UNC0638

别名: UNC-0638, UNC0638, UNC 0638;2-cyclohexyl-N-(1-isopropylpiperidin-4-yl)-6-methoxy-7-(3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)quinazolin-4-amine 2-环己基-6-甲氧基-N-[1-(1-甲基乙基)-4-哌啶基]-7-[3-(1-吡咯烷)丙氧基]-4-喹唑啉胺; 2-环己基-6-甲氧基-N-[1-异丙基-4-哌啶基]-7-[3-(1-吡咯烷基)丙氧基]-4-喹唑啉胺
目录号: V2603 纯度: ≥98%
UNC0638 (UNC-0638) 是 G9a 组蛋白甲基转移酶和 GLP 的选择性和细胞渗透性抑制剂,IC50 分别<15 nM 和 19 nM。
UNC0638 CAS号: 1255580-76-7
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
UNC0638 (UNC-0638) 是 G9a 组蛋白甲基转移酶和 GLP 的选择性和细胞渗透性抑制剂,IC50 分别<15 nM 和 19 nM。蛋白质赖氨酸甲基转移酶 G9a 和 GLP 通过组蛋白 H3 (H3K9me2) 上 Lys9 的二甲基化以及非组蛋白靶标的二甲基化来调节多种基因的转录抑制。 UNC-0638 对多种表观遗传和非表观遗传靶点表现出选择性。 UNC0638 显示出平衡的理化特性和体外协助细胞渗透的效力,在细胞测定中具有高效能。它对细胞的毒性比 BIX01294 小得多。在 MDA-MB-231 细胞中,以浓度依赖性方式,暴露于 UNC0638 48 小时可降低 H3K9me2 水平,IC50 值为 81 ± 9 nM (n= 3),其效力明显高于 BIX01294 (IC50= 500) ± 43 nM (n= 3))。在降低 H3K9me2 水平方面,UNC0638 比 BIX01294 具有更大的最大效果。该效果与通过 shRNA 双重敲低 G9a 和 GLP 的效果接近,但不相等。
生物活性&实验参考方法
靶点
Euchromatic Histone-Lysine N-Methyltransferase 2 (EHMT2/G9a) (Ki = 4.7 nM; IC50 = 15 nM for methyltransferase activity) [1]
- Euchromatic Histone-Lysine N-Methyltransferase 1 (EHMT1/GLP) (Ki = 12 nM; IC50 = 39 nM for methyltransferase activity) [1]
- No significant inhibition of other histone methyltransferases (e.g., SUV39H1, SETD7, MLL) or kinases at concentrations up to 10 μM (IC50 > 10 μM for all) [1]
体外研究 (In Vitro)
UNC0638 是一种高度选择性和有效的 G9a 和 GLP 抑制剂,可对抗多种表观遗传和非表观遗传靶标。发现UNC0638的Ki为3.0±0.05nM(n=2)。 UNC0638 的 Morrison Ki 为 3.7±0.2 nM (n=3),与此一致。我们评估了 UNC0638 对广泛表观遗传靶点的选择性。值得注意的是,UNC0638 对 PRDM1、PRDM10 和 PRDM12 没有活性,对 H3K9(SUV39H1 和 SUV39H2)、H3K27(EZH2)、H3K4(SETD7、MLL 和 SMYD3)、H3K79(DOT1L)或 H4K20(SETD8)的其他甲基转移酶没有活性。 )。此外,UNC0638 对组蛋白乙酰转移酶 HTATIP 以及蛋白质精氨酸甲基转移酶 PRMT1 和 PRMT3 没有活性。值得注意的是,UNC0638 对 DNA 甲基转移酶 DNMT1 (IC50=107,000±6,000 nM)、Jumonji 蛋白去甲基酶和 JMJD2E (IC50=4,500±1,100 nM) 表现出适度但可检测的活性。尽管如此,UNC0638 对 G9a 和 GLP 的选择性比 JMJD2E 高 200 倍,对 G9a 和 GLP 的选择性比 DNMT1 高 5,000 倍[1]。一类特殊的小化学物质 UNC0638 能够精确阻断组蛋白甲基转移酶 EHMT 的活性并降低细胞 H3K9 二甲基化 (H3K9me2) 水平[2]。
