| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 500mg | ||
| 1g | ||
| Other Sizes |
| 靶点 |
- CDK9/cyclin T1 (Positive transcription elongation factor b, P-TEFb): KB-0742 is a potent and selective inhibitor of CDK9. The biochemical IC50 for CDK9/cyclin T1 is 6 nM (at 10 μM ATP). [1]
- Selectivity Profile: KB-0742 shows >50-fold selectivity over all CDK family members profiled (CDK1-8, 12-19) and >100-fold selectivity against cell-cycle CDKs (CDK1-6). Specific IC50 values (μM) for other CDKs: CDK1/cyclin A (>10), CDK2/cyclin A (>10), CDK4/cyclin D1 (>10), CDK6/cyclin D1 (>10), CDK7/cyclin H (0.736), CDK8/cyclin C (0.721), CDK12/cyclin K (>10), CDK13/cyclin K (>10). [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
- CDK9 抑制及下游效应： 在 22Rv1 前列腺癌细胞中，KB-0742 处理在低剂量 (0.1-0.5 μM, 6h) 下减少 RNA 聚合酶 II 在 Ser2 和 Ser7 位点的磷酸化。在最高剂量 (2.5 μM) 下，也减少 Ser5 位点的磷酸化。总 RNA Pol II 和 CDK9 蛋白水平不受影响。在时间过程研究 (1 μM) 中，KB-0742 在 6 小时开始降低全局 AR-FL 和 AR-V 蛋白水平，并在 16 小时完全耗尽，同时伴随 AR 在 Ser81 位点磷酸化的减少。[1]
- 生长抑制 (GR50)： 在 22Rv1 前列腺癌细胞中，KB-0742 的 GR50 为 0.18 μM。在 MV-4-11 AML 细胞中，GR50 为 0.097 μM。[1] - 诱导凋亡： KB-0742 在 22Rv1 细胞中以剂量依赖性方式诱导凋亡，通过 caspase-3/7 活化测量。在较高剂量 (≥3 μM) 下观察到强诱导，在亚微摩尔剂量 (0.3 μM) 下诱导较少。在 MV-4-11 AML 细胞中，与 22Rv1 细胞相比，在较低浓度下凋亡诱导更显著。[1] - 抑制新生转录 (SLAM-seq)： 在 22Rv1 细胞中，KB-0742 (1.2 μM) 处理全局下调新生 mRNA 转录。到 8 小时，95% 的高置信度活跃转录基因显示新生转录下调。转录反应与 KI-ARv-03 (4 μM) 相似。该药物优先下调高转录基因，包括谱系特异性转录因子 (如 FOXA1, SOX4, KLF6) 和 AR/PSA 位点基因，这与靶向超级增强子相关转录一致。[1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
- 22Rv1 前列腺癌异种移植模型（小鼠）： 在雄性 CB17-SCID 小鼠皮下 22Rv1 肿瘤模型中，口服 KB-0742 (3 mg/kg, 每日一次, 21天) 耐受性良好，肿瘤生长抑制率为 46% (p=0.007)。在 10 mg/kg 每日一次时，TGI 为 58% (p<0.0001)。在 30 mg/kg 每日一次时，TGI 为 82% (p=0.000003)，优于多西他赛 (15 mg/kg, 腹腔注射, 每周一次, TGI = 70%)。采用间歇给药方案 (30 mg/kg, 服药 3 天/停药 4 天) 的 TGI 为 58% (p<0.00005)，且耐受性更好。[1]
- MV-4-11 AML 异种移植模型（小鼠）： 在雌性 BALB/c 裸鼠皮下 MV-4-11 肿瘤模型中，口服 KB-0742 25 mg/kg 每日一次导致 74% 的 TGI (p<0.00002)。60 mg/kg 的间歇给药 (服药 3 天/停药 4 天) 产生 81% 的 TGI (p<0.00001)。较低剂量的间歇给药 (15 和 30 mg/kg) 分别显示 24% 和 40% 的 TGI。所有治疗均耐受良好，无明显体重变化。[1] |
| 酶活实验 |
- 体外激酶活性实验 (HotSpot 激酶实验)： 在 Reaction Biology Corp. 使用其 HotSpot 激酶实验对 KB-0742 进行针对 16 种 CDK 的检测。化合物以 10 μM 起始的 3 倍系列稀释、10 个剂量、两复孔进行测试，ATP 浓度采用各激酶的 Km 值。使用对照化合物星形孢菌素。对归一化数据绘图，并在 GraphPad PRISM 中计算 IC50 值。对于在 10 μM 时抑制率 <65% 或 IC50 超出范围的激酶-化合物对，IC50 值设为 10 μM 用于热图表示。该面板确认了 KB-0742 对 CDK9 的高选择性 (IC50 = 6 nM)。[1]
