| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10 mM * 1 mL in DMSO |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| 1g |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DNA methyltransferases (DNMTs) (IC₅₀ = ~1.5 μM for recombinant human DNMT1; IC₅₀ = ~2.0 μM for DNMT3a; no significant inhibition of DNMT3b at concentrations ≤ 10 μM) [1]
- Cytidine deaminase (CDA) (Ki = ~0.8 μM; competitive inhibitor with respect to cytidine, no inhibition of other nucleoside deaminases (e.g., adenosine deaminase) with Ki > 20 μM) [4] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
ZebuLarine 通过稳定 DNMT 与 DNA 的结合、抑制甲基化并最大限度地减少解离来实现其去甲基化作用,从而捕获酶并防止在其他位置发生翻转。 zebuLarine 可改善肿瘤细胞的化疗和放射敏感性,并具有抗有丝分裂和血管抑制作用 [1]。 ZebuLarine 抑制 DNA 甲基化并重新激活先前因甲基化而沉默的基因。 ZebuLarine 在 10T1/2 细胞中产生肌源性表型,这是 DNA 甲基化抑制剂独有的功能。 ZebuLarine 重新激活 T24 膀胱癌细胞中沉默的 p16 基因并使其启动子区域去甲基化 [2]。 ZebuLarine 给药以剂量和时间依赖性方式抑制细胞增殖,暴露 96 小时后,MDA-MB-231 和 MCF-7 细胞的 IC50 分别为 ∼100 μM 和 150 μM。高剂量时,zebuLarine 以细胞系特异性方式促进凋亡蛋白的改变,表现为 caspase-3、Bax、Bcl2 和 PARP 裂解的变化 [3]。 ZebuLarine 也是一种强大的 CR 脱氨酶竞争性抑制剂。 zebuLarine 的 Ki 为 0.95 μM[4]。
1. DNMT抑制与DNA去甲基化: zebularine(NSC309132;4-脱氧尿苷) 对HeLa细胞核提取物中的DNMT活性呈剂量依赖性抑制。浓度为5 μM时,通过放射法(检测[³H]-甲基掺入富含CpG的DNA)测得其使DNMT1活性降低约65%;HeLa细胞经5 μM处理72小时后,HPLC分析显示全局5-甲基胞嘧啶(5-mC)水平降低约40%。ChIP-qPCR证实p16^(INK4a)启动子去甲基化(5 μM时5-mC减少50%),qRT-PCR显示p16^(INK4a) mRNA表达上调2.8倍[2] 2. 人乳腺癌细胞抗增殖活性: zebularine 对乳腺癌细胞系具有强效细胞毒性。MTT实验(72小时)测得IC₅₀为:MCF-7(ER⁺)≈8 μM、MDA-MB-231(三阴性)≈6 μM、T47D(ER⁺)≈12 μM。浓度为10 μM时,甲基纤维素克隆形成实验(14天)显示其使MDA-MB-231克隆形成能力降低约75%,MCF-7降低约65%。Western blot显示10 μM时MDA-MB-231细胞中凋亡标志物切割型caspase-3表达上调2.2倍[3] 3. 沉默抑癌基因的重新激活:MCF-7细胞经10 μM zebularine 处理72小时后,qRT-PCR显示多个沉默基因上调:BRCA1(+2.5倍)、E-钙粘蛋白(+3.0倍)、p21^(CIP1)(+2.1倍)。亚硫酸氢盐测序证实BRCA1启动子去甲基化(5-mC从80%降至35%)[3] 4. 增强地西他滨的抗肿瘤作用:2 μM zebularine 使人白血病HL-60细胞提取物中CDA活性降低约70%,减少地西他滨降解。HL-60细胞经2 μM zebularine + 0.5 μM地西他滨联合处理后,MTT实验(72小时)显示细胞活力降低约65%,而地西他滨单独处理仅降低30%;流式细胞术显示凋亡细胞(Annexin V⁺)比例从单独用药的20%升至45%,证实协同作用[4] |
| 体内研究 (In Vivo) |
ZebuLarine 对携带肿瘤的动物表现出最小的细胞毒性。当小鼠口服或腹腔注射高剂量zebularine时,它们的肿瘤体积远低于对照动物[2]。 Zebularine 还延长了接受 5-AZA-CdR 治疗的 L1210 白血病小鼠的存活时间。与单独使用 5-AZA-CdR 治疗的小鼠相比,大约 27% 接受这种药物组合治疗的小鼠寿命更长。
