PAT-505

别名: PAT-505; 1782070-22-7; 53T7TDA5QJ; 3-[6-Chloranyl-2-Cyclopropyl-1-(1-Ethylpyrazol-4-Yl)-7-Fluoranyl-Indol-3-Yl]sulfanyl-2-Fluoranyl-Benzoic Acid; UNII-53T7TDA5QJ; CHEMBL4642052; 3-((6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7-fluoro-1H-indol-3-yl)thio)-2-fluorobenzoic acid; 3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid;
目录号: V27119 纯度: ≥98%
PAT-505 (PAT505) 是一种新型、选择性和有效的自分泌运动因子抑制剂,有潜力用于治疗 NASH 等多种纤维化肝病。
PAT-505 CAS号: 1782070-22-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
PAT-505 (PAT505) 是一种新型、选择性和有效的自分泌运动因子抑制剂,有潜力用于治疗 NASH 等多种纤维化肝病。作为一种口服生物可利用的自分泌运动因子抑制剂,它抑制 Hep3B 细胞中自分泌运动因子的 IC50 为 2 nM。口服给药后,PAT-505 可显着抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。 PAT-505 治疗对纤维化产生了小幅但显着的改善,对肝细胞气球样变和肝脏炎症仅略有改善。 PAT-505可能代表了一种治疗多种纤维化肝病(包括 NASH)的新型治疗方法。
生物活性&实验参考方法
靶点

IC50: 2 nM (Autotaxin, Hep3B cell), 9.7 nM (Autotaxin, Human blood), 62 nM (Autotaxin, Mouse plasma)[1]

