Azathramycin

别名: Azaerythromycin A; Desmethyl Azithromycin 阿奇霉素 A; 去甲阿奇霉素; 阿奇霉素杂质A; 9-脱氧-9a-氮杂-9a-红霉素A; Azathramycin(脱甲基阿奇霉素);阿奇霉素杂质A(EP) 标准品; 阿奇霉素杂质P; 阿扎红霉素A; 阿扎红霉素A USP标准品
目录号: V5322 纯度: ≥98%
阿扎霉素(Azaerythromycin A)是一种靶向核糖体的抗生素。
Azathramycin CAS号: 76801-85-9
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
250mg
500mg
1g
2g
5g
Other Sizes

Other Forms of Azathramycin:

  • 阿奇霉素
  • 阿奇霉素二水合物
  • 谷氨酸红霉素
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产品描述
阿扎霉素(Azaerythromycin A)是一种靶向核糖体的抗生素。
生物活性&实验参考方法
靶点
Macrolide antibiotic
Azathramycin binds to the ribosome (canonical target) of Mycobacterium tuberculosis.
体外研究 (In Vitro)
尽管基于表型和靶点的高通量筛选方法已被用于发现新的抗生素,但有前景的候选治疗药物的鉴定仍然具有挑战性。每种方法都提供了不同的信息,了解它们的结果可以为作用机制(MoA)提供假设,并揭示可操作的化学物质。在这里,我们描述了一个识别生物活性化合物功效靶标的框架。针对广泛靶标的高通量生物物理图谱与机器学习相结合,用于识别具有给定表型筛选的预测功效靶标的化学特征。我们在24个历史内部抗菌表型筛选中的55000个化合物和高通量生物物理结合分析中筛选的636个细菌靶标的数据上验证了该方法。建立模型是为了揭示表型、靶标和化学型之间的关系,这些关系概括了已知抗菌药物的机制。我们还前瞻性地鉴定了二氢叶酸还原酶的新型抑制剂,该抑制剂对结核分枝杆菌具有纳摩尔抗菌效果。分子建模提供了对靶配体相互作用的结构见解,这些相互作用是对分枝杆菌对人类细胞选择性杀伤活性的基础[1]。
参考文献
[1]. Linking High-Throughput Screens to Identify MoAs and Novel Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis Dihydrofolate Reductase. ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
其他信息
阿扎霉素是一种大环内酯类抗生素。
它被纳入用于高通量筛选的约55,000种化合物的“富集抗菌药物”库中。
利用基于亲和质谱的高通量生物物理结合分析方法——自动配体识别系统(ALIS),检测了阿扎霉素与结核分枝杆菌核糖体的结合。
在筛选的636个细菌靶标中,ALIS平台鉴定出阿扎霉素是其典型靶标(核糖体)的结合物。
该信息用于验证将表型活性与靶标结合联系起来的机器学习框架。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C37H70N2O12
分子量
734.9579
精确质量
734.492
CAS号
76801-85-9
相关CAS号
83905-01-5 (Azithromycin); 117772-70-0 (Azithromycin dihydrate; Azitro; CP 62993; CP-62993; CP62993; Goxal; Odaz; Ribotrex; Toraseptol; Ultreon; XZ-450; XZ450; XZ 450; Zenstavion; Zithromax; Zmax); 41342-53-4 (Erythromycin Ethylsuccinate) 7704-67-8 (Erythromycin Thiocyanate); 16667-03-1 (Erythromycin glutamate)
PubChem CID
9810601
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
815.2±65.0 °C at 760 mmHg
熔点
126-136ºC
闪点
446.8±34.3 °C
蒸汽压
0.0±0.6 mmHg at 25°C
折射率
1.536
LogP
3.11
tPSA
188.87
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
51
分子复杂度/Complexity
1120
定义原子立体中心数目
18
SMILES
O([C@@]1([H])[C@@]([H])([C@]([H])(C([H])([H])[C@@]([H])(C([H])([H])[H])O1)N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])O[H])[C@@]1([H])[C@@](C([H])([H])[H])(C([H])([H])[C@@]([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])N([H])[C@]([H])(C([H])([H])[H])[C@]([H])([C@@](C([H])([H])[H])([C@@]([H])(C([H])([H])C([H])([H])[H])OC([C@]([H])(C([H])([H])[H])[C@]([H])([C@]1([H])C([H])([H])[H])O[C@@]1([H])C([H])([H])[C@](C([H])([H])[H])([C@]([H])([C@]([H])(C([H])([H])[H])O1)O[H])OC([H])([H])[H])=O)O[H])O[H])O[H]
InChi Key
HRKNNHYKWGYTEN-HOQMJRDDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C37H70N2O12/c1-14-26-37(10,45)30(41)23(6)38-18-19(2)16-35(8,44)32(51-34-28(40)25(39(11)12)15-20(3)47-34)21(4)29(22(5)33(43)49-26)50-27-17-36(9,46-13)31(42)24(7)48-27/h19-32,34,38,40-42,44-45H,14-18H2,1-13H3/t19-,20-,21+,22-,23-,24+,25+,26-,27+,28-,29+,30-,31+,32-,34+,35-,36-,37-/m1/s1
化学名
(2R,3S,4R,5R,8R,10R,11R,12S,13S,14R)-11-[(2S,3R,4S,6R)-4-(dimethylamino)-3-hydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-2-ethyl-3,4,10-trihydroxy-13-[(2R,4R,5S,6S)-5-hydroxy-4-methoxy-4,6-dimethyloxan-2-yl]oxy-3,5,8,10,12,14-hexamethyl-1-oxa-6-azacyclopentadecan-15-one
别名
Azaerythromycin A; Desmethyl Azithromycin
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
Ethanol : ~100 mg/mL
DMSO : 33.33~50 mg/mL ( 45.35 ~68.03 mM )
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.40 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 10% DMSO+40% PEG300+5% Tween-80+45% Saline: ≥ 2.5 mg/mL (3.40 mM)

