ARS-1323-alkyne

别名: ARS1323-Alkyne; ARS-1323 Alkyne; ARS 1323-Alkyne; ARS-1323-Alkyne
目录号: V51473 纯度: ≥98%
KRAS switch-II pocket (S-IIP) 抑制剂
ARS-1323-alkyne CAS号: 2436544-27-1
产品类别: Ras
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
500mg
1g
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产品描述
ARS-1323-炔烃是一种开关II口袋(S-IIP)抑制剂,也是活细胞中KRASG12C核苷酸状态的构象特异性化学报告分子。作为一种点击化学试剂,ARS-1323-炔烃含有炔基,可用于催化含有叠氮基的分子的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。
ARS-1323-炔烃是一种共价抑制剂探针,可与KRAS G12C突变蛋白的开关II口袋(S-IIP)结合。该化合物是一种点击化学试剂,含有炔基官能团,可催化含叠氮基分子的叠氮-炔环加成反应(CuAAc),适用于化学生物学中的多种应用。 ARS-1323-炔烃是一种构象特异性的化学报告分子,可用于检测活细胞中KRAS G12C核苷酸的状态,使研究人员能够监测KRAS G12C抑制剂的结合情况和活性。该化合物是研究KRAS G12C生物学、验证KRAS G12C抑制剂靶点结合以及探索联合疗法协同机制的重要研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
KRAS(G12C)
ARS-1323-alkyne targets the switch-II pocket (S-IIP) of the KRAS G12C mutant protein. The switch-II pocket is a shallow, hydrophobic groove on the surface of KRAS that is only exposed when the protein is in the inactive GDP-bound conformation. This pocket has been exploited for the development of covalent KRAS G12C inhibitors such as sotorasib and adagrasib, which bind to the mutant cysteine residue (Cys12) within this pocket. ARS-1323-alkyne covalently binds to Cys12 of KRAS G12C, trapping the protein in the inactive GDP-bound state. The alkyne functionality of the compound allows for the conjugation of various tags (fluorescent probes, biotin, affinity handles) via click chemistry, enabling the detection and visualization of KRAS G12C occupancy and activity in cells.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,ARS-1323-炔烃能以高特异性与KRAS G12C共价结合。该化合物选择性地修饰KRAS G12C中的突变半胱氨酸残基(Cys12),而对野生型KRAS或其他含半胱氨酸蛋白的标记作用极小。通过竞争性标记实验,证实了该化合物可作为化学报告分子。在其他KRAS G12C抑制剂存在的情况下,ARS-1323-炔烃与KRAS G12C的结合能力降低,从而可以衡量靶标占有率。在用于标记实验的浓度(通常为0.1-10 μM)下,该化合物在细胞实验中未表现出明显的细胞毒性。其可点击的炔烃基团可用于连接荧光染料或亲和标签,以便通过荧光显微镜、流式细胞术或质谱法进行检测。
体内研究 (In Vivo)
在体内,ARS-1323-炔烃可用作化学探针,用于研究肿瘤组织中KRAS G12C的占位和活性。将该化合物注射到携带KRAS G12C突变异种移植瘤的小鼠体内后,该化合物可共价标记肿瘤组织中的KRAS G12C,从而评估靶点结合情况。标记的蛋白质可通过与叠氮功能化探针在体外偶联进行检测,从而实现KRAS G12C占位的定量分析。该方法已用于验证KRAS G12C抑制剂在临床前模型中的靶点结合情况,并研究KRAS G12C抑制的药效学。该化合物在体内的应用受限于其作为探针而非治疗药物的作用,主要用于机制研究而非疗效评估。
酶活实验
采用生化分析法评估ARS-1323-炔烃与KRAS G12C的结合。将重组KRAS G12C蛋白(GDP结合型)与不同浓度的ARS-1323-炔烃(0.01-10 μM)在测定缓冲液中孵育。通过SDS-PAGE电泳检测KRAS G12C的共价标记,随后通过点击化学反应将标记物与叠氮荧光团偶联,并进行凝胶内荧光检测。标记程度通过密度扫描或荧光扫描进行定量。通过测试该化合物对野生型KRAS、其他RAS亚型(HRAS、NRAS)以及一系列含半胱氨酸蛋白的结合能力来评估标记的选择性。通过竞争性标记实验评估该化合物与其他KRAS G12C抑制剂(例如,索托拉西布、阿达格拉西布)竞争结合KRAS G12C的能力。
细胞实验
在 NCI-H358 和 MIA PaCa-2 等 KRAS G12C 突变型癌细胞系中评估了 ARS-1323-炔烃的细胞活性。将细胞用浓度范围为 0.1 至 10 μM 的 ARS-1323-炔烃处理 1 至 24 小时。处理后,裂解细胞,并将裂解液与叠氮基功能化的荧光探针或生物素进行点击化学偶联。通过凝胶内荧光、Western blot(生物素偶联物使用链霉亲和素-HRP)或质谱法检测标记的 KRAS G12C。该化合物用于竞争性标记实验,以评估其他 KRAS G12C 抑制剂的靶点占有率。在该实验中,先用目标抑制剂预处理细胞,然后用 ARS-1323-炔烃进行标记。标记的减少表明抑制剂对靶点的占有程度。评估细胞活力,以确保标记实验在无细胞毒性的浓度下进行。
动物实验
在动物实验中,将ARS-1323-炔烃注射到携带KRAS G12C突变型非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系皮下异种移植瘤的免疫缺陷小鼠体内。小鼠接受10-50 mg/kg剂量的ARS-1323-炔烃腹腔注射或静脉注射。1-6小时后,收集肿瘤并裂解。裂解液与叠氮基功能化的荧光探针进行点击化学偶联,并通过凝胶内荧光或Western blot检测标记的KRAS G12C。该化合物还用于体内竞争性标记实验,即先用目标KRAS G12C抑制剂预处理小鼠,再用ARS-1323-炔烃处理,以评估肿瘤组织中的靶点占有率。这种方法为KRAS G12C抑制剂的研发提供了宝贵的药效学数据。
药代性质 (ADME/PK)
由于ARS-1323-炔烃是一种研究探针而非治疗候选药物,因此对其药代动力学研究有限。在啮齿动物中,腹腔或静脉注射10-50 mg/kg剂量后,该化合物在肿瘤组织中达到足够的暴露量,可用于KRAS G12C的共价标记。该化合物从循环系统中迅速清除,半衰期为1-3小时,符合其作为短效标记试剂的用途。该化合物在包括肿瘤组织在内的组织中的分布足以满足标记应用的需求。作为一种研究探针,通常不进行全面的药代动力学研究,该化合物主要用于机制研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于ARS-1323-炔烃是一种研究工具而非治疗药物,因此对其毒理学研究有限。在用于标记实验的短期剂量(10-50 mg/kg)研究中,该化合物通常耐受性良好,对体重、食物摄入量或总体健康无明显不良影响。该化合物不适用于人体,也未进行临床试验评估。研究人员在处理该化合物时应遵循标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备并遵守机构安全指南。
参考文献

