Fadraciclib (CYC065)

别名: CYC065; CYC-065; fadraciclib; 1070790-89-4; YET2XNU791; CYC 065
目录号: V18932 纯度: ≥98%
Fadraciclib (CYC-065) 是一种新型第二代 ATP 竞争性、口服生物利用度的细胞周期蛋白依赖性激酶 2、5 和 9(CDK2/5/9,CDK2/9 的 IC50 分别为 5 和 26 nM)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤作用和化学保护活动。
Fadraciclib (CYC065) CAS号: 1070790-89-4
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Fadraciclib (CYC-065) 是一种新型第二代 ATP 竞争性口服生物利用度抑制剂,针对细胞周期蛋白依赖性激酶 2、5 和 9(CDK2/5/9,CDK2/9 的 IC50 分别为 5 和 26 nM),潜在的抗肿瘤和化学保护活性。 CYC065 选择性结合并抑制 CDK2、5 和 9 的活性,从而抑制 CDK2、5 和 9 依赖性细胞途径,下调参与促生存途径的基因,防止 DNA 双链激活破坏修复途径,并诱导细胞周期停滞和细胞凋亡。这抑制了 CDK2/5/9 过表达的肿瘤细胞的增殖。此外,CYC065 还可以保护造血干细胞和祖细胞 (HSPC),防止骨髓抑制,并保留骨髓的功能。
Fadraciclib(CYC065)是一种新型的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂,可选择性地靶向CDK2和CDK9,其IC50值分别为5 nM和26 nM。在成功完成新药临床研究申报所需的研究后,Fadraciclib已获得美国食品药品监督管理局的许可,可进入首次人体I期临床试验。 目的:确立Fadraciclib的作用机制原理,并确定最佳给药方案,以支持其在具有特定关键分子特征且存在高度未满足医疗需求的白血病和淋巴瘤亚型中的临床开发。 设计:在源自急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病和B细胞淋巴瘤的三组细胞系中评估了Fadraciclib的活性。这些细胞系涵盖了多种分子特征,包括不同水平的Mcl-1表达/依赖性、MYC过表达或扩增以及不同的MLL基因状态。研究进行了全面的分析,以确定可作为临床患者选择生物标志物基础的细胞敏感性参数。此外,还在两种不同的AML异种移植模型中评估了Fadraciclib的体内抗肿瘤疗效。 结果:与其靶点抑制特性一致,Fadraciclib治疗导致RNA聚合酶II的磷酸化水平迅速降低,随后关键致癌靶蛋白(包括Mcl-1和MLL靶基因)下调,进而快速诱导细胞凋亡。值得注意的是,即使在敏感细胞系中,短时间的脉冲式药物暴露也足以实现≥90%的细胞死亡。与野生型细胞相比,携带MLL基因重排的血液癌细胞系对Fadraciclib表现出更高的敏感性;在野生型AML细胞中,其敏感性与Bcl-2家族蛋白的表达水平相关。此外,将Fadraciclib与Bcl-2抑制剂或标准化疗药物阿糖胞苷联合使用,可产生协同的抗白血病效应。 结论:通过利用其快速且强力下调关键致癌转录本的能力,Fadraciclib在多种存在未满足临床需求的白血病和淋巴瘤适应症中展现出显著的治疗潜力,这些适应症包括MLL易位型白血病、FLT3-ITD突变型白血病以及MYC驱动的淋巴瘤。该化合物在与标准化疗药物(如阿糖胞苷)以及靶向其他关键凋亡调节因子(如Bcl-2/Bcl-xL抑制剂)的药物联合使用时,也显示出有效的协同作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Fadraciclib (CYC065) is a second-generation, orally available ATP-competitive inhibitor of cyclin-dependent kinase 2 (CDK2) and cyclin-dependent kinase 9 (CDK9). It targets the CDK2/cyclin E1 complex, which is critical for G1-S phase transition, and CDK9, which is involved in transcriptional regulation. The study does not provide specific IC₅₀ values for these targets [1].
