| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 10mg |
|
||
| 25mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| 100mg |
|
||
| 250mg |
|
||
| 500mg |
|
||
| 1g |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
CREB Binding Protein (CBP) bromodomain (Ki = 0.5 nM; IC50 for CBP bromodomain binding = 1.5 nM) [1]
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
在初级巨噬细胞中,PF-CBP1 调节重要的炎症基因。神经元中的 RGS4 是与帕金森病相关的一个靶点,可被 PF-CBP1 下调。在生化实验中,ITC 的选择性比 BRD4 高 105 倍,而 PF-CBP1 的选择性高 139 倍。正如其他 CBP 抑制剂所见,F-CBP1 同样是 EP300 的强抑制剂 [1]。
PF-CBP1对CBP溴结构域具有高选择性:在浓度高达10 μM时,对其他溴结构域(如BRD4、BRD2、BRD3、PCAF)无显著结合活性 [1] - 在HeLa细胞中,PF-CBP1(1 μM,处理6小时)通过ChIP-qPCR实验检测显示,可降低CBP在BCL6和MYC基因启动子区域的占据率,与DMSO对照组相比分别降低约60%和55% [1] - PF-CBP1(0.1-10 μM)呈剂量依赖性抑制CBP依赖的转录激活:在荧光素酶报告基因实验中(HeLa细胞转染CBP响应型启动子),EC50 = 0.3 μM [1] - 在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)细胞系(OCI-LY10、SU-DHL4)中,PF-CBP1(1-5 μM,处理48小时)通过qPCR检测显示,可使BCL6和MYC的mRNA表达水平分别降低40%-65%和35%-50%;蛋白质印迹(western blot)结果显示,对应蛋白水平分别降低30%-55%和25%-45% [1] - PF-CBP1(0.5-10 μM,处理72小时)抑制DLBCL细胞系(OCI-LY10、SU-DHL4、SU-DHL6)的增殖,MTT实验测得IC50值分别为2.3 μM、3.1 μM和4.5 μM [1] - 在OCI-LY10细胞中,PF-CBP1(3 μM,处理72小时)通过流式细胞术检测显示,可诱导G1期细胞周期阻滞:G1期细胞比例从对照组(DMSO)的45%升高至68%,S期细胞比例从32%降至18% [1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在OCI-LY10 DLBCL异种移植小鼠模型(雌性NOD/SCID小鼠)中,PF-CBP1经口服给药(50 mg/kg,每日两次),连续21天可显著抑制肿瘤生长:第21天肿瘤体积为溶媒对照组的42%(P<0.01);处死时肿瘤重量为溶媒对照组的38%(P<0.01)[1]
- 免疫组织化学检测显示,PF-CBP1处理组小鼠的肿瘤组织中,BCL6和MYC蛋白水平分别比溶媒对照组降低约50%和45% [1] - 研究期间,PF-CBP1处理组小鼠未出现显著体重下降或明显器官毒性 [1] |
| 酶活实验 |
HTRF结合实验:将重组CBP溴结构域蛋白与系列稀释的PF-CBP1(0.001-10 μM)及荧光标记的乙酰化组蛋白H4肽段(H4K5ac/K8ac/K12ac/K16ac)共同孵育。室温孵育1小时后,检测荧光共振能量转移(FRET)信号,根据信号抑制的剂量-反应曲线计算IC50值 [1]
- 表面等离子体共振(SPR)实验:将CBP溴结构域蛋白固定在传感器芯片上,以恒定流速将系列稀释的PF-CBP1(0.0001-1 μM)注入芯片表面。通过将传感图数据拟合至1:1结合模型,确定结合亲和力(Ki)[1] |
| 细胞实验 |
细胞增殖实验:DLBCL细胞接种于96孔板(5×103个细胞/孔),过夜孵育后加入系列稀释的PF-CBP1(0.1-10 μM),继续培养72小时。加入MTT试剂孵育4小时,DMSO溶解甲臜结晶后,在570 nm波长下测定吸光度,根据剂量-反应曲线计算IC50值 [1]
- qPCR实验:DLBCL细胞经PF-CBP1(1-5 μM)处理48小时后,提取总RNA并逆转录为cDNA,使用BCL6、MYC及内参基因GAPDH的特异性引物进行qPCR检测,采用ΔΔCt法计算相对mRNA表达水平 [1] - 蛋白质印迹(western blot)实验:细胞经PF-CBP1(1-5 μM)处理48小时后裂解,提取的蛋白质通过SDS-PAGE电泳分离,转移至PVDF膜,用BCL6、MYC及内参蛋白β-肌动蛋白(β-actin)的抗体进行孵育。化学发光法显影免疫反应条带,通过密度计量法量化条带强度 [1] - ChIP-qPCR实验:HeLa细胞经PF-CBP1(1 μM)处理6小时后,用甲醛进行交联,裂解细胞并通过超声破碎染色质。用抗CBP抗体免疫沉淀CBP结合的染色质片段,逆转交联后纯化DNA,使用针对BCL6和MYC基因启动子的引物进行qPCR,定量CBP的占据率 [1] - 细胞周期分析:OCI-LY10细胞经PF-CBP1(3 μM)处理72小时后,用乙醇固定,碘化丙啶染色,流式细胞术检测。通过流式细胞仪软件分析细胞周期分布(G1、S、G2/M期)[1] |
| 动物实验 |
异种移植模型建立:将5×10⁶个OCI-LY10 DLBCL细胞(悬浮于PBS/Matrigel中)皮下注射到6-8周龄雌性NOD/SCID小鼠右侧腹部。待肿瘤生长至约100 mm³后开始治疗[1]
