PAT-505

别名: PAT-505; 1782070-22-7; 53T7TDA5QJ; 3-[6-Chloranyl-2-Cyclopropyl-1-(1-Ethylpyrazol-4-Yl)-7-Fluoranyl-Indol-3-Yl]sulfanyl-2-Fluoranyl-Benzoic Acid; UNII-53T7TDA5QJ; CHEMBL4642052; 3-((6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7-fluoro-1H-indol-3-yl)thio)-2-fluorobenzoic acid; 3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid;
目录号: V27119 纯度: ≥98%
PAT-505 (PAT505) 是一种新型、选择性和有效的自分泌运动因子抑制剂,有潜力用于治疗 NASH 等多种纤维化肝病。
PAT-505 CAS号: 1782070-22-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PAT-505 (PAT505) 是一种新型、选择性强效的自泌素抑制剂,具有治疗多种纤维化肝病(例如非酒精性脂肪性肝炎 (NASH))的潜力。作为一种口服生物利用度高的自泌素抑制剂,PAT-505 对 Hep3B 细胞中自泌素的 IC50 值为 2 nM。口服 PAT-505 后,血浆和肝组织中的自泌素 (ATX) 活性均显著降低。PAT-505 治疗可使肝纤维化程度略有改善,但对肝细胞气球样变和肝脏炎症的改善作用有限。PAT-505 可能代表一种治疗多种纤维化肝病(包括 NASH)的新型治疗方法。
PAT-505 (CAS 1782070-22-7) 是一种强效、选择性、非竞争性且口服生物利用度高的自泌素 (ATX) 抑制剂。 PAT-505在Hep3B细胞中的IC50值为2 nM,在人血中的IC50值为9.7 nM,在小鼠血浆中的IC50值为62 nM。PAT-505对其他ENPP家族成员具有高度选择性,并被用于癌症和纤维化研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 2 nM (Autotaxin, Hep3B cell), 9.7 nM (Autotaxin, Human blood), 62 nM (Autotaxin, Mouse plasma)[1]
PAT-505 targets autotaxin (ATX), also known as ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (ENPP2), a secreted enzyme that produces lysophosphatidic acid (LPA) from lysophosphatidylcholine. ATX-LPA signaling plays a critical role in cell proliferation, migration, survival, and inflammation. PAT-505 is a noncompetitive inhibitor with an IC50 of 2 nM in Hep3B cells.
体外研究 (In Vitro)
PAT-505 在 Hep3B 细胞中的 IC50 为 2 nM,在人血中的 IC50 为 9.7 nM,在小鼠血浆中的 IC50 为 62 nM,是一种强效、选择性、非竞争性口服自泌素抑制剂。PAT-505 对腺苷 A3 受体、MT1 褪黑素受体、前列腺素 E2 EP4 受体、5-HT5a 血清素受体和 GABA 门控氯离子通道的结合均有轻微抑制作用,其对 ATX 的选择性高于其他 ENPP 蛋白[1]。在 10 µM 浓度下,抑制率在 50% 至 70% 之间。体外实验表明,PAT-505 能有效抑制自泌素活性,在 Hep3B 细胞中的 IC50 为 2 nM,在人血中的 IC50 为 9.7 nM,在小鼠血浆中的 IC50 为 62 nM。它对其他 ENPP 家族成员表现出高度选择性。该化合物抑制 ATX 介导的 LPA 生成以及参与癌症进展和纤维化的下游信号通路。
体内研究 (In Vivo)
PAT-505 在小鼠血浆中的平均 IC50 为 62 nM,平均 IC90 为 630 nM,在大鼠血浆中约为 770 nM,可抑制 ATX 溶血磷脂酶 D (lysoPLD) 活性。在非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 小鼠模型中,PAT-505(30 mg/kg,口服)可显著降低 PSR 阳性区域的百分比、纤维化评分和 α-SMA 免疫反应性[1]。
