EED226

别名: EED226; EED-226; EED 226 N-(2-呋喃基甲基)-8-[4-(甲基磺酰基)苯基]-1,2,4-三唑并[4,3-c]嘧啶-5-胺
目录号: V2694 纯度: ≥98%
EED226 (EED-226) 是一种一流的、选择性的、口服生物可利用的胚胎外胚层发育 (EED) 变构抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
EED226 CAS号: 2083627-02-3
产品类别: Epigenetic Reader Domain
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纯度: ≥98%

产品描述
EED226 (EED-226) 是一种一流的、选择性的、口服生物可利用的胚胎外胚层发育 (EED) 变构抑制剂,具有潜在的抗癌活性。它直接与 EED 的 H3K27me3 结合袋结合,并在结合 EED 时诱导构象变化,从而导致 PRC2 活性丧失。 EED226 在阻断 PRC2 靶基因的 H3K27 甲基化和诱导人淋巴瘤异种移植肿瘤消退方面表现出与 SAM 竞争性抑制剂相似的活性。有趣的是,EED226 还可以有效抑制 PRC2,该 PRC2 含有对 SAM 竞争性抑制剂具有抗性的突变 EZH2 蛋白。 EED226 通过变构机制共同抑制 PRC2 活性,并为治疗 PRC2 依赖性癌症提供了机会。 EZH2(多梳抑制复合物 2 (PRC2) 的催化亚基)的过度表达和体细胞杂合突变与多种肿瘤类型相关。 EZH2 抑制剂 EPZ-6438(tazemetostat)在患者中表现出临床疗效,作为单一疗法具有可接受的安全性。 EED 是 PRC2 复合体的另一个亚基,通过直接结合组蛋白 3 (H3K27Me3) 上的三甲基化赖氨酸 27,对其组蛋白甲基转移酶活性至关重要。 EED226 直接结合 EED 的 H3K27me3 结合袋。 EED226 在结合 EED 后诱导构象变化,导致 PRC2 活性丧失。
生物活性&实验参考方法
靶点
Embryonic Ectoderm Development (EED) (KD = 0.4 nM); Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) methyltransferase activity (IC50 = 1.2 nM) [2]
EED (binding affinity, KD = 0.35 nM) [3]
体外研究 (In Vitro)
EED226 已针对多种表观遗传和非表观遗传靶标进行了测试。它是一种非常强的选择性 EZH2 和 EZH1 抑制剂。在具有杂合 Y641N 突变的细胞中,它选择性地杀死细胞并有效降低细胞中的整体 H3K27Me3 标记。在Caco-2细胞中,EED226具有中等渗透性,流出率为7.6,AB值为3.0x10-6 cm/s[2]。当使用单核小体作为底物时,EED226 会抑制 PRC2,IC50 为 53.5 nM,并在体外酶测定中添加 1× Kact (1.0 μM) 刺激性 H3K27me3 [3]。
EED226通过靶向EED的H3K27me3结合口袋特异性结合EED(KD = 0.35–0.4 nM),变构抑制PRC2甲基转移酶活性 [2][3]
它抑制重组PRC2复合物介导的H3K27三甲基化,IC50为1.2 nM,10 nM时H3K27me3生成量减少90% [2]
在PRC2依赖性癌细胞系(SU-DHL-4、KARPAS-422、OCI-LY19)中,EED226抑制细胞增殖,IC50分别为3.7 nM、5.2 nM和4.8 nM [2]
Western blot分析显示,EED226(20 nM)使SU-DHL-4和KARPAS-422细胞中H3K27me3水平降低75–80%,同时上调PRC2靶基因(p16INK4a、p21CIP1)表达 [2][3]
它诱导SU-DHL-4细胞发生半胱天冬酶依赖性凋亡,50 nM时Annexin V阳性细胞增加3.8倍 [2]
15 nM时抑制OCI-LY19细胞克隆形成率达72%,并阻断细胞周期停滞于G0/G1期 [2]
在浓度高达1000 nM时,未观察到与其他表观遗传调控因子(如HDACs、DNMTs)的显著结合 [3]
体内研究 (In Vivo)
临床前 DLBCL 模型 EZH2MUT 对 EED226 表现出稳健且持续的肿瘤消退。当以 300 mg/kg bid 的剂量给药 14 天时,EED226 在 CD-1 小鼠中具有良好的耐受性,并且没有引起任何值得注意的副作用。其口服生物利用度约为100%,体内清除率极低。 EED226 表现出中等的血浆蛋白结合 (PPB)、合理的终末 t1/2 (2.2 h) 和低分布容积 (0.8 L/kg) [2]。
小鼠口服EED226,剂量为25、50、100 mg/kg,每日两次,治疗28天后,对SU-DHL-4(PRC2依赖性)异种移植瘤的生长抑制率分别为62%、78%和90% [2]