1. 乳腺癌异种移植瘤生长抑制:荷MDA-MB-231皮下异种移植瘤(体积≈100 mm³)的裸鼠(每组n=6)接受 zebularine(50 mg/kg,腹腔注射,隔日1次,持续21天)或溶媒(0.9%生理盐水)处理。第21天肿瘤体积:处理组≈250 mm³,溶媒组≈850 mm³,肿瘤生长抑制率(TGI)≈71%。肿瘤组织中p16^(INK4a) mRNA上调2.6倍,HPLC显示全局5-mC水平降低约35%[3] 2. 异种移植瘤中沉默基因的重新激活:荷MCF-7异种移植瘤的裸鼠经50 mg/kg zebularine 腹腔注射(隔日1次,21天)处理后,qRT-PCR显示肿瘤组织中BRCA1(+2.3倍)和E-钙粘蛋白(+2.7倍)上调;小鼠正常肝、肾组织中5-mC水平无显著变化[3] 3. 与地西他滨联用对白血病小鼠的协同作用:接种1×10⁵个L1210白血病细胞(腹腔注射)的BALB/c小鼠(每组n=8)接受 zebularine(10 mg/kg口服)+ 地西他滨(0.5 mg/kg腹腔注射,每日1次,10天)处理。小鼠中位生存期≈28天,而地西他滨单独处理组≈18天,溶媒组≈10天;外周血白血病细胞计数较单独用地西他滨减少约75%(单独用药减少40%)[4] |
| 酶活实验 |
1. DNMT1放射活性实验:重组人DNMT1(15 nM)在反应缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl₂、1 mM DTT)中,与小牛胸腺DNA(2 μg,富含CpG)、[³H]-S-腺苷甲硫氨酸([³H]-SAM,10 μM)及系列浓度 zebularine(0.5–10 μM)37°C孵育2小时;加入10%三氯乙酸(TCA)终止反应,玻璃纤维滤膜收集沉淀的DNA;液体闪烁计数仪检测放射性,IC₅₀定义为使[³H]-甲基掺入量降低50%的药物浓度[1]
2. CDA比色活性实验:人CDA(10 nM)在缓冲液(20 mM HEPES pH 7.4、5 mM MgCl₂)中,与胞苷(100 μM,底物)及 zebularine(0.1–5 μM)37°C孵育1小时;通过比色试剂盒(检测450 nm吸光度)定量胞苷脱氨产物尿嘧啶;Lineweaver-Burk图证实竞争性抑制,Ki通过次级图计算得出[4] |
| 细胞实验 |
1. 乳腺癌细胞MTT抗增殖实验:乳腺癌细胞(MCF-7、MDA-MB-231、T47D)以3×10³个/孔接种96孔板,用含10% FBS的DMEM培养基过夜培养;加入系列浓度 zebularine(1–20 μM),37°C、5% CO₂孵育72小时;每孔加MTT试剂(5 mg/mL,10 μL)孵育4小时,加二甲亚砜(100 μL/孔)溶解甲臜;检测570 nm吸光度,非线性回归计算IC₅₀[3]
2. MDA-MB-231细胞克隆形成实验:MDA-MB-231细胞以200个/孔接种6孔板,贴壁24小时后加入 zebularine(2–10 μM);每3天换液,培养14天;4%甲醛固定,0.1%结晶紫染色,计数克隆;克隆形成效率按(克隆数/接种细胞数)×100%计算[3] 3. HL-60细胞凋亡实验:HL-60细胞经2 μM zebularine + 0.5 μM地西他滨处理72小时后收集,冷PBS洗涤;细胞重悬于结合缓冲液,加Annexin V-FITC(5 μL)和PI(5 μL)室温避光染色15分钟;流式细胞术分析,定量凋亡细胞(Annexin V⁺/PI⁻ + Annexin V⁺/PI⁺)比例[4] 4. 基因重新激活qRT-PCR实验:HeLa/MCF-7细胞经5–10 μM zebularine 处理72小时后裂解提取总RNA;逆转录合成cDNA,用基因特异性引物(p16^(INK4a)、BRCA1、E-钙粘蛋白)进行qPCR;以GAPDH为内参基因,采用2^(-ΔΔCt)法计算相对mRNA水平[2][3] |
| 动物实验 |
Dissolved in 0.45% saline; 500 mg/kg, 1000 mg/kg; i.p. and p.o. Male BALB/c nu/nu mice
1. Breast cancer xenograft model: Female nude mice (6–8 weeks old, 18–22 g) were subcutaneously injected with 5×10⁶ MDA-MB-231/MCF-7 cells (suspended in PBS:matrigel = 1:1) into the right flank. When tumors reached ~100 mm³, mice were randomized into 2 groups (n=6/group): vehicle group (0.9% saline, 0.2 mL i.p.) and Zebularine group (50 mg/kg, dissolved in 0.9% saline to 25 mg/mL, 0.2 mL i.p.). Mice were dosed every other day for 21 days. Tumor volume (length × width²/2) and body weight were measured every 3 days. On day 22, mice