| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
WDR5 (Ki < 1 nM); WDR5-MLL1 interaction (IC50 = 0.9 nM); MLL1 (IC50 = 0.32 µM)
The primary target of MM-401 is WDR5 (WD repeat domain 5), where it binds with high affinity to disrupt the MLL1-WDR5 interaction. MM-401 exhibits a binding affinity for WDR5 with Ki < 1 nM and an IC50 of 0.9 nM for disrupting the WDR5-MLL1 interaction. By occupying the MLL1-binding interface on WDR5, MM-401 prevents the assembly of the MLL1 core complex, thereby specifically inhibiting MLL1 histone methyltransferase activity (IC50 of 0.32 μM). Importantly, this targeting strategy does not affect the methyltransferase activities of other MLL family members (including MLL2, MLL3, MLL4, SETD1A, and SETD1B), revealing a unique regulatory feature of the MLL1 complex. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
MM-401 抑制 WDR5-MLL1 相互作用，IC50 值为 0.9 nM，同时保持与 WDR5 的强结合亲和力，Ki 值 < 1 nM [1]。通过阻止复合物组装和 MLL1-WDR5 相互作用，MM-401 可以特异性降低 MLL1 活性（IC50 值：0.32μM）[1]。具体而言，细胞中 MLL1 依赖性 H3K4 甲基化受到 MM-401（20 μM；48 小时）的抑制 [1]。 MLL-AF9 转录组的类似改变是由 MM-401 和 MLL1 缺失引起的 [1]。通过引起细胞周期停滞和死亡，MM-401（10、20、40 μM；48 小时）特异性抑制 MLL 白血病细胞的发展 [1]。
体外研究表明，MM-401通过特异性抑制MLL1甲基转移酶活性发挥抗白血病作用。在MLL重排白血病细胞系中，MM-401（10-40 μM，48小时）以浓度依赖性方式诱导细胞周期G1/S期阻滞和细胞凋亡，而对非MLL白血病细胞（如K562、HL60、U937）和正常骨髓细胞无明显抑制作用，GI50未检出。在MLL-AF9细胞中，MM-401（20 μM，48小时）显著降低H3K4me3水平，并下调Hoxa9、Hoxa10等MLL1靶基因的表达。RNA测序分析显示，MM-401处理诱导的基因表达变化与MLL1基因敲除高度相似。从患者体内分离的MLL白血病原始细胞对MM-401同样敏感，而非MLL白血病细胞不敏感。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
研究表明，MM-401在动物模型中通过靶向MLL1-WDR5相互作用发挥体内抗白血病活性。研究发现，抑制MLL1-WDR5相互作用的衍生物已显示出改善的药代动力学特性和体内生物利用度。MM-401作为概念验证工具化合物，虽然其体内药代动力学特性限制了直接的体内给药应用，但其衍生物在MLL白血病小鼠模型中显示出抑制肿瘤生长和延长生存期的效果。通过静脉注射给药，MM-401衍生物能够有效抑制MLL白血病细胞在小鼠体内的扩增，同时未观察到对正常造血功能的明显毒性。
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| 酶活实验 |
组蛋白甲基转移酶测定[1]
按照前面的描述进行HMT测定（Dou et al., 2005）。对于抑制剂研究，不同浓度的化合物首先与预组装的复合物孵育，并通过添加底物引发反应。建立了反应过程曲线进行动力学分析，确定了反应在室温下的线性范围。Lineweaver-Burk曲线，反应（0.5µM酶复合物和50µM底物）在加入终浓度为178µM的β-巯基乙醇后启动并在4分钟后猝灭。 晶体结构[1] WDR5与化合物以1:2的摩尔比混合，得到WDR5//MM-401或WDR5/MM-NC-401二元配合物。该配合物在22℃下通过悬垂-滴-气相扩散结晶。详细信息请参见补充信息。 WDR5蛋白表达与纯化：表达重组人WDR5蛋白，通过亲和层析和尺寸排阻色谱纯化。 生物层干涉测量：使用Octet RED系统，将生物素化的WDR5固定在链霉亲和素传感器上，与不同浓度MM-401结合，测定结合亲和力（KD < 1 nM）。 荧光偏振竞争实验：使用荧光标记的MLL1肽（FAM-WIN肽）与WDR5蛋白和不同浓度MM-401孵育，检测荧光偏振值变化，计算IC50为0.9 nM。 体外组蛋白甲基转移酶实验：将MLL1核心复合物（MLL1-WDR5-ASH2L-RbBP5）与不同浓度MM-401预孵育，加入底物（组蛋白H3和[³H]-SAM）启动反应，通过闪烁计数检测[³H]-甲基掺入量，计算IC50为0.32 μM。 共结晶结构解析：将WDR5与MM-401以1:2摩尔比混合，通过悬滴蒸汽扩散法结晶，解析分辨率为2.1 Å的共晶结构，确认结合模式。 |
| 细胞实验 |
细胞凋亡分析 [1]
