| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CDK9/cyclinT1 6 nM (IC50)
- CDK9/cyclin T1 (Positive transcription elongation factor b, P-TEFb): KB-0742 is a potent and selective inhibitor of CDK9. The biochemical IC50 for CDK9/cyclin T1 is 6 nM (at 10 μM ATP). [1] - Selectivity Profile: KB-0742 shows >50-fold selectivity over all CDK family members profiled (CDK1-8, 12-19) and >100-fold selectivity against cell-cycle CDKs (CDK1-6). Specific IC50 values (μM) for other CDKs: CDK1/cyclin A (>10), CDK2/cyclin A (>10), CDK4/cyclin D1 (>10), CDK6/cyclin D1 (>10), CDK7/cyclin H (0.736), CDK8/cyclin C (0.721), CDK12/cyclin K (>10), CDK13/cyclin K (>10). [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
- CDK9 抑制及下游效应： 在 22Rv1 前列腺癌细胞中，KB-0742 处理在低剂量 (0.1-0.5 μM, 6h) 下减少 RNA 聚合酶 II 在 Ser2 和 Ser7 位点的磷酸化。在最高剂量 (2.5 μM) 下，也减少 Ser5 位点的磷酸化。总 RNA Pol II 和 CDK9 蛋白水平不受影响。在时间过程研究 (1 μM) 中，KB-0742 在 6 小时开始降低全局 AR-FL 和 AR-V 蛋白水平，并在 16 小时完全耗尽，同时伴随 AR 在 Ser81 位点磷酸化的减少。[1]
- 生长抑制 (GR50)： 在 22Rv1 前列腺癌细胞中，KB-0742 的 GR50 为 0.18 μM。在 MV-4-11 AML 细胞中，GR50 为 0.097 μM。[1] - 诱导凋亡： KB-0742 在 22Rv1 细胞中以剂量依赖性方式诱导凋亡，通过 caspase-3/7 活化测量。在较高剂量 (≥3 μM) 下观察到强诱导，在亚微摩尔剂量 (0.3 μM) 下诱导较少。在 MV-4-11 AML 细胞中，与 22Rv1 细胞相比，在较低浓度下凋亡诱导更显著。[1] - 抑制新生转录 (SLAM-seq)： 在 22Rv1 细胞中，KB-0742 (1.2 μM) 处理全局下调新生 mRNA 转录。到 8 小时，95% 的高置信度活跃转录基因显示新生转录下调。转录反应与 KI-ARv-03 (4 μM) 相似。该药物优先下调高转录基因，包括谱系特异性转录因子 (如 FOXA1, SOX4, KLF6) 和 AR/PSA 位点基因，这与靶向超级增强子相关转录一致。[1] 用 KB-0742（0.1–10 μM；22Rv1 细胞）处理 6 小时后，RNA Pol II 在 Ser2 和 Ser7 的下游磷酸化显着降低，而 Ser5 的磷酸化降低。从治疗 6 小时左右开始，全世界雄激素受体 (AR)-FL 和 AR-V 蛋白的水平显着降低，同时磷酸化 AR (Ser81) 水平也降低[1]。 KB-0742 治疗（48-72 小时）对白血病和前列腺癌细胞系具有细胞抑制作用。 KB -0742 对 22Rv1 细胞和 MV-4-11 AML 细胞的 GR50 分别为 0.183 μM 和 0.288 μM，表现出抗增殖活性[1]。 KB-0742 快速抑制 22Rv1 细胞中出现的转录，特别是减少短半衰期转录和 AR 驱动的癌症程序[1]。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
- 22Rv1 前列腺癌异种移植模型（小鼠）： 在雄性 CB17-SCID 小鼠皮下 22Rv1 肿瘤模型中，口服 KB-0742 (3 mg/kg, 每日一次, 21天) 耐受性良好，肿瘤生长抑制率为 46% (p=0.007)。在 10 mg/kg 每日一次时，TGI 为 58% (p<0.0001)。在 30 mg/kg 每日一次时，TGI 为 82% (p=0.000003)，优于多西他赛 (15 mg/kg, 腹腔注射, 每周一次, TGI = 70%)。采用间歇给药方案 (30 mg/kg, 服药 3 天/停药 4 天) 的 TGI 为 58% (p<0.00005)，且耐受性更好。[1]
- MV-4-11 AML 异种移植模型（小鼠）： 在雌性 BALB/c 裸鼠皮下 MV-4-11 肿瘤模型中，口服 KB-0742 25 mg/kg 每日一次导致 74% 的 TGI (p<0.00002)。60 mg/kg 的间歇给药 (服药 3 天/停药 4 天) 产生 81% 的 TGI (p<0.00001)。较低剂量的间歇给药 (15 和 30 mg/kg) 分别显示 24% 和 40% 的 TGI。所有治疗均耐受良好，无明显体重变化。[1] 在 22Rv1 人前列腺癌细胞系来源的异种移植物 (CDX) 模型中，KB-0742（3-30 mg/kg；口服；每日；超过 21 天）可显着降低肿瘤负荷，同时即使在高剂量下也具有良好的耐受性[1]。 |
| 酶活实验 |
- 体外激酶活性实验 (HotSpot 激酶实验)： 在 Reaction Biology Corp. 使用其 HotSpot 激酶实验对 KB-0742 进行针对 16 种 CDK 的检测。化合物以 10 μM 起始的 3 倍系列稀释、10 个剂量、两复孔进行测试，ATP 浓度采用各激酶的 Km 值。使用对照化合物星形孢菌素。对归一化数据绘图，并在 GraphPad PRISM 中计算 IC50 值。对于在 10 μM 时抑制率 <65% 或 IC50 超出范围的激酶-化合物对，IC50 值设为 10 μM 用于热图表示。该面板确认了 KB-0742 对 CDK9 的高选择性 (IC50 = 6 nM)。[1]
