Padnarsertib (KPT-9274)

别名: KPT9274;PAK4-IN-1;KPT-9274;PAK4-IN 1;KPT 9274; PAK4-IN1
目录号: V3144 纯度: ≥98%
Padnarsertib (KPT-9274; KPT9274; PAK4-IN-1) 是一种有效的、选择性的、口服生物可利用的小分子、非竞争性 PAK4/NAMPT 双重抑制剂,具有抗癌活性。
Padnarsertib (KPT-9274) CAS号: 1643913-93-2
产品类别: NAMPT
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
Padnarsertib(KPT-9274;KPT9274;PAK4-IN-1)是一种有效的、选择性的、口服生物可利用的小分子、非竞争性 PAK4/NAMPT 双重抑制剂,具有抗癌活性。 KPT-9274 破坏 PAK4/NAMPT 信号通路,可能导致 G2-M 转运减少、细胞凋亡诱导以及多种人 RCC 细胞系的细胞侵袭和迁移减少。 KPT-9274 对 PAK4 信号通路的抑制会减弱核 β-catenin 以及 Wnt/β-catenin 靶标细胞周期蛋白 D1 和 c-Myc。 KPT-9274 在小鼠模型中展示了预期的靶向效果,目前正在进行针对实体瘤和淋巴瘤的 I 期临床试验。
生物活性&实验参考方法
靶点
Padnarsertib (KPT-9274) targets nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT) and p21-activated kinase 4 (PAK4) [2]
体外研究 (In Vitro)
Padnarsertib 抑制 PAK4/β-catenin 通路,导致 NAD 耗尽,并降低许多 RCC 细胞系侵袭、迁移和保持活力的能力。根据使用重组 NAMPT 抑制 NAMPT 的无细胞酶实验,Padnarsertib 的 IC50 约为 120 nM。在 RCC 细胞系中,padnarsertib 可引起细胞凋亡并损害 G2-M 运输 [2]。
在多种人肾细胞癌(RCC)细胞系中,Padnarsertib (KPT-9274)处理可减少细胞周期G2-M期转换(5 μM KPT-9274处理72h后经Muse Analyzer检测,p<0.05 vs DMSO对照组)、诱导细胞凋亡(72h处理后通过Muse Analyzer检测膜联蛋白V染色,p<0.05 vs DMSO对照组),并降低细胞侵袭和迁移能力。对于经1 μM或5 μM KPT-9274处理24h的786-O RCC细胞:Matrigel侵袭实验显示迁移细胞数减少(p<0.05 vs DMSO),Transwell迁移实验表明迁移至下室的细胞数降低(p<0.05 vs DMSO),划痕/伤口愈合实验发现划痕后12h和24h迁移至伤口区域的细胞数减少(p<0.05 vs DMSO)。KPT-9274可剂量依赖性降低RCC细胞系中的总NAD+NADH水平(孵育48h,p<0.05 vs DMSO),而对正常肾近端小管上皮细胞(RPTEC)的影响较小。机制上,KPT-9274抑制PAK4通路,降低核内β-连环蛋白(β-catenin)水平,并下调Wnt/β-catenin靶基因cyclin D1和c-Myc的表达(不同浓度KPT-9274处理72h后通过蛋白质印迹法检测)。RCC细胞中NAPRT1的下调使其依赖NAMPT合成NAD,KPT-9274对NAMPT的抑制作用降低了RCC细胞的存活率。此外,KPT-9274还可下调RCC细胞中sirt1的表达(处理72h后蛋白质印迹法检测)[2]
体内研究 (In Vivo)
Padnarsertib 和舒尼替尼在抑制异种移植物生长方面表现出相似的功效。 Padnarsertib 似乎在体内没有毒性,并且对正常人 RPTEC 的影响极小 [2]。 Padnarsertib(口服;100 mg/kg 或 200 mg/kg;每天两次,持续 14 天)可导致动物模型中异种移植物生长减少,但不会显着影响动物体重。 8 小时实验结束时,小鼠血浆和肿瘤中的浓度分别为 10757 ng/mL 和 10647 ng/mL [3]。
