Tubastatin A HCl (AG-CR-13900, TubA)

别名: AG-CR-13900; TubA; Tubastatin A hydrochloride; Tubastatin A HCl; TSA HCl N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-B]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺盐酸盐; Tubastatin A HCl 国华司机;Tubastatin A HCL ;N-羟基-4-[[2-甲基-3,4-二氢-1H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5(2H)-基]甲基]苯甲酰胺盐酸盐;Tubastatin A 盐酸盐
目录号: V0281 纯度: =98.73%
Tubastatin A HCl 是 Tubastatin A 的盐酸盐(也称为 TubA、AG-CR-13900),是一种 Tubacin 类似物,是组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 的有效特异性抑制剂,具有潜在的抗肿瘤、神经保护和抗炎活性。
Tubastatin A HCl (AG-CR-13900, TubA) CAS号: 1310693-92-5
产品类别: HDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
5mg
10mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes

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  • Tubastatin A (TubA, AG-CR1-3900)
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纯度/质量控制文件

纯度: =98.73%

纯度: =98.15%

产品描述
Tubastatin A HCl 是 Tubastatin A 的盐酸盐(也称为 TubA、AG-CR-13900),是一种 Tubacin 类似物,可作为组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 的有效且特异性抑制剂,具有潜在的抗肿瘤、神经保护和抗肿瘤作用。抗炎活性。与其他 HDAC 亚型(不包括 HDAC8)相比,它对抑制 HDAC6 表现出最高的选择性(>1,000 倍),其 IC50 为 0.9 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC6 ( IC50 = 15 nM ); HDAC8 ( IC50 = 854 nM ); HDAC1 ( IC50 = 16400 nM )
体外研究 (In Vitro)
体外活性:Tubastatin A 对所有 11 种 HDAC 异构体均具有显着选择性,并且对除 HDAC8 之外的所有异构体保持超过 1000 倍的选择性,其中 HDAC8 的选择性约为 57 倍。在同型半胱氨酸 (HCA) 诱导的神经变性测定中,Tubastatin A 从 5 μM 开始,对 HCA 诱导的神经元细胞死亡表现出剂量依赖性保护作用,在 10 μM 时几乎完全保护。 100 ng/mL 的 Tubastatin A 可增强 Foxp3+ T 调节细胞 (Treg) 对体外 T 细胞增殖的抑制作用。当 α-微管蛋白在生肌过程早期过度乙酰化时,C2C12 细胞中的图巴他汀 A 治疗会导致肌管形成受损。然而,当肌管中的α-微管蛋白过度乙酰化时,就会发生肌管伸长。最近的一项研究表明,原子力显微镜 (AFM) 测试表明,图巴他汀 A 治疗可增加细胞弹性,且不会对小鼠卵巢癌细胞系 MOSE-E 和 MOSE-L 中的肌动蛋白微丝或微管网络产生剧烈变化。激酶测定:酶抑制测定由位于宾夕法尼亚州 Malvern 的 Reaction Biology Corporation 使用 Reaction Biology HDAC Spectrum 平台进行。 (www.reactionbiology.com) HDAC1、2、4、5、6、7、8、9、10 和 11 检测使用分离的重组人蛋白; HDAC3/NcoR2 复合物用于 HDAC3 测定。 HDAC1、2、3、6、10 和 11 测定的底物是来自 p53 残基 379-382 的荧光肽 (RHKKAc); HDAC8 的底物是基于 p53 (RHKAcKAc) 残基 379-382 的荧光二酰肽。乙酰基-Lys(三氟乙酰基)-AMC 底物用于 HDAC4、5、7 和 9 测定。将图巴他汀 A 溶解在 DMSO 中,并以 10 剂量 IC50 模式进行测试,从 30 μM 开始进行 3 倍系列稀释。对照化合物曲古抑菌素 A (TSA) 在 10 剂量 IC50 中进行测试,从 5 μM 开始进行 3 倍连续稀释。 IC50 值通过曲线拟合剂量/反应斜率来提取。细胞测定:如前所述,从胎儿 Sprague-Dawley 大鼠(胚胎第 17 天)的大脑皮层获得原代皮层神经元培养物。所有实验均在电镀后 24 小时开始。在这些条件下,细胞不易受到谷氨酸介导的兴奋性毒性的影响。对于细胞毒性研究,用温 PBS 冲洗细胞,然后置于含有 5.5 g/L 葡萄糖、10% 胎牛血清、2 mM L-谷氨酰胺和 100 μM 胱氨酸的最低必需培养基 (Invitrogen) 中。通过向培养基中添加谷氨酸类似物同型半胱氨酸(HCA;5 mM)来诱导氧化应激。 HCA 由 100 倍浓缩溶液稀释而成,并调节至 pH 7.5。结合 HCA,用指定浓度的图巴他汀 A 处理神经元。 24小时后通过MTT测定(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四唑溴化物)方法评估活力。
体内研究 (In Vivo)
每日治疗 0.5mg/kg 的 Tubastatin A 可抑制 HDAC6,从而促进炎症和自身免疫小鼠模型中的 Tregs 抑制活性,包括多种形式的实验性结肠炎和完全主要组织相容性复合体 (MHC) 不相容的心脏同种异体移植排斥反应。
动物实验
In adoptive transfer and dextran sodium sulfate (DSS) models of colitis, the effects of HDAC6 targeting are assessed in groups of ten mice each. For five days, WT B6 mice's pH-balanced tap water is supplemented with freshly made 4% (wt/vol) DSS every day. Colitis is evaluated by daily monitoring of body weight, stool consistency, and fecal blood. Mice are treated daily for 7 days with either tubacin or niltubacin (0.5 mg/kg of body weight/day, i.p.). Hemoloccult feces are graded as 0 (absent), 2 (occult), or 4 (gross). Stool consistency is graded as 0 (hard), 2 (soft), or 4 (diarrhea). In order to evaluate the prevention of colitis in a T cell-dependent model, B6/Rag1−/− mice receive an intraperitoneal injection of CD4+ CD45RBhi T cells (1×106) isolated from WT mice using magnetic beads (>95% cell purity, flow cytometry) along with CD4+ CD25+ Tregs (1.25×105) isolated from HDAC6−/− or WT mice using magnetic beads (>90% Treg purity, flow cytometry). The mice are then observed every two weeks for signs of colitis. In order to evaluate treatment for established T cell-dependent colitis, CD4+ CD45RBhi cells (1×106) are intraperitoneally injected into B6/Rag1−/− mice. After colitis manifests, mice are also given treatment with HDAC6i (tubastatin A) or HSP90i (17-AAG) or CD4+ CD25+ Tregs (5×105 cells), which were isolated from HDAC6−/− or WT mice as previously described. The mice's continued weight loss and the consistency of their feces are observed. When the study comes to an end, paraffin sections of colons stained with hematoxylin and eosin or Alcian Blue are either immunoperoxidase stained for Foxp3+ Treg infiltration or graded histologically.
参考文献

