MM-401

别名: MM 401; MM-401; 1442106-10-6; MM-401; CHEMBL3798088; isobutyryl-D-aMeLys(1)-Arg-Abu-D-Phg-(1); N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide; CID 71586081; SCHEMBL15004652; BDBM50164787; MM401
目录号: V22884 纯度: ≥98%
MM-401 是一种新型、有效、选择性的组蛋白 H3K4 甲基转移酶 MLL1 活性抑制剂。
MM-401 CAS号: 1442106-10-6
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
Other Sizes

Other Forms of MM-401:

  • MM-401 TFA
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

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产品描述
MM-401 是一种新型、有效、选择性的组蛋白 H3K4 甲基转移酶 MLL1 活性抑制剂。 MM-401 通过将小鼠外胚层干细胞 (EpiSC) 重新编程为原始多能性来发挥作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
WDR5 (Ki < 1 nM); WDR5-MLL1 interaction (IC50 = 0.9 nM); MLL1 (IC50 = 0.32 µM)
体外研究 (In Vitro)
MM-401 抑制 WDR5-MLL1 相互作用,IC50 值为 0.9 nM,同时保持与 WDR5 的强结合亲和力,Ki 值 < 1 nM [1]。通过阻止复合物组装和 MLL1-WDR5 相互作用,MM-401 可以特异性降低 MLL1 活性(IC50 值:0.32μM)[1]。具体而言,细胞中 MLL1 依赖性 H3K4 甲基化受到 MM-401(20 μM;48 小时)的抑制 [1]。 MLL-AF9 转录组的类似改变是由 MM-401 和 MLL1 缺失引起的 [1]。通过引起细胞周期停滞和死亡,MM-401(10、20、40 μM;48 小时)特异性抑制 MLL 白血病细胞的发展 [1]。
酶活实验
组蛋白甲基转移酶测定[1]
按照前面的描述进行HMT测定(Dou et al., 2005)。对于抑制剂研究,不同浓度的化合物首先与预组装的复合物孵育,并通过添加底物引发反应。建立了反应过程曲线进行动力学分析,确定了反应在室温下的线性范围。Lineweaver-Burk曲线,反应(0.5µM酶复合物和50µM底物)在加入终浓度为178µM的β-巯基乙醇后启动并在4分钟后猝灭。
晶体结构[1]
WDR5与化合物以1:2的摩尔比混合,得到WDR5//MM-401或WDR5/MM-NC-401二元配合物。该配合物在22℃下通过悬垂-滴-气相扩散结晶。详细信息请参见补充信息。
细胞实验
细胞凋亡分析 [1]
细胞类型:小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞
测试浓度: 0、20、40 μM
孵育时间:48小时
实验结果:特异性诱导MLL-AF9细胞凋亡。

细胞周期分析 [1]
细胞类型:小鼠 MLL-AF9 和 Hoxa9/Meis1 细胞
测试浓度: 10, 20 , 40 μM
孵育时间: 48 小时 (hrs (小时))
实验结果: 在一定浓度的 MLL-AF9 细胞中诱导显着的 G1/依赖方式S 瘀滞。

RT-PCR[1]
细胞类型: MLL-AF9 细胞
测试浓度: 20 μM
孵育持续时间:48小时
实验结果:H3K4me中,5个Hox A基因的表达量急剧减少,尤其是Hoxa9和Hoxa10。
细胞活力、Wright-Giemsa染色、细胞凋亡、细胞周期和细胞分化[1]
抑制剂从原液稀释到含有0.1% DMSO终浓度的培养基中。细胞以1×105/ml培养,每2天传代一次。根据制造商的说明使用CellTitreGlo®试剂盒测定细胞活力。在分子动力学平板阅读器上监测发光。染色时,将10、20和40µM /MM-401,或40µM MM-NC-401或DMSO载体处理4天的细胞在1× PBS中稀释至2.5×105/ml,用细胞自旋固定在玻片上,然后进行Wright-Giemsa染色。光镜下40倍放大拍摄细胞图像。细胞凋亡、细胞周期和细胞分化分析采用标准方案(见补充信息)。
Real Time-PCR、RNA-seq和CHIP检测[1]
MLL1-AF9细胞在/MM-401或MM-NC-401存在下培养2天。处理结束时,在300×g离心收集细胞,并用1xPBS洗涤。按照标准方案提取重复生物样品的rna。Illumina测序文库使用10ng rna。在Hi-seq测序仪中,将4个RNA序列样品进行多路复用并加载到一个通道中。RNA-seq分析在补充信息中描述。如前所述进行CHIP测定。
参考文献

[1]. Targeting MLL1 H3K4 methyltransferase activity in mixed-lineage leukemia. Mol Cell. 2014 Jan 23;53(2):247-61.

