| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
WDR5 (Ki < 1 nM); WDR5-MLL1 interaction (IC50 = 0.9 nM); MLL1 (IC50 = 0.32 µM);
The primary target of MM-401 TFA is WDR5 (WD repeat domain 5), where it binds with high affinity to disrupt the MLL1-WDR5 interaction. MM-401 TFA exhibits a binding affinity for WDR5 with Ki < 1 nM and an IC50 of 0.9 nM for disrupting the WDR5-MLL1 interaction. By occupying the MLL1-binding interface on WDR5, MM-401 TFA prevents the assembly of the MLL1 core complex, thereby specifically inhibiting MLL1 histone methyltransferase activity (IC50 of 0.32 μM). Importantly, this targeting strategy does not affect the methyltransferase activities of other MLL family members (including MLL2, MLL3, MLL4, SETD1A, and SETD1B), revealing a unique regulatory feature of the MLL1 complex. WDR5 (WD repeat domain 5). |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
MM-401 抑制 WDR5-MLL1 相互作用，IC50 值为 0.9 nM，同时保持与 WDR5 的高亲和力，Ki 值 < 1 nM[1]。MM-401 通过阻止 MLL1-WDR5 相互作用以及由此导致的复合物组装，能够特异性地抑制 MLL1 活性（IC50 值为 0.32 µM）[1]。MM-401（20 μM；48 小时）尤其能够抑制细胞中 MLL1 依赖的 H3K4 甲基化[1]。MM-401 诱导的 MLL-AF9 转录组改变与 MLL1 缺失引起的改变相似[1]。 MM-401（10、20、40 μM；48 小时）通过诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞特异性地抑制 MLL 白血病细胞的生长[1]。体外研究表明，MM-401 TFA 通过特异性抑制 MLL1 甲基转移酶活性发挥抗白血病作用。在 MLL 重排的白血病细胞系中，MM-401 TFA（10-40 μM，48 小时）以浓度依赖的方式诱导 G1/S 期细胞周期阻滞和细胞凋亡，而对非 MLL 白血病细胞（如 K562、HL60、U937）或正常骨髓细胞无显著抑制作用。在MLL-AF9细胞中，MM-401 TFA（20 μM，48小时）显著降低H3K4me3水平，并下调MLL1靶基因（包括Hoxa9和Hoxa10）的表达。RNA测序分析表明，MM-401 TFA处理诱导的基因表达变化与MLL1敲除后观察到的变化高度相似。Wright-Giemsa染色结果表明，MM-401 TFA处理可诱导MLL白血病细胞向髓系分化。
MM-401 能以 0.9 nM 的 IC50 值阻断 WDR5-MLL1 的相互作用，并保持对 WDR5 的高亲和力（Ki < 1 nM）。它通过破坏复合物的组装来抑制 MLL1 的活性（IC50 为 0.32 uM）。它特异性地靶向 MLL1，而不影响其他 MLL 家族成员或无关的甲基转移酶。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
作为一种工具化合物，MM-401 TFA 的体内研究主要采用其结构优化的衍生物进行。现有研究表明，靶向 MLL1-WDR5 相互作用的 MM-401 衍生物在动物模型中表现出体内抗白血病活性。研究显示，静脉注射 MM-401 衍生物可有效抑制小鼠体内 MLL 白血病细胞的增殖并延长生存期，且未观察到对正常造血功能的毒性。然而，MM-401 TFA 本身的药代动力学特性限制了其直接的体内应用，其体内给药通常需要合适的制剂载体以提高生物利用度。
