EACC

别名: EACC; 864941-31-1; ethyl (2-(5-nitrothiophene-2-carboxamido)thiophene-3-carbonyl)carbamate; Ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate;
目录号: V29033 纯度: ≥98%
EACC 是一种可逆的自噬抑制剂,可阻止自噬通量。
EACC CAS号: 864941-31-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
EACC 是一种可逆的自噬抑制剂,可阻止自噬通量。 EACC选择性抑制自噬体特异性SNARE Stx17的易位,从而阻止自噬体和溶酶体的融合。
生物活性&实验参考方法
靶点
Autophagy
体外研究 (In Vitro)
EACC 不影响内溶酶体活性,但会抑制自噬体-溶酶体融合 [1]。通过阻止 SNARE Stx17 加载自噬体,EACC 限制了自噬体融合 [1]。 RAB、系绳和溶酶体功能性 SNARE 不受 EACC 影响,尽管 EACC 阻止它们与 LC3 和 Stx17 相互作用 [1]。
自噬是一种进化上保守的细胞内溶酶体降解途径。这是一个涉及双膜自噬体从头形成的多步骤过程,自噬体捕获细胞质成分(货物)并最终与溶酶体融合,其中货物被降解,从而产生更简单的生物分子被循环利用。除了自噬功能外,一些自噬相关蛋白还在其他囊泡运输途径的界面上起作用。因此,开发不干扰内溶酶体运输的特异性自噬调节剂具有独特的挑战。在本文中,我们报道了一种新的小分子EACC,它通过阻断自噬体与溶酶体的融合来抑制自噬通量。引人注目的是,与其他晚期抑制剂不同,EACC对溶酶体特性或内吞介导的EGF受体降解没有任何影响。EACC影响SNAREs Stx17和SNAP29在自噬体上的易位,但不阻碍自噬体的完成。EACC处理还降低了Stx17与HOPS亚基VPS33A和同源溶酶体R-SNARE VAMP8的相互作用。有趣的是,尽管EACC的这种作用非常强大,但它是可逆的,因此EACC可以用作研究自噬体SNARE运输的工具。我们的研究结果提出了一种通过阻断自噬体SNAREs的作用来阻断自噬通量的新方法。 [1]
细胞实验
CellTiter-Glo细胞活力测定[1]
采用CellTiter-Glo细胞活力法检测化合物的毒性。对HeLa细胞进行计数,等量(1500个/孔)接种于384孔板中的生长培养基中。第二天,在饥饿培养基中混合100 nM ~ 100 μM范围内不同浓度的EACC,加入到细胞中,孵育5小时。5小时后,每孔加入CellTiter-Glo Reagent,使用Varioskan Flash测量发光。
EGFR贩运[1]
HeLa细胞被镀在六孔板上并允许附着。第二天,用PBS洗涤细胞,然后在DMEM(无血清培养基)中饥饿3小时。用<强>EACC预处理1小时,然后用100 ng/ml EGF脉冲细胞,并在0,1 -,2-和3-h间隔收集样本。
参考文献
[1]. Vats S, et al. A reversible autophagy inhibitor blocks autophagosome-lysosome fusion by preventing Stx17 loading onto autophagosomes. Mol Biol Cell. 2019 Aug 1;30(17):2283-2295.
其他信息
EACC介导的自噬通量阻断最显著的特征是Stx17向自噬体的装载受损。据我们所知,目前尚无其他报道指出存在任何能够选择性阻止Stx17转位从而使自噬体“丧失融合能力”的自噬化学调节剂。Stx17转位至完整自噬体的确切机制尚不十分清楚。最近的一项研究表明,Stx17通过与小GTP酶IRGM和哺乳动物ATG8蛋白相互作用而被募集到自噬体上(Kumar等,2018)。虽然我们尚未验证EACC是否会影响Stx17与IRGM的相互作用,但我们认为,在EACC存在或不存在的情况下鉴定Stx17的结合蛋白,可能有助于揭示EACC的靶点,并有助于鉴定可能参与Stx17募集到自噬体上的其他辅助因子。此外,我们还证明EACC的作用是可逆的。洗脱EACC后,自噬通量的阻滞消失,因为Stx17此时能够转位至自噬体并参与进一步的融合事件。因此,由于其作用的可逆性,EACC可作为研究Stx17转运的有效工具。[1]
为了测定自噬通量,通常使用溶酶体抑制剂,例如BafA1和氯喹。然而,这些处理方法并不理想,因为它们不仅会损害溶酶体功能,还会阻碍包括内吞-溶酶体转运在内的所有其他溶酶体途径。我们的结果还表明,EACC的作用特异性地针对自噬体,并不影响溶酶体的pH值、功能或内吞转运。它也不影响溶酶体SNARE或RAB的定位。此外,即使是像渥曼青霉素和3-甲基腺嘌呤这样已知的早期自噬抑制剂也具有非特异性,因为它们会阻断所有磷脂酰肌醇3-激酶依赖的信号通路,从而导致一系列副作用。在这种情况下,使用EACC抑制Stx17转位,从而特异性地阻断自噬,可能是进行自噬通量实验的一种更精确的方法。事实上,沉默Stx17的表达被认为是选择性抑制自噬通量的理想方法(Hegedus等人,2013)。总之,像EACC这样的分子可以填补该领域因缺乏特异性自噬抑制剂而存在的空白。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H11N3O6S2
分子量
369.372940301895
精确质量
369.008
元素分析
C, 42.27; H, 3.00; N, 11.38; O, 25.99; S, 17.36
CAS号
864941-31-1
PubChem CID
3704668
外观&性状
Typically exists as Light yellow to yellow solid at room temperature
LogP
3.3
tPSA
187
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
526
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(OCC)NC(C1=C(NC(C2=CC=C([N+]([O-])=O)S2)=O)SC=C1)=O
InChi Key
ISLJZDYAPAUORR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H11N3O6S2/c1-2-22-13(19)15-10(17)7-5-6-23-12(7)14-11(18)8-3-4-9(24-8)16(20)21/h3-6H,2H2,1H3,(H,14,18)(H,15,17,19)
化学名
ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate
别名
EACC; 864941-31-1; ethyl (2-(5-nitrothiophene-2-carboxamido)thiophene-3-carbonyl)carbamate; Ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~16.88 mg/mL (~45.70 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.69 mg/mL (4.58 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.9 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7073 mL 13.5366 mL 27.0731 mL
5 mM 0.5415 mL 2.7073 mL 5.4146 mL
10 mM 0.2707 mL 1.3537 mL 2.7073 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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