其他信息
本文全面表征了我们近期开发的靶向MLL1 H3K4甲基转移酶活性的抑制剂MM-401。MM-401能够特异性地抑制MLL1活性,其机制是通过阻断MLL1-WDR5相互作用,从而抑制复合物的组装。这种靶向策略不影响其他混合谱系白血病(MLL)家族的组蛋白甲基转移酶(HMT),揭示了MLL1复合物独特的调控特性。我们利用MM-401及其对映体对照MM-NC-401证明,抑制MLL1甲基转移酶活性能够特异性地抑制MLL细胞的增殖,其机制是通过诱导细胞周期阻滞、细胞凋亡和髓系分化,且对正常骨髓细胞或非MLL细胞无毒性。更重要的是,转录组分析表明,MM-401诱导的基因表达变化与MLL1缺失引起的变化相似,这支持了MLL1活性在调控MLL1依赖性白血病转录程序中起主导作用的观点。我们设想MM-401在基础研究和转化研究中具有广泛的应用前景。[1]
总之,我们在此报道的高选择性MLL1抑制剂将在基础研究中具有广泛的应用前景,并为未来在临床领域开发有效的治疗方法奠定基础。我们设想未来可能会出现以下几个研究方向:首先,随着化学探针MM-401的开发,可以研究H3K4甲基化在各种生物学背景下的必要功能。与基因敲除模型相比,MM-401等药理化合物的靶向抑制作用会对MLL1复合物产生微小但特异性的扰动,从而可以确定其甲基转移酶活性的功能。第二,鉴于MLL1和H3K4me调控MLL白血病中的几个关键靶点(例如Hoxa9、Myc和Bcl2)(图7C),比较MLL1和MLL融合蛋白依赖的基因通路至关重要,以确定它们是否高度重叠,或者它们是否属于对MLL白血病进展至关重要的不同通路。第三,测试MLL1抑制剂是否具有治疗MLL白血病以外多种疾病的潜力至关重要。具体而言,抑制MLL1活性可能有助于治疗具有野生型MLL1等位基因和Hoxa9过表达的急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)(Ayton和Cleary,2001;Dou和Hess,2008)。它也可能适用于MLL1扩增和串联重复的AML。未来,在多种人类疾病中测试MM-401或其衍生物将提供更深入的见解。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H46N8O5
分子量
586.726146221161
精确质量
586.359
元素分析
C, 59.37; H, 7.90; N, 19.10; O, 13.63
CAS号
1442106-10-6
相关CAS号
MM-401 TFA;1442106-11-7
PubChem CID
71586081
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
0.9
tPSA
210
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
977
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(=O)NCCCC[C@@](C(=O)N[C@H](C(=O)N1)CCCN=C(N)N)(C)NC(=O)C(C)C)C2=CC=CC=C2
InChi Key
SILRGLDFBXVGOQ-ZMROOPMESA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H46N8O5/c1-5-20-24(39)36-22(19-12-7-6-8-13-19)26(41)32-16-10-9-15-29(4,37-23(38)18(2)3)27(42)35-21(25(40)34-20)14-11-17-33-28(30)31/h6-8,12-13,18,20-22H,5,9-11,14-17H2,1-4H3,(H,32,41)(H,34,40)(H,35,42)(H,36,39)(H,37,38)(H4,30,31,33)/t20-,21-,22+,29+/m0/s1
化学名
N-[6(S)-Ethyl-9(S)-(3-guanidino-propyl)-12(R)-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3(R)-phenyl-1,4,7,10tetraaza-cyclohexadec-12-yl]-isobutyramide
别名
MM 401; MM-401; 1442106-10-6; MM-401; CHEMBL3798088; isobutyryl-D-aMeLys(1)-Arg-Abu-D-Phg-(1); N-[(3R,6S,9S,12R)-9-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-6-ethyl-12-methyl-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]-2-methylpropanamide; CID 71586081; SCHEMBL15004652; BDBM50164787; MM401
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7044 mL 8.5218 mL 17.0436 mL
5 mM 0.3409 mL 1.7044 mL 3.4087 mL
10 mM 0.1704 mL 0.8522 mL 1.7044 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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