| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 250mg |
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描述:DS-1001B 是一种强效且选择性的突变型 IDH1(异柠檬酸脱氢酶-1)抑制剂,具有抗肿瘤活性,可改善软骨肉瘤中异常的组蛋白修饰并抑制肿瘤活性。
| 靶点 |
Mutant isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1)
- IDH1 R132H: IC50 = 8 nM [3] - IDH1 R132C: IC50 = 11 nM [3] - Wild-type IDH1: IC50 = 180 nM [3] The compound does not inhibit IDH2 R140Q, IDH2 R172Q, or wild-type IDH2 (IC50 > 10,000 nM) [3]. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
DS-1001b 处理(1 和 10 µM,处理 72 小时)显著降低了 IDH1 突变型软骨肉瘤细胞系(IDH1 R132G 突变的 JJ012 和 IDH1 R132C 突变的 L835)中的细胞内 2-HG 水平,但对 IDH2 突变型(SW1353)或 IDH 野生型(OUMS27、NDC5-1)细胞系无影响。细胞内 D-2-HG 水平比 L-2-HG 高 100 倍,并且在两种 IDH1 突变型细胞系中均可被 1 µM DS-1001b 完全阻断。[2] - DS-1001b 以剂量依赖的方式抑制 JJ012 和 L835 细胞的增殖。 JJ012细胞的GI50值为81 nM(第14天),L835细胞的GI50值为77 nM(6周)。该药物对IDH野生型细胞系(OUMS27和NDC5-1;GI50 > 10 µM)的增殖几乎没有影响。[2] 在3D球状体和低氧(1% O2)条件下,DS-1001b以剂量依赖的方式降低细胞活力。JJ012细胞在7天时的GI50值分别为289.6 nM(单层)、1,444 nM(球状体)和1,363 nM(1% O2)。L835细胞在3周时的GI50值分别为160.9 nM(单层)和2,878 nM(1% O2)。 [2]
- 在 JJ012 和 L835 细胞中,DS-1001b 处理以剂量依赖的方式降低了细胞内 2-HG 水平,在 1 µM 浓度下处理 72 小时可完全阻断 2-HG 的产生。[2] - 在 L835 细胞中,DS-1001b(10 µM,处理 6 周)上调了软骨细胞分化通路基因(SOX9、RUNX2、COL2A1、COL10A1、ACAN)的 mRNA 和蛋白(SOX9)水平,这通过 RT-PCR 和蛋白质印迹法测定。 [2] 在 JJ012 细胞中,DS-1001b(1 µM,处理 7 天)诱导 G1 期阻滞(G0/G1 期细胞比例增加 5.4%,S 期细胞比例减少 4.4%),并上调 CDKN1C (p57) mRNA 和蛋白表达,RT-PCR 和 Western blot 分析结果均证实了这一点。[2] Western blot 分析结果显示,DS-1001b(1 µM,处理 7 天)处理显著降低了 JJ012 和 L835 细胞中 H3K4me3 和 H3K9me3 的水平,而 H3K27me3 的水平保持不变。 [2]染色质免疫沉淀 (ChIP)-qPCR 显示,DS-1001b 处理(1 µM,7 天)显著降低了 L835 细胞中 SOX9 位点和 JJ012 细胞中 CDKN1C 位点的 H3K9me3 水平。[2]在 L835 细胞的 3D 球状培养物中,DS-1001b 处理(100 nM,2 周)增加了软骨陷窝,减小了细胞核大小和染色质增多,增加了核内 SOX9 表达,并显著增加了 Alcian 蓝阳性软骨细胞基质面积。[2]DS-1001b 处理(20–50 nM)抑制了 IDH1 R132H 或 IDH1 R132C 突变细胞中 2-HG 的产生。[3] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在皮下移植JJ012 (IDH1 R132G)肿瘤的异种移植小鼠模型中,持续口服DS-1001b(混入灭菌颗粒饲料中)显著抑制了皮下肿瘤的生长,与对照组相比差异显著。在最终随访时,治疗组的肿瘤重量也显著降低。[2] DS-1001b治疗组小鼠的肿瘤内2-HG水平显著低于未治疗组(P < 0.001)。[2] DS-1001b抑制了小鼠模型中血浆2-HG水平的升高,而未治疗组小鼠的血浆2-HG水平则逐渐升高(P = 0.006)。 [2] RT-PCR 证实,DS-1001b 处理显著上调了异种移植瘤中 CDKN1C 的表达,与体外实验结果一致。免疫组化分析显示,部分经 DS-1001b 处理的 JJ012 细胞中存在核 CDKN1C 表达,而未处理的细胞中未观察到此现象。[2] 在具有 IDH1 R132H 杂合突变的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 (PDX) 模型中,DS-1001b 的给药显著降低了肿瘤中 2-HG 的含量,并对皮下 A1074 PDX 模型表现出明显的抗肿瘤作用。[3]
