EN6

别名: EN6 EN-6 EN 6 N-[4-氟-3-(丙-2-烯酰胺)苯基]-1-(2-氟苯基)-1H-吡唑-4-甲酰胺
目录号: V32198 纯度: ≥98%
EN6 是一种小分子体内自噬激活剂,共价靶向溶酶体液泡 H+ ATP 酶 (v-ATP 酶) ATP6V1A 亚基中的半胱氨酸 277。
EN6 CAS号: 1808714-73-9
产品类别: Autophagy
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
EN6 是一种小分子体内自噬激活剂,共价靶向溶酶体液泡 H+ ATP 酶 (v-ATP 酶) ATP6V1A 亚基中的半胱氨酸 277。 EN6 介导的 ATP6V1A 修饰使 v-ATPase 与 Rags 解偶联,从而抑制 mTORC1 信号传导、增加溶酶体酸化和激活自噬。 EN6 以溶酶体依赖性方式清除 TDP-43 聚集物,这是额颞叶生物可利用性痴呆的致病因子。
生物活性&实验参考方法
靶点
Autophagy; ATP6V1A subunit of the lysosomal v-ATPase
体外研究 (In Vitro)
EN6(50 μM;1、4、8 小时)会触发 HEK293A 细胞中时间和剂量依赖性 LC3 的产生,并增加 LC3BII 水平 [1]。在 HEK293A 细胞中,EN6(25 μM;1 小时)抑制 mTORC1 溶酶体定位和激活,导致自噬体和自噬 [1]。在 GFP-TDP43 U2OS 骨肉瘤细胞系模型中,EN6(50 μM;4 小时)刺激 HEK293A 细胞中的 v-EN6(25 μM;7 小时),以支持 IPTG 诱导的蛋白质聚集体自噬清除 [1]。
体内研究 (In Vivo)
在体内,EN6(50 mg/kg;腹腔注射;单次)抑制 mTORC1 并促进自噬 [1]。
酶活实验
体外v-ATP酶测定[1]
简言之,将两个15cm汇合的HEK293T细胞与30μg/ml与Oregon Green 514(Dx-OG514,Invitrogen)缀合的70 kDa葡聚糖孵育过夜。第二天,洗涤细胞并在无血清DMEM中追逐2小时,以允许Dx-OG514的溶酶体积累。裂解前15分钟,加入1μM FCCP以消散溶酶体pH梯度。然后收获细胞,并使用23G针在部分缓冲液中机械破碎:140mM KCl、1mM EGTA、20mM HEPES、50mM蔗糖(pH 7.4),补充有5mM葡萄糖、蛋白酶抑制剂和1μM FCCP。将溶解的细胞在4°C下以1700rpm离心10分钟,并收集上清液。将得到的核后上清液(PNS)在4°C下以最大速度旋转,得到含有器官部分的沉淀。将每个级分重悬于180μl不含FCCP的分馏缓冲液中,并转移到96多孔(黑色)中。在SpectraMax i3中以30秒的间隔在490nm激发后,在530nm处收集基线荧光,持续5分钟。将各种化合物加入每个孔中,然后加入5mM ATP和MgCl2,并在45分钟内恢复荧光读数。由于v-ATP酶的溶酶体再酸化,Dx-OG514的荧光发射随时间呈指数衰减。
细胞实验
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: HEK293A 细胞
测试浓度: 50 μM
孵育时间: 1 、4、8 小时
实验结果:时间和剂量依赖性触发 LC3 斑点形成并增加 LC3BII 水平。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: HEK293A 细胞
测试浓度: 25 μM
孵育时间: 1 小时
实验结果: 导致 mTORC1 信号传导完全失活,例如经典底物、S6 激酶 1 (S6K1)、4EBP1 和 ULK1 的磷酸化。

免疫荧光 [1]
细胞类型: HEK293A 细胞
测试浓度: 50 μM
孵育时间: 4 h
实验结果:导致HEK293A细胞中溶酶体酸化显着增加,而这种增强的酸化被BafA1阻断。

