| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 2mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
WDR5 (Ki < 1 nM); WDR5-MLL1 interaction (IC50 = 0.9 nM); MLL1 (IC50 = 0.32 µM)
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| 体外研究 (In Vitro) |
MM-401 抑制 WDR5-MLL1 相互作用,IC50 值为 0.9 nM,同时保持与 WDR5 的强结合亲和力,Ki 值 < 1 nM [1]。通过阻止复合物组装和 MLL1-WDR5 相互作用,MM-401 可以特异性降低 MLL1 活性(IC50 值:0.32μM)[1]。具体而言,细胞中 MLL1 依赖性 H3K4 甲基化受到 MM-401(20 μM;48 小时)的抑制 [1]。 MLL-AF9 转录组的类似改变是由 MM-401 和 MLL1 缺失引起的 [1]。通过引起细胞周期停滞和死亡,MM-401(10、20、40 μM;48 小时)特异性抑制 MLL 白血病细胞的发展 [1]。
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| 酶活实验 |
组蛋白甲基转移酶测定[1]
按照前面的描述进行HMT测定(Dou et al., 2005)。对于抑制剂研究,不同浓度的化合物首先与预组装的复合物孵育,并通过添加底物引发反应。建立了反应过程曲线进行动力学分析,确定了反应在室温下的线性范围。Lineweaver-Burk曲线,反应(0.5µM酶复合物和50µM底物)在加入终浓度为178µM的β-巯基乙醇后启动并在4分钟后猝灭。 晶体结构[1] WDR5与化合物以1:2的摩尔比混合,得到WDR5//MM-401或WDR5/MM-NC-401二元配合物。该配合物在22℃下通过悬垂-滴-气相扩散结晶。详细信息请参见补充信息。 |
| 细胞实验 |
细胞凋亡分析 [1]
细胞类型:小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度: 0、20、40 μM 孵育时间:48小时 实验结果:特异性诱导MLL-AF9细胞凋亡。 细胞周期分析 [1] 细胞类型:小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞 测试浓度: 10, 20 , 40 μM 孵育时间: 48 小时 (hrs (小时)) 实验结果: 在一定浓度的 MLL-AF9 细胞中诱导显着的 G1/依赖方式S 瘀滞。 RT-PCR[1] 细胞类型: MLL-AF9 细胞 测试浓度: 20 μM 孵育持续时间:48小时 实验结果:H3K4me中,5个Hox A基因的表达量急剧减少,尤其是Hoxa9和Hoxa10。 细胞活力、Wright-Giemsa染色、细胞凋亡、细胞周期和细胞分化[1] 抑制剂从原液稀释到含有0.1% DMSO终浓度的培养基中。细胞以1×105/ml培养,每2天传代一次。根据制造商的说明使用CellTitreGlo®试剂盒测定细胞活力。在分子动力学平板阅读器上监测发光。染色时,将10、20和40µM /MM-401,或40µM MM-NC-401或DMSO载体处理4天的细胞在1× PBS中稀释至2.5×105/ml,用细胞自旋固定在玻片上,然后进行Wright-Giemsa染色。光镜下40倍放大拍摄细胞图像。细胞凋亡、细胞周期和细胞分化分析采用标准方案(见补充信息)。 Real Time-PCR、RNA-seq和CHIP检测[1] MLL1-AF9细胞在/MM-401或MM-NC-401存在下培养2天。处理结束时,在300×g离心收集细胞,并用1xPBS洗涤。按照标准方案提取重复生物样品的rna。Illumina测序文库使用10ng rna。在Hi-seq测序仪中,将4个RNA序列样品进行多路复用并加载到一个通道中。RNA-seq分析在补充信息中描述。如前所述进行CHIP测定。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
本文全面表征了我们近期开发的靶向MLL1 H3K4甲基转移酶活性的抑制剂MM-401。MM-401能够特异性地抑制MLL1活性,其机制是通过阻断MLL1-WDR5相互作用,从而抑制复合物的组装。这种靶向策略不影响其他混合谱系白血病(MLL)家族的组蛋白甲基转移酶(HMT),揭示了MLL1复合物独特的调控特性。我们利用MM-401及其对映体对照MM-NC-401证明,抑制MLL1甲基转移酶活性能够特异性地抑制MLL细胞的增殖,其机制是通过诱导细胞周期阻滞、细胞凋亡和髓系分化,且对正常骨髓细胞或非MLL细胞无毒性。更重要的是,转录组分析表明,MM-401诱导的基因表达变化与MLL1缺失引起的变化相似,这支持了MLL1活性在调控MLL1依赖性白血病转录程序中起主导作用的观点。我们设想MM-401在基础研究和转化研究中具有广泛的应用前景。[1]
总之,我们在此报道的高选择性MLL1抑制剂将在基础研究中具有广泛的应用前景,并为未来在临床领域开发有效的治疗方法奠定基础。我们设想未来可能会出现以下几个研究方向:首先,随着化学探针MM-401的开发,可以研究H3K4甲基化在各种生物学背景下的必要功能。与基因敲除模型相比,MM-401等药理化合物的靶向抑制作用会对MLL1复合物产生微小但特异性的扰动,从而可以确定其甲基转移酶活性的功能。第二,鉴于MLL1和H3K4me调控MLL白血病中的几个关键靶点(例如Hoxa9、Myc和Bcl2)(图7C),比较MLL1和MLL融合蛋白依赖的基因通路至关重要,以确定它们是否高度重叠,或者它们是否属于对MLL白血病进展至关重要的不同通路。第三,测试MLL1抑制剂是否具有治疗MLL白血病以外多种疾病的潜力至关重要。具体而言,抑制MLL1活性可能有助于治疗具有野生型MLL1等位基因和Hoxa9过表达的急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)(Ayton和Cleary,2001;Dou和Hess,2008)。它也可能适用于MLL1扩增和串联重复的AML。未来,在多种人类疾病中测试MM-401或其衍生物将提供更深入的见解。[1] |
