Hoechst 33258 analog 6

别名: 2,6-ditert-butyl-4-[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]phenol

目录号: V33318 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

Hoechst 33258 类似物 6 是 Hoechst 系列的标记染料。

Hoechst 33258 analog 6 CAS号: 129244-66-2
产品类别: New2

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

Hoechst 33258 类似物 6 是 Hoechst 系列的标记染料。 Hoechst 系列是活细胞核标记染料。 Hoechst 通过与 DNA 双链中的小沟结合来结合核酸。 Hoechst 更喜欢与富含 A/T 的 DNA 链结合。同时，富含A/T的双链DNA显着增强荧光强度。 Hoechst 可以穿过细胞膜并与活细胞或固定细胞结合。 Hoechst 染料的荧光强度随着溶液 pH 值的增加而增加。

生物活性&实验参考方法

靶点	Marker dye
体外研究 (In Vitro)	赫斯特/Hoechst 工作液的制备： 1.1储备液的制备用DMSO制备1mg/mL赫斯特储备液注意：建议将赫斯特储备液等分，并在-4℃或-20℃避光储存 1.2工作液的准备用预热的无血清细胞培养基或PBS将储备液稀释至终浓度为10μg/mL的赫斯特工作液注意：请根据您的具体需求调整赫斯特工作液的浓度，并使用新制备的溶液 2. 细胞染色（悬浮细胞） 2.1离心收集细胞，用PBS洗涤两次，每次5分钟。细胞密度为1×10~6/mL 2.2加入1 mL赫斯特工作液，在室温下孵育3-10分钟 2.3 400g，离心3-4分钟，弃去上清液 2.4用PBS洗涤细胞两次，每次5分钟将细胞重新悬浮在1 mL无血清培养基或PBS中后，使用荧光显微镜或流式细胞仪进行观察 3. 细胞染色（贴壁细胞） 3.1在无菌盖玻片上培养贴壁细胞 3.2从培养基上取下盖玻片，吸出多余的培养基 3.3加入100μL染料工作液，轻轻摇晃至完全覆盖细胞，孵育3-10分钟 3.4取出染料工作液，用培养基洗涤2-3次，每次5分钟，用荧光显微镜或流式细胞仪观察
酶活实验	使用DNA酶I和微球菌核酸酶足迹技术分析了次要凹槽结合配体DAPI（4'，6-二脒-2-苯基吲哚）和Hoechst 33258（双苯甲酰亚胺）的DNA结合位点。这两种药物似乎都能与富含AT的区域结合，这些区域至少含有四个这样的碱基对。Hoechst 33258似乎与含有交替步骤TpA的核苷酸序列结合相对较差。然而，与DAPI相比，它更容易适应结合位点末端鸟苷残基的存在。我们在可比条件下比较了DAPI和Hoechst 33258的DNA结合位点与相关小沟槽结合配体贝雷尼、奈曲普辛和双霉素A的结合位点，并讨论了在分析药物与DNA相互作用时使用不同足迹探针的重要性[1]。
参考文献	[1]. Latt SA, Stetten G, Juergens LA, Recent developments in the detection of deoxyribonucleic acid synthesis by 33258 Hoechst fluorescence. The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society 23 (7): 493-505. [2]. a b c "Hoechst Stains". Invitrogren (Molecular Probes). [3]. Portugal J, Waring MJ. Assignment of DNA binding sites for 4',6-diamidine-2-phenylindole and bisbenzimide (Hoechst 33258). A comparative footprinting study. Biochimica et Biophysica Acta 949 (2): 158-68.
其他信息	This article describes a variety of applications of fluorescence microscopy for detecting deoxyribonucleic acid synthesis. These applications include: (a) analyzing the exchange and separation of sister chromatids during mitosis; (b) locating regions on chromosomes containing deoxyribonucleic acid and with asymmetrical distribution of thymine residues between polynucleotide chains; and (c) detecting regions in metaphase chromosomes during late replication. In both fixed cytological specimens and unfixed cultured cells, it was confirmed that the biosynthesized 5-bromodeoxyuridine incorporated into the interphase nucleus could inhibit Hoechst 33258 fluorescence. Many of the cytological observations described in this article may lay the foundation for future biochemical research. [3]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C33H40N6O
分子量	536.7103
精确质量	536.326
CAS号	129244-66-2
相关CAS号	Hoechst 33258;23491-44-3;Hoechst 33258 analog;258843-62-8
PubChem CID	136218783
外观&性状	Off-white to pink solid powder
LogP	5.753
tPSA	83.81
氢键供体(HBD)数目	3
氢键受体(HBA)数目	5
可旋转键数目(RBC)	5
重原子数目	40
分子复杂度/Complexity	838
定义原子立体中心数目	0
InChi Key	LXRWWFIBSFWADZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C33H40N6O/c1-32(2,3)23-16-21(17-24(29(23)40)33(4,5)6)31-35-25-10-8-20(18-27(25)36-31)30-34-26-11-9-22(19-28(26)37-30)39-14-12-38(7)13-15-39/h8-11,16-19,40H,12-15H2,1-7H3,(H,34,37)(H,35,36)
化学名	2,6-ditert-butyl-4-[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]phenol
别名	2,6-ditert-butyl-4-[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]phenol
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~25 mg/mL (~46.58 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 2.5 mg/mL (4.66 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~25 mg/mL (~46.58 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.66 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.8632 mL	9.3160 mL	18.6320 mL
	5 mM	0.3726 mL	1.8632 mL	3.7264 mL
	10 mM	0.1863 mL	0.9316 mL	1.8632 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。