在荷皮下786-O(VHL突变)人RCC移植瘤的裸鼠模型中,每日两次口服给予Padnarsertib (KPT-9274) 100 mg/kg或200 mg/kg,可剂量依赖性抑制肿瘤生长(p<0.05 vs 溶媒对照组),且无明显毒性(实验期间小鼠体重保持稳定)。对收获肿瘤的蛋白质印迹分析证实了KPT-9274的靶点效应(PAK4/NAMPT通路相关蛋白下调)[2]
酶活实验
开展无细胞实验评估NAMPT活性随Padnarsertib (KPT-9274)浓度变化的情况,检测不同浓度KPT-9274存在下NAMPT的酶活性,以明确药物对NAMPT的抑制作用。此外,在U-2骨肉瘤细胞中通过CRISPR-Cas9技术敲除PAK4,采用MTT实验评估细胞存活率,蛋白质印迹法验证PAK4敲除效果,结果显示细胞存活曲线右移,表明细胞对PAK4存在依赖性[2]
细胞实验
细胞活力实验:将RCC细胞系和正常RPTEC细胞接种于96孔板(3000个细胞/孔,n=8),与DMSO或Padnarsertib (KPT-9274)共同孵育72h;采用MTT法检测细胞活力,结果显示KPT-9274可选择性降低RCC细胞活力(p<0.05 vs DMSO对照组),对RPTEC细胞影响较小。
NAD+NADH检测实验:将300个细胞/孔接种于96孔板(n=4),与DMSO或KPT-9274孵育48h;检测RCC细胞系和RPTEC细胞中的总NAD+NADH水平,发现KPT-9274可降低RCC细胞中的NAD+NADH水平(p<0.05 vs DMSO)。
细胞周期分析实验:将RCC细胞和RPTEC细胞培养至50%汇合度,与DMSO或5 μM KPT-9274孵育72h;通过Muse Analyzer分析细胞周期分布,显示RCC细胞G2-M期转换减少(p<0.05 vs DMSO)。
凋亡检测实验:KPT-9274孵育72h后,采用膜联蛋白V染色通过Muse Analyzer检测细胞凋亡,结果显示RCC细胞凋亡增加(p<0.05 vs DMSO)。
蛋白质印迹实验:将RCC细胞接种于6孔板(1000个细胞/孔),与不同浓度KPT-9274孵育72h;提取细胞裂解液进行蛋白质印迹,检测PAK4/NAMPT通路相关蛋白(如β-catenin、cyclin D1、c-Myc、sirt1)和凋亡标志物裂解型PARP的表达。
侵袭/迁移实验:786-O细胞经DMSO、1 μM或5 μM KPT-9274处理24h后,采用Matrigel包被的Transwell小室进行侵袭实验(20h后固定、染色并计数迁移细胞),Transwell小室进行迁移实验(染色、拍照并计数迁移细胞),以及划痕/伤口愈合实验(划痕后0、12、24h监测迁移至伤口区域的细胞数)。
siRNA转染实验:将RCC细胞和RPTEC细胞培养至50%汇合度,转染PAK4特异性siRNA或阴性对照siRNA;随后进行蛋白质印迹(验证PAK4敲低效果)和流式细胞术凋亡检测[2]
动物实验
动物/疾病模型:小鼠[1]
剂量:100mg/kg 或 200 mg/kg
给药途径:口服;100mg/kg 或 200 mg/kg;每日两次;14 天
实验结果:显示 KPT-9274 治疗组小鼠的异种移植瘤生长显著减少。
将 786-O 人肾细胞癌 (RCC) 细胞皮下移植到裸鼠(每组 n=8)体内;肿瘤形成后,小鼠经口灌胃给予 Padnarsertib (KPT-9274),剂量为 100 mg/kg 或 200 mg/kg,每日两次(载体对照组仅灌胃溶剂)。每周使用游标卡尺测量肿瘤体积,并计算平均肿瘤体积±标准误(SEM)。同时记录小鼠体重以评估毒性。实验结束时,处死小鼠,收集并混合肿瘤组织,对肿瘤裂解液进行免疫印迹分析,以检测靶蛋白(PAK4/NAMPT通路相关蛋白),并以β-肌动蛋白作为内参[2]。
参考文献