| 分子式 |
C29H46N8O5
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|---|---|
| 分子量 |
586.726146221161
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| 精确质量 |
586.359
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| 元素分析 |
C, 59.37; H, 7.90; N, 19.10; O, 13.63
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| CAS号 |
1442106-10-6
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| 相关CAS号 |
MM-401 TFA;1442106-11-7
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| PubChem CID |
71586081
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
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| LogP |
0.9
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| tPSA |
210
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| 氢键供体(HBD)数目 |
7
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
8
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| 重原子数目 |
42
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| 分子复杂度/Complexity |
977
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| 定义原子立体中心数目 |
4
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| SMILES |
CC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(=O)NCCCC[C@@](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCN=C(N)N)(C)NC(=O)C(C)C)C2=CC=CC=C2
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| InChi Key |
SILRGLDFBXVGOQ-ZMROOPMESA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H46N8O5/c1-5-20-24(39)36-22(19-12-7-6-8-13-19)26(41)32-16-10-9-15-29(4,37-23(38)18(2)3)27(42)35-21(25(40)34-20)14-11-17-33-28(30)31/h6-8,12-13,18,20-22H,5,9-11,14-17H2,1-4H3,(H,32,41)(H,34,40)(H,35,42)(H,36,39)(H,37,38)(H4,30,31,33)/t20-,21-,22+,29+/m0/s1
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| 化学名 |
N-[6(S)-Ethyl-9(S)-(3-guanidino-propyl)-12(R)-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3(R)-phenyl-1,4,7,10tetraaza-cyclohexadec-12-yl]-isobutyramide
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| 别名 |
MM 401; MM-401; 1442106-10-6; MM-401; CHEMBL3798088; isobutyryl-D-aMeLys(1)-Arg-Abu-D-Phg-(1); N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide; CID 71586081; SCHEMBL15004652; BDBM50164787; MM401
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7044 mL | 8.5218 mL | 17.0436 mL | |
| 5 mM | 0.3409 mL | 1.7044 mL | 3.4087 mL | |
| 10 mM | 0.1704 mL | 0.8522 mL | 1.7044 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。