[1]. Rational Design and Simple Chemistry Yield a Superior, Neuroprotective HDAC6 Inhibitor, Tubastatin A J. Am. Chem. Soc., 2010, 132 (31), pp 10842-10846.

[2]. Histone deacetylase 6 and heat shock protein 90 control the functions of Foxp3(+) T-regulatory cells. Mol Cell Biol. 2011 May;31(10):2066-78.

[3]. Dysferlin interacts with histone deacetylase 6 and increases alpha-tubulin acetylation. PLoS One. 2011;6(12):e28563.

[4]. Actin filaments play a primary role for structural integrity and viscoelastic response in cells. Integr Biol (Camb). 2012 May;4(5):540-9.

[5]. HDAC6 Inhibition Promotes Transcription Factor EB Activation and Is Protective in Experimental Kidney Disease. Front Pharmacol. 2018 Feb 1;9:34.

[6]. Target deconvolution of HDAC pharmacopoeia reveals MBLAC2 as common off-target. Nat Chem Biol. 2022 Apr 28.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H21N3O2.HCL
分子量
371.86
精确质量
371.14
元素分析
C, 64.60; H, 5.96; Cl, 9.53; N, 11.30; O, 8.60
CAS号
1310693-92-5
外观&性状
Solid powder
SMILES
CN1CCC2=C(C1)C3=CC=CC=C3N2CC4=CC=C(C=C4)C(=O)NO.Cl
InChi Key
LJTSJTWIMOGKRJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H21N3O2.ClH/c1-22-11-10-19-17(13-22)16-4-2-3-5-18(16)23(19)12-14-6-8-15(9-7-14)20(24)21-25;/h2-9,25H,10-13H2,1H3,(H,21,24);1H
化学名
N-hydroxy-4-[(2-methyl-3,4-dihydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide;hydrochloride
别名
AG-CR-13900; TubA; Tubastatin A hydrochloride; Tubastatin A HCl; TSA HCl
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外)
DMSO: 10.8~74 mg/mL (29.0~199.0 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体内)
1% DMSO+30% polyethylene glycol+1% Tween 80: 30 mg/mL
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 50% PEG300 → 5% Tween-80 → 35% ddH2O;假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄 清 DMSO 储备液加到 500 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入350 μL ddH2O定容至 1 mL);
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6892 mL 13.4459 mL 26.8918 mL
5 mM 0.5378 mL 2.6892 mL 5.3784 mL
10 mM 0.2689 mL 1.3446 mL 2.6892 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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