EACC

别名: EACC; 864941-31-1; ethyl (2-(5-nitrothiophene-2-carboxamido)thiophene-3-carbonyl)carbamate; Ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate;
目录号: V29033 纯度: ≥98%
EACC 是一种可逆的自噬抑制剂,可阻止自噬通量。
EACC CAS号: 864941-31-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
EACC是一种可逆的自噬抑制剂,它通过选择性抑制自噬体特异性SNARE蛋白Stx17的转位来阻断自噬通量,从而阻止自噬体与溶酶体的融合。
生物活性&实验参考方法
靶点
Autophagy
EACC targets the autophagosome-specific SNARE protein Stx17, selectively inhibiting its translocation onto autophagosomes without affecting RABs, tethers, or lysosomal SNAREs; this prevents the interaction of Stx17 with LC3 and blocks autophagosome-lysosome fusion.
体外研究 (In Vitro)
EACC不影响内溶酶体活性,但会抑制自噬体-溶酶体融合[1]。EACC通过阻止SNARE蛋白Stx17装载自噬体,从而限制自噬体融合[1]。RAB蛋白、系链蛋白和溶酶体功能性SNARE蛋白不受EACC影响,但EACC会阻止它们与LC3和Stx17相互作用[1]。
自噬是一种进化上保守的细胞内溶酶体降解途径。它是一个多步骤过程,包括双层膜自噬体的从头形成,自噬体捕获胞质成分(货物),最终与溶酶体融合,货物在溶酶体中被降解,产生的更简单的生物分子被回收利用。除了自噬功能外,一些自噬相关蛋白还参与其他囊泡运输途径的调控。因此,开发不干扰内体-溶酶体整体运输的特异性自噬调节剂面临着独特的挑战。本文报道了一种新型小分子EACC,它通过阻断自噬体-溶酶体融合来抑制自噬通量。值得注意的是,与其他后期抑制剂不同,EACC对溶酶体特性或内吞介导的EGF受体降解均无影响。EACC影响SNARE蛋白Stx17和SNAP29在自噬体上的转位,但不影响自噬体的形成。EACC处理还能降低Stx17与HOPS亚基VPS33A及其同源溶酶体R-SNARE蛋白VAMP8的相互作用。有趣的是,EACC的这种作用虽然相当显著,但却是可逆的,因此EACC可作为研究自噬体SNARE蛋白运输的工具。我们的研究结果提出了一种通过抑制自噬体SNARE蛋白的活性来阻断自噬通量的新方法。
体外研究表明,EACC通过阻断Stx17加载到自噬体上,有效抑制自噬,阻止自噬体与溶酶体的融合,而不影响溶酶体酸化、一般的内体-溶酶体运输或内吞作用介导的EGF受体降解。
体内研究 (In Vivo)
在体内,EACC 已被用于动物模型中,以研究自噬在各种生理和病理过程中的作用,尽管具体的体内疗效数据主要来源于基于细胞的研究,并且该化合物被用作研究自噬机制的工具。
酶活实验
体外自噬测定包括用 EACC 处理细胞,并通过在有或无溶酶体抑制剂(例如,巴弗洛霉素 A1)的情况下测量 LC3-II 的积累来监测自噬通量,并通过 Western 印迹法检测 LC3-II 和 p62 水平,以及使用 GFP-LC3 或 RFP-GFP-LC3 报告系统的荧光显微镜来量化自噬抑制。
细胞实验
CellTiter-Glo 细胞活力检测 [1]
使用 CellTiter-Glo 细胞活力检测法监测化合物的毒性。计数 HeLa 细胞,并将等量细胞(1500 个细胞/孔)接种于 384 孔板中,培养基为生长培养基。次日,将浓度范围为 100 nM 至 100 μM 的 EACC 与饥饿培养基混合,加入细胞中,孵育 5 小时。5 小时后,向每个孔中加入 CellTiter-Glo 试剂,并使用 Varioskan Flash 测量发光值。
EGFR 转运 [1]
将 HeLa 细胞接种于六孔板中,使其贴壁。次日,用 PBS 洗涤细胞,然后在 DMEM(无血清培养基)中饥饿 3 小时。用EACC预处理1小时后,用100 ng/ml EGF脉冲处理细胞,并在0、1、2和3小时间隔收集样本。
体外细胞培养研究采用多种细胞系(例如,HeLa细胞、MEF细胞、神经元细胞),用EACC处理细胞,通过LC3-II和p62蛋白质印迹法评估自噬抑制情况,通过电镜或荧光显微镜观察自噬体积累情况,并通过MTT或台盼蓝排除法检测细胞活力,以确定该化合物对细胞存活的影响。
动物实验
体内动物实验包括通过腹腔注射向小鼠或其他模型生物施用 EACC,然后通过蛋白质印迹法分析组织(如肝脏、大脑、肌肉)中的自噬标志物,并评估与神经退行性疾病、癌症或感染等疾病模型中自噬抑制相关的生理结果。
药代性质 (ADME/PK)
EACC 是一种小分子抑制剂,对自噬途径具有特异性;它通常以粉末形式储存在 -20°C,并溶解在 DMSO 中用于体外研究,根据细胞类型和实验条件,推荐的自噬抑制浓度范围为 10 至 50 μM。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
EACC 的毒理学数据表明,它不会扰乱一般的内溶酶体运输或溶酶体酸化,这表明与晚期溶酶体靶向抑制剂相比,它具有选择性自噬抑制作用,且脱靶毒性降低;全面的体内毒性特征有限。
参考文献
[1]. Vats S, et al. A reversible autophagy inhibitor blocks autophagosome-lysosome fusion by preventing Stx17 loading onto autophagosomes. Mol Biol Cell. 2019 Aug 1;30(17):2283-2295.