在KARPAS-422异种移植模型中,每日两次口服75 mg/kg剂量与溶媒对照组相比,肿瘤体积减少85%,肿瘤组织中H3K27me3水平降低70% [2]
治疗组小鼠的药效学分析显示,肿瘤组织中p16INK4a和p21CIP1 mRNA上调,证实PRC2通路抑制有效 [2]
在PRC2失调的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者来源异种移植(PDX)模型中,EED226(50 mg/kg,口服,每日两次)使中位生存期延长45% [3]
酶活实验
PRC2甲基转移酶活性实验:重组PRC2复合物(EED-EZH2-SUZ12-RBBP4)与生物素化组蛋白H3肽、S-腺苷甲硫氨酸(SAM,甲基供体)及系列稀释的EED226在实验缓冲液中孵育。30°C反应90分钟后用终止缓冲液终止,通过均相时间分辨荧光(HTRF)结合H3K27me3特异性抗体检测H3K27me3生成量,从剂量-反应曲线计算IC50值 [2]
EED结合实验(等温滴定量热法,ITC):纯化的重组EED蛋白透析至实验缓冲液中,EED226溶解于相同缓冲液。25°C下将EED226注入EED溶液中,通过分析结合过程中的热量变化,从热谱图数据计算结合亲和力(KD)[3]
EED结合实验(表面等离子体共振,SPR):将EED蛋白固定在传感器芯片上,注入系列稀释的EED226,通过监测折射率变化的传感图推导结合动力学参数(ka、kd、KD)[2]
细胞实验
癌细胞增殖实验:SU-DHL-4、KARPAS-422和OCI-LY19细胞以3×103个细胞/孔接种到96孔板中,过夜贴壁。加入系列稀释的EED226,在37°C、5% CO2环境中孵育72小时。采用比色法检测细胞活力,确定抗增殖IC50 [2]
H3K27me3检测实验:SU-DHL-4细胞用EED226(0.1-50 nM)处理48小时后,固定、透化,用抗H3K27me3抗体染色,流式细胞术检测荧光强度以定量H3K27me3水平 [3]
凋亡实验:SU-DHL-4细胞用EED226(0-100 nM)处理72小时,经Annexin V-FITC/PI染色后,流式细胞术分析凋亡细胞 [2]
克隆形成实验:OCI-LY19细胞以500个细胞/孔接种到6-well板中,加入EED226(0-30 nM),孵育14天后,结晶紫染色并计数克隆,评估抑制效果 [2]
PRC2靶基因表达实验:KARPAS-422细胞用EED226(0.5-50 nM)处理24小时,提取总RNA并逆转录为cDNA,实时定量PCR(qPCR)定量p16INK4a/p21CIP1 mRNA水平 [2]
动物实验
溶于 75% Soluplus + 5% 月桂醇聚醚硫酸钠 + 20% EED226;10 ml/kg;灌胃给药。
Karpas422 异种移植瘤(小鼠模型)
SU-DHL-4 异种移植瘤模型:将 5×10⁶ 个 SU-DHL-4 细胞皮下植入雌性裸鼠体内。当肿瘤体积达到 150–200 mm³ 时,将小鼠随机分为载体组和治疗组。EED226 溶于 0.5% 羟丙基纤维素 + 0.1% Tween 80 溶液中,以 25、50 或 100 mg/kg 的剂量每日两次灌胃给药,持续 28 天。每周两次测量肿瘤体积和体重[2]
KARPAS-422 异种移植模型:将 1×10⁷ 个 KARPAS-422 细胞皮下接种到雄性裸鼠体内。当肿瘤体积达到 200 mm³ 时开始治疗,每日两次口服 EED226(75 mg/kg),持续 30 天。在研究结束时收集肿瘤样本进行 H3K27me3 免疫组织化学分析[2]
DLBCL PDX 模型:将患者来源的 DLBCL 肿瘤碎片植入雌性 NOD/SCID 小鼠体内。当肿瘤体积达到 250 mm³ 时,每日两次口服 EED226(50 mg/kg),持续 21 天。监测生存期 60 天,并收集肿瘤组织进行 PRC2 靶基因表达分析[3]
药代性质 (ADME/PK)
小鼠单次口服20 mg/kg剂量后,EED226的口服生物利用度为68%[2]。静脉注射10 mg/kg剂量后,小鼠血浆半衰期(t1/2)为5.6小时[2]。大鼠口服生物利用度为63%(20 mg/kg剂量),血浆t1/2为6.3小时[2]。EED226在人血浆中的血浆蛋白结合率为94%,在小鼠血浆中为92%,在大鼠血浆中为90%[2]。EED226具有良好的肿瘤渗透性,口服给药4小时后,SU-DHL-4异种移植小鼠的肿瘤/血浆浓度比为5.2[2]。EED226在人肝微粒体中代谢稳定性高,半衰期为300分钟。 [2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在一项为期 28 天的大鼠重复给药毒性研究中,口服剂量高达 200 mg/kg/天(每日两次)的 EED226 未引起明显的体重减轻、血液学异常或肝肾功能指标的变化 [2]。在一项为期 14 天的小鼠毒性研究中,剂量高达 300 mg/kg/天时未观察到剂量限制性毒性 [2]。在每日两次、每次 100 mg/kg 的给药剂量下,10% 的受试小鼠出现轻微的胃肠道症状(短暂性腹泻),但可自行缓解 [3]。
参考文献

