LCAHA

别名: LCAHA; 117094-40-3; (4R)-N-hydroxy-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanamide; Lithocholic acid hydroxyamide;
目录号: V23830 纯度: ≥98%
LCAHA 是一种新型有效的 USP2a 抑制剂
LCAHA CAS号: 117094-40-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
LCAHA 是一种新型有效的 USP2a 抑制剂,在 Ub-AMC 测定和 Di-Ub 测定中的 IC50 分别为 9.7 μM 和 3.7μM。 LCAHA 破坏 Cyclin D1 的稳定性并通过抑制去泛素酶 USP2 诱导 G0/G1 停滞
生物活性&实验参考方法
靶点
Deubiquitinase USP2a (IC50 = 9.7 μM)
体外研究 (In Vitro)
LCAHA的 GI50 分别为 0.87±0.09 和 0.96±0.29μM,LD50 分别为 27.8±3.9 和 26.5±0.1μM,可抑制 HCT116wt 和 HCT116 p53-/-结肠癌细胞的活力[1]。 最有效的LCA衍生物LCA羟酰胺(LCAHA)抑制USP2a,导致细胞周期蛋白D1的Akt/GSK3β非依赖性失稳,但不会改变p27的表达。这导致了细胞周期进程中的缺陷。因此,LCAHA抑制表达细胞周期蛋白D1的细胞生长,但不抑制细胞周期蛋白D2阴性细胞的生长,与p53状态无关。我们发现LCA衍生物可能被认为是治疗细胞周期蛋白D1添加的p53表达和p53缺陷型癌症的未来疗法。[1]
对于一种LCA衍生物,LCAHA,在测试的两种细胞类型中都观察到了双相反应:低浓度GI效应和高浓度毒性效应(图1A)。仅在与高浓度毒性作用相对应的浓度下观察到LDH释放(图1B)。根据MTT结果计算的两种细胞系的GI50值均低于1μM(表2),在2-20μM的浓度范围内,细胞的生长受到约60%的抑制(图1A)。对于致死效应,两种细胞系的LD50值均高于25μM,这表明GI效应的选择性高于p53wt细胞的31.9倍和p53-/-细胞的27.6倍的致死效应(表2)。[1]
为了评估观察到的效应是否伴随着凋亡的诱导,我们检测了HCT116 p53wt细胞中胱天蛋白酶3和7的激活。在用1或5μM LCAHA处理48或72小时的细胞中检测到胱天蛋白酶活性的微弱而不显著的增加。只有在10μM LCAHA时胱天蛋白酶的活性才显著增加(图1C)。因此,在化合物的GI浓度范围内不能有效诱导细胞凋亡。用已知的凋亡诱导剂星孢菌素治疗,导致胱天蛋白酶3和7的活性显著增加(图1C)。 [1]
LCAHA将HCT116细胞阻滞在G0/G1期[1]
低浓度的LCAHA抑制HCT116细胞的生长,而不影响其存活。为了研究这种效应,我们分析了细胞周期分布。用LCAHA或DMSO处理48小时的细胞用BrdU脉冲标记1小时,并用异硫氰酸荧光素(FITC)-抗溴脱氧尿苷(BrdU)抗体和碘化丙啶(PI)染色。流式细胞术分析显示,用5或10μM LCAHA处理的HCT116 p53wt和HCT116 p53−/-细胞均出现轻度但显著的G0/G1期阻滞(图1D)。BrdU掺入分析显示,LCAHA处理细胞的DNA合成速率呈剂量依赖性下降(图1E)。这表明,除了G0/G1期阻滞外,LCAHA还影响S期的进展

为了验证这一点,我们用BrdU对用LCAHA处理48小时1小时的HCT116 p53wt细胞进行脉冲标记,并再收获或培养3、6或9小时。为了精确追踪S期和G0/G1期阻滞的进展,我们使用ModFit LT软件分别分析了FITC阳性和阴性细胞的细胞周期分布。FITC阳性细胞代表掺入BrdU的细胞(在脉冲标记期间处于S期的群体,在随后的几个小时内向G2/M发展),FITC阴性细胞代表不掺入Brd U的细胞,即在脉冲标记过程中处于G0/G1期或G2/M期并在随后的几小时内进入S期或分裂的群体