细胞类型：小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度： 0、20、40 μM 孵育时间：48小时 实验结果：特异性诱导MLL-AF9细胞凋亡。 细胞周期分析 [1] 细胞类型：小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度： 10, 20 , 40 μM 孵育时间： 48 小时 (hrs (小时)) 实验结果： 在一定浓度的 MLL-AF9 细胞中诱导显着的 G1/依赖方式S 瘀滞。 RT-PCR[1] 细胞类型： MLL-AF9 细胞 测试浓度： 20 μM 孵育持续时间：48小时 实验结果：H3K4me中，5个Hox A基因的表达量急剧减少，尤其是Hoxa9和Hoxa10。 细胞活力、Wright-Giemsa染色、细胞凋亡、细胞周期和细胞分化[1] 抑制剂从原液稀释到含有0.1% DMSO终浓度的培养基中。细胞以1×105/ml培养，每2天传代一次。根据制造商的说明使用CellTitreGlo®试剂盒测定细胞活力。在分子动力学平板阅读器上监测发光。染色时，将10、20和40µM /MM-401，或40µM MM-NC-401或DMSO载体处理4天的细胞在1× PBS中稀释至2.5×105/ml，用细胞自旋固定在玻片上，然后进行Wright-Giemsa染色。光镜下40倍放大拍摄细胞图像。细胞凋亡、细胞周期和细胞分化分析采用标准方案（见补充信息）。 Real Time-PCR、RNA-seq和CHIP检测[1] MLL1-AF9细胞在/MM-401或MM-NC-401存在下培养2天。处理结束时，在300×g离心收集细胞，并用1xPBS洗涤。按照标准方案提取重复生物样品的rna。Illumina测序文库使用10ng rna。在Hi-seq测序仪中，将4个RNA序列样品进行多路复用并加载到一个通道中。RNA-seq分析在补充信息中描述。如前所述进行CHIP测定。 细胞培养：培养MLL重排白血病细胞（如MLL-AF9转导的小鼠骨髓细胞、ML-2、KOPN-8、MV4-11等）和非MLL白血病细胞（K562、HL60、U937），于含10-20%胎牛血清的RPMI-1640培养基中，37°C、5% CO₂条件下培养。 细胞活力检测：将细胞接种于96孔板（1×10⁵/mL），加入不同浓度MM-401（0-40 μM）或对照MM-NC-401，培养3天。采用CellTiter-Glo发光法检测细胞活力，计算GI50。 细胞周期分析：细胞经MM-401（10、20、40 μM）处理48小时后，用70%乙醇固定，PI染色，流式细胞术检测细胞周期分布。 细胞凋亡检测：细胞经MM-401（10、20、40 μM）处理48小时后，Annexin V-FITC/PI双染，流式细胞术检测凋亡率。 Wright-Giemsa染色：细胞经MM-401处理4天后，离心涂片，Wright-Giemsa染色，光镜下观察形态学变化和髓系分化标志。 RT-PCR和Western blot：细胞经MM-401（20 μM）处理48小时后，提取RNA或蛋白，检测Hoxa9、Hoxa10等基因表达及H3K4me3水平。 |
| 动物实验 |
动物模型：使用免疫缺陷小鼠（如NSG小鼠）通过尾静脉注射MLL重排白血病细胞（如MLL-AF9细胞）构建播散性白血病模型。
给药方案：MM-401衍生物（如MM-589）通过静脉注射给药，给药方案为每日一次，连续数周。
药效评估：通过生物发光成像监测肿瘤负荷，记录生存期，通过流式细胞术检测外周血和骨髓中白血病细胞比例。
毒性评估：监测动物体重变化、行为学表现，以及外周血细胞计数评估造血功能。
数据分析：比较治疗组与安慰剂组的生存期差异和肿瘤负荷变化，Kaplan-Meier分析计算中位生存期。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
MM-401作为环肽类工具化合物，其药代动力学特性已通过结构优化得到改善。与母体化合物MM-101相比，MM-401通过环化策略提高了代谢稳定性。目前已有的MM-401衍生物（如MM-589）已显示出改进的药代动力学特性和体内生物利用度。MM-401可溶于DMSO，常用作体外实验储备液。该化合物储存条件为-20°C，干燥、避光保存。如需体内应用，建议使用溶解度更高的盐形式（如MM-401 TFA盐）并采用适当的制剂配方。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
基于现有研究数据，MM-401对正常细胞具有良好的安全性。在MLL白血病细胞与非MLL白血病细胞和正常骨髓细胞的对比研究中，MM-401仅特异性抑制MLL重排白血病细胞的增殖，而对非MLL白血病细胞和正常骨髓细胞无明显的细胞毒性作用。具体表现为：在K562、HL60和U937非MLL白血病细胞中，MM-401处理未观察到生长抑制作用，GI50无法确定。此外，MM-401处理未引起正常骨髓细胞的显著凋亡或分化异常。根据供应商信息，MM-401纯度≥98%，仅供科学研究使用，不适用于人体或兽医用途。操作时应遵守标准实验室安全规范。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
本文全面表征了我们近期开发的靶向MLL1 H3K4甲基转移酶活性的抑制剂MM-401。MM-401能够特异性地抑制MLL1活性，其机制是通过阻断MLL1-WDR5相互作用，从而抑制复合物的组装。这种靶向策略不影响其他混合谱系白血病（MLL）家族的组蛋白甲基转移酶（HMT），揭示了MLL1复合物独特的调控特性。我们利用MM-401及其对映体对照MM-NC-401证明，抑制MLL1甲基转移酶活性能够特异性地抑制MLL细胞的增殖，其机制是通过诱导细胞周期阻滞、细胞凋亡和髓系分化，且对正常骨髓细胞或非MLL细胞无毒性。更重要的是，转录组分析表明，MM-401诱导的基因表达变化与MLL1缺失引起的变化相似，这支持了MLL1活性在调控MLL1依赖性白血病转录程序中起主导作用的观点。我们设想MM-401在基础研究和转化研究中具有广泛的应用前景。[1]