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| 酶活实验 |
使用体外酶活性测定法测试了DS-1001b对突变型和野生型IDH酶的抑制活性。IDH1 R132H、IDH1 R132C和野生型IDH1的IC50值分别为8 nM、11 nM和180 nM。该化合物不抑制IDH2 R140Q、IDH2 R172Q或野生型IDH2(IC50值>10,000 nM)。[3]
- 对IDH1 R132C、NADPH和化合物A(DS-1001b衍生物)的三元复合物进行了X射线晶体衍射分析。分析表明,化合物A位于二聚体表面的变构口袋中,而IDH1 R132C处于“开放”的非活性状态。[3] |
| 细胞实验 |
将细胞(JJ012、L835、SW1353、OUMS27、NDC5-1)用不同浓度的DS-1001b处理。为了测定IC50/GI50值,细胞处理时间各不相同(例如,JJ012细胞处理7天,L835细胞处理3-6周)。通过计数累积细胞数来评估细胞增殖。评估了细胞在常氧、低氧(1% O2)和3D球状体培养条件下的活力。[2]
- 在用DS-1001b处理72小时后,采用LC-MS/MS和LC-TOFMS测定细胞内总2-HG及其对映体(D-2-HG和L-2-HG)的水平。 [2] - 对于 RNA-seq 分析,L835 细胞用 10 µM 的 DS-1001b 处理 6 周,JJ012 细胞用 1 µM 的 DS-1001b 处理 7 天。通过通路分析分析基因表达变化,并用 qRT-PCR 进行验证。[2] - 对用 DS-1001b(0、1、10 µM,处理 6 周)处理的 L835 细胞和用 1 µM 的 DS-1001b 处理 7 天的 JJ012 细胞进行 Western blot 分析,以评估 SOX9、CDKN1C、H3K4me3、H3K9me3 和 H3K27me3 的蛋白水平。 [2] - 使用BrdU和7-AAD染色,通过流式细胞术分析了用DS-1001b(1 µM,7天)处理的JJ012细胞的细胞周期进程。[2] - 对于3D球状体培养,将L835细胞在软骨生成培养基中培养形成球状体。4周后,用100 nM的DS-1001b处理球状体2周。组织学分析包括H&E染色、SOX9染色、II型胶原免疫组化染色和阿利新蓝染色。 [2] - 使用针对 SOX9 和 CDKN1C 位点的 H3K4me3、H3K9me3 和 H3K27me3 的特异性抗体,对经 DS-1001b(1 µM,处理 7 天)处理的 L835 和 JJ012 细胞进行染色质免疫沉淀 (ChIP)-qPCR 分析。[2] |
| 动物实验 |
在软骨肉瘤模型中开展体内疗效研究时,将JJ012-Luc+细胞皮下移植到NOD-SCID小鼠体内。移植后3周(经生物发光成像确认肿瘤植入后),开始向小鼠(n=7)持续给予DS-1001b,药物与灭菌颗粒饲料混合喂食。对照组(n=5)喂食对照饲料。测量肿瘤体积,并进行生物发光成像以监测肿瘤负荷。每2或3周测量一次血浆2-HG水平。在最后一次随访时,评估肿瘤内2-HG水平、肿瘤重量以及CDKN1C表达(通过qRT-PCR和免疫组织化学检测)。 [2] 在 IDH1 R132H 突变的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 (PDX) 模型中,给予 DS-1001b 以显示其抗肿瘤作用并降低肿瘤内 2-HG 的含量。所提供的文本中未详细说明具体的给药方案,但该化合物对皮下 A1074 PDX 模型有效。[3]
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| 药代性质 (ADME/PK) |
DS-1001b 是一种口服生物利用度高的化合物。[2]
- 使用放射性标记的 [14C] DS-1001a 在小鼠中测试了该化合物的脑暴露情况。结果表明,DS-1001a(DS-1001b 的活性部分)能够穿透血脑屏障 (BBB)。[3] - 在小鼠异种移植模型中,DS-1001b 的血浆浓度范围为 2.4-10.4 µM。[2] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
- 在小鼠异种移植模型中,连续给药DS-1001b长达6周不会引起体重减轻或其他严重副作用,表明长期连续给药在临床上是可行的。[2]
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
DS-1001b 是一种临床研究药物。一项针对携带 IDH1 突变的胶质瘤患者的 I 期临床试验正在进行中(ClinicalTrials.gov 注册号:NCT03030066)。[2][3]
