BAY-598

别名: BAY598; BAY 598; BAY-598 S-isomer
目录号: V4167 纯度: ≥98%
BAY-598(BAY598 S-异构体)是一种新型、有效、选择性和肽竞争性的赖氨酸甲基转移酶SMYD2小分子抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
BAY-598 CAS号: 1906919-67-2
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • BAY-598 R-isomer
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纯度: ≥98%

产品描述
BAY-598(BAY598 S-异构体)是一种新型、有效、选择性和肽竞争性赖氨酸甲基转移酶 SMYD2 的小分子抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。 SMYD2 在多种癌症中过度表达。 BAY-598 是一种化学探针,相对于当前的 SMYD2 化学探针 LLY-507 具有独特的化学型。 BAY-598 体外抑制 p53K370 甲基化,IC50 = 27 nM,选择性比其他组蛋白甲基转移酶和其他非表观遗传靶标高 100 倍以上。 BAY-598 抑制细胞中 p53K370 的甲基化,IC50 < 1 µM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Treatment with BAY-598 prevents SMYD2 from methylating MAPKAPK3 in vitro, but it has no effect on the KMT SMYD2-associated SMYD2. After nine days in culture, BAY-598 administration inhibited the growth of Kras;p53 mutant PDAC cells, but had no effect on the growth of Kras;p53;Smyd2 mutant cells [1].
体外研究 (In Vitro)
BAY-598 治疗可在体外阻止 SMYD2 甲基化 MAPKAPK3,但对 KMT SMYD2 相关的 SMYD2 没有影响。培养9天后,BAY-598给药抑制Kras;p53突变型PDAC细胞的生长,但对Kras;p53;Smyd2突变型细胞的生长没有影响[1]。
BAY-598 处理 9 天后,可减少 Kras;p53 突变型 PDAC 细胞的生长,但对 Kras;p53、Smyd2 双突变型细胞影响甚微,这支持了其对 SMYD2 的特异性。[1]
BAY-598 与吉西他滨联用,或在缺乏 SMYD2 的细胞中,吉西他滨对 Kras;p53 突变型 PDAC 细胞克隆扩增的抑制作用更强,表明化疗与 SMYD2 抑制之间存在协同作用。[1]
人 PDAC 细胞系(SW1990, MIA PaCa2)对低剂量多柔比星与 BAY-598 的联合急性治疗(48 小时)高度敏感,而对任一药物单用则基本耐药。[1]
体内研究 (In Vivo)
在免疫缺陷小鼠中,使用 BAY-598(50 mg/kg,每日一次腹腔注射)联合吉西他滨(100 mg/kg,每三天一次)抑制 SMYD2,与单药治疗相比,可减弱 SW1990 异种移植瘤的生长。[1]
酶活实验
体外甲基化实验使用重组的 SMYD2 及其底物 MAPKAPK3(或使用 SMYD3 及其底物 MAP3K2 作为对照)。反应体系包含重组蛋白、SAM 或氘代 SAM 以及反应缓冲液。在抑制实验中,BAY-598 或 DMSO 需与 SMYD2 预孵育,然后加入放射性标记的 SAM。反应过夜后,通过 SDS-PAGE 分离,并通过放射自显影或免疫印迹进行分析。BAY-598 能特异性抑制 SMYD2 介导的 MAPKAPK3 甲基化,但不影响 SMYD3 的活性。[1]
细胞实验
对于细胞活力实验,将 PDAC 细胞接种于 96 孔板中,并用 BAY-598、多柔比星或联合用药的系列稀释液进行处理。72 小时后,使用 MTT 法评估细胞活力。[1]
对于长期克隆形成实验,将来自小鼠模型的原代 PDAC 细胞接种于 6 孔板中,并用 DMSO、BAY-598、吉西他滨或联合药物治疗 9 天。然后固定细胞,用 Sapphire 700 染料染色,并成像进行定量分析。[1]
动物实验
For xenograft studies, SW1990 human PDAC cells were implanted subcutaneously into NSG mice. Mice were treated with BAY-598 (50 mg/kg once daily, intraperitoneal injection), gemcitabine (100 mg/kg every third day), or vehicle control. Tumor volumes were measured with calipers. [1]
In spontaneous PDAC models (Kras;p53 mutant mice), gemcitabine was administered at 100 mg/kg every third day for three cycles to assess chemosensitivity in the context of SMYD2 inhibition. [1]
药代性质 (ADME/PK)
In vitro, BAY-598 showed moderate metabolic stability in rat hepatocytes (blood clearance, CLblood = 2.5 L/h/kg).[2]
In a Caco-2 permeability assay, BAY-598 exhibited moderate apparent permeability (Papp(A-B) = 34 nm/s) with an indication of active efflux (efflux ratio = 5).[2]
Its aqueous solubility was 20 mg/L.[2]
Following a single intravenous bolus administration of 0.4 mg/kg to rats, BAY-598 showed moderate blood clearance (1.6 L/h/kg).[2]
Following a single oral administration of 0.8 mg/kg to rats, the bioavailability was 24%.[2]
In mice, oral administration of 10 or 100 mg/kg once daily achieved plasma exposures that covered the unbound cellular IC₅₀ for approximately 9 or 12 hours at steady state, respectively.[2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
In the in vivo efficacy study in mice, the combination treatment of BAY-598 (500 mg/kg, po, qd) with doxorubicin resulted in only a minor increase in treatment-related body weight loss compared to monotherapy groups.[2]
参考文献

