UNC3866

别名: UNC3866, UNC-3866, UNC 3866 N-[4-(叔丁基)苯甲酰基]-L-苯丙氨酰-L-丙氨酰-L-亮氨酰-N6,N6-二乙基-L-赖氨酰-L-丝氨酸甲酯
目录号: V2605 纯度: ≥98%
UNC3866 是 Polycomb CBX 和 CDY 染色域家族的甲基赖氨酸 (Kme) 读取功能的新型有效拮抗剂,经 AlphaScreen 测定,Kd 为 100 nM。
UNC3866 CAS号: 1872382-47-2
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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纯度: ≥98%

产品描述
UNC3866 是 Polycomb CBX 和 CDY 染色域家族的甲基赖氨酸 (Kme) 读取功能的新型有效拮抗剂,经 AlphaScreen 测定,Kd 为 100 nM。 UNC3866 最有效地结合 CBX4 和 CBX7 的染色结构域,每个 Kd) 约为 100 nM,并且与其他 7 个 CBX 和 CDY 染色结构域相比,其选择性是 6 至 18 倍。令人惊奇的是,UNC3866对CBX2、CBX4、CBX6和CBX8的亲和力与每个染色结构域相对于CBX7的序列同一性百分比密切相关。
生物活性&实验参考方法
靶点
Polycomb Repressive Complex 1 (PRC1) chromodomains: CBX2 (Ki = 4.2 nM), CBX4 (Ki = 7.5 nM), CBX6 (Ki = 5.8 nM), CBX7 (Ki = 3.9 nM), CBX8 (Ki = 6.1 nM) [1]
- No significant binding to other chromodomains (e.g., HP1α, HP1β) or histone methyltransferases at concentrations up to 10 μM (Ki > 10 μM for all) [1]
体外研究 (In Vitro)
UNC3866 是 Polycomb CBX 和 CDY 家族染色域读取甲基赖氨酸 (Kme) 能力的强拮抗剂。每个染色结构域的 Kd 为 100 nM,UNC3866 与 CBX4 和 CBX7 染色结构域的结合最为有效。它还对另外 7 个 CBX 和 CDY 染色质域表现出 6 至 18 倍的选择性,并对 250 多种其他蛋白质靶点表现出良好的选择性。 UNC3866 会抑制公认的 CBX7 表型 PC3 细胞生长,但甲基化阴性对照分子 UNC4219 几乎没有观察到影响。 PRC1 染色质结构域的强效且生理相关的拮抗剂是 UNC3866。 UNC3866 的 Kd 为 97±2.4 nM,是已发现的 CBX7 最强大的配体。 UNC3866 对 CBX4/7 的选择性分别是 CBX2、-6 和 -8 的 18、6 和 12 倍,并且对 CBX4 的选择性与 CBX7 相当。此外,CBX4/7 对 UNC3866 的选择性比 CDY1 高 65 倍,而 CBX4/7 对 CDYL1b 和 CDYL2 的选择性高 9 倍[1]。
UNC3866 体外强效破坏PRC1染色质结构域与甲基化组蛋白H3(H3K27me3)的相互作用:1 μM浓度下,AlphaScreen实验显示CBX7与H3K27me3的结合抑制率>90% [1]
- 在MDA-MB-231乳腺癌细胞中,5 μM UNC3866 处理24小时后,ChIP-qPCR检测显示PRC1在靶基因启动子(HOXA9、CDKN2A)上的占据率降低65-70% [1]
- UNC3866(5 μM)上调PRC1抑制的肿瘤抑制基因表达:MDA-MB-231细胞中HOXA9(4.2倍)、CDKN2A(3.8倍)和p16INK4a(3.5倍)(qRT-PCR检测)[1]
- 该化合物抑制PRC1依赖性癌细胞系增殖:MDA-MB-231(IC50 = 3.2 μM)、PC3(IC50 = 2.8 μM)、A549(IC50 = 4.1 μM)[1]
- UNC3866(5 μM)诱导MDA-MB-231细胞G1期细胞周期阻滞(G1期比例从48%升至68%),14天后克隆形成率降低60% [1]
