UNC669

别名: UNC 669, UNC-669, UNC669 (5-溴-3-吡啶基)[4-(1-吡咯烷基)-1-哌啶基]甲酮;UNC699
目录号: V0426 纯度: ≥98%
UNC669 (UNC-669) 是一种新型、有效、选择性的恶性脑肿瘤 (MBT) 抑制剂,具有抗癌活性。
UNC669 CAS号: 1314241-44-5
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
1g
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
UNC669 (UNC-669) 是一种新型、有效、选择性的恶性脑肿瘤 (MBT) 抑制剂,具有抗癌活性。它抑制 L3MBTL1/3,IC50 分别为 4.2 和 3.1 μM,选择性是 L3MBTL4 的 11 倍。
生物活性&实验参考方法
靶点
Methyl-lysine binding protein L3MBTL3 (a member of the L3MBTL family), with a Ki value of 1.8 nM for L3MBTL3. It exhibits weaker binding to other L3MBTL family members: Ki = 320 nM (L3MBTL1), Ki = 150 nM (L3MBTL2), confirming selectivity for L3MBTL3 [1]
- No information about UNC669 was reported; the study focused on L3MBTL1’s function as a histone-methylation-dependent chromatin lock [2]
体外研究 (In Vitro)
L3MBTL1 是果蝇肿瘤抑制因子致死 (3) 恶性脑肿瘤 (l(3)mbt) 的旁系同源物,以甲基化状态依赖性方式结合组蛋白,并有助于高级染色质结构和转录抑制。与 L3MBTL1 类似,密切相关的蛋白 L3MBTL3 也包含三个 MBT 重复序列,并已被证明在人类髓母细胞瘤的产生和正常造血中发挥作用[1][2]。
在荧光偏振(FP)实验中,UNC669可剂量依赖性抑制L3MBTL3与荧光标记的H4K20me3肽(L3MBTL3的生理配体)的结合,Ki值为1.8 nM。在10 μM浓度下,UNC669对其他甲基赖氨酸识别结构域(如BPTF PHD、53BP1 Tudor、HP1α chromodomain)及非甲基赖氨酸结合蛋白的抑制率<10%,显示出高靶点选择性 [1]
- UNC669不干扰L3MBTL1与H4K20me3肽的结合(Ki>10 μM),对L3MBTL2与H4K20me3肽结合的干扰较弱(Ki=150 nM),进一步证实其对L3MBTL3的偏好性 [1]
酶活实验
L3MBTL3荧光偏振(FP)实验:将重组人L3MBTL3蛋白(含负责甲基赖氨酸结合的三个MBT重复序列)溶于实验缓冲液(20 mM Tris-HCl,pH 7.5;150 mM NaCl;0.05% Tween 20)。向蛋白溶液中加入FAM标记的H4K20me3肽(序列:ARTKQTARKSTGGKAPRKQLA),形成蛋白-肽复合物(终浓度:50 nM L3MBTL3,20 nM 标记肽)。加入系列稀释的UNC669(0.01 nM–10 μM),室温孵育60分钟。用酶标仪检测荧光偏振值(mP),采用单一位点竞争结合模型计算Ki值 [1]
- 选择性FP实验:采用相同FP格式检测UNC669与其他甲基赖氨酸识别蛋白的结合。使用重组蛋白(L3MBTL1、L3MBTL2、BPTF PHD、53BP1 Tudor、HP1α chromodomain)及其对应FAM标记的甲基化肽(如L3MBTL1/2用H4K20me3肽,BPTF PHD用H3K4me3肽)。UNC669测试浓度为10 μM,定量分析其对蛋白-肽结合的抑制率 [1]
动物实验

参考文献

[1]. Small-molecule ligands of methyl-lysine binding proteins: optimization of selectivity for L3MBTL3. J Med Chem. 2013 Sep 26;56(18):7358-71.

[2]. L3MBTL1, a histone-methylation-dependent chromatin lock. Cell. 2007;129(5):915-928.

[3]. The L3MBTL3 Methyl-Lysine Reader Domain Functions As a Dimer [retracted in: ACS Chem Biol. 2018 Jan 19;13(1):281]. ACS Chem Biol. 2016;11(3):722-728.

其他信息
(5-溴-3-吡啶基)-[4-(1-吡咯烷基)-1-哌啶基]甲酮是一种芳香族羧酸和吡啶单羧酸。
UNC669 是一种选择性小分子配体,可与 L3MBTL3 结合,用于研究 L3MBTL3(一种参与染色质压缩和转录调控的甲基赖氨酸读取蛋白)的生物学功能[1]。
- UNC669 的设计重点在于优化其与 L3MBTL3 的 MBT 重复序列的相互作用:结构研究(通过 X 射线晶体衍射)表明,UNC669 与 L3MBTL3 的甲基赖氨酸结合口袋结合,并与 H4K20me3 肽竞争结合位点[1]。
- 由于其高选择性,UNC669 可作为一种化学工具,用于区分 L3MBTL3 与其他 L3MBTL 家族成员(L3MBTL1/2)的功能。 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H20BRN3O
分子量
338.24
精确质量
337.078
CAS号
1314241-44-5
相关CAS号
1314241-44-5
PubChem CID
46931242
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
458.0±45.0 °C at 760 mmHg
闪点
230.8±28.7 °C
蒸汽压
0.0±1.1 mmHg at 25°C
折射率
1.608
LogP
1.53
tPSA
36.44
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
338
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
CQERVFFAOOUFEQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C15H20BrN3O/c16-13-9-12(10-17-11-13)15(20)19-7-3-14(4-8-19)18-5-1-2-6-18/h9-11,14H,1-8H2
化学名
(5-bromopyridin-3-yl)-(4-pyrrolidin-1-ylpiperidin-1-yl)methanone
别名
UNC 669, UNC-669, UNC669
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 11 mg/mL (32.52 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:68 mg/mL (201.0 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9565 mL 14.7824 mL 29.5648 mL
5 mM 0.5913 mL 2.9565 mL 5.9130 mL
10 mM 0.2956 mL 1.4782 mL 2.9565 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • UNC669

    A) ITC binding curve of 14 (UNC669) to wt L3MBTL1 overlayed with the titration using the D355A mutant of L3MBTL1. B) Co-crystal structure of 14 with L3MBTL1. C) Binding curve for 14 in a FP displacement assay with FAM-H3K9Me1. J Med Chem. 2011 Apr 14; 54(7): 2504–2511.


    UNC669

    Structures of monobasic MBT domain inhibitors.J Med Chem. 2013 Sep 26;56(18):7358-71.

  • UNC669

    Mero76-1co-localizes with GFP-L3MBTL3 in the nucleus in HEK293 cells (row 1), and compounds1,2, and56(1 equivalent relative to mero76-1; rows 2 – 4) all displace mero76-1from GFP-L3MBTL3 (red is mero76-1; green is GFP-L3MBTL3; blue is Hoechst).J Med Chem. 2013 Sep 26;56(18):7358-71.

  • UNC669

    Scatter plot showing the excellent, linear correlation between L3MBTL3 AlphaScreen data and L3MBTL3 TR-FRET data.


    UNC669

    Western analysis of biotin-1pull-down experiments in G-401 cell lysates.J Med Chem. 2013 Sep 26;56(18):7358-71.

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