- 热转移实验： CDK9/cyclin T1 (2 μM) 与 KB-0742 (10 μM) 和 SYPRO-Orange 染料一起测定。温度以 3°C/分钟的速度升高，测量荧光以评估化合物结合后蛋白质的热稳定性。[1] |
| 细胞实验 |
- 细胞活力实验 (CellTiter-Glo)： 将前列腺癌细胞接种于 384 孔板。24 小时后，用 DMSO 或 KB-0742 处理细胞 72 小时。使用 CellTiter-Glo 测量 ATP 含量作为细胞活力的指标。平均原始发光值并归一化至 DMSO 对照。[1]
- 生长速率抑制和凋亡实验 (IncuCyte)： 将细胞接种于含有 IncuCyte Caspase-3/7 Green 凋亡检测试剂的 96 孔板中，并用 DMSO 或 KB-0742 处理。使用 IncuCyte S3 每 3 小时成像一次，持续 72 小时 (22Rv1) 或 48 小时 (MV-4-11)。分析图像的融合度 (GR 指标) 和凋亡信号 (caspase-3/7 阳性细胞)。使用 GRcalculator 工具计算 GR50 值。[1] - 蛋白质印迹： 在含有蛋白酶/磷酸酶抑制剂的 RIPA 缓冲液中裂解细胞。通过 SDS-PAGE 分离蛋白质，转移到硝酸纤维素膜上，并用特异性一抗 (如抗 CDK9、抗 p-RNA Pol II Ser2、抗 AR、抗 AR pSer81) 孵育。使用 HRP 或荧光染料标记的二抗在 ChemiDoc 或 Odyssey CLx 系统上进行检测。GAPDH 或 β-肌动蛋白作为上样对照。[1] - SLAM-seq (新生转录谱分析)： 用 800 μM s4U 脉冲标记 22Rv1 细胞 30 分钟，然后用 DMSO、KB-0742 (1.2 μM) 或 KI-ARv-03 (4 μM) 处理 2、4 或 8 小时。提取 RNA，用碘乙酰胺处理以烷基化 s4U 标记的 RNA，并使用 QuantSeq 3' mRNA-Seq 文库制备试剂盒构建文库。在 NextSeq 500 上进行测序。使用 SlamDunk 流程比对和处理读段，以量化新生 mRNA 分数。[1] - RT-qPCR： 对于 PSA (KLK3) 表达，LNCaP 细胞用化合物处理 24 小时。裂解细胞，反转录 mRNA。使用 GAPDH (FAM) 和 KLK3 (Cy5) 的 PrimePCR 探针检测试剂盒在 CFX384 Touch 系统上进行 qPCR。使用 ΔΔCt 方法计算倍数变化。[1] |
| 动物实验 |
- 22Rv1 异种移植模型： 雄性 CB17-SCID 小鼠 (6-8 周龄) 皮下接种 2x10⁶ 个 22Rv1 细胞。当肿瘤体积达到 ~170 mm³ 时，将小鼠随机分组 (每组 n=10)。KB-0742 配制在 10% EtOH, 20% PEG400, 和 70% (20% HPβCD) 中，以 3、10 或 30 mg/kg 的剂量每日一次口服给药，持续 21 天。另一组以 30 mg/kg 的剂量按“服药 3 天/停药 4 天”的方案给药。使用多西他赛 (15 mg/kg, 腹腔注射, 每周一次) 作为对照。每周测量两次体重，肿瘤体积计算为 V = 0.5 x a x b²。计算肿瘤生长抑制率。[1]
- MV-4-11 异种移植模型： 雌性 BALB/c 裸鼠 (6-8 周龄) 皮下接种 1x10⁶ 个 MV-4-11 细胞。当肿瘤体积达到 ~154 mm³ 时，将小鼠随机分组 (每组 n=10)。KB-0742 按上述方法配制，以 25 mg/kg 每日一次口服给药，持续 21 天，或按“服药 3 天/停药 4 天”的方案以 15、30 或 60 mg/kg 的剂量口服给药。类似地监测肿瘤体积和体重。[1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
- 所提供的文献未包含 KB-0742 的详细药代动力学参数 (如半衰期、Cmax、AUC、生物利用度)。然而，该化合物被描述为“口服生物利用度高”，这在其口服给药后的体内疗效中得到证实。使用的制剂为 10% EtOH, 20% PEG400, 和 70% (20% HPβCD)。[1]
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
- 体外选择性： KB-0742 对其他 CDK 显示出 >50 倍的选择性，这表明与泛 CDK 抑制剂相关的脱靶毒性风险降低。[1]
- 体内耐受性 (体重减轻)： 在 22Rv1 异种移植模型中，每日口服 3 和 10 mg/kg 的 KB-0742 导致体重减轻最小 (<10%)。在 30 mg/kg 每日一次给药时，治疗期间体重减轻达到 15%，但在第一周后稳定下来。通过使用“服药 3 天/停药 4 天”的间歇给药方案，体重减轻降低至 7.5%。在 MV-4-11 模型中，在所有测试剂量下 (最高间歇 60 mg/kg) 均未观察到显著的体重变化。[1] - 化合物锚定的靶点结合： KB-0742 (作为游离竞争剂) 能够将 CDK9 从 KI-ARv-03 功能化的珠子上置换下来，证实了可逆的靶点结合。[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