[1]. Coordination of stress signals by the lysine methyltransferase SMYD2 promotes pancreaticcancer. Genes Dev. 2016 Apr 1;30(7):772-85.

[2]. Discovery and Characterization of a Highly Potent and Selective Aminopyrazoline-Based in Vivo Probe (BAY-598) for the Protein Lysine Methyltransferase SMYD2. J Med Chem. 2016 May 26;59(10):4578-600.

其他信息
BAY-598 is described as a highly selective SMYD2 inhibitor used to probe SMYD2 function in pancreatic cancer. It was obtained from the Structural Genomics Consortium. [1]
The study suggests that SMYD2 inhibition may enhance the efficacy of standard chemotherapy (gemcitabine, doxorubicin) in PDAC by modulating stress response pathways. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H20CL2F2N6O3
分子量
525.335409164429
精确质量
524.09
元素分析
C, 50.30; H, 3.84; Cl, 13.50; F, 7.23; N, 16.00; O, 9.14
CAS号
1906919-67-2
相关CAS号
1906919-67-2 (S-isomer);1906920-28-2 (BAY598 R-isomer);1906920-07-7 (BAY598 recamic mixture);
PubChem CID
117072551
外观&性状
Beige Solid powder
LogP
4.4
tPSA
114
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
854
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CCN([C@H]1CN(N=C1C2=CC(=C(C=C2)Cl)Cl)C(=NC3=CC(=CC=C3)OC(F)F)NC#N)C(=O)CO
InChi Key
OTTJIRVZJJGFTK-SFHVURJKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H20Cl2F2N6O3/c1-2-31(19(34)11-33)18-10-32(30-20(18)13-6-7-16(23)17(24)8-13)22(28-12-27)29-14-4-3-5-15(9-14)35-21(25)26/h3-9,18,21,33H,2,10-11H2,1H3,(H,28,29)/t18-/m0/s1
化学名
(S,E)-N-(1-(N'-cyano-N-(3-(difluoromethoxy)phenyl)carbamimidoyl)-3-(3,4-dichlorophenyl)-4,5-dihydro-1H-pyrazol-4-yl)-N-ethyl-2-hydroxyacetamide
别名
BAY598; BAY 598; BAY-598 S-isomer
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~237.94 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9035 mL 9.5176 mL 19.0353 mL
5 mM 0.3807 mL 1.9035 mL 3.8071 mL
10 mM 0.1904 mL 0.9518 mL 1.9035 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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