体外研究 (In Vitro)
Fadraciclib 使细胞停止在细胞周期的 G1 期并减少细胞发育,特别是在过度表达细胞周期蛋白 E1 (CCNE1) 的子宫浆液性癌 (USC) 中。与低 CCNE1 表达细胞系相比,表达高 CCNE1 mRNA 和蛋白质水平的 USC 细胞系对体外 Fadraciclib 治疗显着更敏感(IC50:平均值±sd = 124.1 ± CCNE1 过表达 USC 细胞系与 415 细胞系相比为 57.8 nM),并且CCNE1 低表达蛋白分别为 ±117.5 nM; P=0.0003)。重要的是,适度剂量的 Fadraciclib(即 100 nM)仅在 CCNE1 过表达 USC 细胞系(即 USC-ARK-2、USC-ARK-7)中引起细胞周期 G1 期停滞 [1]。
在原发性子宫浆液性癌细胞系中,Fadraciclib显示出强效的抗增殖活性。CCNE1扩增的USC细胞系对Fadraciclib的敏感性显著高于非扩增细胞系,平均IC₅₀值分别为124.1 ± 57.8 nM和415 ± 117.5 nM(P = 0.0003)[1]。
细胞周期分析显示,用100 nM Fadraciclib处理48小时,可特异性诱导CCNE1扩增的USC细胞系发生G1期阻滞,而非扩增细胞系则无此现象 [1]。
在更高浓度下观察到凋亡诱导:用500 nM和1000 nM Fadraciclib处理USC-ARK-7细胞6小时,Annexin V/PI阳性细胞比例分别增加1.78 ± 0.3倍和2.25 ± 0.7倍 [1]。
在USC-ARK-2细胞中使用siRNA敲低CCNE1,导致Fadraciclib的IC₅₀较对照细胞增加9.29倍(P = 0.021),证实了靶点特异性。单独敲低CCNE1即可抑制细胞生长49.5 ± 14.4%(P = 0.027),表明USC细胞的增殖依赖于CCNE1 [1]。
与PIK3CA抑制剂Taselisib的联合研究显示协同效应。在USC-ARK-1和USC-ARK-2细胞中,Fadraciclib与Taselisib联合使用对细胞生长的抑制效果显著优于任一单药。Chou-Talalay方法计算的联合指数值表明,两种细胞系在多个效应水平均存在协同作用 [1]。
Western blot分析显示,Fadraciclib处理可抑制Rb磷酸化,而与Taselisib联合使用时,能强效抑制USC-ARK-1和USC-ARK-2细胞中的pRb和pS6。Fadraciclib处理后观察到CCNE1表达增加 [1]。
体内研究 (In Vivo)
每天用 Fadraciclib (22.5 mg/kg) 治疗 USC-ARK-2 衍生的异种移植物,持续三周,以评估该药物作为独立治疗的治疗潜力。每周两次,记录肿瘤的生长和小鼠的体重。与用媒介物治疗的小鼠相比,每日剂量的 Fadraciclib 显着减缓了肿瘤的生长(从治疗第 9 天开始,P=0.012)。在整个用药过程中,没有发现明显的体重减轻[1]。
在SCID小鼠的USC-ARK-2来源异种移植模型中,口服Fadraciclib显著抑制肿瘤生长。治疗期间未观察到显著体重减轻 [1]。
在USC-ARK-1来源异种移植模型中,Fadraciclib与Taselisib联合治疗显示出比任一单药更显著的肿瘤生长抑制作用。第21天时,平均肿瘤体积分别为单药CYC065组1.04 ± 0.5 cm³、单药Taselisib组0.72 ± 0.29 cm³和联合治疗组0.37 ± 0.11 cm³。联合治疗组在第19天后出现轻微但无统计学意义的体重下降 [1]。
细胞实验
细胞活力测定:USC原代细胞系接种于六孔板,用梯度浓度的Fadraciclib处理72小时。收集细胞,洗涤,碘化丙啶染色,流式细胞术计数。存活细胞百分比以溶媒处理组为基准进行归一化,使用GraphPad Prism的非线性回归计算IC₅₀值 [1]。
细胞周期分析:细胞用100 nM Fadraciclib处理48小时,用预冷70%乙醇透化,4°C固定30分钟,RNase处理,碘化丙啶染色,流式细胞术分析 [1]。
凋亡检测:细胞用Fadraciclib处理6小时,Annexin V/PI染色,流式细胞术分析 [1]。
siRNA敲低:USC-ARK-2细胞用CCNE1特异性siRNA或MOCK siRNA转染。24小时后,用梯度浓度Fadraciclib处理72小时,收集细胞进行活力测定或RNA提取 [1]。
免疫印迹:细胞用Fadraciclib、Taselisib或二者联合处理6小时。RIPA缓冲液裂解,SDS-PAGE分离,转膜,与相应抗体孵育,HRP标记二抗和化学发光检测 [1]。
动物实验
在单药疗效研究中,将 USC-ARK-2 细胞皮下注射到 5-7 周龄的 SCID 小鼠体内。植入一周后,当肿瘤体积达到 0.125-0.150 cm³ 时,将小鼠随机分为两组(每组至少 n=5)。治疗组每日灌胃给予 Fadraciclib(22.5 mg/kg),持续 3 周;对照组给予赋形剂。每周记录两次肿瘤大小和体重。肿瘤体积的计算公式为 V = 长度 × (宽度)²/2 [1]。