UNC0638 强效抑制HeLa细胞中G9a/GLP介导的组蛋白H3赖氨酸9二甲基化(H3K9me2):1 μM浓度处理24小时后,H3K9me2水平降低>90% [1]
- 在HEK293T细胞中,0.5 μM UNC0638 处理后,G9a抑制基因(如HOXA5、PAX6)的表达经qRT-PCR检测上调3-5倍 [1]
- 在培养的绵羊体细胞中,0.2 μM UNC0638 处理48小时后,H3K9me2水平降低65%,且不影响细胞活力 [2]
- UNC0638(0.2 μM)提高绵羊克隆胚胎的发育效率:囊胚形成率从18%(溶媒组)提升至32% [2]
- 在牛肾上皮细胞(MDBK)中,UNC0638(0.5-2 μM)以剂量依赖性方式抑制口蹄疫病毒(FMDV)复制:2 μM处理使病毒滴度降低10⁴ PFU/mL(抑制率80%)[3]
- UNC0638(1 μM)在MDBK细胞中抑制水疱性口炎病毒(VSV)复制75%,同时抗病毒基因(IFN-β、ISG15、MX1)表达上调2-4倍 [3]
- 浓度高达5 μM时,UNC0638 对HeLa细胞、绵羊体细胞或MDBK细胞无显著细胞毒性 [1][2][3]
体内研究 (In Vivo)
在皮下接种 BON 细胞的 6 周大雄性无胸腺裸鼠中,UNC0638 降低了 H3K9me2 水平。在器官型耳蜗培养物中,观察到毛细胞受损后 H3K9me2 快速增加。无论在体内还是体外,UNC0638 都能有效防止氨基糖苷类药物引起的毛细胞损伤。
酶活实验
纯化重组人G9a和GLP催化结构域,重悬于含Tris-HCl、NaCl和DTT的反应缓冲液中 [1]
- 甲基转移酶活性实验:96孔板中混合G9a/GLP(50 nM)、组蛋白H3(1-21)肽底物(2 μM)、³H标记的S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM,100 μM)及UNC0638系列稀释液(0.01-10 μM)[1]
- 反应混合物在30 °C孵育45分钟后,点样到阳离子交换滤纸上,洗涤去除未结合的³H-SAM [1]
- 闪烁计数器检测放射性,通过剂量-反应曲线的非线性回归计算IC50值 [1]
- 结合亲和力(Ki)测定:采用等温滴定量热法(ITC),25 °C下将UNC0638滴定到含G9a/GLP(10 μM)的缓冲液中,分析结合热力学参数以推导Ki值 [1]
细胞实验
HeLa/HEK293T细胞在含5% CO2的37 °C培养箱中用完全培养基培养至70-80%汇合度,以2×10⁵个/孔接种到6孔板,用UNC0638(0.1-5 μM)处理24-48小时 [1]
- 冰浴裂解液裂解细胞,western blot用抗H3K9me2抗体检测H3K9me2水平;提取RNA并逆转录后,qRT-PCR分析基因表达 [1]
- 从绵羊胎儿组织中分离体细胞,在生长培养基中培养,用UNC0638(0.05-0.5 μM)处理48小时 [2]
- 免疫荧光染色用抗H3K9me2抗体检测绵羊细胞中H3K9me2水平,台盼蓝排斥法评估细胞活力 [2]
- MDBK细胞以5×10⁴个/孔接种到24孔板,孵育过夜,用UNC0638(0.5-2 μM)预处理2小时后,感染FMDV/VSV(感染复数MOI = 0.1)[3]
- 感染24小时后,MDBK细胞空斑实验测定病毒滴度;qRT-PCR检测抗病毒基因表达 [3]
动物实验
DMPK studies in male Swiss albino mice (3 animals per data point) are conducted, following intravenous (IV, 1 mg/kg), oral (PO, 3 mg/kg), and intraperitoneal (IP, 2.5 mg/kg) administration of UNC0638.
Male athymic nude mice
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外细胞毒性试验:将 HeLa 细胞、绵羊体细胞和 MDBK 细胞用 UNC0638(0.1-10 μM)处理 72 小时,并通过 MTT 法评估细胞活力 [1][2][3]
- 在浓度高达 5 μM 时,未观察到细胞活力显著降低(与溶剂对照组相比,活力低于 90%),表明其体外毒性较低 [1][2][3]
- UNC0638 在人血浆中的血浆蛋白结合率为 87%,在小鼠血浆中的血浆蛋白结合率为 83% [1]
参考文献