- 热转移实验： CDK9/cyclin T1 (2 μM) 与 KB-0742 (10 μM) 和 SYPRO-Orange 染料一起测定。温度以 3°C/分钟的速度升高，测量荧光以评估化合物结合后蛋白质的热稳定性。[1] |
| 细胞实验 |
- 细胞活力实验 (CellTiter-Glo)： 将前列腺癌细胞接种于 384 孔板。24 小时后，用 DMSO 或 KB-0742 处理细胞 72 小时。使用 CellTiter-Glo 测量 ATP 含量作为细胞活力的指标。平均原始发光值并归一化至 DMSO 对照。[1]
- 生长速率抑制和凋亡实验 (IncuCyte)： 将细胞接种于含有 IncuCyte Caspase-3/7 Green 凋亡检测试剂的 96 孔板中，并用 DMSO 或 KB-0742 处理。使用 IncuCyte S3 每 3 小时成像一次，持续 72 小时 (22Rv1) 或 48 小时 (MV-4-11)。分析图像的融合度 (GR 指标) 和凋亡信号 (caspase-3/7 阳性细胞)。使用 GRcalculator 工具计算 GR50 值。[1] - 蛋白质印迹： 在含有蛋白酶/磷酸酶抑制剂的 RIPA 缓冲液中裂解细胞。通过 SDS-PAGE 分离蛋白质，转移到硝酸纤维素膜上，并用特异性一抗 (如抗 CDK9、抗 p-RNA Pol II Ser2、抗 AR、抗 AR pSer81) 孵育。使用 HRP 或荧光染料标记的二抗在 ChemiDoc 或 Odyssey CLx 系统上进行检测。GAPDH 或 β-肌动蛋白作为上样对照。[1] - SLAM-seq (新生转录谱分析)： 用 800 μM s4U 脉冲标记 22Rv1 细胞 30 分钟，然后用 DMSO、KB-0742 (1.2 μM) 或 KI-ARv-03 (4 μM) 处理 2、4 或 8 小时。提取 RNA，用碘乙酰胺处理以烷基化 s4U 标记的 RNA，并使用 QuantSeq 3' mRNA-Seq 文库制备试剂盒构建文库。在 NextSeq 500 上进行测序。使用 SlamDunk 流程比对和处理读段，以量化新生 mRNA 分数。[1] - RT-qPCR： 对于 PSA (KLK3) 表达，LNCaP 细胞用化合物处理 24 小时。裂解细胞，反转录 mRNA。使用 GAPDH (FAM) 和 KLK3 (Cy5) 的 PrimePCR 探针检测试剂盒在 CFX384 Touch 系统上进行 qPCR。使用 ΔΔCt 方法计算倍数变化。[1] 蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： 22Rv1 细胞 测试浓度： 0.1 μM、0.5 μM、1 μM、10 μM 孵育持续时间：6 小时 实验结果：RNA Pol II Ser2 和 Ser7 下游磷酸化显着减少，Ser5 磷酸化减少。 |
| 动物实验 |
- 22Rv1 异种移植模型： 雄性 CB17-SCID 小鼠 (6-8 周龄) 皮下接种 2x10⁶ 个 22Rv1 细胞。当肿瘤体积达到 ~170 mm³ 时，将小鼠随机分组 (每组 n=10)。KB-0742 配制在 10% EtOH, 20% PEG400, 和 70% (20% HPβCD) 中，以 3、10 或 30 mg/kg 的剂量每日一次口服给药，持续 21 天。另一组以 30 mg/kg 的剂量按“服药 3 天/停药 4 天”的方案给药。使用多西他赛 (15 mg/kg, 腹腔注射, 每周一次) 作为对照。每周测量两次体重，肿瘤体积计算为 V = 0.5 x a x b²。计算肿瘤生长抑制率。[1]
- MV-4-11 异种移植模型： 雌性 BALB/c 裸鼠 (6-8 周龄) 皮下接种 1x10⁶ 个 MV-4-11 细胞。当肿瘤体积达到 ~154 mm³ 时，将小鼠随机分组 (每组 n=10)。KB-0742 按上述方法配制，以 25 mg/kg 每日一次口服给药，持续 21 天，或按“服药 3 天/停药 4 天”的方案以 15、30 或 60 mg/kg 的剂量口服给药。类似地监测肿瘤体积和体重。[1] 动物/疾病模型： 注射 22Rv1 人前列腺癌细胞的雄性 CB17-SCID（严重联合免疫缺陷）小鼠[1] 剂量： 3 mg/kg、10 mg/kg 和 30 mg/kg 给药途径： 口服；每日；持续 21 天 实验结果： 显著抑制去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 的肿瘤生长。 |
| 药代性质 (ADME/PK) |
该化合物被描述为“口服生物利用度高”，这在其口服给药后的体内疗效中得到证实。使用的制剂为 10% EtOH, 20% PEG400, 和 70% (20% HPβCD)。[1]
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
- 体外选择性： KB-0742 对其他 CDK 显示出 >50 倍的选择性，这表明与泛 CDK 抑制剂相关的脱靶毒性风险降低。[1]
- 体内耐受性 (体重减轻)： 在 22Rv1 异种移植模型中，每日口服 3 和 10 mg/kg 的 KB-0742 导致体重减轻最小 (<10%)。在 30 mg/kg 每日一次给药时，治疗期间体重减轻达到 15%，但在第一周后稳定下来。通过使用“服药 3 天/停药 4 天”的间歇给药方案，体重减轻降低至 7.5%。在 MV-4-11 模型中，在所有测试剂量下 (最高间歇 60 mg/kg) 均未观察到显著的体重变化。[1] - 化合物锚定的靶点结合： KB-0742 (作为游离竞争剂) 能够将 CDK9 从 KI-ARv-03 功能化的珠子上置换下来，证实了可逆的靶点结合。[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