总之，我们在此报道的高选择性MLL1抑制剂将在基础研究中具有广泛的应用前景，并为未来在临床领域开发有效的治疗方法奠定基础。我们设想未来可能会出现以下几个研究方向：首先，随着化学探针MM-401的开发，可以研究H3K4甲基化在各种生物学背景下的必要功能。与基因敲除模型相比，MM-401等药理化合物的靶向抑制作用会对MLL1复合物产生微小但特异性的扰动，从而可以确定其甲基转移酶活性的功能。第二，鉴于MLL1和H3K4me调控MLL白血病中的几个关键靶点（例如Hoxa9、Myc和Bcl2）（图7C），比较MLL1和MLL融合蛋白依赖的基因通路至关重要，以确定它们是否高度重叠，或者它们是否属于对MLL白血病进展至关重要的不同通路。第三，测试MLL1抑制剂是否具有治疗MLL白血病以外多种疾病的潜力至关重要。具体而言，抑制MLL1活性可能有助于治疗具有野生型MLL1等位基因和Hoxa9过表达的急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）（Ayton和Cleary，2001；Dou和Hess，2008）。它也可能适用于MLL1扩增和串联重复的AML。未来，在多种人类疾病中测试MM-401或其衍生物将提供更深入的见解。[1] |
| 分子式 |
C29H46N8O5
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|---|---|
| 分子量 |
586.726146221161
|
| 精确质量 |
586.359
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| 元素分析 |
C, 59.37; H, 7.90; N, 19.10; O, 13.63
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| CAS号 |
1442106-10-6
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| 相关CAS号 |
MM-401 TFA;1442106-11-7
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| PubChem CID |
71586081
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
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| LogP |
0.9
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| tPSA |
210
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| 氢键供体(HBD)数目 |
7
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
8
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| 重原子数目 |
42
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| 分子复杂度/Complexity |
977
|
| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
CC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(=O)NCCCC[C@@](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCN=C(N)N)(C)NC(=O)C(C)C)C2=CC=CC=C2
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| InChi Key |
SILRGLDFBXVGOQ-ZMROOPMESA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H46N8O5/c1-5-20-24(39)36-22(19-12-7-6-8-13-19)26(41)32-16-10-9-15-29(4,37-23(38)18(2)3)27(42)35-21(25(40)34-20)14-11-17-33-28(30)31/h6-8,12-13,18,20-22H,5,9-11,14-17H2,1-4H3,(H,32,41)(H,34,40)(H,35,42)(H,36,39)(H,37,38)(H4,30,31,33)/t20-,21-,22+,29+/m0/s1
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| 化学名 |
N-[6(S)-Ethyl-9(S)-(3-guanidino-propyl)-12(R)-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3(R)-phenyl-1,4,7,10tetraaza-cyclohexadec-12-yl]-isobutyramide
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| 别名 |
MM 401; MM-401; 1442106-10-6; MM-401; CHEMBL3798088; isobutyryl-D-aMeLys(1)-Arg-Abu-D-Phg-(1); N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide; CID 71586081; SCHEMBL15004652; BDBM50164787; MM401
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7044 mL | 8.5218 mL | 17.0436 mL | |
| 5 mM | 0.3409 mL | 1.7044 mL | 3.4087 mL | |
| 10 mM | 0.1704 mL | 0.8522 mL | 1.7044 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
BI-9466
MRK-740-NC
SKLB-03220
(Rac)-NSD2-PWWP1-IN-4
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