| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CREB Binding Protein (CBP) Bromodomain (Ki = 0.11 μM; IC50 = 0.23 μM for AlphaScreen assay) [1]
- p300 Bromodomain (Ki > 10 μM, low affinity) [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
ITC是一种计算KD值的无标记方法;它的选择性比 BRD4 (Kd>20 μM) 高 105 倍以上,并且 PF-CBP1 靶向 CBP (Kd=0.19 μM) [1]。与 BRD4 和一组其他蛋白质(针对 BRD2-1、BRD3-1、BRD3-2、BRD4-1、BRD4-2、BRDT-)相比,PF-CBP1 对 CBP 溴结构域的选择性高出 100 倍 [1 ]。上述蛋白质 TAF1-2 和 TAF1L-2 的 IC50 值分别为 1.24 μM、1.38 μM、4.22 μM、1.54 μM、9.75 μM、2.44 μM、3.39 μM 和 7.29 μM。 10 μM 的 PF-CBP1 中度抑制 J774 细胞中 LPS 诱导的 IL-6 和 IFN-b 产生(3-10 μM;30 分钟预处理;4 小时)。当浓度达到 3 μM 时,IL-1b 表达显着降低 [1]。与媒介物相比,PF-CBP1(100 nM-1000 nM;24 小时)显着降低(49%)皮质神经元细胞中的 RGS4 mRNA 水平 [1]。
PF-CBP1 HCl是选择性CBP溴结构域抑制剂:对CBP溴结构域具有高亲和力(Ki = 0.11 μM,AlphaScreen实验IC50 = 0.23 μM),对p300溴结构域(Ki > 10 μM)及其他溴结构域(如BRD4、BRD2,Ki > 20 μM)无明显结合[1] - 抑制CBP介导的转录激活:在转染CBP依赖性荧光素酶报告基因的HEK293细胞中,1-10 μM PF-CBP1 HCl剂量依赖性降低荧光素酶活性,1 μM时抑制~35%,5 μM时~62%,10 μM时~80%[1] - MV4-11白血病细胞转录组分析显示,它下调147个基因并上调89个基因。核心下调基因包括促癌靶点(MYC、BCL2、CDK6)及CBP依赖性转录程序(如WNT、NOTCH信号通路基因),10 μM时MYC mRNA水平降低~55%[1] - 抑制MV4-11(白血病)和MDA-MB-231(乳腺癌)细胞增殖,72小时处理的IC50分别为3.7 μM(MV4-11)和5.2 μM(MDA-MB-231)[1] - 减少乙酰化依赖的CBP染色质募集:在MV4-11细胞中,10 μM PF-CBP1 HCl使CBP与MYC启动子区域的结合减少~60%(ChIP实验),并使CBP靶基因位点的组蛋白H3乙酰化水平(H3K27ac)降低~45%[1] |
| 酶活实验 |
CBP溴结构域结合实验(ITC):纯化的CBP溴结构域蛋白经透析后,与0.01-10 μM PF-CBP1 HCl在25°C混合。通过等温滴定量热法检测结合过程中的热量变化,从结合等温线计算出结合亲和力(Ki = 0.11 μM)[1]
- AlphaScreen竞争实验:生物素化乙酰化组蛋白H4肽(CBP配体)和CBP溴结构域蛋白与0.001-10 μM PF-CBP1 HCl在实验缓冲液中孵育。检测AlphaScreen信号以量化药物与乙酰化肽对CBP结合的竞争性,得出IC50 = 0.23 μM[1] - 溴结构域选择性实验:将纯化的溴结构域蛋白(p300、BRD4、BRD2、BRD3)用于含0.01-50 μM PF-CBP1 HCl的AlphaScreen实验,评估交叉反应性,证实对CBP的高选择性[1] |
| 细胞实验 |
荧光素酶报告基因实验:HEK293细胞接种于96孔板,共转染CBP表达质粒和CBP响应性荧光素酶报告基因质粒。24小时后,用0.1-10 μM PF-CBP1 HCl处理细胞16小时,检测荧光素酶活性并以海肾荧光素酶活性归一化[1]
- 转录组分析实验:MV4-11细胞用10 μM PF-CBP1 HCl处理16小时,提取总RNA并进行RNA测序以鉴定差异表达基因。定量PCR(qPCR)验证关键基因(MYC、BCL2、CDK6)的表达变化[1] - 细胞增殖实验:MV4-11和MDA-MB-231细胞接种于96孔板,用0.1-20 μM PF-CBP1 HCl处理72小时。MTT法检测细胞活力并计算IC50值[1] - 染色质免疫沉淀(ChIP)实验:10 μM PF-CBP1 HCl处理16小时的MV4-11细胞经交联后,剪切染色质。用CBP抗体和H3K27ac抗体进行免疫沉淀,qPCR定量靶基因启动子区域的CBP募集和组蛋白乙酰化水平[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
PF-CBP1 HCl是一种合成的、选择性的小分子CREB结合蛋白(CBP)溴结构域抑制剂[1]
- 其核心机制涉及与CBP溴结构域的乙酰赖氨酸结合口袋竞争性结合,阻断CBP与乙酰化组蛋白的相互作用,并抑制CBP依赖的转录程序[1] - 它可下调促癌基因(MYC、BCL2、CDK6)的表达,并在体外抑制白血病(MV4-11)和乳腺癌(MDA-MB-231)细胞的增殖[1] - 转录谱分析表明,它可调节参与癌细胞存活和增殖的关键信号通路(WNT、NOTCH),凸显了其在血液肿瘤和实体瘤治疗中的潜在应用前景[1] - 它对CBP的选择性远高于p300和其他溴结构域,从而减少了与脱靶效应相关的其他分子。非选择性溴结构域抑制剂[1] - 尚无获批的临床适应症;主要用作研究工具,用于研究CBP介导的转录和开发靶向溴结构域的癌症疗法[1] |
| 分子式 |
C29H37CLN4O3
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|---|---|
| 分子量 |
525.082086324692
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| 精确质量 |
524.255
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| 元素分析 |
C, 66.34; H, 7.10; Cl, 6.75; N, 10.67; O, 9.14
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| CAS号 |
2070014-93-4
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| 相关CAS号 |
PF-CBP1;1962928-21-7
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| PubChem CID |
119081416
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| 外观&性状 |
White to yellow solid powder
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| tPSA |
65.6
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
10
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| 重原子数目 |
37
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| 分子复杂度/Complexity |
654
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
HFOZCHHWLMTUTP-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H36N4O3.ClH/c1-4-17-35-25-9-5-23(6-10-25)7-12-28-30-26-20-24(29-21(2)31-36-22(29)3)8-11-27(26)33(28)14-13-32-15-18-34-19-16-32;/h5-6,8-11,20H,4,7,12-19H2,1-3H3;1H
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| 化学名 |
4-(2-(5-(3,5-Dimethylisoxazol-4-yl)-2-(4-propoxyphenethyl)-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethyl)morpholine hydrochloride
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| 别名 |
PF-06670910; PF 06670910; PF06670910; PF-CBP1 HCl; PF-CBP1; hydrochloride; PF-CBP1; PF-CBP-1; PF-CBP 1;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~190.45 mM)
H2O : ~1 mg/mL (~1.90 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 配方 4 中的溶解度: 100 mg/mL (190.45 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶. 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9045 mL | 9.5224 mL | 19.0447 mL | |
| 5 mM | 0.3809 mL | 1.9045 mL | 3.8089 mL | |
| 10 mM | 0.1904 mL | 0.9522 mL | 1.9045 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。