正如预期的那样,在时间点t0,大多数BrdU+细胞处于S期,大多数Brd U−细胞处于G0/G1或G2/M期(图1F)。9小时后,用DMSO处理的BrdU+细胞中只有23%仍处于S期,超过50%的细胞已经完成细胞周期,处于G0/G1期(图1F,上图)。LCAHA治疗剂量依赖性地抑制了BrdU+细胞通过S期的转变,这可以从留在S期的细胞比例显著增加(在5μM LCAHA治疗时高达56%)和G0/G1期细胞比例显著降低(低至24%)中得到证明。与此同时,用DMSO处理的BrdU−细胞中约有44%离开G0/G1期并进入S期,而用LCAHA处理的化合物在5μM浓度下显著且剂量依赖性地抑制了这一转变,使其降至20%(图1F,底部三幅图)。这些结果显示,G0/G1期阻滞比对整个细胞群的简单分析所表明的要强烈得多(图1C)。图S2显示了测试的完整结果,以3小时的间隔显示了细胞周期的进展。
LCAHA诱导的G0/G1期阻滞伴随着细胞周期蛋白D1表达的降低[1]
从G1期到S期的进展在很大程度上依赖于D细胞周期蛋白的表达和活性。为了验证LCAHA治疗后观察到的细胞周期进展障碍是否与D细胞周期蛋白有关,我们研究了HCT116 p53wt和HCT116 p53−/−细胞中细胞周期蛋白D1和D3的表达。在用5或20μM LCAHA处理的两种细胞系中,观察到细胞周期蛋白D1表达的显著剂量依赖性降低;然而,这种效应在HCT116 p53wt细胞中更为明显(图2A)。LCA不影响细胞周期蛋白D1的表达,LCAE对HCT116细胞的存活没有双相作用,降低了HCT116 p53wt细胞中该蛋白的表达,但这种作用比LCAHA弱得多(图2A)。用任何化合物处理24小时均不影响HCT116细胞系中细胞周期蛋白D1的表达(图S3B)。
酶活实验
热迁移实验(TSA) [1]
在USP2a和测试化合物存在下,通过监测SYPRO Orange染料的荧光强度随温度升高(22°C至98°C)的变化进行TSA分析。实验在pH=7.4的PBS缓冲液中进行。将USP2a(1 μM)单独或与LCAE/LCAHA化合物(均为50 μM)共同孵育。应用恒定温度梯度(0.2°C/min),使用实时热循环仪监测荧光变化。通过荧光强度对温度的一阶导数曲线估算熔解温度(Tm)。
基于MALDI-TOF的高通量DUB活性检测[1]
实验方法参照先前报道(Ritorto等,2014)。将31种人源DUBs用反应缓冲液(40mM Tris-HCl,pH 7.6,5mM DTT,0.005% BSA)新鲜稀释至适当浓度。酶与LCAHA和LCAE(终浓度100 μM)在室温孵育30分钟。将二聚泛素拓扑异构体(K63、K48、K11和M1)稀释至0.2 μl/μg,使用纳升级移液系统加入反应体系(终浓度1.5 μM)。密封板后在室温孵育30分钟,加入TFA(终浓度2% v/v)终止反应。
终止的反应液(1.050 μl)转移至384孔板,加入15N-泛素内标(0.15 μl,16 μM),与新鲜配制的2.5 DHAP基质(7.6 mg 2,5 DHAP溶于375 μl乙醇和125 μl 12 mg/ml柠檬酸氢二铵水溶液)按1:1混合。取200 μl混合液点样至MTP AnchorChip 1,536 TF(600 mm anchor)靶板。
质谱数据在UltrafleXtreme MALDI-TOF质谱仪(Compass 1.3控制和数据处理软件)上采集。每次分析前进行样品载体校准以优化激光聚焦。使用15N-Ub峰[M+H]+(平均值=8,569.3)进行内标校准。如文献报道(Ritorto等,2014)采用自动模式分析样品。面积计算时考虑完整同位素分布。使用内部脚本计算15N和单泛素峰面积;图表绘制、标准差和变异系数(%)计算在Microsoft Excel中完成。
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型: HCT116wt 和 HCT116 p53-/- 结肠癌细胞
测试浓度: 0.01、0.1、1、10 和100 μM
孵育时间: 6 天
实验结果: 对于 HCT116wt 和 HCT116 p53-/-,GI50 分别为 0.87±0.09 和 0.96±0.29 μM结肠癌细胞。
细胞周期分析 [1]
细胞分别用DMSO或LCAHA处理48小时,并在处理最后1小时脉冲标记10 μM溴脱氧尿苷(BrdU)。随后,细胞经胰蛋白酶消化后立即用96%乙醇固定,或在无BrdU条件下继续培养3-9小时后收集固定。使用PI和FITC标记的抗BrdU抗体染色后,通过Fortessa流式细胞仪检测,并采用ModFit LT软件分析细胞周期分布。
Caspase 3/7活性检测 [1]
将细胞接种于96孔白色平底板,分别用DMSO、LCAHA或Staurosporine处理。按照制造商说明书使用Caspase-Glo 3/7检测系统测定caspase活性。鉴于LCAHA具有抑制细胞生长的特性,结果根据细胞数量进行标准化校正(校正系数来源于透明培养板上Hoechst染色细胞的核计数:DMSO处理3天的平均核数为6452个/视野,而不同浓度LCAHA处理组分别为3957、4229和2783个/视野)。
克隆形成实验 [1]
MCF-7或SAOS-2细胞经DMSO或5 μM LCAHA预处理5天后,取1000个细胞接种于6孔板,培养2-4周至形成肉眼可见克隆。结晶紫染色后,通过ChemiDoc MP系统成像,并运用ImageJ软件(Schneider等,2012)的"Analyze particles"工具分析。存活分数(SF)计算公式为:SF = (处理组PE/对照组PE)×100%,其中PE(平板效率)=形成克隆数/接种细胞数。
参考文献