免疫荧光[1]
细胞类型: IPTG诱导的 GFP-TDP43 U2OS 骨肉瘤细胞系模型
测试浓度: 25 μM
孵育持续时间:7小时
实验结果:IPTG诱导的TDP43聚集体减少了75%。
动物实验
Animal/Disease Models: Sixweeks old male C57BL/6 mice [1].
Doses: 50 mg/kg
Route of Administration: intraperitoneal (ip) injection; Single
Experimental Results:Significant inhibition of mTORC1 signaling in skeletal muscle and heart, as evidenced by diminished phosphorylation of S6, 4EBP1, and ULK1. Increased LC3BII levels and diminished p62 levels indicate strong activation of autophagy.
Assessing mTORC1 inhibition in vivo and pharmacokinetics of EN6 in mice [1]
6-week-old male C57BL/6 mice (Jackson Laboratory) were injected intraperitoneally with solvent control, EN6 (50 mg/kg) or rapamycin (10 mg/kg) in saline/ethanol/PEG-40 (v/v/v = 18:1:1). After 4 h, mice were euthanized, and tissues were harvested and lysed in lysis buffer (1% Triton X-100, 10 mM β-glycerol phosphate, 10 mM sodium pyrophosphate, 4 mM EDTA, 40 mM HEPES at pH 7.4, and 1 tablet of EDTA-free protease inhibitors per 50 ml) at 4 °C for 30 min. The lysates were cleared by centrifugation in a microcentrifuge at 21,130 g for 10 minutes at 4 °C and protein concentration of supernatant was determined by BCA assay. The lysates were then diluted to 1.5 mg/mL, mixed with 4× sample buffer, heated at 95 °C for 5 minutes, resolved by precast 4–20% TGX gels, and analyzed by immunoblotting. Antibodies were obtained from various commercial sources and dilutions were prepared per recommended manufacturers’ procedures.[1]
For pharmacokinetics studies, mice were injected intraperitoneally with solvent control or EN6 at indicated doses. At indicated time intervals, mice were euthanized, and tissues were harvested. The tissues were then weighed and homogenized, and EN6 was extracted from chloroform:methanol:PBS solution mixture (2:1:1, v/v/v; 4 mL total) with dodecylglycerol (10 nmol) as internal standard. The organic layer was collected, evaporated under stream of N2, re-dispersed in chloroform and analyzed by multiple-reaction monitoring (MRM)-based targeted LC-MS/MS on an Agilent 6430 QQQ using a Luna reverse phase C5 column (50 mm × 4.6 mm with 5 mm diameter particles, Phenomenex). Mobile phases: Buffer A, 95:5 water / methanol; Buffer B: 60:35:5 2-propanol / methanol / water, both with 0.1 % formic acid and 50 mM ammonium formate additives. Flow rate began at 0.2 mL/min for 2 min, followed by a gradient starting at 0 % B and increasing linearly to 100 % B over the course of 23 min with a flow rate of 0.4 mL/min, followed by an isocratic gradient of 100 % B for 5 min with a flow rate increasing linearly from 0.04 mL/min to 0.4 mL/min. MS analysis was performed using electrospray ionization (ESI) with a drying gas temperature of 350 °C, drying gas flow rate of 10 L/min, nebulizer pressure 35 psi, capillary voltage 3.0 kV, and fragmentor voltage 100 V. Parent/daughter ion MRM transitions used to determine EN6 levels were 369.34/163.2 and 369.34/189 with fragmentor voltage of 10 and 20, and 30 and 40, respectively. Peak area of EN6 to that of dodecylglycerol was calibrated to amount of EN6 per gram of tissues by LC-MS/MS analysis of a set of solution mixtures containing dodecylglycerol (10 nmol) and known concentrations of EN6 (0.01, 0.1, 1, 10 and 30 nmol). Data was analyzed using Agilent Qualitative Analysis software by calculating area under the curve.
参考文献
[1]. Chung CY, et al. Covalent targeting of the vacuolar H+-ATPase activates autophagy via mTORC1 inhibition. Nat Chem Biol. 2019 Aug;15(8):776-785.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₁₉H₁₄F₂N₄O₂
分子量
368.34
精确质量
368.11
元素分析
C, 61.96; H, 3.83; F, 10.32; N, 15.21; O, 8.69
CAS号
1808714-73-9
外观&性状
White to off-white solid
LogP
2.7
tPSA
76Ų
SMILES
O=C(C1=CN(C2=CC=CC=C2F)N=C1)NC3=CC=C(F)C(NC(C=C)=O)=C3
InChi Key
SUSXQEYPNDORDQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H14F2N4O2/c1-2-18(26)24-16-9-13(7-8-14(16)20)23-19(27)12-10-22-25(11-12)17-6-4-3-5-15(17)21/h2-11H,1H2,(H,23,27)(H,24,26)
化学名
N-(3-Acrylamido-4-fluorophenyl)-1-(2-fluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide
别名
EN6 EN-6 EN 6
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外)
DMSO : ~5 mg/mL (~13.57 mM)
Ethanol : ~1.11 mg/mL (~3.01 mM)
溶解度 (体内)
配方 1 中的溶解度: 10 mg/mL (27.15 mM) in 50% PEG300 +50% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7149 mL 13.5744 mL 27.1488 mL
5 mM 0.5430 mL 2.7149 mL 5.4298 mL
10 mM 0.2715 mL 1.3574 mL 2.7149 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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