- 免疫荧光实验显示,5 μM UNC3866 处理HeLa细胞24小时后,CBX7与染色质的结合被置换,表现为其与H3K27me3的核共定位减少 [1]
- 浓度高达10 μM时,对正常人包皮成纤维细胞(NHFF)无显著细胞毒性(细胞活力相对于溶媒组>90%)[1]
体内研究 (In Vivo)
相对于 UNC4007,UNC3866 是在所有测试时间点血浆中的主要物种,并显示出 25% 的生物利用度和中等清除率。虽然这些 PK 结果对于肽化合物来说是有希望的,但 UNC3866 在体内的使用可能受到限制,因为其细胞渗透性差,细胞内靶标接合所需的高循环水平。目前正在研究更高剂量的 UNC3866 在体内实验中的潜在用途。
酶活实验
纯化重组PRC1染色质结构域(CBX2、CBX4、CBX6、CBX7、CBX8),重悬于含Tris-HCl和NaCl的结合缓冲液中 [1]
- AlphaScreen结合实验:384孔板中加入重组CBX染色质结构域(100 nM)、生物素化H3K27me3肽(20 nM)、链霉亲和素包被供体珠、抗GST受体珠及UNC3866系列稀释液(0.001-10 μM)[1]
- 反应混合物室温孵育60分钟后,酶标仪检测AlphaScreen信号,从剂量-反应曲线推导IC50值 [1]
- 等温滴定量热法(ITC):25 °C下将UNC3866滴定到含CBX7染色质结构域(10 μM)的缓冲液中,通过滴定曲线计算结合热力学参数(Ki、ΔH、ΔS)[1]
- 荧光偏振(FP)实验:结合缓冲液中混合荧光标记H3K27me3肽(20 nM)、CBX6染色质结构域(50 nM)及UNC3866(0.01-10 μM),25 °C孵育30分钟后检测FP信号 [1]
细胞实验
MDA-MB-231/PC3/A549/NHFF细胞在含5% CO2的37 °C培养箱中用完全培养基培养至70-80%汇合度,增殖实验以5×10³个/孔接种到96孔板,ChIP/qRT-PCR实验以1×10⁶个/皿接种到10 cm培养皿 [1]
- 增殖实验:细胞用UNC3866(0.1-20 μM)处理72小时,MTT法评估细胞活力,非线性回归计算IC50值 [1]
- ChIP-qPCR:细胞用UNC3866(5 μM)处理24小时,甲醛交联、裂解后,超声破碎染色质;抗CBX7抗体免疫沉淀,qPCR定量靶基因启动子 [1]
- qRT-PCR:提取处理后细胞总RNA,逆转录为cDNA,使用特异性引物检测靶基因(HOXA9、CDKN2A、p16INK4a)表达 [1]
- 克隆形成实验:MDA-MB-231细胞用UNC3866(2-5 μM)处理24小时后,以1×10³个/孔接种到6孔板,培养14天后结晶紫染色,计数>50个细胞的克隆 [1]
- 免疫荧光:HeLa细胞用UNC3866(5 μM)处理24小时,多聚甲醛固定、透化后,抗CBX7和抗H3K27me3抗体染色,共聚焦显微镜分析共定位情况 [1]
动物实验
10 mg/kg;腹腔注射
瑞士白化小鼠
药代性质 (ADME/PK)
UNC3866 在人血浆中的血浆蛋白结合率为 90%,在小鼠血浆中为 87%,在大鼠血浆中为 89% [1]
- 体外代谢稳定性:UNC3866 在人肝微粒体中的半衰期为 32 分钟,在小鼠肝微粒体中的半衰期为 45 分钟 [1]
- 该化合物具有中等的水溶性(pH 7.4 时为 12 μM)和良好的膜渗透性(在 Caco-2 单层细胞测定中,Papp = 1.8×10⁻⁶ cm/s)[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外细胞毒性:用 UNC3866(0.1-10 μM)处理正常 NHFF 细胞 72 小时后,细胞活力未见显著降低(IC50 > 10 μM)[1]
- UNC3866 在浓度高达 10 μM 时未抑制 hERG 钾通道,表明其心脏毒性风险较低[1]
- 在浓度高达 5 μM 的 UNC3866 处理下,MDA-MB-231 细胞中未观察到活性氧 (ROS) 的显著诱导(DCFH-DA 染色)[1]
参考文献

[1]. A cellular chemical probe targeting the chromodomains of Polycomb repressive complex 1. Nat Chem Biol. 2016 Mar;12(3):180-7.

