APY29

别名: APY29 APY 29 APY-29 APY29 ;N2-1H-苯并咪唑-6-基-N4-(5-环丙基-1H-吡唑-3-基)-2,4-嘧啶二胺

目录号: V7033 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

APY29 是一种 ATP 竞争性抑制剂，是 IRE1α 的特异性变构调节剂，通过与 ATP 结合袋结合来抑制 IRE1α 的自主磷酸化，IC50 为 280 nM。

APY29 CAS号: 1216665-49-4
产品类别: New1

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

APY29 是一种 ATP 竞争性抑制剂，也是 IRE1α 的特异性变构调节剂，它通过与 ATP 结合口袋结合来抑制 IRE1α 的自主磷酸化，IC50 值为 280 nM。APY29 还可以变构激活 IRE1α 的邻近 RNase 结构域。

生物活性&实验参考方法

靶点	IRE1α (inositol-requiring enzyme 1 alpha). It is a Type I ATP-competitive inhibitor that binds to the kinase domain's ATP-binding site, stabilizing an active (DFG-in) conformation. [1]
体外研究 (In Vitro)	APY29 以不同的方式改变 IRE1α 的寡聚状态和 RNase 活性。APY29 使用相同的结合位点，但对 RNase 活性的影响截然相反。APY29 对 IRE1α 的寡聚化有不同程度的影响。APY29 对内质网应激引起的内源性 IRE1α RNase 激活的剂量依赖性作用与此相反 [1]。 APY29 是一种 ATP 竞争性抑制剂，可与 IRE1α 的激酶结构域结合。酵母 IRE1 与 APY29 的共晶体结构显示，激酶催化结构域处于活性构象，这通常是蛋白激酶与 ATP 和其他 I 型抑制剂结合时所呈现的构象。[1] APY29 以剂量依赖性方式抑制 IRE1α 的自磷酸化。在利用重组人IRE1α蛋白（IRE1α，氨基酸残基469-977）进行的体外激酶活性测定中，APY29表现出抑制自身磷酸化的IC50值。（文中/图中未提供定量IC50值）。[1] 与对激酶活性的影响不同，APY29激活IRE1α的RNase结构域。在利用FRET淬灭的XBP1 RNA小底物进行的体外RNase活性测定中，APY29以剂量依赖的方式增强了去磷酸化、低活性形式的IRE1α（dP-IRE1α）的切割活性，使其活性恢复至磷酸化IRE1α水平的约60%。测定了该激活作用的EC50值。（文中/图中未提供定量EC50值）。 [1] APY29促进IRE1α的寡聚化。在IRE1α浓度递增的交联实验中，饱和浓度的APY29（200 μM）与DMSO对照组相比，提高了IRE1α寡聚体（二聚体及更高级的亚基）与单体的比例。[1] 在竞争实验中，递增浓度的APY29逐渐逆转了固定浓度II型抑制剂化合物3对IRE1α RNase活性的抑制作用。这表明APY29和化合物3通过相同的ATP结合位点对RNase活性发挥相反的作用。 [1] 利用同位素编码亲和标签（ICAT）试剂进行的生化足迹实验表明，APY29与IRE1α的ATP结合位点结合。它屏蔽了位于激酶铰链区的Cys645，使其免受烷基化，并减缓了位于激活环中的Cys715的烷基化速率。这种模式与APY29稳定激活环的DFG-in构象相一致。[1] 分子对接研究预测，APY29与人IRE1α ATP结合位点的DFG-in构象结合良好，其吡唑环与激酶铰链区形成氢键，嘧啶部分占据腺嘌呤口袋。未获得APY29与DFG-out构象模型结合的有利构象。 [1]
细胞实验	在INS-1细胞中进行XBP1 mRNA剪接分析：将大鼠胰岛瘤INS-1细胞用不同浓度的APY29或DMSO对照预处理1小时。然后用6 nM毒胡萝卜素（Tg）处理细胞4小时以诱导内质网（ER）应激。提取总RNA，进行逆转录，并通过PCR扩增XBP1 cDNA。将PCR产物在琼脂糖凝胶上进行电泳分离，并定量分析剪接型XBP1（XBP1s）与总XBP1（剪接型+未剪接型）的比值。APY29对ER应激诱导的XBP1 mRNA剪接表现出剂量依赖性的拮抗作用。（未提供具体的EC50/IC50值）。 [1] INS-1细胞中IRE1α磷酸化检测：用化合物预处理INS-1细胞，然后用Tg诱导内质网应激。使用抗总IRE1α和抗磷酸化IRE1α抗体进行免疫印迹分析细胞提取物。结果表明，APY29抑制细胞中IRE1α的自磷酸化。[1]
参考文献	[1]. Divergent allosteric control of the IRE1α endoribonuclease using kinase inhibitors. Nat Chem Biol. 2012 Dec;8(12):982-9.
其他信息	APY29是一种预测的I型激酶抑制剂，能够稳定IRE1α激酶结构域的活性（DFG-in）构象。[1] 通过稳定这种活性激酶构象，APY29作为变构激活剂，激活相邻的RNase结构域。这表明，即使没有上游内质网应激或自身磷酸化，配体占据激酶ATP结合位点本身也能触发RNase激活。[1] APY29（I型）和化合物3（II型）对IRE1α RNase活性的不同影响——激活与抑制——凸显了通过使用不同类型的ATP竞争性抑制剂靶向其激酶结构域，从而双向药理学调控这一关键UPR调节因子的潜力。[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C17H16N8
分子量	332.371
精确质量	332.149
CAS号	1216665-49-4
PubChem CID	42627755
外观&性状	White to yellow solid powder
密度	1.6±0.1 g/cm3
沸点	782.3±70.0 °C at 760 mmHg
闪点	426.9±35.7 °C
蒸汽压	0.0±2.7 mmHg at 25°C
折射率	1.861
LogP	1.66
tPSA	107.2
氢键供体(HBD)数目	4
氢键受体(HBA)数目	6
可旋转键数目(RBC)	5
重原子数目	25
分子复杂度/Complexity	458
定义原子立体中心数目	0
SMILES	C1CC1C2=CC(=NN2)NC3=NC(=NC=C3)NC4=CC5=C(C=C4)N=CN5
InChi Key	WJNBSTLIALIIEW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C17H16N8/c1-2-10(1)13-8-16(25-24-13)22-15-5-6-18-17(23-15)21-11-3-4-12-14(7-11)20-9-19-12/h3-10H,1-2H2,(H,19,20)(H3,18,21,22,23,24,25)
化学名	2-N-(3H-benzimidazol-5-yl)-4-N-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine
别名	APY29 APY 29 APY-29
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~53.33 mg/mL (~160.46 mM) H2O : ~5 mg/mL (~15.04 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (15.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 5 mg/mL (15.04 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (15.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~53.33 mg/mL (~160.46 mM)
H2O : ~5 mg/mL (~15.04 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (15.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 5 mg/mL (15.04 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (15.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	3.0087 mL	15.0435 mL	30.0870 mL
	5 mM	0.6017 mL	3.0087 mL	6.0174 mL
	10 mM	0.3009 mL	1.5043 mL	3.0087 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