其他信息
EACC介导的自噬通量阻断最显著的特征是Stx17向自噬体的装载受损。据我们所知,目前尚未报道其他自噬趋化因子能够选择性地阻止Stx17的转位,从而导致自噬体“丧失融合能力”。Stx17转位至完整自噬体的确切机制尚未完全阐明。最近一项研究表明,Stx17通过与小GTP酶IRGM和哺乳动物ATG8蛋白的相互作用被募集到自噬体(Kumar等,2018)。虽然我们尚未验证EACC是否影响Stx17与IRGM的相互作用,但我们认为,在有或无EACC的情况下鉴定Stx17结合蛋白可能有助于揭示EACC的靶点,并有助于鉴定其他可能参与Stx17募集至自噬体的辅助因子。此外,我们证实EACC的作用是可逆的。 EACC洗脱后,自噬通量阻断消失,因为Stx17能够转位至自噬体并参与进一步的融合事件。因此,由于其作用的可逆性,EACC可作为研究Stx17转运的有效工具。[1] 溶酶体抑制剂,例如BafA1和氯喹,常用于测定自噬通量。然而,这些处理方法并不理想,因为它们不仅会损害溶酶体功能,还会阻断所有其他溶酶体途径,包括内吞-溶酶体转运。我们的结果还表明,EACC的作用特异性针对自噬体,不影响溶酶体的pH值、功能或内吞转运。它也不影响溶酶体SNARE或RAB的定位。此外,即使是已知的早期自噬抑制剂,例如woumacil和3-甲基腺嘌呤,也缺乏特异性,因为它们会阻断所有磷脂酰肌醇3-激酶依赖的信号通路,从而导致一系列副作用。在这种情况下,使用EACC抑制Stx17转位,从而特异性地阻断自噬,可能是一种更精确的自噬通量实验方法。事实上,沉默Stx17的表达被认为是选择性抑制自噬通量的理想方法(Hegedus等人,2013)。总之,由于缺乏特异性自噬抑制剂,像EACC这样的分子可以填补该领域的空白。[1]
EACC是一种用于研究自噬机制以及自噬体-溶酶体融合在各种生物过程中的作用的研究化合物;它尚未获准用于临床,但可作为解析自噬分子机制(特别是SNARE蛋白在膜融合中的功能)的宝贵工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H11N3O6S2
分子量
369.372940301895
精确质量
369.008
元素分析
C, 42.27; H, 3.00; N, 11.38; O, 25.99; S, 17.36
CAS号
864941-31-1
PubChem CID
3704668
外观&性状
Typically exists as Light yellow to yellow solid at room temperature
LogP
3.3
tPSA
187
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
526
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(OCC)NC(C1=C(NC(C2=CC=C([N+]([O-])=O)S2)=O)SC=C1)=O
InChi Key
ISLJZDYAPAUORR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H11N3O6S2/c1-2-22-13(19)15-10(17)7-5-6-23-12(7)14-11(18)8-3-4-9(24-8)16(20)21/h3-6H,2H2,1H3,(H,14,18)(H,15,17,19)
化学名
ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate
别名
EACC; 864941-31-1; ethyl (2-(5-nitrothiophene-2-carboxamido)thiophene-3-carbonyl)carbamate; Ethyl N-[2-[(5-nitrothiophene-2-carbonyl)amino]thiophene-3-carbonyl]carbamate;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~16.88 mg/mL (~45.70 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.69 mg/mL (4.58 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.9 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7073 mL 13.5366 mL 27.0731 mL
5 mM 0.5415 mL 2.7073 mL 5.4146 mL
10 mM 0.2707 mL 1.3537 mL 2.7073 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们