BAY 41-4109 racemate 中文名称: Bay 41-4109消旋体

别名: BAY-414109; BAY414109; BAY 414109; BAY-41-4109; BAY41-4109; BAY 41-4109 4-(2-氯-4-氟苯基)-2-(3,5-二氟-2-吡啶基)-1,4-二氢-6-甲基-5-嘧啶羧酸甲酯

目录号: V4177 纯度: ≥98%

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BAY 41-4109 外消旋体是 BAY 41-4109 的外消旋混合物，BAY 41-4109 是一种新型、有效的人乙型肝炎病毒 (HBV) 抑制剂，IC50 为 53 nM。

BAY 41-4109 racemate CAS号: 298708-79-9
产品类别: HBV

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

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Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

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产品描述

BAY 41-4109 外消旋体是 BAY 41-4109 的外消旋混合物，BAY 41-4109 是一种新型、有效的人乙型肝炎病毒 (HBV) 抑制剂，IC50 为 53 nM。 BAY-41-4109 是一种杂芳基二氢嘧啶 (HAP) 抗病毒化合物，对乙型肝炎病毒 (HBV) 衣壳组装和预先形成的 HBV 衣壳有效。

生物活性&实验参考方法

靶点	HBV(IC50= 53 nM ) In vitro, BAY 41-4109 has the capacity to misdirect and speed up capsid assembly. BAY 41-4109 stabilizes formed capsids up to a ratio of one inhibitor molecule for every two dimers [2]. In HepG2.2.15 cells, BAY 41-4109 exhibits an equivalent level of efficacy in suppressing HBV DNA release and cytoplasmic HBcAg levels, with IC50 values of 32.6 and 132 nM, respectively. The dose-dependent inhibition of HBV DNA and HBcAg suggests that the anti-HBV mechanisms are linked to and reliant on the rate of HBcAg inhibition[3].
体外研究 (In Vitro)	在体外，BAY 41-4109 具有误导和加速衣壳组装的能力。 BAY 41-4109 可以稳定形成的衣壳，达到每两个二聚体一个抑制剂分子的比例 [2]。在 HepG2.2.15 细胞中，BAY 41-4109 在抑制 HBV DNA 释放和细胞质 HBcAg 水平方面表现出同等水平的功效，IC50 值分别为 32.6 和 132 nM。 HBV DNA 和 HBcAg 的剂量依赖性抑制表明，抗 HBV 机制与 HBcAg 抑制率相关并依赖于此[3]。在HepG2.2.15细胞实验中，BAY 41-4109抑制HBV复制的半数抑制浓度（IC50）估计为53 nM。对HepG2.2.15细胞的半数细胞毒性浓度（CC50）为7 µM。 [1]
体内研究 (In Vivo)	BAY 41-4109 的功效与 3TC 相似，以剂量依赖性方式减少肝脏和血浆中的病毒 DNA。 BAY 41 -4109 降低了 HBV 转基因小鼠肝脏中的乙型肝炎病毒核心抗原 (HBcAg)。小鼠药代动力学研究表明，大鼠和狗的吸收速度快，生物利用度为 30%，与剂量成比例的血浆浓度约为 60%[1]。通过靶向病毒衣壳，BAY41-4109 抑制体内病毒的产生[2]。在HBV转基因小鼠（Tg [HBV1.3 fsX-3'5']）中，每日两次口服给予BAY 41-4109（15 mg/kg和30 mg/kg），持续28天，可显著降低肝脏中的HBV特异性DNA水平（通过斑点印迹杂交法测定）。30 mg/kg剂量的效果更显著。 [1] 在同一模型中，每日两次口服给予BAY 41-4109（15 mg/kg和30 mg/kg），持续28天，也显著降低了血浆中的HBV-DNA水平（通过实时荧光定量PCR法测定）。在血浆中的抗病毒效果比在肝脏中更明显。 [1] BAY 41-4109（30 mg/kg，每日三次，持续20天）显著降低了转基因雄性和雌性小鼠肝脏中的细胞质乙肝病毒核心抗原（HBeAg）染色（通过免疫组织化学法评估）。相比之下，核苷类似物3TC治疗并未减少细胞质HBeAg。 [1] 在该转基因小鼠模型中，BAY 41-4109在降低肝脏和血浆HBV-DNA方面的抗病毒效果优于每日两次给予30 mg/kg的3TC。 [1]
细胞实验	MTT比色法用于测量细胞代谢。在 96 孔板中，HepG2.2.15 细胞以每孔 2 × 103 个细胞的密度铺板。用不同浓度的每种抗病毒化合物处理 8 天后，向每个孔中添加 20 μL MTT 溶液 (5 g/L)，然后将孔在 37°C 下孵育 4 小时。为了溶解晶体，然后添加 150 μL DMSO 并搅拌 10 分钟。 ELISA 读数器用于记录 490 nm 处的吸光度值。曲线回归方程用于计算MTT值[3]。化合物的抗病毒活性在基于HepG2.2.15细胞的实验中进行评估。将HepG2.2.15细胞接种于96孔板中，并与系列稀释的测试化合物共同孵育。在第4天更换培养基。在第8天，收集细胞培养上清并裂解细胞。使用斑点印迹杂交法检测和定量上清及细胞裂解物中的HBV-DNA，然后进行化学发光检测并用成像系统分析。 [1]
动物实验	小鼠：本研究采用HBV转基因小鼠。化合物（BAY 41-4109）以含0.5%泰洛糖的悬浮液配制，每日两次，连续给药28天。安慰剂为0.5%泰洛糖。末次给药后6小时处死动物，立即取出肝脏并冷冻保存以备后续检查。麻醉后，对动物进行心脏穿刺取血[1]。为进行疗效研究，使用HBV转基因小鼠（Tg [HBV1.3 fsX-3'5']）。小鼠经预先筛选，血清HBV-DNA水平符合要求。每组包含5只雄性小鼠和5只雌性小鼠（约10周龄）。[1] BAY 41-4109配制成含0.5%泰洛糖的悬浮液（安慰剂对照组为0.5%泰洛糖）。 [1] 将化合物混悬液口服（per os）给小鼠。在主要疗效研究中，以 3、7.5、15 和 30 mg/kg 的剂量，每日两次（bid）给药，连续 28 天。[1] 在另一项比较对 HBeAg 影响的实验中，以 30 mg/kg 的剂量，每日三次（tid）给药 BAY 41-4109，连续 20 天。[1] 小鼠在最后一次给药后 6 小时处死。通过心脏穿刺采集血液，取出肝脏并立即冷冻，用于后续的 HBV-DNA 和组织学分析。[1] 在药代动力学研究中，分别在静脉注射和口服 BAY 41-4109 后的不同时间点采集小鼠血液（每个时间点采集三只动物）。[1]