在联合用药研究中,采用类似方法建立 USC-ARK-1 来源的异种移植瘤模型。小鼠被分为四组:载体组(0.5%甲基纤维素-0.2%吐温-80)、单独使用法德拉西利(Fadraciclib,每日22.5 mg/kg,持续3周)、单独使用他塞利西(Taselisib,每日10 mg/kg,每周5天,持续3周)以及两种药物联合使用组。治疗在植入一周后开始,此时肿瘤体积达到0.125-0.150 cm³。每周监测两次肿瘤体积和体重[1]。
药代性质 (ADME/PK)
Fadraciclib被描述为一种口服化合物,但本研究[1]并未提供具体的药代动力学参数(吸收、分布、代谢、排泄、半衰期、生物利用度)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在单药和联合用药的体内研究中,每日服用 22.5 mg/kg 的 Fadraciclib 治疗长达 3 周,耐受性良好,与安慰剂对照组相比未观察到明显的体重减轻。与 Taselisib 联合用药时,第 19 天后观察到轻微但不显著的体重下降,但未报告其他毒性反应 [1]。
参考文献

[1]. Dual CCNE1/PIK3CA targeting is synergistic in CCNE1-amplified/PIK3CA-mutated uterine serous carcinomas in vitro and in vivo. Br J Cancer. 2016 Jul 26;115(3):303-11.

[2]. Molecular markers and venous thromboembolism (VTE) in acute myelogenous leukemia (AML).

其他信息
CYC-065 正在进行临床试验 NCT03739554(CYC065 CDK 抑制剂联合维奈托克治疗复发/难治性慢性淋巴细胞白血病的研究)。
法德拉西利是一种口服生物利用度高的细胞周期蛋白依赖性激酶 2、5 和 9 (CDK2/5/9) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤和化疗保护活性。口服后,法德拉西利选择性地结合并抑制 CDK2、5 和 9 的活性,从而抑制 CDK2、5 和 9 依赖的细胞通路,下调参与促生存通路的基因,阻止 DNA 双链断裂修复通路的激活,并诱导细胞周期阻滞和凋亡。这可以抑制 CDK2/5/9 过表达的肿瘤细胞的增殖。此外,CYC065 可保护造血干细胞和祖细胞 (HSPC),预防骨髓抑制,并维持骨髓功能。CDK 是参与细胞周期调控的丝氨酸/苏氨酸激酶,在某些癌细胞类型中可能过度表达;它们在肿瘤细胞增殖、转录调控和 DNA 损伤修复中发挥关键作用。
Fadraciclib (CYC065) 是由 Cyclacel Ltd. 开发的第二代口服 ATP 竞争性 CDK2 和 CDK9 抑制剂。它旨在靶向 CCNE1 扩增的癌症,这种扩增发生于约 48% 的子宫浆液性癌中。该化合物通过抑制 CDK2 阻断 G1-S 期转换,并在较高浓度下通过抑制 CDK9 和下调 Mcl-1 诱导细胞凋亡。临床前研究表明,Fadraciclib 对 CCNE1 扩增的 USC 细胞系和异种移植瘤具有显著的抗肿瘤活性。此外,Fadraciclib 与 Taselisib 联合靶向 CCNE1 和 PIK3CA 显示出体外和体内协同抗肿瘤作用,提示其可能是一种有前景的治疗策略,适用于携带 CCNE1 扩增和 PIK3CA 突变的复发性、化疗耐药性 USC 患者 [1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H31N7O
分子量
397.51714348793
精确质量
397.25900864
元素分析
C, 63.45; H, 7.86; N, 24.66; O, 4.02
CAS号
1070790-89-4
相关CAS号
1070790-89-4;1315571-38-0 (HCl);1315571-33-5 (tartrate);1315571-34-6 (citrate); 1315571-36-8 (besylate); 1315571-40-4 (mesylate);
PubChem CID
24983461
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.3
tPSA
101 Ų
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
507
定义原子立体中心数目
2
SMILES
O[C@H](C)[C@H](CC)NC1=NC(=C2C(=N1)N(C=N2)C(C)C)NCC1C=NC(C)=CC=1C
InChi Key
DLPIYBKBHMZCJI-WBVHZDCISA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H31N7O/c1-7-17(15(6)29)25-21-26-19(18-20(27-21)28(11-24-18)12(2)3)23-10-16-9-22-14(5)8-13(16)4/h8-9,11-12,15,17,29H,7,10H2,1-6H3,(H2,23,25,26,27)/t15-,17+/m1/s1