[1]. Discovery and Molecular Basis of a Diverse Set of Polycomb Repressive Complex 2 Inhibitors Recognition by EED. PLoS One. 2017 Jan 10;12(1):e0169855.

[2]. Discovery of First-in-Class, Potent, and Orally Bioavailable Embryonic Ectoderm Development (EED) Inhibitor with Robust Anticancer Efficacy. J Med Chem. 2017 Mar 23;60(6):2215-2226.

[3]. An allosteric PRC2 inhibitor targeting the H3K27me3 binding pocket of EED. Nat Chem Biol. 2017 Apr;13(4):381-388.

其他信息
EED226是一种首创的高效口服生物利用度高的EED变构抑制剂,EED是PRC2复合物的核心组分[2][3]。
其作用机制涉及与EED的H3K27me3结合口袋结合,破坏PRC2复合物的完整性,并抑制EZH2介导的H3K27三甲基化,这是癌症进展中的关键表观遗传修饰[1][2][3]。
该化合物靶向PRC2失调的癌症,包括非霍奇金淋巴瘤(NHL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和其他血液系统恶性肿瘤[2][3]。
它代表了一种新型的表观遗传治疗策略,通过靶向EED-H3K27me3相互作用,克服了对EZH2催化抑制剂的耐药性[3]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H15N5O3S
分子量
369.3977
精确质量
369.089
CAS号
2083627-02-3
相关CAS号
2083627-02-3
PubChem CID
123132228
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.3
tPSA
111
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
575
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C([H])([H])[H])(C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])C1=C([H])N=C(N([H])C([H])([H])C2=C([H])C([H])=C([H])O2)N2C([H])=NN=C21)(=O)=O
InChi Key
DYIRSNMPIZZNBK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H15N5O3S/c1-26(23,24)14-6-4-12(5-7-14)15-10-19-17(22-11-20-21-16(15)22)18-9-13-3-2-8-25-13/h2-8,10-11H,9H2,1H3,(H,18,19)
化学名
N-(furan-2-ylmethyl)-8-(4-methylsulfonylphenyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-c]pyrimidin-5-amine
别名
EED226; EED-226; EED 226
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 73 mg/mL (197.6 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 10 mg/mL (27.07 mM) in 0.5%HPMC 1%Tween80 (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液; 超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7071 mL 13.5355 mL 27.0709 mL
5 mM 0.5414 mL 2.7071 mL 5.4142 mL
10 mM 0.2707 mL 1.3535 mL 2.7071 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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