CO)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O)=O
InChi Key
VNAMPXYTTUOEFP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C237H370N66O69S/c1-23-125(16)189(291-206(343)146(72-75-174(243)313)270-209(346)151(93-120(6)7)277-212(349)155(98-134-106-254-138-58-34-33-57-137(134)138)284-228(365)191(129(20)310)293-218(355)158(102-182(322)323)262-179(318)110-256-198(335)149(91-118(2)3)275-219(356)165(115-307)287-203(340)141(59-35-39-78-238)266-196(333)126(17)260-207(344)152(95-131-51-27-24-28-52-131)278-213(350)156(99-135-107-251-117-259-135)281-214(351)159(103-183(324)325)282-215(352)161(105-185(328)329)285-226(363)186(122(10)11)296-294-136(112-304)113-305)225(362)258-108-177(316)255-109-178(317)264-164(114-306)199(336)257-111-180(319)263-163(101-176(245)315)232(369)300-86-46-66-168(300)222(359)271-143(61-37-41-80-240)205(342)292-190(128(19)309)227(364)261-127(18)197(334)274-157(100-175(244)314)217(354)289-187(123(12)13)234(371)298-84-45-65-167(298)194(331)193(330)139(71-74-173(242)312)295-297-192(130(21)311)229(366)290-188(124(14)15)235(372)302-88-49-69-171(302)223(360)272-147(77-90-373-22)204(341)268-145(64-44-83-253-237(249)250)201(338)276-150(92-119(4)5)208(345)269-144(63-43-82-252-236(247)248)200(337)267-142(60-36-40-79-239)202(339)286-162(94-121(8)9)231(368)299-85-47-67-169(299)224(361)283-160(104-184(326)327)216(353)288-166(116-308)220(357)280-154(97-133-55-31-26-32-56-133)211(348)279-153(96-132-53-29-25-30-54-132)210(347)273-148(62-38-42-81-241)230(367)303-89-50-70-172(303)233(370)301-87-48-68-170(301)221(358)265-140(195(246)332)73-76-181(320)321/h24-34,51-58,106-107,112,117-130,136,139-172,186-192,254,294-297,305-311H,23,35-50,59-105,108-111,113-116,238-241H2,1-22H3,(H2,242,312)(H2,243,313)(H2,244,314)(H2,245,315)(H2,246,332)(H,251,259)(H,255,316)(H,256,335)(H,257,336)(H,258,362)(H,260,344)(H,261,364)(H,262,318)(H,263,319)(H,264,317)(H,265,358)(H,266,333)(H,267,337)(H,268,341)(H,269,345)(H,270,346)(H,271,359)(H,272,360)(H,273,347)(H,274,334)(H,275,356)(H,276,338)(H,277,349)(H,278,350)(H,279,348)(H,280,357)(H,281,351)(H,282,352)(H,283,361)(H,284,365)(H,285,363)(H,286,339)(H,287,340)(H,288,353)(H,289,354)(H,290,366)(H,291,343)(H,292,342)(H,293,355)(H,320,321)(H,322,323)(H,324,325)(H,326,327)(H,328,329)(H4,247,248,252)(H4,249,250,253)
化学名
5-amino-4-[[1-[1-[6-amino-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[1-[2-[[6-amino-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[1-[2-[[2-[2-[6-amino-1-[1-[2-[[4-amino-2-[2-[[2-[[6-amino-2-[[1-[4-amino-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[5-amino-2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[6-amino-2-[2-[[2-[[2-[[3-carboxy-2-[[3-carboxy-2-[[2-[2-(1-hydroxy-3-oxopropan-2-yl)hydrazinyl]-3-methylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]propanoylamino]hexanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]hexanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]amino]propanoylamino]-4-oxobutanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]pyrrolidin-2-yl]-1,2,6-trioxohexan-3-yl]hydrazinyl]-3-hydroxybutanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]hexanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]hexanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoic acid
别名
Super-TDU;SuperTDU;Super TDU
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: N/A
Water:~100 mg/mL (19 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 25 mg/mL (4.73 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.1894 mL 0.9470 mL 1.8940 mL
5 mM 0.0379 mL 0.1894 mL 0.3788 mL
10 mM 0.0189 mL 0.0947 mL 0.1894 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Super-TDU

    Downregulation ofVGLL4Was Associated with Upregulation of YAP Target Genes and GC Prognosis.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    VGLL4 Inhibits Gastric Tumor Cell Growth through Inhibiting YAP-Induced TEAD4 Transactivation.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    Crystal Structure of VGLL4-TEAD4 Complex.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    The Tandem TDU Domains of VGLL4 Are Sufficient to Inhibit YAP Activity.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    TheSuper-TDUPotently Inhibits Gastric Tumor Growth.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    TheSuper-TDUInhibits Human Primary GC Growth and GC Tumorigenesis in theH.pylori-Infected Mouse Model.2014 Feb 10;25(2):166-80.

  • Super-TDU

    VGLL4 levels are decreased in the CRC samples.2017 Jan 4;8:14058
  • Super-TDU

    Downregulation of VGLL4 is associated with upregulation of Wnt target genes.2017 Jan 4;8:14058

  • Super-TDU

    VGLL4 inhibits colorectal cancer cell growth.2017 Jan 4;8:14058
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