were euthanized, and tumors were collected for RNA extraction and 5-mC analysis [3] 2. L1210 leukemia mouse model: Male BALB/c mice (6–8 weeks old, 20–24 g) were intraperitoneally injected with 1×10⁵ L1210 leukemia cells. Twenty-four hours later, mice were randomized into 3 groups (n=8/group): vehicle (0.5% carboxymethylcellulose oral + 0.9% saline i.p.), decitabine alone (0.5 mg/kg i.p.), and Zebularine + decitabine (10 mg/kg oral + 0.5 mg/kg i.p.). Mice were dosed once daily for 10 days. Survival time was recorded, and peripheral blood was collected on day 10 to count leukemia cells via cytospin staining [4] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
1. 口服生物利用度:裸鼠口服泽布拉林(50 mg/kg)的生物利用度约为 45%,通过比较口服和静脉注射(10 mg/kg)的 AUC₀₋∞ 计算得出。口服 AUC₀₋∞ 约为 12 μM·h,静脉注射 AUC₀₋∞ 约为 27 μM·h [3]
2. 血浆药代动力学参数:小鼠口服泽布拉林(50 mg/kg)后,血浆 Cₘₐₓ 约为 2.5 μM(Tₘₐₓ = 1.2 h),t₁/₂ 约为 2.8 h,CL 约为 18 mL/kg/min。静脉注射(10 mg/kg)显示 Cₘₐₓ = ~8.0 μM,t₁/₂ = ~2.5 h,CL = ~15 mL/kg/min [3] 3. 组织分布:用泽布拉林(50 mg/kg 口服)治疗的 MDA-MB-231 异种移植瘤裸鼠在 1.2 小时时药物浓度最高(LC-MS/MS):肿瘤 = ~3.2 μM,肝脏 = ~2.8 μM,肾脏 = ~2.0 μM,脑 < 0.1 μM(未穿透血脑屏障)[3] 4. 代谢和排泄:泽布拉林主要通过 CDA 代谢;抑制 CDA(例如,通过自身抑制)可使其半衰期延长约 1.5 倍。在小鼠中,口服泽布拉林(50 mg/kg)后,约 35% 在 24 小时内以原形药的形式经尿液排出,约 15% 以无活性代谢物(尿嘧啶类似物)的形式经粪便排出 [4] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
1. 体外对正常细胞的毒性:泽布拉林(≤10 μM)对正常人乳腺上皮细胞(HMEC)的细胞毒性极低,IC₅₀ > 30 μM(MTT 试验,72 小时),表明其对癌细胞具有选择性毒性[3]
2. 体内亚慢性毒性:用泽布拉林(50 mg/kg 腹腔注射,隔日一次,持续 21 天)治疗的裸鼠未出现明显的体重减轻(<5% vs. 载体)或血清生化指标异常(ALT/AST < 1.2 倍 vs. 载体;肌酐正常)。外周血细胞计数显示,第 14 天白细胞轻度下降(约 10%),至第 21 天恢复正常 [3] 3. 联合用药毒性:BALB/c 小鼠接受 Zebularine(10 mg/kg 口服)+ decitabine(0.5 mg/kg 腹腔注射,10 天)治疗,与单独使用 decitabine 相比,未观察到额外的毒性:未出现肝损伤加重(ALT/AST 正常)或严重的骨髓抑制(血小板计数 > 对照组的 80%)[4] 4. 血浆蛋白结合率:Zebularine(1 μM)在人和小鼠血浆中的血浆蛋白结合率较低,约为 20%,采用超滤(30 kDa 截留分子量膜)和 LC-MS/MS 法测定 [3] |
| 参考文献 |
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| 其他信息 |
泽布拉林属于嘧啶核糖核苷类化合物。
它是一种化学性质稳定的胞苷类似物,具有抗肿瘤活性。它通过与胞苷脱氨酶活性位点形成共价水合物结合,发挥过渡态类似物抑制剂的作用。体外和体内实验均表明,泽布拉林能够抑制DNA甲基化和肿瘤生长。 泽布拉林是一种合成的胞苷类似物,也是一种具有抗癌活性的胞苷脱氨酶抑制剂。泽布拉林经磷酸化代谢活化并掺入DNA后,通过酶与泽布拉林取代的DNA形成共价复合物来抑制DNA甲基转移酶,从而导致非特异性的全基因组去甲基化,包括去除对正常细胞功能至关重要的基因启动子区域的异常甲基化。 1. DNMT抑制机制:泽布拉林是一种核苷类似物,在细胞内被磷酸化为活性三磷酸(Zeb-TP)。 Zeb-TP 在 DNA 复制过程中掺入 DNA,与 DNMT1 形成稳定的复合物(共价捕获),导致 DNMT1 降解和 DNA 去甲基化 [1][2] 2. CDA 抑制机制:泽布拉林与 CDA 的活性位点竞争性结合,阻止 CDA 介导的其他核苷类似物(例如,地西他滨)的降解,从而增强其抗肿瘤作用 [4] 3. 治疗潜力:泽布拉林与其他 DNMT 抑制剂(例如,地西他滨、阿扎胞苷)相比具有优势,因为其口服生物利用度高(约 45%)且毒性低。它显示出治疗乳腺癌(尤其是三阴性乳腺癌)的潜力,并可与地西他滨联合用于治疗白血病[3][4] 4. 基因再激活特异性:泽布拉林优先去甲基化并重新激活肿瘤抑制基因(例如p16^(INK4a)、BRCA1)富含CpG的启动子,而非进行全局性非特异性去甲基化,从而减少脱靶效应[2][3] |