本研究描述了一种新型小分子 ATX 抑制剂 PAT-505 [3-((6-氯-2-环丙基-1-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-7-氟-1H-吲哚-3-基)硫代)-2-氟苯甲酸钠盐] 的临床前药理学、药代动力学和药效学特性。 PAT-505 是一种强效、选择性、非竞争性抑制剂,口服后可显著抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。在非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 的 Stelic 小鼠动物模型中,PAT-505 治疗可显著改善纤维化,但对肝细胞气球样变性和肝脏炎症的改善甚微。在胆碱缺乏、高脂饮食诱导的 NASH 模型中,PAT-505 治疗可显著降低肝纤维化,但对脂肪变性、肝细胞气球样变性或炎症无显著影响。这些数据表明,抑制自泌素具有抗纤维化作用,可能代表一种治疗多种纤维化肝病(包括 NASH)的新疗法。[1]
体内实验表明,口服 PAT-505 可显著抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。该化合物具有良好的口服生物利用度,并表现出强效且选择性的非竞争性 ATX 抑制作用。它已在癌症和纤维化的临床前模型中进行了研究。
酶活实验
使用 FS-3 底物进行生化分析[2]
从最高浓度 20 μM 开始,将 10 μL 化合物稀释系列(1/5 稀释)加入孔中。糖基化人 ATX 蛋白(参见补充信息)的最终浓度为 0.4 或 0.64 μg/mL。酶用 50 mM Tris-HCl(2-氨基-2-(羟甲基)-1,3-丙二醇盐酸盐,pH 8.0)、250 mM NaCl、5 mM KCl、1 mM MgCl₂、1 mM CaCl₂ 和 0.1% 无脂肪酸 BSA 稀释,总体积为 20 μL。将酶混合物加入化合物中,并将所得混合物在室温下振荡孵育 30 分钟。反应通过加入 20 μL 浓度为 0.75 μM 的 FS-3 启动,FS-3 的稀释缓冲液与上述相同。室温孵育 30 分钟后,使用 Envision 荧光分析仪读取荧光值(激发波长 485 nm,发射波长 520 nm)。[2]
使用 LPC 16:0 底物进行生化分析[2]
从最高浓度 20 μM 开始,向孔中加入 5 μL 化合物稀释系列(1/5 稀释)。糖基化人 ATX 蛋白(参见补充信息)的最终浓度为 1 或 3 μg/mL。酶用 50 mM Tris-HCl(pH 8.5)、500 mM NaCl、5 mM KCl、10 mM CaCl2 和 0.1% 无脂肪酸 BSA 稀释,总体积为 10 μL。反应通过加入 10 μL 浓度为 150 μM 的 LPC 16:0(用上述相同缓冲液稀释)启动,混合物在 37 °C 下孵育 30 分钟。反应终止后,通过加入 25 μL 混合物来定量胆碱,该混合物包含 0.6 U/mL 的胆碱氧化酶、0.6 U/mL 的辣根过氧化物酶 (HRP)、1.8 mM 的 TOOS(N-乙基-N-(2-羟基-3-磺丙基)-3-甲基苯胺钠盐二水合物)、1.2 mM 的 4-氨基安替比林和 20 mM 的 EGTA(乙二醇-双(2-氨基乙醚)-N,N,N′,N′-四乙酸,终止显影液)(用上述缓冲液稀释)。室温孵育30分钟后,使用Envision仪器读取发光值(激发波长555 nm,激发光强度70%)。[2]
大鼠血浆测定[2]
将大鼠血浆在冰上解冻,并加入含有待测化合物不同剂量范围的微孔板中。在37℃孵育2小时后,取10 μL血浆,加入过量甲醇沉淀,甲醇中含有LPA 17:0作为内标。离心后,将上清液稀释并注入C18色谱柱。在等度条件下洗脱分析物。未对LPA 18:2绘制标准曲线,所有定量均基于峰面积比值(LPA 18:2/LPA 17:0)。对于每种化合物浓度,LPA 数据均以降低百分比 (% 降低) 表示,计算公式为:100 – [((LPA 比值)/(对照样品中的 LPA 比值)) × 100]。
PAT-505 的特异性无细胞酶/受体结合测定方案包括使用纯化的重组 ATX 蛋白进行自泌素酶活性测定。酶活性通过检测溶血磷脂酰胆碱产生的 LPA 来测定,检测方法基于荧光或质谱分析。IC50 值由浓度-反应曲线确定。
细胞实验
PAT-505 的体外细胞检测采用 Hep3B 肝癌细胞和其他表达 ATX 的细胞系。用 PAT-505 处理细胞后,通过 ELISA 或质谱法检测培养上清液中 LPA 的生成。通过检测下游通路激活情况(例如 AKT、ERK 磷酸化)来评估该化合物对 ATX-LPA 信号通路的影响。
动物实验
在雄性C57BL/6小鼠中诱导非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。简而言之,5周龄小鼠先饲喂普通饲料1周以适应环境,然后转为低胆碱、L-氨基酸限定的高脂饮食(CDAHFD),其中脂肪占总热量的60%,蛋氨酸含量为0.1%。CDAHFD喂养4周后,通过颌下静脉采血,从每只小鼠采集约200 μL血液,并分析血清中的肝酶水平。任何血清总胆红素水平>1 mg/dL的小鼠在给药前均被排除出研究。小鼠继续饲喂CDAHFD 5周后,随机分组(每组n=7-10)。从第 5 周到第 12 周,每天一次通过 0.5% 甲基纤维素 (MC) 灌胃给予载体或 PAT-505 (3-30 mg/kg)[1].