体外研究 (In Vitro)
PAT-505 在 Hep3B 细胞中的 IC50 为 2 nM,在人血液中为 9.7 nM,在小鼠血浆中为 62 nM,是一种强效、选择性、非竞争性、口服自分泌运动因子抑制剂。腺苷 A3 受体、MT1 褪黑激素受体、前列腺素 E2 EP4 受体、5-HT5a 血清素受体和 GABA 门控 Cl 通道结合均受到 PAT-505 的轻微抑制,PAT-505 对 ATX 的选择性高于其他 ENPP 蛋白[1]。 10 µM 时抑制范围为 50% 至 70%。
体内研究 (In Vivo)
PAT-505 抑制 ATX lysoPLD 活性,在小鼠血浆中的平均 IC50 为 62 nM,平均 IC90 为 630 nM,在大鼠血浆中为 ~770 nM。在非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 小鼠模型中,PAT-505(30 mg/kg,口服)可显着降低 PSR 阳性区域的百分比、纤维化评分和 α-SMA 免疫反应性[1]。
在这项研究中,我们描述了一种新型小分子ATX抑制剂PAT-505[3-(6-氯-2-环丙基-1-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-7-氟-1H-吲哚-3-基)硫代)-2-氟苯甲酸钠盐]的临床前药理学、药代动力学和药效学特性。PAT-505是一种强效、选择性、非竞争性抑制剂,口服后可显著抑制血浆和肝组织中的ATX活性。当在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的Stelic小鼠动物模型中进行治疗时,PAT-505治疗导致纤维化略有但显著改善,肝细胞气球样变和肝脏炎症仅略有改善。在NASH的胆碱缺乏、高脂肪饮食模型中,PAT-505的治疗性治疗显著减少了肝纤维化,对脂肪变性、肝细胞气球样变或炎症没有显著影响。这些数据表明,抑制autotaxin具有抗纤维化作用,可能是治疗包括NASH在内的多种纤维化肝病的一种新的治疗方法
酶活实验
Biochemical Assay with FS-3 Substrate/FS-3底物生化检测[2]
从最高浓度20μM开始,向孔中加入10μL的化合物稀释系列,1/5稀释。糖基化人ATX蛋白(见支持信息)的终浓度为0.4或0.64μg/mL。将酶稀释在50 mM Tris-HCl(2-氨基-2-(羟甲基)-1,3-丙二醇盐酸盐)pH 8.0、250 mM NaCl、5 mM KCl、1 mM MgCl2、1 mM CaCl2和0.1%无脂肪酸BSA中,总体积为20μL。将酶混合物加入化合物中,将所得混合物在室温下摇动孵育30分钟。通过加入20μL在上述相同缓冲液中稀释的0.75μM FS-3开始反应。在室温下孵育30分钟后,在Envision装置上读取荧光(激发485nm,发射520nM)。[2]
LPC 16:0底物生化分析[2]
从最高浓度20μM开始,向孔中加入5μL的化合物稀释系列(1/5稀释)。糖基化人ATX蛋白(见支持信息)的终浓度为1或3μg/mL。酶在50 mM Tris-HCl pH 8.5、500 mM NaCl、5 mM KCl、10 mM CaCl2和0.1%无脂肪酸BSA中稀释,总体积为10μL。通过加入10μL在上述相同缓冲液中稀释的150μM LPC 16:0开始反应,并将混合物在37°C下孵育30分钟。通过加入25μL混合物来终止反应并定量胆碱,该混合物含有0.6 U/mL胆碱氧化酶、0.6 U/mL辣根过氧化酶(HRP)、1.8 mM TOOS(N-乙基-N-(2-羟基-3-磺丙基)-3-甲基苯胺,钠盐二水合物)、1.2 mM 4-氨基安替比林和20 mM EGTA(乙二醇双(2-氨基乙醚)-N,N,N′,N′-四乙酸,终止显影剂溶液),稀释在缓冲液中。如上所述。在室温下孵育30分钟后,在Envision装置上读取发光(激发555nm,激发光=70%)。[2]
大鼠血浆测定[2]
将大鼠血浆在冰上解冻,并加入含有待测化合物剂量范围的平板中。在37°C下孵育2小时后,用过量含LPA 17:0的甲醇作为内标沉淀10μL等分试样中的血浆蛋白。离心后,将相应的上清液稀释并注射到C18柱上。在等度条件下将分析物从柱中洗脱出来。没有为LPA 18:2制备校准曲线,所有定量都是基于峰面积比(LPA 18:2/LPA 17:0)进行的。对于每种浓度的化合物,LPA数据表示为减少百分比(减少百分比),使用公式:100-[(LPA比率)/(对照样品中的LPA比例)×100]。
动物实验
在雄性C57BL/6小鼠中诱导非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。简而言之,5周龄小鼠先饲喂普通饲料1周以适应环境,然后转为低胆碱、L-氨基酸限定的高脂饮食(CDAHFD),其中脂肪占总热量的60%,蛋氨酸含量为0.1%。CDAHFD喂养4周后,通过颌下静脉采血,从每只小鼠采集约200 μL血液,并分析血清中的肝酶水平。任何血清总胆红素水平>1 mg/dL的小鼠在给药前均被排除出研究。小鼠继续饲喂CDAHFD 5周后,随机分组(每组n=7-10)。从第 5 周到第 12 周,每天一次通过 0.5% 甲基纤维素 (MC) 灌胃给予载体或 PAT-505 (3-30 mg/kg)[1].
大鼠药代动力学/药效学与化合物 40( PAT-505 的类似物)[2]
雄性 Sprague-Dawley 大鼠在受控环境中饲养,并以 5 mg/kg 的剂量给予化合物 40,该化合物 40 配制于 10% (2-羟丙基)-β-环糊精中,用柠檬酸将 pH 值调节至 3(1 mg/mL 的 40)。根据GALAPAGOS动物福利伦理委员会批准的方案,并经法国高等教育与研究部和省人口保护局同意,通过导管经颈静脉采集血样。采集时间点为给药后0.5、1和3小时,并将血样置于含肝素锂抗凝剂的试管中。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定LPA 18:2血浆峰面积和化合物40血浆浓度。化合物40的血浆浓度根据包含8个浓度水平、振幅为3个对数单位的校准曲线进行测定。质控样品(三个浓度水平,每个浓度水平重复测定两次)的反算值用于判断整批样品是否合格。化合物40的定量下限为4 ng/mL(使用25 μL血浆)。将血浆蛋白用含内标的过量甲醇沉淀,并将相应的上清液注入C18色谱柱。通过增加有机流动相的比例,将分析物从高效液相色谱系统中洗脱出来。使用WinNonlin软件(Pharsight,版本5.2)进行非房室模型分析,对个体血浆浓度取平均值后计算药代动力学参数。汇总血浆浓度数据,并取每个采样时间点三只大鼠血浆浓度的平均值。为了分析LPA 18:2血浆峰面积,取10 μL血浆等分试样,用含内标LPA 17:0的过量甲醇沉淀血浆蛋白。离心后,将相应的上清液稀释并注入C18色谱柱。在等度条件下将分析物从色谱柱中洗脱出来。未对 LPA 18:2 制备校准曲线,所有定量分析均基于峰面积比值 (LPA 18:2/LPA 17:0) 进行。LPA 数据最终以减少百分比 (% 减少) 表示,计算公式为:100 – [((时间点 t 的 LPA 值)/(载体组在同一时间点 t 的 LPA 平均值)) × 100]。
参考文献

[1]. Selective Inhibition of Autotaxin Is Efficacious in Mouse Models of Liver Fibrosis. J Pharmacol Exp Ther. 2017 Jan;360(1):1-13. Epub 2016 Oct 17.

