Pelabresib (CPI0610)

别名: CPI0610; CPI 0610; CPI-0610 (4S)-6-(4-氯苯基)-1-甲基-4H-异恶唑并[5,4-d][2]苯并氮杂卓-4-乙酰胺;CPI0610
目录号: V2609 纯度: ≥98%
Pelabresib (CPI-0610; CPI0610) 是一种有效的选择性苯并异恶唑氮卓 BET(布罗莫结构域和末端外)布罗莫结构域抑制剂 (IC50 = 39 nM),具有抗癌作用。
Pelabresib (CPI0610) CAS号: 1380087-89-7
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
Pelabresib (CPI-0610; CPI0610) 是一种有效的选择性苯并异恶唑氮卓 BET(布罗莫结构域和末端)布罗莫结构域抑制剂 (IC50 = 39 nM),具有抗癌作用。目前正在进行针对血液恶性肿瘤的人体临床试验。在细胞因子存在下以及与骨髓基质细胞共培养时,CPI-0610 可抑制 MM(多发性骨髓瘤)细胞的生长。 CPI-0610 诱导与 MYC 下调相关的细胞凋亡和 G1 细胞周期停滞。然而,BET 抑制后,MM 细胞中 BCL2、NF-κB 和 MCL1 的蛋白水平保持不变。 CPI-0610 在 MM 细胞的转录和蛋白质水平上抑制 Ikaros 和 IRF4 的表达。
生物活性&实验参考方法
靶点
BRD4-BD1 (IC50=39 nM)
体外研究 (In Vitro)
CPI-0610(0-1500 nM;72 小时;多发性骨髓瘤细胞系和原代 MM 细胞)治疗会剂量依赖性地降低 MM 细胞活力[2]。 G1 细胞周期停滞是由 CPI-0610(800 nM;72 小时;INA6 和 MM.1S 细胞)处理引起的[2]。 72 小时后,用 CPI-0610(800 nM;INA6 和 MM.1S 细胞)处理可显着促进 MM 细胞凋亡[2]。
体内研究 (In Vivo)
在研究过程中,CPI-0610(30-60 mg/kg;口服;持续 28 天;MV-4-11 小鼠异种移植模型)治疗显着抑制肿瘤生长(41%、80% 和 74% 肿瘤)生长抑制,分别),而不导致动物体重显着减轻[1]。
酶活实验
热位移测定方案
所有测定均在384孔板中进行。将BRD4 BD1(2μM)与Sypro Orange(Life Technologies)在50mM Tris、1mM DTT、pH 8.5中混合至最终染料浓度为5X。将试管短暂离心以去除沉淀物,然后将蛋白质:染料溶液加入黑色OptiplateTM板(Greiner)中,短暂旋转(1分钟,900xg),然后将23μL转移到DMSO对照品或从最终化合物浓度为800μM(0.8%v/v DMSO)的100mM DMSO储备物中电镀的片段中。随后,将样品(15μL)转移到LightCycler®480板(Roche Diagnostics)上,旋转(2分钟,900xg),并在Roche LightCycler 480 II上使用20-85°C的温度梯度和1.2°C/分钟的扫描速率进行分析。使用内部开发的应用程序评估熔化转变的中点(Tm),该应用程序测量作为温度函数的荧光变化速率的一阶导数。相对于同一平板内的DMSO对照,计算化合物引起的熔融温度Tm的变化

生化测定方案
将5μL测定缓冲液(50mM HEPES pH 7.5、1mM TCEP、69uM Brij-35、150mM NaCl和0.1mg/mL的BSA)中的BRD4蛋白(BD1或BD2)添加到384孔白色Proxiplates(Perkin-Elmer)中,该化合物先前作为DMSO储备分配用于10点剂量反应滴定(一式两份)。向其中加入总体积为10μL的生物素化小分子配体。10分钟后,加入SureightTM Streptavidin和Eu(W1024)-抗His(均为Perkin-Elmer)检测试剂作为额外的5uL等分试样。最终测定是在含有0.8%(v/v)DMSO、25(BD1)或100(BD2)nM Surelight Streptavidin(以生物素结合位点表示的浓度)、0.2 nM Eu抗体以及分别含有25或100 nM生物素配体的2.5 nM(BD1。在EnVision上读取60分钟室温培养板后,使用适当的过滤器,使用20次闪光/孔,数据采集延迟40μs,闪光之间延迟16.6 msec。在每个平板的基础上计算相对于阳性(无蛋白质)和阴性(无抑制剂)对照的抑制百分比。通过拟合抑制百分比与化合物浓度的关系来确定IC50值。对于其他通过TR-FRET评估的非BET溴结构域,在相同的缓冲液中以类似的方式进行分析。盐、报告子、生物配体和溴结构域浓度的变化见下表