大鼠药代动力学/药效学与化合物 40( PAT-505 的类似物)[2]
雄性 Sprague-Dawley 大鼠在受控环境中饲养,并以 5 mg/kg 的剂量给予化合物 40,该化合物 40 配制于 10% (2-羟丙基)-β-环糊精中,用柠檬酸将 pH 值调节至 3(1 mg/mL 的 40)。根据GALAPAGOS动物福利伦理委员会批准的方案,并经法国高等教育与研究部和省人口保护局同意,通过导管经颈静脉采集血样。采集时间点为给药后0.5、1和3小时,并将血样置于含肝素锂抗凝剂的试管中。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定LPA 18:2血浆峰面积和化合物40血浆浓度。化合物40的血浆浓度根据包含8个浓度水平、振幅为3个对数单位的校准曲线进行测定。质控样品(三个浓度水平,每个浓度水平重复测定两次)的反算值用于判断整批样品是否合格。化合物40的定量下限为4 ng/mL(使用25 μL血浆)。将血浆蛋白用含内标的过量甲醇沉淀,并将相应的上清液注入C18色谱柱。通过增加有机流动相的比例,将分析物从高效液相色谱系统中洗脱出来。使用WinNonlin软件(Pharsight,版本5.2)进行非房室模型分析,对个体血浆浓度取平均值后计算药代动力学参数。汇总血浆浓度数据,并取每个采样时间点三只大鼠血浆浓度的平均值。为了分析LPA 18:2血浆峰面积,取10 μL血浆等分试样,用含内标LPA 17:0的过量甲醇沉淀血浆蛋白。离心后,将相应的上清液稀释并注入C18色谱柱。在等度条件下将分析物从色谱柱中洗脱出来。未对LPA 18:2进行校准曲线分析,所有定量分析均基于峰面积比值(LPA 18:2/LPA 17:0)。LPA数据最终以减少百分比(%减少)表示,计算公式为:100 – [((t时间点LPA值)/(载体组t时间点LPA平均值)) × 100]。
PAT-505的体内动物研究已在小鼠模型中进行。该化合物经口服给药,并在血浆和肝组织中检测ATX活性。在癌症和纤维化模型中进行的疗效研究评估了肿瘤生长抑制或纤维化减少情况。研究测量了LPA水平等药效学标志物。
药代性质 (ADME/PK)
PAT-505 的分子式为 C23H18ClF2N3O2S,分子量为 473.92 g/mol。其化学名称为 3-{[6-氯-2-环丙基-1-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-7-氟-1H-吲哚-3-基]硫基}-2-氟苯甲酸。其 UNII 为 53T7TDA5QJ。该化合物可口服。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中未提供PAT-505的具体毒理学数据。该化合物仅供研究使用,不适用于人类治疗。作为一种阻断LPA生成的ATX抑制剂,其潜在毒性可能与对细胞增殖和迁移的影响有关。
参考文献

[1]. Selective Inhibition of Autotaxin Is Efficacious in Mouse Models of Liver Fibrosis. J Pharmacol Exp Ther. 2017 Jan;360(1):1-13. Epub 2016 Oct 17.