- DS-1001b 的专利申请已根据《专利合作条约》公开,公开号为 WO2016/052697 A1。[2] - 该化合物是 DS-1001a 的叔丁胺盐。[3] - 该化合物对突变型 IDH1 具有高度选择性,对野生型 IDH1 和突变型及野生型 IDH2 均无明显选择性。其对野生型 IDH1 的 IC50 为 180 nM,对所有测试的 IDH2 形式的 IC50 均大于 10,000 nM。[3] |
| 分子式 |
C29H29CL3FN3O4
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|---|---|
| 分子量 |
608.91566824913
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| 精确质量 |
607.12
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| CAS号 |
1898207-64-1
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| 相关CAS号 |
Safusidenib;1898206-17-1
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| PubChem CID |
139600317
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| tPSA |
111
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
7
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
40
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| 分子复杂度/Complexity |
859
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
ClC1C=C(C=C(C=1C1C(C(N2C=C(C)C3C(/C=C/C(=O)O)=CC=CC2=3)=O)=C(C(C)(C)F)ON=1)Cl)Cl.NC(C)(C)C
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| InChi Key |
UPPAAWQBZQBNIE-USRGLUTNSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C25H18Cl3FN2O4.C4H11N/c1-12-11-31(17-6-4-5-13(19(12)17)7-8-18(32)33)24(34)21-22(30-35-23(21)25(2,3)29)20-15(27)9-14(26)10-16(20)281-4(2,3)5/h4-11H,1-3H3,(H,32,33)5H2,1-3H3/b8-7+
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| 化学名 |
t-Butylamine (E)-3-(1-(5-(2-fluoropropan-2-yl)-3-(2,4,6-trichlorophenyl)isoxazole-4-carbonyl)-3-methyl-1H-indol-4-yl)acrylate
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| 别名 |
DS-1001B DS 1001B DS1001B DS-1001 DS 1001 DS1001.
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~29 mg/mL (~47.63 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.42 mg/mL (3.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 24.2 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.42 mg/mL (3.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 24.2 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.6423 mL | 8.2113 mL | 16.4225 mL | |
| 5 mM | 0.3285 mL | 1.6423 mL | 3.2845 mL | |
| 10 mM | 0.1642 mL | 0.8211 mL | 1.6423 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。