其他信息
自泌素(ATX)是一种分泌型糖蛋白,可将溶血磷脂酰胆碱(LPC)转化为具有生物活性的磷脂溶血磷脂酸(LPA),并且是循环LPA的主要生成酶。抑制LPA信号通路在包括肺、肾、皮肤和腹膜在内的多个器官系统中具有显著的抗纤维化作用。然而,LPA的生成途径不止一种,ATX在局部组织LPA生成和纤维化中的作用仍不明确且存在争议。本研究描述了一种新型小分子ATX抑制剂PAT-505 [3-((6-氯-2-环丙基-1-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-7-氟-1H-吲哚-3-基)硫代)-2-氟苯甲酸钠盐]的临床前药理学、药代动力学和药效学特性。 PAT-505 是一种强效、选择性、非竞争性抑制剂,口服后可显著抑制血浆和肝组织中的 ATX 活性。在非酒精性脂肪性肝炎 (NASH) 的 Stelic 小鼠动物模型中,PAT-505 治疗可显著改善肝纤维化,但对肝细胞气球样变性和肝脏炎症的改善作用甚微。在胆碱缺乏、高脂饮食诱导的 NASH 模型中,PAT-505 治疗可显著降低肝纤维化程度,但对脂肪变性、肝细胞气球样变性或炎症无显著影响。这些数据表明,抑制自泌素具有抗纤维化作用,并可能代表一种治疗多种纤维化肝病(包括非酒精性脂肪性肝炎)的新型治疗方法。[1] 自泌素 (ATX) 是一种分泌酶,通过水解溶血磷脂酰胆碱 (LPC) 在血液中溶血磷脂酸 (LPA) 的生成中发挥重要作用。ATX-LPA 信号通路在药物研发领域引起了广泛关注,因为它与多种疾病相关,包括癌症、纤维化疾病和炎症等。通过高通量筛选 (HTS) 发现了一系列咪唑并[1,2-a]吡啶类 ATX 抑制剂。其中一种化合物与 ATX 的共晶结构揭示了一种新的结合模式:该化合物占据了 ATX 的疏水性口袋和通道,但并未与催化位点的锌离子发生相互作用。对结构-活性关系的探索发现了在生化和血浆测定中表现出高活性的化合物,例如化合物 40。化合物 40 在口服给药给大鼠后,还能降低血浆 LPA 水平。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H18CLF2N3O2S
分子量
473.922729969025
精确质量
473.077
元素分析
C, 58.29; H, 3.83; Cl, 7.48; F, 8.02; N, 8.87; O, 6.75; S, 6.76
CAS号
1782070-22-7
相关CAS号
1782070-22-7 (free);1782070-85-2 (sodium);
PubChem CID
118094189
外观&性状
Typically exists as Pale purple to off-white solids at room temperature
LogP
5.3
tPSA
85.4Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
704
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
BQMMCRXYIIKAOB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H18ClF2N3O2S/c1-2-28-11-13(10-27-28)29-20(12-6-7-12)22(15-8-9-16(24)19(26)21(15)29)32-17-5-3-4-14(18(17)25)23(30)31/h3-5,8-12H,2,6-7H2,1H3,(H,30,31)
化学名
3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid
别名
PAT-505; 1782070-22-7; 53T7TDA5QJ; 3-[6-Chloranyl-2-Cyclopropyl-1-(1-Ethylpyrazol-4-Yl)-7-Fluoranyl-Indol-3-Yl]sulfanyl-2-Fluoranyl-Benzoic Acid; UNII-53T7TDA5QJ; CHEMBL4642052; 3-((6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7-fluoro-1H-indol-3-yl)thio)-2-fluorobenzoic acid; 3-[6-chloro-2-cyclopropyl-1-(1-ethylpyrazol-4-yl)-7-fluoroindol-3-yl]sulfanyl-2-fluorobenzoic acid;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~48.33 mg/mL (~101.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4.83 mg/mL (10.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 48.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 4.83 mg/mL (10.19 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 48.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1101 mL 10.5503 mL 21.1006 mL
5 mM 0.4220 mL 2.1101 mL 4.2201 mL
10 mM 0.2110 mL 1.0550 mL 2.1101 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

相关产品
联系我们