Interaction of ATP-competitive inhibitors with the bifunctional kinase/RNase, IRE1α (a) Proposed binding modes of type I and type II kinase inhibitors with the ATP-binding pocket of IRE1α. Left panel shows the contacts the type I inhibitor APY29 forms with yeast IRE1α (PDB code 3SDJ)18. The right panel shows the proposed contacts a type II inhibitor 1 forms with IRE1α based on the co-crystal structure of the same inhibitor bound to Src (PDB code 3EL8) (also see Supplementary Fig. 3). (b) XBP1 RNA minisubstrate assay used for screening IRE1α modulators. The recombinant human IRE1α—IRE1α*—used in the assay spans residues 469–977, which includes the cytosolic kinase and RNase domains. Cleavage of the 5’FAM-3’BHQ-labeled XBP1 minisubstrate by IRE1α* results in FRET-dequenching. [1].Wang L, et al. Divergent allosteric control of the IRE1α endoribonuclease using kinase inhibitors. Nat Chem Biol. 2012 Dec;8(12):982-9.

APY29 and 3 divergently modulate the RNase activity and oligomerization state of IRE1α* (a) Inhibition of IRE1α* autophosphorylation in vitro by APY29 and 3. Normalized autophosphorylation levels and IC50 values for both compounds are shown. (b) λ-PPase treatment of IRE1α* produces dephosphorylated IRE1α* (dP-IRE1α*). Immunoblots using anti-IRE1α and anti-phospho IRE1α antibodies are shown. (c) RNase activities of IRE1α* and dP-IRE1 α* under varying concentrations of APY29 or 3 per the assay of Figure 1b. EC50 values were determined by fitting normalized fluorescence intensities (mean ± SD, n = 3). (d) Urea PAGE of XBP1 mini-substrate cleavage by IRE1α* and dP-IRE1α* with and without 3 or APY29. (e) RNase competition assays between APY29 and 3. The red line shows IRE1α* RNase activity under fixed 3 and varying APY29 concentrations. The black line shows IRE1α* RNase activity under fixed APY29 and varying 3 concentrations. The blue line shows IRE1α* RNase activity under fixed STF-083010 and varying APY29 concentrations (mean ± SD, n = 3).[1].Wang L, et al. Divergent allosteric control of the IRE1α endoribonuclease using kinase inhibitors. Nat Chem Biol. 2012 Dec;8(12):982-9.

Characterization of 3's interaction with the ATP-binding site of IRE1α Results of the ICAT footprinting experiments with IRE1α*. Alkylation rates were measured in the presence of DMSO (black), APY29 (blue) (20 µM), or 3 (red) (20 µM) (mean ± SD, n = 3). (a) Alkylation rate of Cys572. (b) Alkylation rate of Cys645. (c) Alkylation rate of Cys715. (d) A molecular model of 3's interaction with the ATP-binding site of IRE1α (grey). IRE1α is in the DFG-out inactive conformation. The imidazopyrazine ring of 3 occupies the adenine pocket and the 3-trifluoromethylurea occupies the DFG-out pocket. No favorable poses for 3 bound to the DFG-in conformation of IRE1α could be determined.[1].Wang L, et al. Divergent allosteric control of the IRE1α endoribonuclease using kinase inhibitors. Nat Chem Biol. 2012 Dec;8(12):982-9.