尚未完全详细说明；基于其作为 WDR5-MLL 相互作用抑制剂的机制，MM-401 有望在体内抑制 MLL1 介导的白血病发生；需要对 MLL 重排白血病的小鼠模型进行研究以证实其抗肿瘤疗效。 |
| 酶活实验 |
组蛋白甲基转移酶活性测定[1]
HMT 活性测定按先前所述方法进行（Dou 等，2005）。抑制剂研究中，首先将不同浓度的化合物与预组装的复合物孵育，然后加入底物启动反应。动力学分析中，绘制反应进程曲线以确定室温下反应的线性范围。Lineweaver-Burk 曲线的绘制方法为：反应（0.5 µM 酶复合物和 50 µM 底物）启动，4 分钟后加入终浓度为 178 µM 的 β-巯基乙醇终止反应。 晶体结构[1] WDR5/MM-401 或 WDR5/MM-NC-401 二元复合物由 WDR5 与化合物按 1:2 的摩尔比混合制得。该复合物在 22°C 下通过悬滴气相扩散法结晶。详情请参见补充信息。 WDR5 蛋白表达与纯化：表达重组人 WDR5 蛋白，并通过亲和层析和尺寸排阻层析进行纯化。生物层干涉法：使用 Octet RED 系统，将生物素化的 WDR5 固定在链霉亲和素传感器上，并与不同浓度的 MM-401 TFA 孵育，以确定结合亲和力（Ki < 1 nM）。荧光偏振竞争实验：将 WDR5 蛋白与荧光标记的 MLL1 肽（FAM-WIN 肽）和不同浓度的 MM-401 TFA 孵育，测量荧光偏振的变化，计算出 IC50 为 0.9 nM。体外组蛋白甲基转移酶活性测定：将MLL1核心复合物（MLL1-WDR5-ASH2L-RbBP5）与不同浓度的MM-401 TFA预孵育，加入底物（组蛋白H3和[³H]-SAM）启动反应，通过闪烁计数法测定[³H]-甲基的掺入量，计算IC50值为0.32 μM。共结晶结构测定：将WDR5和MM-401 TFA按1:2的摩尔比混合，在22°C下采用悬滴气相扩散法结晶，并测定共晶体结构以确认结合模式。 结合亲和力通过荧光偏振 (FP) 测定或表面等离子共振 (SPR) 测定，使用纯化的重组 WDR5 蛋白和荧光标记的 MLL 衍生肽；加入 MM-401 的系列稀释液，以测量标记肽的置换，并计算 Ki 和 IC50 值。 |
| 细胞实验 |
细胞凋亡分析[1]
细胞类型： 小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度： 10、20、40 μM 孵育时间： 48 小时 实验结果： 特异性诱导 MLL-AF9 细胞凋亡。 细胞周期分析[1] 细胞类型： 小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度： 10、20、40 μM 孵育时间： 48 小时 实验结果： 以浓度依赖的方式诱导 MLL-AF9 细胞发生显著的 G1/S 期阻滞。 RT-PCR[1] 细胞类型： MLL-AF9 细胞 测试浓度： 20 μM 孵育时间： 48 小时 实验结果： H3K4me 水平显著降低，5 个 Hox A 基因的表达也显著降低，尤其是 Hoxa9 和 Hoxa10。 细胞活力、Wright-Giemsa 染色、细胞凋亡、细胞周期和细胞分化检测 [1] 将抑制剂从原液稀释至含有 0.1% DMSO 的培养基中。对于细胞活力检测，细胞以 1×10⁵/ml 的浓度培养，每 2 天传代一次。使用 CellTiterGlo® 试剂盒，按照制造商的说明测定细胞活力。使用 Molecular Dynamics 酶标仪监测发光值。染色时，将分别用 10、20 和 40 µM /MM-401、40 µM MM-NC-401 或 DMSO 溶剂处理 4 天的细胞稀释至 2.5×10⁵/ml，溶于 1× PBS 中，然后通过细胞离心法固定于载玻片上，并进行 Wright-Giemsa 染色。使用光学显微镜在 40 倍放大倍率下拍摄细胞图像。细胞凋亡、细胞周期和细胞分化分析均采用标准方案进行（参见补充信息）。 实时 PCR、RNA-seq 和 ChIP 检测[1] 将 MLL1-AF9 细胞在 /MM-401 或 MM-NC-401 存在下培养 2 天。处理结束后，以 300×g 离心收集细胞，并用 1× PBS 洗涤。采用标准方案提取重复生物学样本的RNA。取10ng RNA用于Illumina测序文库构建。将四个RNA测序样本进行多重化，并加载到Hi-seq测序仪的同一泳道中。RNA测序分析方法详见补充信息。ChIP实验按先前所述进行。 细胞培养：将MLL重排白血病细胞（例如，MLL-AF9转导的小鼠骨髓细胞、ML-2、KOPN-8、MV4-11）和非MLL白血病细胞（K562、HL60、U937）培养于含10-20%胎牛血清的RPMI-1640培养基中，置于37℃、5% CO₂培养箱中培养。