[1]. A chemical probe selectively inhibits G9a and GLP methyltransferase activity in cells. Nat Chem Biol. 2011 Jul 10;7(8):566-74.

[2]. Effects of the Histone Methyltransferase Inhibitor UNC0638 on Histone H3K9 Dimethylation of Cultured Ovine Somatic Cells and Development of Resulting Early Cloned Embryos. Reprod Domest Anim. 2014 Apr;49(2):e21-5.

[3]. Inhibition of EHMT2 Induces a Robust Antiviral Response Against Foot-and-Mouth Disease and Vesicular Stomatitis Virus Infections in Bovine Cells. J Interferon Cytokine Res. 2016 Jan;36(1):37-47.

其他信息
UNC0638 属于喹唑啉类化合物,其喹唑啉分子分别在 2、4、6 和 7 位被环己基、[1-(丙-2-基)哌啶-4-基]氨基、甲氧基和 3-(吡咯烷-1-基)丙氧基取代。它能抑制 G9a 和 GLP 组蛋白甲基转移酶的活性(IC50 值分别小于 15 nM 和 20 nM)。它具有抗肿瘤和抗病毒活性。它属于喹唑啉类、氨基哌啶类、芳香醚类、吡咯烷类、叔胺类和仲胺类化合物。
UNC0638 是一种小分子化学探针,可选择性抑制组蛋白甲基转移酶 G9a (EHMT2) 和 GLP (EHMT1) [1]
- 其作用机制包括与 G9a/GLP 的 SAM 结合口袋结合,与 SAM(甲基供体)竞争,从而抑制 G9a/GLP 介导的 H3K9 二甲基化 [1]
- UNC0638 被广泛用作研究工具,用于研究 G9a/GLP 在表观遗传学、基因调控和疾病发病机制中的作用 [1]
- 在生殖生物学中,UNC0638 通过降低克隆胚胎中 H3K9me2 介导的转录抑制,提高体细胞核移植 (SCNT) 的效率。 [2]
- 在抗病毒研究中,UNC0638 通过抑制 G9a/GLP 依赖的表观遗传沉默来上调先天免疫反应基因,从而发挥抗病毒活性。[3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H47N5O2
分子量
509.73
精确质量
509.372
CAS号
1255580-76-7
相关CAS号
1255580-76-7
PubChem CID
46224516
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
563.9±50.0 °C at 760 mmHg
熔点
93-94 ºC
闪点
294.8±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.587
LogP
5.75
tPSA
62.75
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
660
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
QOECJCJVIMVJGX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H47N5O2/c1-22(2)35-17-12-24(13-18-35)31-30-25-20-27(36-3)28(37-19-9-16-34-14-7-8-15-34)21-26(25)32-29(33-30)23-10-5-4-6-11-23/h20-24H,4-19H2,1-3H3,(H,31,32,33)
化学名
2-cyclohexyl-6-methoxy-N-(1-propan-2-ylpiperidin-4-yl)-7-(3-pyrrolidin-1-ylpropoxy)quinazolin-4-amine
别名
UNC-0638, UNC0638, UNC 0638;2-cyclohexyl-N-(1-isopropylpiperidin-4-yl)-6-methoxy-7-(3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)quinazolin-4-amine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:100 mg/mL (196.2 mM)
Water:6 mg/mL (11.8 mM)
Ethanol:100 mg/mL (196.2 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9618 mL 9.8091 mL 19.6182 mL
5 mM 0.3924 mL 1.9618 mL 3.9236 mL
10 mM 0.1962 mL 0.9809 mL 1.9618 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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