[1]. Lithocholic Acid Hydroxyamide Destabilizes Cyclin D1 and Induces G 0/G1 Arrest by Inhibiting Deubiquitinase USP2a. Cell Chem Biol. 2017 Apr 20;24(4):458-470.e18.

其他信息
总之,我们发现LCAHA诱导的细胞生长抑制伴随着细胞周期蛋白D1水平的显著降低,这是由于该蛋白稳定性下降所致。我们还发现LCAHA拮抗培养基中血清传递的增殖信号,并阐明了USP2a蛋白参与LCAHA诱导的细胞周期蛋白D1不稳定化的机制。我们的研究为基于LCA骨架设计更有效的USP抑制剂以改善癌症治疗奠定了基础。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H41NO3
分子量
391.587247610092
精确质量
391.308
元素分析
C, 73.61; H, 10.55; N, 3.58; O, 12.26
CAS号
117094-40-3
PubChem CID
126961696
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.5
tPSA
69.6
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
594
定义原子立体中心数目
9
SMILES
O[C@@H]1CC[C@@]2(C)C(C1)CC[C@@H]1[C@@H]2CC[C@]2(C)[C@@H]([C@H](C)CCC(NO)=O)CC[C@H]21
InChi Key
WZXAGWREMCSWMF-HVATVPOCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H41NO3/c1-15(4-9-22(27)25-28)19-7-8-20-18-6-5-16-14-17(26)10-12-23(16,2)21(18)11-13-24(19,20)3/h15-21,26,28H,4-14H2,1-3H3,(H,25,27)/t15-,16-,17-,18+,19-,20+,21+,23+,24-/m1/s1
化学名
(4R)-N-hydroxy-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanamide
别名
LCAHA; 117094-40-3; (4R)-N-hydroxy-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3-hydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanamide; Lithocholic acid hydroxyamide;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~45 mg/mL (~114.92 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5537 mL 12.7685 mL 25.5369 mL
5 mM 0.5107 mL 2.5537 mL 5.1074 mL
10 mM 0.2554 mL 1.2768 mL 2.5537 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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