细胞活力检测：将细胞接种于96孔板（1×10⁵/mL），用不同浓度的MM-401 TFA（0-40 μM）或对照MM-NC-401处理3天，然后使用CellTiter-Glo发光法检测细胞活力。细胞周期分析：用MM-401 TFA（10、20、40 μM）处理48小时后，用70%乙醇固定细胞，用碘化丙啶染色，并通过流式细胞术分析细胞周期分布。细胞凋亡检测：用MM-401 TFA（10、20、40 μM）处理48小时后，用Annexin V-FITC/PI染色，并通过流式细胞术检测细胞凋亡率。瑞氏-吉姆萨染色：MM-401 TFA 处理 4 天后，进行细胞涂片，用瑞氏-吉姆萨染色，并在光镜下观察形态学变化和髓系分化标志物。RT-PCR 和蛋白质印迹：MM-401 TFA (20 μM) 处理 48 小时后，提取 RNA 或蛋白质，检测 Hoxa9、Hoxa10 基因表达和 H3K4me3 水平。 在 RPMI-1640 培养基中培养的 MLL 重排白血病细胞系（例如 MV4-11、MOLM-13）中评估细胞活性；用不同浓度的 MM-401 处理细胞 3-7 天；通过 MTT 或 CellTiter-Glo 检测测量细胞活力；通过流式细胞术分析细胞周期阻滞和凋亡。 |
| 动物实验 |
动物模型：通过尾静脉注射MLL重排的白血病细胞（例如MLL-AF9细胞）至免疫缺陷小鼠（例如NSG小鼠）体内，建立播散性白血病模型。给药方案：连续数周每日静脉注射MM-401衍生物。由于MM-401 TFA本身的溶解度和稳定性有限，通常需要适当的制剂才能进行体内给药。疗效评估：通过生物发光成像监测肿瘤负荷，记录生存期，并通过流式细胞术检测外周血和骨髓中白血病细胞的百分比。毒性评估：监测动物体重变化、行为表现和外周血细胞计数，以评估对正常造血功能的影响。数据分析：比较治疗组和安慰剂组的生存期差异和肿瘤负荷变化，并使用Kaplan-Meier分析计算中位生存期。
通常情况下，将 MV4-11 细胞皮下植入免疫缺陷小鼠体内以生成异种移植瘤；肿瘤形成后，通过腹腔注射给予 MM-401；每周测量两次肿瘤大小；终点包括肿瘤生长抑制、体重变化和生存期。 |
| 药代性质 (ADME/PK) |
MM-401 TFA 是一种环状肽化合物的三氟乙酸盐形式，其药代动力学性质与母体化合物 MM-401 相似。与线性母体化合物 MM-101 相比，MM-401 通过环化策略展现出更高的代谢稳定性。该化合物在 DMSO 中溶解度良好（最高可达 100 mg/mL），但在水性缓冲液中的溶解度有限。粉末在 -20°C 或 4°C 避光保存可稳定 2-3 年；溶液在 -80°C 避光保存可稳定 6 个月。对于体内应用，建议使用合适的制剂载体以提高生物利用度。该化合物仅供研究使用，不得用于人体。
PK特性尚未完全详细说明；作为一种肽衍生的抑制剂，其口服生物利用度可能有限，血浆稳定性中等；微粒体稳定性和体内PK参数（半衰期、清除率）尚未在公开资料中得到充分表征。 |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
根据安全数据表，MM-401 TFA 不属于危险物质或混合物，因此无需遵守全球化学品统一分类和标签制度 (GHS)。基于现有研究数据，MM-401 TFA 对正常细胞具有良好的安全性。在 MLL 白血病细胞、非 MLL 白血病细胞和正常骨髓细胞的对比研究中，MM-401 TFA 特异性抑制 MLL 重排白血病细胞的增殖，而对非 MLL 白血病细胞（K562、HL60、U937）或正常骨髓细胞无显著细胞毒性。MM-401 TFA 处理不会诱导正常骨髓细胞发生显著凋亡或分化异常。该化合物纯度≥98%，仅供研究使用，不得用于人类或兽医用途。操作时应遵循标准实验室安全操作规程。
毒理学特征尚未完全描述；作为一种仅供研究使用的实验化合物，没有全面的毒性数据；其对 WDR5-MLL1 相互作用的选择性表明其安全性可能良好，但仍需要进行正式的体内毒性研究。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
本文全面阐述了我们近期开发的抑制剂MM-401，该抑制剂靶向MLL1 H3K4甲基转移酶的活性。MM-401通过阻断MLL1-WDR5相互作用，特异性抑制MLL1活性，从而抑制该复合物的组装。这种靶向策略不影响其他混合谱系白血病（MLL）家族的组蛋白甲基转移酶（HMT），揭示了MLL1复合物独特的调控特性。我们使用MM-401及其对映体对照MM-NC-401证明，抑制MLL1甲基转移酶活性能够特异性地抑制MLL细胞的增殖，其机制是通过诱导细胞周期阻滞、凋亡和髓系分化，且对正常骨髓细胞或非MLL细胞无毒性。更重要的是，转录组分析表明，MM-401诱导的基因表达变化与MLL1缺陷诱导的基因表达变化相似，这支持了MLL1活性在调控MLL1依赖性白血病转录程序中起主导作用的观点。我们认为MM-401在基础研究和转化研究中具有广阔的应用前景。[1]