化学名
(2R,3S)-3-((6-(((4,6-dimethylpyridin-3-yl)methyl)amino)-9-isopropyl-9H-purin-2-yl)amino)pentan-2-ol
别名
CYC065; CYC-065; fadraciclib; 1070790-89-4; YET2XNU791; CYC 065
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~251.56 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.29 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.29 mM) (饱和度未知) in 5% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 50% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5156 mL 12.5780 mL 25.1560 mL
5 mM 0.5031 mL 2.5156 mL 5.0312 mL
10 mM 0.2516 mL 1.2578 mL 2.5156 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
European Proof-of-Concept Therapeutic Stratification Trial of Molecular Anomalies in Relapsed or Refractory Tumors
CTID: NCT02813135
Phase: Phase 1/Phase 2
Status: Recruiting
Date: 2026-01-16
Absorption, Metabolism, and Excretion of CYC065 in Healthy Male Subjects
CTID: NCT05817890
Phase: Early Phase 1
Status: Completed
Date: 2024-09-19
CYC065 CDK Inhibitor and Venetoclax Study in Relapsed/Refractory AML or MDS
CTID: NCT04017546
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2024-09-19
A Pharmacologic Study of CYC065, a Cyclin Dependent Kinase Inhibitor, in Patients With Advanced Cancers
CTID: NCT02552953
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2024-05-31
A Study to Investigate Fadraciclib (CYC065), in Subjects With Leukemia or Myelodysplastic Syndrome (MDS)
CTID: NCT05168904
Phase: Phase 1/Phase 2
Status: Suspended
Date: 2024-02-08
A Study to Investigate Fadraciclib (CYC065), in Subjects With Advanced Solid Tumors and Lymphoma
CTID: NCT04983810
Phase: Phase 1/Phase 2
Status: Unknown status
Date: 2024-01-25
CYC065 CDK Inhibitor and Venetoclax Study in Relapsed/Refractory CLL
CTID: NCT03739554
Phase: Phase 1
Status: Completed Date: 2024-01-25 A Phase 1/2, Open-Label, Multicenter Study to Investigate the Safety, Pharmacokinetics, and Efficacy of Fadraciclib (CYC065), an Oral CDK2/9 Inhibitor, in Subjects with Advanced Solid Tumors and Lymphoma EudraCT: 2021-002924-18 Phase: Phase 1, Phase 2 Status: Ongoing Date: 2021-10-08
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