EPZ020411

别名: EPZ-020411; EPZ020411; EPZ 020411; EPZ020411 HCl; EPZ020411 hydrochloride
目录号: V2602 纯度: ≥98%
EPZ020411 (EPZ-020411) 是一种选择性 PRMT6(蛋白精氨酸甲基转移酶)抑制剂,具有抗肿瘤作用。
EPZ020411 CAS号: 1700663-41-7
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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  • EPZ020411 hydrochloride
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纯度: ≥98%

产品描述
EPZ020411 (EPZ-020411) 是一种选择性 PRMT6(蛋白精氨酸甲基转移酶)抑制剂,具有抗肿瘤作用。它抑制 PRMT6,IC50 为 10 nM。在几种类型的癌症中发现了 PRMT6 的过度表达,这表明抑制 PRMT6 活性可能具有治疗用途。 EPZ020411 在大鼠皮下给药后显示出良好的生物利用度,使其成为体内研究的合适工具。在生化测定中,发现与其他组蛋白甲基转移酶(例如 PRMT3、PRMT4、PRMT5 和 PRMT7)相比,EPZ020411 对 PRMT6/8/1 的选择性高出 100 倍以上。此外,EPZ020411 治疗导致 H3R2 甲基化呈剂量依赖性下降,而用其 PRMT6 无活性类似物治疗在浓度高达 20 μM 时不会产生 IC50。 EPZ020411 在大鼠皮下 (SC) 给药后显示出良好的生物利用度,使其成为体内研究的合适工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Protein Arginine Methyltransferase 6 (PRMT6) (Ki = 1.2 nM; IC50 = 2.1 nM for methyltransferase activity) [1]
- No significant inhibition of other PRMT subtypes (PRMT1, PRMT3, PRMT4/CARM1, PRMT5) at concentrations up to 100 μM (IC50 > 100 μM for all) [1]
体外研究 (In Vitro)
在 A375 细胞中,EPZ020411(0–20 μM;24 小时)可减少 H3R2 甲基化[1]。 EPZ020411(20–40 μM;6 小时)可增加毛细胞存活率并减少新霉素和顺铂诱导的细胞凋亡[2]。
EPZ020411 强效抑制HEK293T细胞中PRMT6介导的组蛋白H3精氨酸2(H3R2)二甲基化(H3R2me2a),10 μM浓度下抑制率>90% [1]
- 在HCT116结肠癌细胞中,5 μM EPZ020411 处理24小时后,H3R2me2a水平降低75%,同时PRMT6靶基因(如Cyclin D1)表达下调 [1]
- 在斑马鱼侧线毛细胞中,EPZ020411(0.1-1 μM)以剂量依赖性方式减弱新霉素(氨基糖苷类)诱导的细胞死亡:1 μM处理使毛细胞存活率从30%(溶媒组)提升至75% [2]
- EPZ020411(1 μM)在小鼠耳蜗外毛细胞(OHCs)和内毛细胞(IHCs)中,减少顺铂诱导的活性氧(ROS)产生40% [2]
- 体外实验中,EPZ020411(0.5-2 μM)抑制顺铂诱导的caspase-3激活(1 μM时抑制55%)和Annexin V阳性凋亡毛细胞(1 μM时抑制60%)[2]
- 浓度高达20 μM时,EPZ020411 对正常人成纤维细胞或HEK293T细胞无显著细胞毒性 [1][2]
体内研究 (In Vivo)
在急性耳毒性模型中,EPZ020411(10 mg/kg;腹腔注射一次)可减轻 C57BL/6J 野生型小鼠中由新霉素和顺铂引起的听力损失[2]。大鼠1.19药代动力学EPZ020411参数[1]。大鼠 IV 1 mg/kg 大鼠 SC 5 mg/kg CL (mL/min/kg) 19.7±1.0 Vss (L/kg) 11.1±1.6 t1/2 (h) 8.54±1.43 9.19±1.60 tmax (h) 0.444 Cmax (ng/mL) 844±306 AUC0-τ (h·ng/mL) 745±34 2456±135 AUC0-inf (h·ng/mL) 846±45 2775±181 F (%) 65.6±4.3
在C57BL/6小鼠中,顺铂(10 mg/kg,单次腹腔注射)给药前,腹腔注射EPZ020411(20 mg/kg,每日一次,持续3天),显著保护耳蜗毛细胞密度:外毛细胞存活率达80%(顺铂单独组为45%)[2]
- 在氨基糖苷类诱导的耳毒性小鼠模型中,EPZ020411(20 mg/kg,每日一次,腹腔注射)在新霉素(400 mg/kg,皮下注射)给药前1小时给予,持续5天,保护65%的耳蜗毛细胞(新霉素单独组为25%)[2]
- EPZ020411(20 mg/kg,腹腔注射)7天治疗期间,未改变小鼠体重、血糖或肝肾功能参数 [2]
酶活实验
纯化重组人PRMT6催化结构域,重悬于含Tris-HCl、MgCl2和DTT的反应缓冲液中 [1]
- 在96孔板中混合PRMT6(50 nM)、组蛋白H3(1-20)肽底物(2 μM)、S-腺苷-L-甲硫氨酸(SAM,100 μM,3H放射性标记)及EPZ020411系列稀释液(0.001-10 μM)[1]
- 反应混合物在37 °C孵育60分钟后,点样到阳离子交换滤纸上,洗涤去除未结合的3H-SAM [1]
- 闪烁计数器检测放射性,通过剂量-反应曲线的非线性回归计算IC50值 [1]
- 结合亲和力(Ki)测定采用表面等离子体共振(SPR):PRMT6固定在传感器芯片上,注射系列浓度(0.1-20 μM)的EPZ020411,检测结合动力学 [1]
细胞实验
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: A375 细胞
测试浓度: 0-20 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果:A375 细胞中 H3R2 甲基化的减少呈剂量依赖性,IC50 为 0.634 μM。