MM-401 TFA 是一种研究化合物，广泛用作研究 MLL1 在表观遗传调控和 MLL 重排白血病中的功能的工具；它尚未获准用于临床；尚未进行临床试验；它作为参考抑制剂，用于验证 WDR5-MLL 相互作用作为治疗靶点。 |
| 分子式 |
C31H47F3N8O7
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|---|---|
| 分子量 |
700.749497652054
|
| 精确质量 |
700.351
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| CAS号 |
1442106-11-7
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| 相关CAS号 |
MM-401;1442106-10-6
|
| PubChem CID |
137662115
|
| 序列 |
isobutyryl-D-aMeLys(1)-Arg-Abu-D-Phg-(1).TFA
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| 外观&性状 |
White to light yellow solid powder
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| tPSA |
247
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
8
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
11
|
| 可旋转键数目(RBC) |
8
|
| 重原子数目 |
49
|
| 分子复杂度/Complexity |
1060
|
| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
C(F)(F)(F)C(=O)O.O=C1NCCCC[C@@](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC)C(=O)N[C@]1([H])C1C=CC=CC=1)(C)NC(=O)C(C)C
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| InChi Key |
UCPNHHHBFDAYBP-HXXCMCGZSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H46N8O5.C2HF3O2/c1-5-20-24(39)36-22(19-12-7-6-8-13-19)26(41)32-16-10-9-15-29(4,37-23(38)18(2)3)27(42)35-21(25(40)34-20)14-11-17-33-28(30)31;3-2(4,5)1(6)7/h6-8,12-13,18,20-22H,5,9-11,14-17H2,1-4H3,(H,32,41)(H,34,40)(H,35,42)(H,36,39)(H,37,38)(H4,30,31,33);(H,6,7)/t20-,21-,22+,29+;/m0./s1
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| 化学名 |
N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
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| 别名 |
MM-401 TFA; 1442106-11-7; MM-401 (TFA); CHEMBL4099772;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : 100 mg/mL (142.70 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.4270 mL | 7.1352 mL | 14.2704 mL | |
| 5 mM | 0.2854 mL | 1.4270 mL | 2.8541 mL | |
| 10 mM | 0.1427 mL | 0.7135 mL | 1.4270 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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