其他信息
自泌素(ATX)是一种分泌型糖蛋白,可将溶血磷脂酰胆碱(LPC)转化为具有生物活性的磷脂溶血磷脂酸(LPA),并且是循环LPA的主要生成酶。抑制LPA信号通路在包括肺、肾、皮肤和腹膜在内的多个器官系统中具有显著的抗纤维化作用。然而,LPA的生成途径众多,ATX在局部组织LPA生成和纤维化中的作用仍不明确且存在争议。本研究描述了一种新型小分子ATX抑制剂PAT-505 [3-((6-氯-2-环丙基-1-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-7-氟-1H-吲哚-3-基)硫代)-2-氟苯甲酸钠盐]的临床前药理学、药代动力学和药效学。 PAT-505 是一种强效、选择性、非竞争性抑制剂,口服后可显著抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。在 Stelic 小鼠非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 模型中,PAT-505 治疗显著改善了肝纤维化,但对肝细胞气球样变性和肝脏炎症的影响甚微。在胆碱缺乏、高脂饮食诱导的 NASH 模型中,PAT-505 治疗显著降低了肝纤维化的程度,但对脂肪变性、肝细胞气球样变性或炎症无显著影响。这些数据表明,抑制自体分泌素具有抗纤维化作用,可能为包括非酒精性脂肪性肝炎在内的多种纤维化肝病提供一种新的治疗方法。 [1] 自分泌酶 (ATX) 是一种分泌酶,它通过水解溶血磷脂酰胆碱 (LPC) 在血液中溶血磷脂酰胆碱 (LPA) 的生成过程中发挥重要作用。ATX-LPA 信号通路与多种疾病相关,包括癌症、纤维化疾病和炎症,因此在药物研发领域备受关注。通过高通量筛选 (HTS) 发现了一系列咪唑并[1,2-a]吡啶类 ATX 抑制剂。其中一种化合物与 ATX 的共晶结构揭示了一种新的结合模式:该化合物占据了 ATX 的疏水性口袋和通道,但不与催化位点的锌离子相互作用。构效关系研究发现了一些在生化和血浆活性测定中表现出高活性的化合物,例如化合物 40。化合物 40 在大鼠口服给药后也能降低血浆 LPA 水平。 [2]
PAT-505 (CAS 1782070-22-7) 是一种高效、选择性强、非竞争性、口服有效的自泌素抑制剂,其 IC50 值分别为 2 nM(Hep3B 细胞)、9.7 nM(人血)和 62 nM(小鼠血浆)。它对其他 ENPP 家族成员具有高度选择性。口服后,该化合物可抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H18CLF2N3O2S
分子量
473.922729969025
精确质量
473.077
元素分析
C, 58.29; H, 3.83; Cl, 7.48; F, 8.02; N, 8.87; O, 6.75; S, 6.76
CAS号
1782070-22-7
相关CAS号
1782070-22-7 (free);1782070-85-2 (sodium);
PubChem CID
118094189
外观&性状
Typically exists as Pale purple to off-white solids at room temperature
LogP
5.3
tPSA
85.4Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
704
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
BQMMCRXYIIKAOB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H18ClF2N3O2S/c1-2-28-11-13(10-27-28)29-20(12-6-7-12)22(15-8-9-16(24)19(26)21(15)29)32-17-5-3-4-14(18(17)25)23(30)31/h3-5,8-12H,2,6-7H2,1H3,(H,30,31)
化学名
3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid
别名
PAT-505; 1782070-22-7; 53T7TDA5QJ; 3-[6-Chloranyl-2-Cyclopropyl-1-(1-Ethylpyrazol-4-Yl)-7-Fluoranyl-Indol-3-Yl]sulfanyl-2-Fluoranyl-Benzoic Acid; UNII-53T7TDA5QJ; CHEMBL4642052; 3-((6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7-fluoro-1H-indol-3-yl)thio)-2-fluorobenzoic acid; 3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~48.33 mg/mL (~101.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4.83 mg/mL (10.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 48.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 4.83 mg/mL (10.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 48.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1101 mL 10.5503 mL 21.1006 mL
5 mM 0.4220 mL 2.1101 mL 4.2201 mL
10 mM 0.2110 mL 1.0550 mL 2.1101 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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