伊替索西利（Istisociclib）是一种口服生物利用度高的选择性丝氨酸/苏氨酸细胞周期蛋白依赖性激酶9 (CDK9) 抑制剂，CDK9是RNA聚合酶II (RNA Pol II) 延伸因子正性转录延伸因子b (PTEF-b; PTEFb) 的催化亚基，具有潜在的抗肿瘤活性。口服后，伊替索西利靶向结合并阻断CDK9的磷酸化和激酶活性，从而阻止PTEFb介导的RNA Pol II激活，进而抑制包括MYC和雄激素受体(AR)在内的多种抗凋亡蛋白和致癌转录因子的基因转录。这可诱导细胞周期阻滞和凋亡，并抑制肿瘤细胞增殖。CDK9通过磷酸化RNA Pol II的丝氨酸2位点(p-Ser2-RNAPII)来调节转录延伸，并且是多种致癌转录因子的重要辅助因子。它在多种肿瘤细胞类型中表达上调，并在RNA聚合酶II介导的抗凋亡蛋白转录调控中发挥关键作用。肿瘤细胞的存活依赖于抗凋亡蛋白。
- 作用机制： KB-0742 是一种选择性的 ATP 竞争性 CDK9 抑制剂，CDK9 是 P-TEFb 复合物的激酶亚基。CDK9 磷酸化 RNA 聚合酶 II C 末端结构域的 Ser2，这是有效转录延伸所必需的。抑制 CDK9 导致全局 RNA Pol II 暂停，这会不成比例地影响短半衰期转录本和高转录输出的基因，包括致癌驱动因子如 AR、MYC 和谱系特异性转录因子 (如 FOXA1)。在前列腺癌中，这导致 AR 和 AR-V7 蛋白表达和稳定性降低，从而破坏 AR 驱动的致癌程序，诱导细胞周期停滞和凋亡。[1] - 发现路径： KB-0742 是对 SMM 来源的先导化合物 KI-ARv-03 进行药物化学优化的结果。关键的结构改变包括在吡唑并嘧啶核心上引入支链 3-戊烷基团，以及环戊烷-1,3-二胺的立体化学反转，这些改变在保持选择性的同时增加了效力。[1] - 与母体化合物的比较： KB-0742 在抑制 22Rv1 细胞增殖方面比 KI-ARv-03 强约 18 倍 (GR50 0.18 μM vs. 3.26 μM)，并且生化效力更高 (CDK9 IC50 6 nM vs. 68 nM)。[1] |
| 分子式 |
C16H25N5
|
|---|---|
| 分子量 |
287.40
|
| 精确质量 |
287.21
|
| 元素分析 |
C, 66.86; H, 8.77; N, 24.37
|
| CAS号 |
2416873-83-9
|
| 相关CAS号 |
2416874-75-2
|
| PubChem CID |
146502834
|
| 外观&性状 |
White to off-white solid at room temperature
|
| LogP |
2.6
|
| tPSA |
68.2
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
4
|
| 可旋转键数目(RBC) |
5
|
| 重原子数目 |
21
|
| 分子复杂度/Complexity |
333
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
|
| SMILES |
CCC(CC)C1=NC2=CC=NN2C(=C1)N[C@H]3CC[C@@H](C3)N
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| InChi Key |
VYKCLMALANGCDF-STQMWFEESA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C16H25N5/c1-3-11(4-2)14-10-16(19-13-6-5-12(17)9-13)21-15(20-14)7-8-18-21/h7-8,10-13,19H,3-6,9,17H2,1-2H3/t12-,13-/m0/s1
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| 化学名 |
(1S,3S)-3-N-(5-pentan-3-ylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)cyclopentane-1,3-diamine
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| 别名 |
Istisociclib; KB-0742; 2416873-83-9; KB0742; F7J6KSY5I8
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: ~175 mg/mL (608.9 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.4795 mL | 17.3974 mL | 34.7947 mL | |
| 5 mM | 0.6959 mL | 3.4795 mL | 6.9589 mL | |
| 10 mM | 0.3479 mL | 1.7397 mL | 3.4795 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
AOH-1996
hMAO-B-IN-3
Flupyrimin
阿曲库铵
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