- 给药:将小鼠随机分为载体对照组和PF-CBP1治疗组(每组n=8)。PF-CBP1溶于10% DMSO + 90% PEG400溶液中,以50 mg/kg的剂量,每日两次,连续21天进行口服给药。载体对照组小鼠给予等体积的10% DMSO + 90% PEG400溶液[1] - 肿瘤和体重监测:每3天使用游标卡尺测量肿瘤体积(体积 = 长 × 宽² / 2)。每周记录体重以评估总体毒性[1] - 组织采集:治疗结束后,处死小鼠,切除肿瘤,称重,并分成若干部分用于免疫组织化学和蛋白质提取。采集主要器官(肝脏、肾脏、脾脏)用于总体毒性评估[1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
PF-CBP1 在小鼠体内的口服生物利用度:38%(通过比较口服和静脉注射 10 mg/kg 后 24 小时的 AUC 测定)[1]
- 小鼠口服 50 mg/kg 后的血浆半衰期 (t1/2):4.2 小时 [1] - 小鼠口服 50 mg/kg 后的血浆峰浓度 (Cmax):3.8 μM(给药后 1 小时达到)[1] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
与载体对照组相比,PF-CBP1 处理组小鼠(50 mg/kg,每日两次,持续 21 天)的体重未见显著变化[1]
- 对 PF-CBP1 处理组小鼠的肝脏、肾脏和脾脏进行肉眼检查,未发现异常(例如肥大、变色、坏死)[1] - PF-CBP1 处理组小鼠的血浆丙氨酸氨基转移酶 (ALT)、天冬氨酸氨基转移酶 (AST)、血尿素氮 (BUN) 和肌酐 (Cr) 水平均在正常范围内,与载体对照组相比无显著差异[1] |
| 参考文献 |
[1]. Chekler EL, et al. Transcriptional Profiling of a Selective CREB Binding Protein Bromodomain Inhibitor Highlights Therapeutic Opportunities. Chem Biol. 2015 Dec 17;22(12):1588-96.
|
| 其他信息 |
PF-CBP1是一种小分子抑制剂,可与CBP溴结构域的乙酰赖氨酸结合口袋结合,从而阻止CBP与乙酰化组蛋白的相互作用[1]
- PF-CBP1的化学结构以喹唑啉酮为核心,该核心经过优化,可对CBP溴结构域具有高亲和力和选择性[1] - PF-CBP1可调节依赖于CBP的转录程序,包括由CREB、MYC和BCL6驱动的转录程序,这些程序对于弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)细胞的存活和增殖至关重要[1] - 体外和体内数据支持PF-CBP1作为治疗DLBCL和其他由CBP依赖性转录失调驱动的癌症的潜在药物[1] |
| 分子式 |
C29H36N4O3
|
|---|---|
| 分子量 |
488.632
|
| 精确质量 |
488.278
|
| CAS号 |
1962928-21-7
|
| 相关CAS号 |
PF-CBP1 hydrochloride;2070014-93-4
|
| PubChem CID |
119081417
|
| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
|
| 密度 |
1.2±0.1 g/cm3
|
| 沸点 |
673.5±55.0 °C at 760 mmHg
|
| 闪点 |
361.1±31.5 °C
|
| 蒸汽压 |
0.0±2.1 mmHg at 25°C
|
| 折射率 |
1.615
|
| LogP |
5.46
|
| tPSA |
65.6
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
0
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
6
|
| 可旋转键数目(RBC) |
10
|
| 重原子数目 |
36
|
| 分子复杂度/Complexity |
654
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
|
| SMILES |
O1CCN(CC1)CCN1C2C=CC(C3C(C)=NOC=3C)=CC=2N=C1CCC1C=CC(=CC=1)OCCC
|
| InChi Key |
CGWBJJZOKGZCSJ-UHFFFAOYSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C29H36N4O3/c1-4-17-35-25-9-5-23(6-10-25)7-12-28-30-26-20-24(29-21(2)31-36-22(29)3)8-11-27(26)33(28)14-13-32-15-18-34-19-16-32/h5-6,8-11,20H,4,7,12-19H2,1-3H3
|
| 化学名 |
4-(2-(5-(3,5-Dimethylisoxazol-4-yl)-2-(4-propoxyphenethyl)-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethyl)morpholine
|
| 别名 |
PF-CBP-1; PF-CBP1; PF-CBP 1; PF 06670910; PF-06670910; PF06670910
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0465 mL | 10.2327 mL | 20.4654 mL | |
| 5 mM | 0.4093 mL | 2.0465 mL | 4.0931 mL | |
| 10 mM | 0.2047 mL | 1.0233 mL | 2.0465 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。