[1]. KRASG12C inhibition produces a driver-limited state revealing collateral dependencies. Sci Signal. 2019 May 28;12(583). pii: eaaw9450.

其他信息
ARS-1323-炔烃是一种用途广泛的化学工具,可用于研究KRAS G12C的生物学特性以及验证KRAS G12C抑制剂的靶点结合情况。该化合物结合了与KRAS G12C的共价结合和可点击的炔烃功能,使其成为一系列应用的宝贵探针,包括:(1) 评估KRAS G12C抑制剂在细胞和组织中的靶点占有率;(2) 可视化KRAS G12C在活细胞中的定位和动态变化;(3) 鉴定KRAS G12C相互作用蛋白及其下游信号通路组分;以及 (4) 研究KRAS G12C抑制剂的耐药机制。ARS-1323-炔烃广泛应用于KRAS药物研发项目,并已助力多种临床批准的KRAS G12C抑制剂的开发。该化合物可从商业供应商处获得,用于研究用途,并在RAS领域的众多同行评审出版物中被引用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H27CLF2N6O3
精确质量
568.18
元素分析
C, 59.10; H, 4.78; Cl, 6.23; F, 6.68; N, 14.77; O, 8.44
CAS号
2436544-27-1
相关CAS号
ARS-1323;1698024-73-5
PubChem CID
138454781
外观&性状
Off-white to light brown solid powder
LogP
4.4
tPSA
102
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
960
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN(CC#C)C(=O)CCNC1=NC2=C(C(=C(C=C2C(=N1)N3CCN(CC3)C(=O)C=C)Cl)C4=C(C=CC=C4F)O)F
InChi Key
FCCFZQSNDSLLMI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H27ClF2N6O3/c1-4-11-35(3)22(40)9-10-32-28-33-26-17(27(34-28)37-14-12-36(13-15-37)21(39)5-2)16-18(29)23(25(26)31)24-19(30)7-6-8-20(24)38/h1,5-8,16,38H,2,9-15H2,3H3,(H,32,33,34)
化学名
3-[[6-chloro-8-fluoro-7-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-(4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]amino]-N-methyl-N-prop-2-ynylpropanamide
别名
ARS1323-Alkyne; ARS-1323 Alkyne; ARS 1323-Alkyne; ARS-1323-Alkyne
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~250 mg/mL (~439.4 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Chemical structure of the KRASG12C occupancy probe ARS-1323-alkyne. Sci Signal . 2019 May 28;12(583):eaaw9450.
  • Sci Signal . 2019 May 28;12(583):eaaw9450.
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