Thalidomide-NH-C4-NH-Boc

目录号: V40173 纯度: ≥98%
Thalidomide-NH-C4-NH-Boc(化合物 15)是一种合成的 E3 连接酶配体-接头缀合物,其中包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 PROTAC 技术中使用的接头。
Thalidomide-NH-C4-NH-Boc CAS号: 2093388-52-2
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
沙利度胺-NH-C4-NH-Boc(化合物 15)是一种合成的 E3 连接酶配体-连接子偶联物,它包含基于沙利度胺的 cereblon 配体和 PROTAC 技术中使用的连接子。
沙利度胺-NH-C4-NH-Boc 是一种合成的 E3 连接酶配体-连接子偶联物,用于 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)技术。它包含基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) 配体和 Boc 保护的四碳连接子。该化合物的分子量为 444.48 g/mol,分子式为 C22H28N4O6。它是一种双功能结构单元,专为药物化学和 PROTAC 研究而设计。
生物活性&实验参考方法
靶点
Thalidomide-NH-C4-NH-Boc targets the E3 ubiquitin ligase cereblon (CRBN). As a ligand for CRBN, it recruits the E3 ligase to target proteins that are bound to the other end of the PROTAC molecule. By bringing the target protein into proximity with the E3 ligase, it induces ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of the target protein.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,沙利度胺-NH-C4-NH-Boc 能够与脑蛋白(CRBN)结合,并在 PROTAC 分子中作为 E3 连接酶配体发挥作用。当其被整合到 PROTAC 分子中时,它是一种新型、高效且选择性的溴结构域蛋白 4 (BRD4) 和溴结构域蛋白 2 (BRD2) 降解剂。
体内研究 (In Vivo)
在体内,沙利度胺-NH-C4-NH-Boc 可用作合成 PROTAC 分子的结构单元,这些 PROTAC 分子能够诱导靶向蛋白降解。含有该连接基团的 PROTAC 可用于动物模型,以研究降解特定靶蛋白的效果。其体内活性是通过使用该缀合物合成的 PROTAC 分子实现的。
酶活实验
沙利度胺-NH-C4-NH-Boc的体外活性测定通常包括与cereblon (CRBN)的结合研究。将重组CRBN蛋白与浓度递增的沙利度胺在结合缓冲液中孵育。采用表面等离子共振(SPR)、等温滴定量热法(ITC)或荧光偏振法测定结合亲和力。可通过三元复合物形成实验评估沙利度胺-NH-C4-NH-Boc与CRBN的结合能力。
细胞实验
在体外细胞实验中,使用沙利度胺-NH-C4-NH-Boc合成PROTAC分子。用PROTAC处理表达靶蛋白的细胞。通过Western blot检测靶蛋白的降解情况。采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞活力。通过Western blot或qRT-PCR分析化合物对下游信号通路的影响。
动物实验
利用由该缀合物合成的PROTAC分子进行沙利度胺-NH-C4-NH-Boc的体内动物研究。PROTAC通过口服或腹腔注射给药于啮齿动物。通过Western blot检测组织中靶蛋白的降解情况。通过测量下游信号通路和生物学反应来评估药效学效应。采集血样进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
沙利度胺-NH-C4-NH-Boc(CAS:2093388-52-2)的分子量为444.48 g/mol,分子式为C22H28N4O6。化学名称:叔丁基(4-((2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-1,3-二氧异吲哚啉-4-基)氨基)丁基)氨基甲酸酯。纯度:≥98%。储存条件:-20°C。该化合物是沙利度胺衍生的E3连接酶配体-连接子偶联物,用于PROTAC研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
沙利度胺-NH-C4-NH-Boc 是一种研究用化合物,尚未获准用于人体治疗。作为沙利度胺衍生物,它具有潜在的致畸作用,应采取适当的预防措施进行操作。该化合物仅用作研究试剂,用量极少。操作该化合物时,应遵循标准的实验室安全操作规程。
参考文献

[1]. Discovery of novel small molecule induced selective degradation of the bromodomain and extra-terminal (BET) bromodomain protein BRD4 and BRD2 with cellular potencies.Bioorg Med Chem. 2020 Jan 1;28(1):115181.

其他信息
Thalidomide-NH-C4-NH-Boc 是一种合成的 E3 连接酶配体-连接子偶联物,用于 PROTAC 技术。它包含一个基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) 配体和一个 Boc 保护的四碳连接子。其分子量为 444.48 g/mol,分子式为 C22H28N4O6。该产品尚未获得 FDA 批准,仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H28N4O6
分子量
444.480925559998
精确质量
444.2
CAS号
2093388-52-2
PubChem CID
138694407
外观&性状
Yellow to green solid powder
LogP
2.1
tPSA
134
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
777
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C2C(=CC=CC=2C(N1C1C(NC(CC1)=O)=O)=O)NCCCCNC(=O)OC(C)(C)C
InChi Key
OYPNLZMEXLFKLB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H28N4O6/c1-22(2,3)32-21(31)24-12-5-4-11-23-14-8-6-7-13-17(14)20(30)26(19(13)29)15-9-10-16(27)25-18(15)28/h6-8,15,23H,4-5,9-12H2,1-3H3,(H,24,31)(H,25,27,28)
化学名
tert-butyl N-[4-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]butyl]carbamate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~224.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.62 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.62 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2498 mL 11.2491 mL 22.4982 mL
5 mM 0.4500 mL 2.2498 mL 4.4996 mL
10 mM 0.2250 mL 1.1249 mL 2.2498 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们