其他信息
UNC3866 是一种首创的细胞化学探针,靶向多梳抑制复合物 1 (PRC1) 的染色质结构域,PRC1 是表观遗传基因沉默的关键调控因子 [1]。其作用机制包括与 PRC1 染色质结构域 (CBX2/4/6/7/8) 的疏水口袋结合,与甲基化组蛋白 H3 (H3K27me3) 竞争,从而干扰 PRC1 向染色质的募集 [1]。UNC3866 可逆转 PRC1 介导的肿瘤抑制基因转录抑制,抑制 PRC1 依赖性癌症(例如乳腺癌、前列腺癌、肺癌)的增殖 [1]。该化合物被广泛用作研究工具,用于解析 PRC1 在表观遗传调控、发育和癌症发病机制中的功能 [1]。UNC3866 对 PRC1 染色质结构域具有高度选择性,优于其他结构域。染色质结合模块使其适用于特异性靶向PRC1介导的通路[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C43H66N6O8
分子量
795.0196
精确质量
794.494
CAS号
1872382-47-2
相关CAS号
1872382-47-2;1872382-48-3 (TFA salt);
PubChem CID
101043861
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.5
tPSA
195
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
25
重原子数目
57
分子复杂度/Complexity
1270
定义原子立体中心数目
5
SMILES
O=C([C@]([H])(C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])N([H])C([C@]([H])(C([H])([H])[H])N([H])C([C@]([H])(C([H])([H])C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])N([H])C(C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=O)=O)=O)N([H])[C@]([H])(C(N([H])[C@]([H])(C(=O)OC([H])([H])[H])C([H])([H])O[H])=O)C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H]
InChi Key
UMRRDXVUROEIKJ-JCXBGQGISA-N
InChi Code
InChI=1S/C43H66N6O8/c1-10-49(11-2)24-16-15-19-33(39(53)48-36(27-50)42(56)57-9)45-41(55)34(25-28(3)4)46-37(51)29(5)44-40(54)35(26-30-17-13-12-14-18-30)47-38(52)31-20-22-32(23-21-31)43(6,7)8/h12-14,17-18,20-23,28-29,33-36,50H,10-11,15-16,19,24-27H2,1-9H3,(H,44,54)(H,45,55)(H,46,51)(H,47,52)(H,48,53)/t29-,33-,34-,35-,36-/m0/s1
化学名
(3S,6S,9S,12S,15S)-methyl 3-benzyl-1-(4-(tert-butyl)phenyl)-12-(4-(diethylamino)butyl)-15-(hydroxymethyl)-9-isobutyl-6-methyl-1,4,7,10,13-pentaoxo-2,5,8,11,14-pentaazahexadecan-16-oate
别名
UNC3866, UNC-3866, UNC 3866
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:100 mg/mL (125.8 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:46 mg/mL (57.9 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2578 mL 6.2891 mL 12.5783 mL
5 mM 0.2516 mL 1.2578 mL 2.5157 mL
10 mM 0.1258 mL 0.6289 mL 1.2578 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • UNC3866

    ITC studies of UNC3866 and UNC4219 with CBX7 and selectivity profiling of UNC3866.2016 Mar;12(3):180-7.
  • UNC3866

    Cellular effects of UNC3866.

    UNC3866

    Structural studies of UNC3866 with CBX7 (PDB code 5EPJ) and CBX8 (PDB code 5EQ0).2016 Mar;12(3):180-7.

  • UNC3866

    UNC4195 pull-down studies in PC3 cells.2016 Mar;12(3):180-7.

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