在384孔Proxiplates的测定缓冲液(40mM Hepes pH 7.0、1mM DTT、69uM Brij-35、40mM NaCl和0.1mg/mL BSA)中进行BET选择性AlphaLISA测定,将化合物作为DMSO储备加入至0.8%(v/v)10点剂量反应滴定的最终浓度。用BET蛋白、生物素化的JQ1类似物和体积为9uL的化合物建立初始结合反应。将样品温育20分钟,然后在测定缓冲液中加入含有链亲和素供体珠和抗Flag AlphaLISA受体珠(均为PerkinElmer)的10uL混合物,使10或30nM BET蛋白、10nM生物素化配体以及供体和受体珠的终浓度分别为15ug/mL,在测定缓冲溶液加0.8%DMSO(v/v)中。将板密封,在室温下孵育90分钟,并使用AlphaScreen®设置在配备LANCE Dual Laser 50/200(PerkinElmer)的EnVision 2104多标签读取器上读取。在每个平板的基础上计算相对于阳性和阴性对照的抑制百分比。对于滴定实验,通过拟合抑制百分比与化合物浓度的关系来确定IC50值。ATAD2溴结构域AlphaLISA测定的条件与先前报道的相同。
细胞实验
细胞活力测定 [2]
细胞类型:多发性骨髓瘤 (MM) 细胞系和原代 MM 细胞
测试浓度:0 nM、200 nM、400 nM、600 nM、800 nM、1000 nM、1200 nM 或 1500 nM
孵育时间:72 小时
实验结果:MM 细胞活力降低以剂量依赖性方式。

细胞周期分析[2]
细胞类型: INA6 和 MM.1S 细胞
测试浓度: 800 nM
孵育持续时间:72 小时
实验结果:G1 细胞周期停滞。

细胞凋亡分析[2]
细胞类型: INA6 和 MM.1S 细胞
测试浓度: 800 nM
孵育时间:72小时
实验结果:72小时后MM细胞凋亡增加。
动物实验
Animal/Disease Models: MV-4-11 mouse xenograft model[1]
Doses: 30 mg/kg one time/day, 30 mg/kg twice (two times) daily, or 60 mg/kg one time/day
Route of Administration: Oral administration; for 28 days
Experimental Results: Suppressed of tumor growth, without any significant body weight loss in the animals.
参考文献

[1]. Identification of a Benzoisoxazoloazepine Inhibitor (CPI-0610) of the Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Family as a Candidate for Human Clinical Trials. J Med Chem. 2016 Feb 25;59(4):1330-9.

[2]. Preclinical activity of CPI-0610, a novel small-molecule bromodomain and extra-terminal protein inhibitor in the therapy of multiple myeloma. Leukemia. 2017 Aug;31(8):1760-1769.

其他信息
Pelabresib Anhydrous is the anhydrous form of pelabresib, a small molecule inhibitor of the Bromodomain and Extra-Terminal (BET) family of proteins, with potential antineoplastic activity. Upon administration, pelabresib binds to the acetylated lysine recognition motifs on the bromodomain of BET proteins, thereby preventing the interaction between the BET proteins and acetylated histone peptides. This disrupts chromatin remodeling and gene expression. Prevention of the expression of certain growth-promoting genes may lead to an inhibition of tumor cell growth. Characterized by a tandem repeat of two bromodomains at the N-terminus, the BET proteins (BRD2, BRD3, BRD4 and BRDT) are transcriptional regulators that play an important role during development and cellular growth.
Pelabresib is the hydrated form of pelabresib, a small molecule inhibitor of the Bromodomain and Extra-Terminal (BET) family of proteins, with potential antineoplastic activity. Upon administration, pelabresib binds to the acetylated lysine recognition motifs on the bromodomain of BET proteins, thereby preventing the interaction between the BET proteins and acetylated histone peptides. This disrupts chromatin remodeling and gene expression. Prevention of the expression of certain growth-promoting genes may lead to an inhibition of tumor cell growth. Characterized by a tandem repeat of two bromodomains at the N-terminus, the BET proteins (BRD2, BRD3, BRD4 and BRDT) are transcriptional regulators that play an important role during development and cellular growth.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H16CLN3O2
分子量
365.81
精确质量
365.093
CAS号
1380087-89-7
相关CAS号
1380087-89-7
PubChem CID
57389999
外观&性状
White to off-white solid
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
622.8±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
330.5±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.8 mmHg at 25°C
折射率
1.692
LogP
2.72
tPSA
81.5Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
561
定义原子立体中心数目
1
SMILES
ClC1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])C1C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C2C2C(C([H])([H])[H])=NOC=2[C@@]([H])(C([H])([H])C(N([H])[H])=O)N=1
InChi Key
GCWIQUVXWZWCLE-INIZCTEOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H16ClN3O2/c1-11-18-14-4-2-3-5-15(14)19(12-6-8-13(21)9-7-12)23-16(10-17(22)25)20(18)26-24-11/h2-9,16H,10H2,1H3,(H2,22,25)/t16-/m0/s1
化学名
2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-1-methyl-4H-[1,2]oxazolo[5,4-d][2]benzazepin-4-yl]acetamide
别名
CPI0610; CPI 0610; CPI-0610
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:73 mg/mL (199.5 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:12 mg/mL (32.8 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7337 mL 13.6683 mL 27.3366 mL
5 mM 0.5467 mL 2.7337 mL 5.4673 mL
10 mM 0.2734 mL 1.3668 mL 2.7337 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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