MM-401 TFA

别名: MM-401 TFA; 1442106-11-7; MM-401 (TFA); CHEMBL4099772; MM401 TFA
目录号: V41183 纯度: ≥98%
MM-401 (TFA) 是一种 MLL1 H3K4 甲基转移酶抑制剂。
MM-401 TFA CAS号: 1442106-11-7
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
MM-401 (TFA) 是一种 MLL1 H3K4 甲基转移酶抑制剂。 MM-401 通过阻断 MLL1-WDR5 相互作用来抑制 MLL1 活性(IC50 为 0.32 µM)。 MM-401 诱导细胞周期停滞、细胞凋亡和分化。 MM-401可用于MLL白血病的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
WDR5 (Ki < 1 nM); WDR5-MLL1 interaction (IC50 = 0.9 nM); MLL1 (IC50 = 0.32 µM)
体外研究 (In Vitro)
MM-401 抑制 WDR5-MLL1 相互作用,IC50 值为 0.9 nM,同时保持与 WDR5 的强结合亲和力,Ki 值 < 1 nM[1]。通过阻止 MLL1-WDR5 相互作用以及由此产生的复杂组装,MM-401 可以特异性抑制 MLL1 活性(IC50 值为 0.32μM)[1]。细胞中 MLL1 依赖性 H3K4 甲基化尤其受到 MM-401(20 μM;48 小时)的抑制[1]。与 MLL1 缺失一样,MM-401 也会诱导 MLL-AF9 转录组发生类似的改变[1]。 MM-401(10、20、40 μM;48 小时)通过引起细胞凋亡和细胞周期停滞来特异性阻止 MLL 白血病细胞生长[1]。
酶活实验
组蛋白甲基转移酶测定[1]
按照前面的描述进行HMT测定(Dou et al., 2005)。对于抑制剂研究,不同浓度的化合物首先与预组装的复合物孵育,并通过添加底物引发反应。建立了反应过程曲线进行动力学分析,确定了反应在室温下的线性范围。Lineweaver-Burk曲线,反应(0.5µM酶复合物和50µM底物)在加入终浓度为178µM的β-巯基乙醇后启动并在4分钟后猝灭。
晶体结构[1]
WDR5与化合物以1:2的摩尔比混合,得到WDR5//MM-401或WDR5/MM-NC-401二元配合物。该配合物在22℃下通过悬垂-滴-气相扩散结晶。详细信息请参见补充信息。
细胞实验
细胞凋亡分析[1]
细胞类型:小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞
测试浓度: 10、20、40 μM
孵育时间:48小时
实验结果:特异性诱导MLL-AF9细胞凋亡。

细胞周期分析[1]
细胞类型:鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞
测试浓度: 10, 20 , 40 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 以浓度依赖性方式在 MLL-AF9 细胞中诱导显着的 G1/S 停滞。

RT-PCR[1]
细胞类型: MLL-AF9 细胞
测试浓度: 20 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: H3K4me、5 个 Hox A 基因的表达显着降低,尤其是 Hoxa9 和 Hoxa10。
细胞活力、Wright-Giemsa染色、细胞凋亡、细胞周期和细胞分化[1]
抑制剂从原液稀释到含有0.1% DMSO终浓度的培养基中。细胞以1×105/ml培养,每2天传代一次。根据制造商的说明使用CellTitreGlo®试剂盒测定细胞活力。在分子动力学平板阅读器上监测发光。染色时,将10、20和40µM /MM-401,或40µM MM-NC-401或DMSO载体处理4天的细胞在1× PBS中稀释至2.5×105/ml,用细胞自旋固定在玻片上,然后进行Wright-Giemsa染色。光镜下40倍放大拍摄细胞图像。细胞凋亡、细胞周期和细胞分化分析采用标准方案(见补充信息)。
Real Time-PCR、RNA-seq和CHIP检测[1]
MLL1-AF9细胞在/MM-401或MM-NC-401存在下培养2天。处理结束时,在300×g离心收集细胞,并用1xPBS洗涤。按照标准方案提取重复生物样品的rna。Illumina测序文库使用10ng rna。在Hi-seq测序仪中,将4个RNA序列样品进行多路复用并加载到一个通道中。RNA-seq分析在补充信息中描述。如前所述进行CHIP测定。
参考文献

[1]. Targeting MLL1 H3K4 methyltransferase activity in mixed-lineage leukemia. Mol Cell. 2014 Jan 23;53(2):247-61.

其他信息
本文全面表征了我们近期开发的靶向MLL1 H3K4甲基转移酶活性的抑制剂MM-401。MM-401能够特异性地抑制MLL1活性,其机制是通过阻断MLL1-WDR5相互作用,从而抑制复合物的组装。这种靶向策略不影响其他混合谱系白血病(MLL)家族的组蛋白甲基转移酶(HMT),揭示了MLL1复合物独特的调控特性。我们利用MM-401及其对映体对照MM-NC-401证明,抑制MLL1甲基转移酶活性能够特异性地抑制MLL细胞的增殖,其机制是通过诱导细胞周期阻滞、细胞凋亡和髓系分化,且对正常骨髓细胞或非MLL细胞无毒性。更重要的是,转录组分析表明,MM-401 诱导的基因表达变化与 MLL1 缺失引起的变化相似,这支持了 MLL1 活性在调控 MLL1 依赖性白血病转录程序中起主导作用的观点。我们设想 MM-401 在基础研究和转化研究中具有广泛的应用前景。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H47F3N8O7
分子量
700.749497652054
精确质量
700.351
CAS号
1442106-11-7
相关CAS号
MM-401;1442106-10-6
PubChem CID
137662115
外观&性状
White to light yellow solid powder
tPSA
247
氢键供体(HBD)数目
8
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
49
分子复杂度/Complexity
1060
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C(F)(F)(F)C(=O)O.O=C1NCCCC[C@@](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC)C(=O)N[C@]1([H])C1C=CC=CC=1)(C)NC(=O)C(C)C
InChi Key
UCPNHHHBFDAYBP-HXXCMCGZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H46N8O5.C2HF3O2/c1-5-20-24(39)36-22(19-12-7-6-8-13-19)26(41)32-16-10-9-15-29(4,37-23(38)18(2)3)27(42)35-21(25(40)34-20)14-11-17-33-28(30)31;3-2(4,5)1(6)7/h6-8,12-13,18,20-22H,5,9-11,14-17H2,1-4H3,(H,32,41)(H,34,40)(H,35,42)(H,36,39)(H,37,38)(H4,30,31,33);(H,6,7)/t20-,21-,22+,29+;/m0./s1
化学名
N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
别名
MM-401 TFA; 1442106-11-7; MM-401 (TFA); CHEMBL4099772;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (142.70 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4270 mL 7.1352 mL 14.2704 mL
5 mM 0.2854 mL 1.4270 mL 2.8541 mL
10 mM 0.1427 mL 0.7135 mL 1.4270 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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