- 作用机制： KB-0742 是一种选择性的 ATP 竞争性 CDK9 抑制剂，CDK9 是 P-TEFb 复合物的激酶亚基。CDK9 磷酸化 RNA 聚合酶 II C 末端结构域的 Ser2，这是有效转录延伸所必需的。抑制 CDK9 导致全局 RNA Pol II 暂停，这会不成比例地影响短半衰期转录本和高转录输出的基因，包括致癌驱动因子如 AR、MYC 和谱系特异性转录因子 (如 FOXA1)。在前列腺癌中，这导致 AR 和 AR-V7 蛋白表达和稳定性降低，从而破坏 AR 驱动的致癌程序，诱导细胞周期停滞和凋亡。[1]
- 发现路径： KB-0742 是对 SMM 来源的先导化合物 KI-ARv-03 进行药物化学优化的结果。关键的结构改变包括在吡唑并嘧啶核心上引入支链 3-戊烷基团，以及环戊烷-1,3-二胺的立体化学反转，这些改变在保持选择性的同时增加了效力。[1] - 与母体化合物的比较： KB-0742 在抑制 22Rv1 细胞增殖方面比 KI-ARv-03 强约 18 倍 (GR50 0.18 μM vs. 3.26 μM)，并且生化效力更高 (CDK9 IC50 6 nM vs. 68 nM)。[1] |
| 分子式 |
C16H27CL2N5
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|---|---|
| 分子量 |
360.3251
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| 精确质量 |
359.164
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| 元素分析 |
C, 53.33; H, 7.55; Cl, 19.68; N, 19.44
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| CAS号 |
2416874-75-2
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| 相关CAS号 |
2416874-75-2 (HCl);2416873-83-9;
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| PubChem CID |
155819527
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
|
| tPSA |
68.2
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
4
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
4
|
| 可旋转键数目(RBC) |
5
|
| 重原子数目 |
23
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| 分子复杂度/Complexity |
333
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
|
| SMILES |
CCC(CC)C1=NC2=CC=NN2C(=C1)N[C@H]3CC[C@@H](C3)N.Cl.Cl
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| InChi Key |
OTUPXOLLHVLWQF-NJHZPMQHSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C16H25N5.2ClH/c1-3-11(4-2)14-10-16(19-13-6-5-12(17)9-13)21-15(20-14)7-8-18-21;;/h7-8,10-13,19H,3-6,9,17H2,1-2H3;2*1H/t12-,13-;;/m0../s1
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| 化学名 |
(1S,3S)-N1-(5-(pentan-3-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)cyclopentane-1,3-diamine dihydrochloride
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| 别名 |
KB-0742; KB0742; KB 0742 2HCl;
Istisociclib; KB-0742 HCl; 2416873-83-9; KB0742; F7J6KSY5I8; KB 0742 dihydrochloride; KB 0742 hydrochloride;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
H2O : 100 mg/mL (277.52 mM)
DMSO : 62.5 mg/mL (173.45 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 配方 4 中的溶解度: 100 mg/mL (277.52 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.7752 mL | 13.8762 mL | 27.7523 mL | |
| 5 mM | 0.5550 mL | 2.7752 mL | 5.5505 mL | |
| 10 mM | 0.2775 mL | 1.3876 mL | 2.7752 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
M1-20
CDK12-Cyclin K Ligand-Linker Conjugates 1
CGP-74514 dihydrochloride
(S)-CDK2 degrader 6
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