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3606 mL 6.8031 mL 13.6062 mL
5 mM 0.2721 mL 1.3606 mL 2.7212 mL
10 mM 0.1361 mL 0.6803 mL 1.3606 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Overview of our cheminformatic approach to mechanism of action prediction for antimicrobial drug discovery.[1].ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
  • Joint identification of enriched chemotypes facilitates retrospective validation of known antibiotic mechanism of action. A) 6 enriched chemotypes for bioactivity in an E. coli live/dead phenotypic assay and for the top enriched target, FolA, yielded 4 well-known antibiotics inhibiting dihydrofolate reductase, 2 of which were active hits in the phenotypic screen. B) The M. tuberculosis ribosome was an enriched target for a S. aureus live/dead phenotypic screen, and joint identification of 19 chemotypes (8 shown) lead to identification of 14 known ribosomal antibiotics in 3 distinct chemical classes (12 active, 2 were untested in this screen).[1].ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
  • Identification of compounds that target DHFR to inhibit the growth of M. tuberculosis. A) 7 enriched chemotypes yielded 6 compounds with growth inhibitory activity and hypothesized to act through Rv2763c (Mtb DHFR). B) Correlation between in vitro inhibition of purified Mtb DHFR and inhibition of bacterial growth. [1].ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
  • A) Overlay of 10-PAP and dihydrofolate ligands in the active sites of both Mtb and human DHFR. B) Key interactions are illustrated between the diaminopyrimidine pharmacophore and conserved active site residues.[1].ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
  • Assessment of target space coverage to generate efficacy target hypotheses for phenotypic actives. A) Percentage of phenotypic assay actives (vertical axis) that could be associated with a potential efficacy target for each organism.[1].ACS Chem Biol. 2017 Sep 15; 12(9): 2448–2456.
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