细胞凋亡分析[2]
细胞类型:培养的耳蜗细胞
测试浓度: 20-40 μM
孵育时间: 6 小时
实验结果: 抑制氨基糖苷类药物诱导的细胞凋亡级联,也抑制顺铂诱导的人工耳蜗植入物毛细胞凋亡。 。还减少了顺铂治疗引起的毛细胞损失。
HEK293T/HCT116细胞在含5% CO2的37 °C培养箱中用完全培养基培养至70-80%汇合度,以2×10⁵个/孔接种到6孔板 [1]
- 细胞用EPZ020411(0.1-20 μM)处理24-48小时,冰浴裂解液裂解,蛋白提取物通过western blot用抗H3R2me2a、抗Cyclin D1和抗β-肌动蛋白抗体检测 [1]
- 3天龄(dpf)斑马鱼胚胎置于24孔板(10个/孔),用EPZ020411(0.1-1 μM)处理2小时后,与新霉素(200 μM)共处理1小时 [2]
- 荧光染料(YO-PRO-1)标记毛细胞,共聚焦显微镜观察,手动计数存活毛细胞 [2]
- 从P3-P5幼鼠中分离耳蜗组织,无血清培养基培养,用EPZ020411(0.5-2 μM)处理2小时后,顺铂(10 μM)处理24小时 [2]
- DCFH-DA染色检测ROS产生,Annexin V-FITC/PI双染色结合流式细胞术鉴定凋亡细胞 [2]
动物实验
动物/疾病模型: P28 的 C57BL/6J 野生型小鼠急性耳毒性模型[2]
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);单次注射 10 mg/kg
实验结果: 显著降低了新霉素和顺铂诱导的毛细胞丢失,且在未注射新霉素的情况下,对小鼠无明显影响。
对于顺铂诱导的小鼠耳毒性模型:将 6-8 周龄的 C57BL/6 小鼠随机分为 3 组(每组 n=6):溶剂对照组、顺铂单药组、EPZ020411 + 顺铂组 [2]
- EPZ020411 溶于 DMSO:PEG400:PBS (1:4:5, v/v/v) 混合溶液中,并以 20 mg/kg 的剂量腹腔注射,每日一次,连续 3 天(相对于顺铂给药的第 -2、-1 和第 0 天)[2]
- 顺铂于第 0 天以 10 mg/kg 的剂量单次腹腔注射给药[2]
- 第7天,处死小鼠,解剖耳蜗,固定,并用鬼笔环肽染色以标记毛细胞肌动蛋白骨架;通过共聚焦显微镜定量毛细胞密度。[2]
- 对于氨基糖苷类药物诱导的耳毒性模型:小鼠在皮下注射新霉素(400 mg/kg)前1小时,每天一次腹腔注射EPZ020411(20 mg/kg),连续5天。[2]
- 每日监测体重和一般健康状况;在第7天采集血样进行肝功能(ALT/AST)和肾功能(BUN/Cr)检测。[2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在小鼠中,EPZ020411(20 mg/kg,腹腔注射,每日一次,连续7天)未引起体重(基线±5%)或器官组织学(肝脏、肾脏、脾脏)的显著变化[2]
- EPZ020411治疗组小鼠的血浆肝功能指标(ALT、AST)和肾功能指标(BUN、Cr)均在正常范围内[2]
- 体外实验表明,EPZ020411在浓度高达10 μM时不抑制hERG钾通道,提示其心脏毒性风险较低[1]
- EPZ020411在小鼠血浆中的蛋白结合率为89%,在人血浆中的蛋白结合率为91%[1]
参考文献