[1]. WO2015003166A1.

[2]. Dual and Specific Inhibition of NAMPT and PAK4 By KPT-9274 Decreases Kidney Cancer Growth. Mol Cancer Ther. 2016 Sep;15(9):2119-29.

[3]. Dual and Specific Inhibition of NAMPT and PAK4 By KPT-9274 Decreases Kidney Cancer Growth.Mol Cancer Ther. 2016 Sep;15(9):2119-29.

其他信息
帕纳塞替尼是一种口服生物利用度高的丝氨酸/苏氨酸激酶P21活化激酶4 (PAK4) 和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD) 合成酶烟酰胺磷酸核糖转移酶 (NAMPT;NAMPRTase) 的抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。给药后,帕纳塞替尼通过变构作用与PAK4结合,使其不稳定并导致其降解。这抑制了PAK4介导的信号传导,诱导PAK4过表达肿瘤细胞死亡,并抑制其增殖。此外,帕纳塞替尼还能与NAMPT结合并抑制其活性。这会消耗细胞内NAD并抑制NAD依赖性酶,而NAD和NAD依赖性酶对于细胞快速增殖至关重要;最终导致NAMPT过表达的癌细胞死亡。 PAK4 是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,属于 PAK 蛋白家族,在多种癌细胞类型中表达上调,它调控细胞的运动、增殖和存活。NAMPT 是一种负责维持细胞内 NAD 池的酶,在细胞代谢调控中发挥关键作用,并具有细胞因子样活性。NAMPT 在多种癌症和代谢紊乱中经常过表达,肿瘤细胞依赖 NAMPT 的活性来获取 NAD。
Padnarsertib (KPT-9274) 是一种 NAMPT 和 PAK4 的双重特异性抑制剂。肾细胞癌 (RCC) 是美国第六大常见恶性肿瘤,其发病率不断上升,且对现有疗法普遍耐药;PAK4 和 NAD 生物合成途径对 RCC 的生长至关重要。肾细胞癌 (RCC) 细胞中 NAPRT1 的下调使肿瘤依赖于 NAMPT 进行 NAD 合成,而 KPT-9274 对 NAMPT 的抑制作用可降低 RCC 细胞的存活率。KPT-9274 正在进行一项 I 期人体临床试验,用于治疗实体瘤和淋巴瘤,并有望转化为 RCC 的治疗 [2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C35H29F3N4O3
分子量
610.63
精确质量
610.219
CAS号
1643913-93-2
相关CAS号
1643913-93-2;Padnarsertib HCl;
PubChem CID
117779453
外观&性状
White to light yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
857.5±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
472.4±34.3 °C
蒸汽压
0.0±3.2 mmHg at 25°C
折射率
1.677
LogP
4.74
tPSA
102
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
45
分子复杂度/Complexity
1040
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CN(CCC1(F)F)C(=O)C2=CC=C(C=C2)C3=CC(=C4C(=C3)C=C(O4)CNC(=O)/C=C/C5=CN=C(C=C5)N)C6=CC=C(C=C6)F
InChi Key
MRFOPLWJZULAQD-SWGQDTFXSA-N
InChi Code
InChI=1S/C35H29F3N4O3/c36-28-9-7-24(8-10-28)30-19-26(23-3-5-25(6-4-23)34(44)42-15-13-35(37,38)14-16-42)17-27-18-29(45-33(27)30)21-41-32(43)12-2-22-1-11-31(39)40-20-22/h1-12,17-20H,13-16,21H2,(H2,39,40)(H,41,43)/b12-2+
化学名
(1Z,2E)-3-(6-aminopyridin-2-yl)-N-((5-(4-(4,4-difluoropiperidine-1-carbonyl)phenyl)-7-(4-fluorophenyl) benzofuran-2-yl)methyl)acrylimidic acid
别名
KPT9274;PAK4-IN-1;KPT-9274;PAK4-IN 1;KPT 9274; PAK4-IN1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:100 mg/mL (163.8 mM)
Water:
Ethanol:100 mg/mL (163.8 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (3.41 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (3.41 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.41 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6377 mL 8.1883 mL 16.3765 mL
5 mM 0.3275 mL 1.6377 mL 3.2753 mL
10 mM 0.1638 mL 0.8188 mL 1.6377 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • KPT-9274

    KPT-9274 inhibits NAMPT and PAK4 and associated signaling pathways in RCC cells.2016 Sep;15(9):2119-29.

  • KPT-9274


    KPT-9274 preferentially attenuates RCC cell viability and decreases RCC invasion and migration.2016 Sep;15(9):2119-29.

  • KPT-9274

    KPT-9274 decreases G2/M transit and causes apoptosis preferentially in RCC cells.2016 Sep;15(9):2119-29.

  • KPT-9274


    KPT-9274 shows specificity for attenuation of PAK4 targets preferentially in RCC cells.2016 Sep;15(9):2119-29.

  • KPT-9274


    KPT-9274 shows specificity for attenuation of NAD biosynthesis targets preferentially in RCC cells.2016 Sep;15(9):2119-29.

  • KPT-9274


    KPT-9274 attenuates xenograft growthin vivowith minimal toxicity and shows the expected on-target effects.2016 Sep;15(9):2119-29.

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