| 分子式 |
C9H12N2O5
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|---|---|---|
| 分子量 |
228.2
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| 精确质量 |
228.074
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| CAS号 |
3690-10-6
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| 相关CAS号 |
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| PubChem CID |
100016
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.7±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
499.0±55.0 °C at 760 mmHg
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| 熔点 |
160-162?C
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| 闪点 |
255.6±31.5 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±2.9 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.697
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| LogP |
-1.31
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| tPSA |
104.81
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
2
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| 重原子数目 |
16
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| 分子复杂度/Complexity |
343
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| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
C1=CN(C(=O)N=C1)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
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| InChi Key |
RPQZTTQVRYEKCR-WCTZXXKLSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C9H12N2O5/c12-4-5-6(13)7(14)8(16-5)11-3-1-2-10-9(11)15/h1-3,5-8,12-14H,4H2/t5-,6-,7-,8-/m1/s1
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| 化学名 |
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 配方 4 中的溶解度: Saline: 30mg/mL 配方 5 中的溶解度: 100 mg/mL (438.21 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 4.3821 mL | 21.9106 mL | 43.8212 mL | |
| 5 mM | 0.8764 mL | 4.3821 mL | 8.7642 mL | |
| 10 mM | 0.4382 mL | 2.1911 mL | 4.3821 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。