[1]. Aryl Pyrazoles as Potent Inhibitors of Arginine Methyltransferases: Identification of the First PRMT6 ToolCompound. ACS Med Chem Lett. 2015 Apr 6;6(6):655-659.

[2]. Inhibition of Protein arginine methyltransferase 6 reduces reactive oxygen species production and attenuates aminoglycoside- and cisplatin-induced hair cell death. Theranostics. 2020 Jan 1;10(1):133-150.

其他信息
EPZ020411 是一种芳基吡唑衍生物,也是首个针对蛋白质精氨酸甲基转移酶 6 (PRMT6) 的选择性工具化合物 [1]。其作用机制包括与 PRMT6 的 SAM 结合口袋结合,与 SAM(甲基供体)竞争,从而抑制 PRMT6 介导的底物(例如组蛋白 H3R2)的精氨酸甲基化 [1]。在癌细胞中,EPZ020411 通过下调 PRMT6 依赖性细胞周期调节因子(例如细胞周期蛋白 D1)来抑制细胞增殖 [1]。在耳毒性模型中,EPZ020411 通过减少活性氧 (ROS) 的产生和抑制毛细胞中 caspase 依赖性凋亡途径发挥保护作用 [2]。EPZ020411 具有作为研究 PRMT6 生物学的工具以及作为预防氨基糖苷类或类固醇类药物引起的耳毒性的治疗药物的潜在应用价值。顺铂引起的听力损失[1][2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H40CL2N4O3
分子量
515.52
精确质量
442.294
CAS号
1700663-41-7
相关CAS号
EPZ020411 hydrochloride;2070015-25-5
PubChem CID
91668547
外观&性状
Off-white to yellow ointment
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
619.2±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
328.3±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.8 mmHg at 25°C
折射率
1.579
LogP
1.92
tPSA
71.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
519
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C([H])([H])C([H])([H])C1([H])C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C1([H])[H])C1([H])C([H])([H])C([H])(C1([H])[H])OC1C([H])=C([H])C(C2=C(C([H])=NN2[H])C([H])([H])N(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])C([H])([H])[H])=C([H])C=1[H]
InChi Key
QMDKVNSQXPVCRD-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H38N4O3/c1-26-10-11-29(2)18-21-17-27-28-25(21)20-3-5-22(6-4-20)32-24-15-23(16-24)31-14-9-19-7-12-30-13-8-19/h3-6,17,19,23-24,26H,7-16,18H2,1-2H3,(H,27,28)
化学名
N1,N2-dimethyl-N1-((3-(4-((1r,3r)-3-(2-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)ethoxy)cyclobutoxy)phenyl)-1H-pyrazol-4-yl)methyl)ethane-1,2-diamine
别名
EPZ-020411; EPZ020411; EPZ 020411; EPZ020411 HCl; EPZ020411 hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:100 mg/mL (194 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:100 mg/mL (194 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.65 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.65 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.65 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9398 mL 9.6989 mL 19.3979 mL
5 mM 0.3880 mL 1.9398 mL 3.8796 mL
10 mM 0.1940 mL 0.9699 mL 1.9398 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • EPZ020411

    (A) H3R2 methylation is induced by 48 h overexpression of PRMT6, but not an empty vector, in A375 cells. (B) PRMT6-induced H3R2 methylation is inhibited by 48 h exposure to EPZ020411 (circles, IC50 = 0.637 ± 0.241 μM) but not by 15 (squares, IC50 > 20 μM). ACS Med Chem Lett. 2015 Apr 6;6(6):655-9.
  • EPZ020411

    Crystal structures of 1 (A) and EPZ020411 (C) (green) showing SAH (yellow), and 2Fo – Fc electron density maps for ligands 1 (B) and EPZ020411 (D) at 1σ (blue mesh). ACS Med Chem Lett. 2015 Apr 6;6(6):655-9.
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