药代性质 (ADME/PK)	在小鼠中，BAY 41-4109是一种高清除率药物。口服给药后，吸收迅速，达峰时间 (tmax) 为 0.17 小时。[1] 小鼠口服 BAY 41-4109 的生物利用度约为 30%。[1] 小鼠血浆中 BAY 41-4109 的半衰期约为 2 小时。[1] 在大鼠和犬中，口服生物利用度约为 60%，吸收也很快（大鼠 tmax = 0.17 小时，犬 tmax = 0.8 小时）。[1] 利用动物数据，通过异速缩放法预测了人体药代动力学参数（清除率、分布容积）。预测的稳态分布容积 (Vss) 为 2.9 L/kg。 [1] 采用乙腈沉淀蛋白质后，通过液相色谱-串联质谱法（LC/MSMS）测定血浆中BAY 41-4109的浓度。[1]
参考文献	[1]. Inhibition of human hepatitis B virus (HBV) by a novel non-nucleosidic compound in a transgenic mouse model. Antiviral Res. 2002 May;54(2):69-78. [2]. BAY 41-4109 has multiple effects on Hepatitis B virus capsid assembly. J Mol Recognit. 2006 Nov-Dec;19(6):542-8. [3]. Inhibition of hepatitis B virus replication by Bay 41-4109 and its association with nucleocapsid disassembly. J Chemother. 2008 Aug;20(4):458-67.
其他信息	BAY 41-4109（(R)-4-(2-氯-4-氟苯基)-2-(3,5-二氟-2-吡啶基)-6-甲基-1,4-二氢嘧啶-5-羧酸甲酯）属于一类新型杂芳基嘧啶化合物，已被证实是乙型肝炎病毒（HBV）复制的强效抑制剂。[1] 其作用机制似乎与核苷类似物（如3TC）不同，这体现在其能够降低肝细胞胞质中HBeAg的水平，而3TC则不具备此作用。其活性可能源于对病毒复制机制的直接抑制和/或对病毒组装过程的抑制。[1] 该化合物在HBV复制的转基因小鼠模型中表现出剂量依赖性的抗病毒功效，能够降低肝脏和血浆中的病毒DNA水平。[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C18H13CLF3N3O2
分子量	395.76
精确质量	395.06
元素分析	C, 54.63; H, 3.31; Cl, 8.96; F, 14.40; N, 10.62; O, 8.09
CAS号	298708-79-9
相关CAS号	Bay 41-4109;298708-81-3;Bay 41-4109 (less active enantiomer);476617-51-3
PubChem CID	9865484
外观&性状	Light yellow to yellow solid powder
熔点	126 °C
LogP	3.1
tPSA	63.6
氢键供体(HBD)数目	1
氢键受体(HBA)数目	7
可旋转键数目(RBC)	4
重原子数目	27
分子复杂度/Complexity	645
定义原子立体中心数目	0
SMILES	O=C(C1=C(C)N=C(C2=NC=C(F)C=C2F)NC1C3=CC=C(F)C=C3Cl)OC
InChi Key	FVNJBPMQWSIGJK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C18H13ClF3N3O2/c1-8-14(18(26)27-2)15(11-4-3-9(20)5-12(11)19)25-17(24-8)16-13(22)6-10(21)7-23-16/h3-7,15H,1-2H3,(H,24,25)
化学名	Methyl 4-(2-chloro-4-fluorophenyl)-2-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-6-methyl-1,4-dihydropyrimidine-5-carboxylate
别名	BAY-414109; BAY414109; BAY 414109; BAY-41-4109; BAY41-4109; BAY 41-4109
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : 50~79 mg/mL ( 126.34~199.61 mM ) Ethanol : ~11 mg/mL Water : ˂1 mg/mL
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.32 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 10% DMSO+40% PEG300+5% Tween-80+45% Saline: 2.5 mg/mL (6.32 mM) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : 50~79 mg/mL ( 126.34~199.61 mM )
Ethanol : ~11 mg/mL
Water : ˂1 mg/mL

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.32 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 10% DMSO+40% PEG300+5% Tween-80+45% Saline: 2.5 mg/mL (6.32 mM)

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.5268 mL	12.6339 mL	25.2678 mL
	5 mM	0.5054 mL	2.5268 mL	5.0536 mL
	10 mM	0.2527 mL	1.2634 mL	2.5268 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。