SLF TFA

目录号: V34764 纯度: ≥98%
SLF TFA 是 FK506 结合蛋白 (FKBP) 的合成配体,对 FKBP51 的亲和力为 3.1 μM,对 FKBP12 的 IC50 为 2.6 μM。
SLF TFA CAS号: 2378802-47-0
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
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产品描述
SLF TFA 是一种 FK506 结合蛋白 (FKBP) 的合成配体,对 FKBP51 的亲和力为 3.1 μM,对 FKBP12 的 IC50 为 2.6 μM。它可用于制备 PROTAC 分子。
SLF TFA(CAS号:2378802-47-0)是一种FK506结合蛋白(FKBP)的合成配体,常用于化学生物学和蛋白质工程领域的研究。TFA盐形式可提高其稳定性和操作性。SLF TFA广泛用于合成PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)分子,以进行靶向蛋白质降解研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
SLF TFA primarily targets FK506-binding proteins, specifically FKBP12 and FKBP51. FKBP12 is a cytosolic prolyl isomerase that has been frequently used to study ligand-induced protein degradation. The compound exhibits an affinity of 3.1 microM for FKBP51 and an IC50 of 2.6 microM for FKBP12.
体外研究 (In Vitro)
人类蛋白质组中的三个片段(KB02、KB03 和 KB05)融合在一起时,其半胱氨酸残基与 SLF 配体显著结合,覆盖了两个不同的亲电基团(丙烯酰胺和氯乙酰胺)。该配体具有反应活性,能够特异性地与 FKBP12 结合。FKBP12 是一种胞质脯氨酰异构酶,广泛用于配体诱导蛋白质降解的研究 [3]。
体外实验表明,SLF TFA 与胞质脯氨酰异构酶 FKBP12 具有高亲和力结合。与 SLF 配体融合的三个先导片段(KB02、KB03 和 KB05)在人类蛋白质组中显示出广泛的半胱氨酸反应性。该化合物具有反应活性,并能特异性地结合 FKBP12,使其成为研究配体诱导的蛋白质降解的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
由于SLF TFA主要用作体外PROTAC开发的化学工具而非治疗剂,因此其体内活性数据有限。其体内效应通常取决于它所结合的特定PROTAC分子。该化合物的用途在于其能够募集FKBP蛋白,以便在细胞模型以及潜在的体内模型中进行靶向降解研究。
酶活实验
体外酶/受体结合试验通常采用纯化的FKBP12或FKBP51蛋白进行竞争性结合试验。放射性标记或荧光标记的FK506类似物用作示踪剂。将化合物与靶蛋白和示踪剂孵育,通过测量示踪剂的置换来确定结合亲和力。IC50值由剂量反应曲线计算得出。试验在生理pH值的缓冲体系中进行。
细胞实验
体外细胞检测SLF TFA的方法通常是用含有SLF TFA的PROTAC分子处理培养细胞,以评估靶蛋白的降解情况。将细胞与化合物孵育不同时间(例如4-24小时),然后进行Western blot分析以检测靶蛋白水平。细胞活力和增殖情况可通过MTT或CCK-8法进行评估。降解效率通过蛋白条带的密度分析进行定量。
动物实验
使用SLF TFA进行的体内动物研究通常是在特定PROTAC分子而非单独使用SLF TFA的情况下进行的。标准方案包括在啮齿动物模型中通过静脉注射、腹腔注射或口服途径给药PROTAC化合物。在不同时间点采集组织样本,用于药代动力学分析以及通过免疫组织化学或蛋白质印迹法评估靶蛋白降解情况。肿瘤异种移植模型可用于疗效评估。
药代性质 (ADME/PK)
SLF TFA 的药代动力学特性主要在 PROTAC 分子体系中进行表征。该化合物在 DMSO 中具有较高的溶解度(200 mg/mL,约 313 mM)。与游离碱相比,TFA 盐形式的溶解度更高。作为一种小分子配体,预计其具有良好的细胞渗透性。具体的药代动力学参数,例如半衰期、清除率和生物利用度,取决于具体的 PROTAC 偶联物制剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
单独使用SLF TFA的具体毒性数据有限。作为一种研究用化学品,它需按照标准的实验室安全预防措施进行操作。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。毒性特征通常在临床前开发阶段,结合特定的PROTAC分子进行评估。标准的体外细胞毒性试验(例如,在各种细胞系上进行MTT试验)和啮齿动物体内耐受性研究可用于安全性评估。
参考文献

[1]. FKBP Ligands-Where We Are and Where to Go? Front Pharmacol. 2018 Dec 5;9:1425.

[2]. Creating diverse target-binding surfaces on FKBP12: synthesis and evaluation of a rapamycin analogue library. ACS Comb Sci. 2011 Sep 12;13(5):486-95.

[3]. Electrophilic PROTACs that degrade nuclear proteins by engaging DCAF16. Nat Chem Biol. 2019 Jul;15(7):737-746.

其他信息
SLF TFA 是一种合成的 FKBP 配体,广泛用作 PROTAC 技术中的构建模块。它可用于设计双功能分子,这些分子能够募集 FKBP12 作为 E3 连接酶接头,从而实现靶向蛋白质降解。该化合物以三氟乙酸盐形式存在,以提高稳定性。它仅供研究用途,尚未获准用于临床。SLF TFA 是研究蛋白质稳态和开发新型治疗策略的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H41F3N2O8
分子量
638.671760320663
精确质量
638.281
CAS号
2378802-47-0
相关CAS号
SLF;195513-96-3
PubChem CID
155981980
外观&性状
Light brown to brown solid powder
tPSA
146
氢键供体(HBD)数目
2
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
45
分子复杂度/Complexity
885
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C(F)(F)(F)C(=O)O.C(N1CCCC[C@H]1C(=O)O[C@@H](C1C=CC=C(N)C=1)CCC1C=CC(OC)=C(OC)C=1)(=O)C(=O)C(C)(C)CC
InChi Key
HKRBJXCFMLSYKV-KZDWWKKTSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H40N2O6.C2HF3O2/c1-6-30(2,3)27(33)28(34)32-17-8-7-12-23(32)29(35)38-24(21-10-9-11-22(31)19-21)15-13-20-14-16-25(36-4)26(18-20)37-5;3-2(4,5)1(6)7/h9-11,14,16,18-19,23-24H,6-8,12-13,15,17,31H2,1-5H3;(H,6,7)/t23-,24+;/m0./s1
化学名
[(1R)-1-(3-aminophenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (156.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (7.83 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5658 mL 7.8288 mL 15.6575 mL
5 mM 0.3132 mL 1.5658 mL 3.1315 mL
10 mM 0.1566 mL 0.7829 mL 1.5658 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们